摘要
目的评价电泳评级法及Nano/Qubit浓度比值法在二代测序建库DNA片段化过程中超声打断时间的一致性。方法收集中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院病理科323例石蜡固定样本。分别通过DNA电泳评级法和Nano/Qubit浓度比值法确定二代测序建库DNA片段化过程中的超声打断时间,利用Kappa一致性检验对二者的一致性进行比较。结果Kappa系数表明电泳评级法与Nano/Qubit浓度比值法2种方法评估DNA超声打断时间的一致性良好(Kappa=0.540,P<0.05),但对于低质量标本,缺乏一致性:Nano/Qubit值>7.5(Kappa=0.021,P=0.751)或D级(Kappa=0.040,P=0.146)。结论电泳评级法与Nano/Qubit浓度比值评估二代测序文库DNA片段化时间的一致性良好,可以用Nano/Qubit值大致推算标本的质量,但对于Nano/Qubit值>7.5的标本,应当通过电泳评级法进行评估。
作者
高洁
刘添齐
鲁涛
Gao Jie;Liu Tianqi;Lu Tao(Department of Pathology,Peking Union Medical College Hospital,Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College,Beijing 100730,China)
出处
《中华病理学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期855-858,共4页
Chinese Journal of Pathology