摘要
目的:采用生物信息学分析抗沉默功能1B组蛋白伴侣(ASF1B)在结直肠癌中的表达水平及其与临床预后和生物学功能的关系。方法:利用TCGA数据库和GEO数据库分析ASF1B在结直肠癌及其癌旁正常组织中的表达情况,并分析ASF1B表达与结直肠癌患者预后关系;利用HPA数据库分析ASF1B在结直肠癌中的蛋白表达情况;使用仙桃学术网站及R语言分析ASF1B表达与结直肠癌患者临床病理特征、预后的关系;利用基因功能注释富集分析探索ASF1B在结直肠癌中参与的信号途径。结果:与癌旁组织相比,结直肠癌组织中ASF1B的表达水平明显上调。ASF1B高表达与结直肠癌患者总体生存期和无进展间隔期呈显著正相关性;ASF1B高表达与肿瘤分期(T)、淋巴结转移(N)、远处转移(M)、CEA水平、淋巴结侵袭及神经侵袭存在明显相关性。Cox回归分析显示ASF1B高表达是结直肠癌患者总生存期的独立危险因素。ROC分析显示,ASF1B在结直肠癌中具有较高的诊断价值。功能富集分析显示,ASF1B与细胞周期、DNA修复、Mcm信号途径等显著相关。此外,共表达基因相关性分析显示ASF1B与周期相关基因、转录因子等显著正相关。结论:ASF1B在结直肠癌中高表达,并与结直肠癌患者的预后和发生发展存在一定相关性,其可能成为结直肠癌患者预后的生物标志物。
出处
《微量元素与健康研究》
CAS
2024年第6期1-4,30,共5页
Studies of Trace Elements and Health
基金
贵州省卫生健康委员会项目(gzwkj2022-298)
贵州中医药大学学术新苗项目(贵科合学术新苗[2023]-05号)
贵州省高等学校工程研究中心项目(黔教技[2023]037号)
贵州省科技计划项目(黔科合基础-ZK[2023]一般437)。