履行搬迁协议后才知签协议的行政机关被撤销 这份行政协议为何会“违法但有效”?

几年前,×省×县一家金属铸件厂与所在地的经济区管委会签订了一份搬迁补偿协议。履行协议后,金属铸件厂得知拆迁时的资产评估报告有2份,补偿标准却是按照评估价值较低的报告确定,对补偿金额产生不满,遂以管委会对相关拆迁政策解释不够明朗,有诱导和欺骗之嫌为由,起诉到法院要求撤销此协议。诉讼期间,法院查明,经济区管委会签订协议前已被当地县政府撤销。