柯乐猪OPN基因多态性及其与繁殖性状的关联分析

本文旨在研究柯乐猪骨调素(Osteopontin,OPN)基因多态性及其与繁殖性状的关系,为该品种的遗传改良和优化繁殖计划提供理论依据。采用PCR产物直接测序法检测200头柯乐猪OPN基因第6外显子的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)位点,通过RNAfold预测OPN基因突变前后的mRNA二级结构,并利用SPSS 26.0软件分析OPN基因SNP位点与柯乐猪繁殖性状的相关性。结果显示,在OPN基因第6外显子中筛查到5个SNPs位点,分别为g.131083657 A>G、g. 131083770 A>G、g.131083791A>C、g.131083805C>T和g.131083806G>C位点,均产生3种基因型,且均为中度多态,其中g.131083657 A>G和g.131083806G>C位点属于错义突变,分别导致丙氨酸突变为络氨酸、缬氨酸突变为丙氨酸。卡方检验结果显示,5个SNPs位点均符合Hardy-Weinberg平衡,且5个SNPs位点两两之间存在强连锁不平衡。5个SNPs联合产生4种单倍型和5种双倍型,突变后单倍型H3(GAACG)的mRNA二级结构稳定性增加,而H4(GGATC)和H1(AAACG)稳定性减弱,突变后单倍型H1、H3在三级结构第109个氨基酸前后和158个氨基酸处有明显变化。关联分析结果表明,各位点与产活仔猪数、断奶仔猪数和断奶窝重呈显著相关,g.131083657 A>G、g.131083770 A>G和g.131083791A>C位点有利基因型均为AA,g.131083805C>T、g.131083806G>C位点有利基因型分别为CC和GG。双倍型H1H1(AAAAAACCGG)个体产活仔猪数和断奶仔猪数优于双倍型H1H2(AGAGACCTCG)及H3H3个体(GGAAAACCGG)(P<0.05),H1H1和H2H3(GGAGACCTCG)断奶平均重显著低于H1H2。本研究揭示OPN基因第6外显子上的5个突变位点与柯乐猪的产活仔猪数、断奶仔猪数和断奶窝重3个繁殖性能指标均存在显著关联,可作为柯乐猪繁殖性状选择的候选分子标记。