桑属植物叶绿体基因组特征比较及系统发育分析

Feature comparison and phylogenetic analysis of chloroplast genome of Morus plants

探究桑属叶绿体基因组特征及该属物种的系统发育进化关系。收集8种桑属植物叶绿体基因序列,基于最大似然法重建桑属植物系统发育关系,并运用生物信息学手段进行叶绿体基因组特征分析。桑树叶绿体基因组结构为典型的四段式结构,大单拷贝区长89952 bp,小单拷贝区长20149 bp,2个反向重复区长25751 bp。共检测到661个SSR位点,包含480个单核苷酸位点、57个二核苷酸位点、25个三核苷酸位点、82个四核苷酸位点、16个五核苷酸位点、1个六核苷酸位点,碱基组成以A/T碱基类型为主,平均GC含量为36.2%。变异度在前3位的间隔区依次是psbl-trnS(GCU)-trnG(UCC)、rps4-trnT(UGU)-trnL(UAA)、rp132-trnL(UAG)。桑属树种的叶绿体基因组相对较大,且序列稳定,变异主要发生在LSC区。相较于基因编码区,桑属植物的基因非编码区更容易积累突变。桑与蒙桑具有较近的亲缘关系,其次是华桑与吉隆桑。