基于混池高通量测序的花生含油量相关基因初定位

Preliminary mapping of peanut oil content related genes based on mixed pool high-throughput sequencing

为开发花生高油相关分子标记,促进花生高油育种,并提高我国食用油自给率,以普通油酸含量高油花生品种HFLS与3个高油酸花生品种(系)花育665、花育668、FB4为亲本搭配4个杂交组合,选择含油量遗传规律相对简单且主基因遗传率最高的HFLS×花育665组合,利用F_(2)群体构建各包括30个个体的极端高油和极端低油混池,连同亲本HFLS和花育665进行高通量测序。将花生含油量基因初步定位在A02和A05染色体上,候选区间总长度分别为5.3、5.1 Mb。在候选区间内设计119对SNP和InDel引物,筛选出双亲间具有多态性的InDel标记和SNP标记共14对;利用F_(2)群体验证这14对标记,经单标记分析发现,A02染色体上的4对标记(Chr02-7、Chr02-25、Chr02-65和Chr02-34)和A05染色体上的1对标记(Chr05-80)与花生含油量显著相关,表型变异解释率分别为46.4%、33.2%、34.8%、31.0%和28.3%。其中,标记Chr02-65、Chr02-7、Chr02-25和Chr02-34所对应的物理位置为A02染色体87578082~88550841 bp之间,区间大小约为0.97 Mb,区间内基因为37个。本研究定位区间与前人报道的无重叠,为花生高油分子育种提供了新的标记。