基于网络药理学和分子对接技术探究侧柏叶防治慢性牙周炎的作用机制

目的:基于网络药理学和分子对接方法探讨侧柏叶防治慢性牙周炎的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP),筛选侧柏叶中的活性化学成分及可能作用的蛋白质靶点,通过UniProt数据库转换为Gene Symbol,利用OMIM数据库和GeneCards网站收集慢性牙周炎相关基因。选取交集靶点,利用Cytoscape软件绘制慢性牙周炎-侧柏叶-活性成分-靶点的网络图。利用STRING数据库构建基于交集靶点的蛋白质间相互作用(PPI)网络。借助Metascape平台,对靶点进行基因本体(GO)功能分类和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路的富集分析。利用MCODE插件确定关键基因簇,最后通过分子对接方法找到可能作用的靶点。结果:通过筛选得到侧柏叶主要活性成分7个,共获得98个防治慢性牙周炎的潜在靶点,KEGG通路富集、基因本体论(GO)分类富集结果显示,侧柏叶防治慢性牙周炎的机制涉及多个生物学过程,包括细胞对无机物的反应、细胞对化学刺激的反应等过程。蛋白-蛋白互作后发现关键基因簇,包括TP53、AKT1、白细胞介素(IL)-6等。分子对接结果表明,各靶点皆具有较为良好的亲合能。结论:侧柏叶治疗慢性牙周炎通过多成分、多靶点、多通路协同起效。