石榴TIFY基因家族的全基因组鉴定与表达分析

Whole genome identification and expression analysis of TIFY gene family in Punica granatum L.

TIFY转录因子在植物生长发育和逆境响应中起重要作用。以石榴基因组数据为基础,利用生物信息学方法,开展TIFY转录因子的鉴定,并进行蛋白理化性质、系统进化关系、保守基序、基因结构、表达模式、顺式作用元件分析。结果表明,在石榴基因组中共鉴定到16个TIFY基因,可分为ZML、JAZ、TIFY、PPD这4个亚家族。PgTIFY基因结构存在明显差异,其中ZML亚家族基因结构最复杂。表达分析结果表明,PgTIFY2、PgTIFY3、PgTIFY7、PgTIFY10、PgTIFY12在叶片中高表达;PgTIFY1、PgTIFY4、PgTIFY5、PgTIFY8、PgTIFY13、PgTIFY16在根中高表达;PgTIFY15、PgTIFY11在花中高表达。JAZ亚家族基因在盐胁迫和ABA处理组织中差异表达。16个PgTIFY基因启动子均含有低温、干旱、缺氧等胁迫响应元件和茉莉酸甲酯、ABA、生长素、JA相关激素响应元件类型。推测PgTIFY基因家族可能在石榴果实发育、逆境响应、激素信号调控等方面发挥重要作用。