摘要
本试验旨在探讨海南定安猪群体的遗传多样性及群体结构,揭示定安猪群体现状。利用全基因组重测序技术对15头海南定安猪进行了测序,共获得有效数据937.38 Gb,平均测序深度为23.43×,过滤后共检测到10 946 171个高质量SNP位点。定安猪的期望杂合度(He)为0.32、观测杂合度(Ho)为0.36、核苷酸多态性(pi)为0.001 6,连锁不平衡程度(LD)分析结果显示衰减速度较快,说明定安猪的遗传多样性较高;系统进化树、主成分分析、群体结构及群体分化指数(Fst)分析发现,所有定安猪个体均聚集为一类,与其他群体间出现明显遗传分化,体现出定安猪的独特性。本研究结果在分子水平为定安猪群体遗传多样性及遗传结构提供了理论支撑,为未来定安猪的保种及创新利用奠定了基础。
出处
《中国畜牧杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期112-117,共6页
Chinese Journal of Animal Science
基金
海南省“南海新星”科技创新人才平台项目(NHXXR CXM202313)
国家自然科学基金(32260814)。
