几种直接从高温热泉沉积物中提取DNA方法之比较

Comparison of several methods for DNA isolation from sediments of hot spring

用酶解法、化学裂解法和微波炉法、冻融法等物理裂解方法组合出 5种方法直接从滇西一个高温热泉沉积物提取DNA。经常规的琼脂糖凝胶电泳检测 ,发现用溶菌酶、蛋白酶K酶解 ,SDS化学裂解结合微波炉法裂解不仅可以得到较大量的DNA ,而且碎片段较少。提取出来的DNA经RNA酶和蛋白酶K处理后可直接进行PCR扩增。同时DGGE(变性梯度凝胶电泳 )电泳检测 ,结果表明 ,此法不仅可以得到该环境中较多微生物分类单位的DNA ,而且还能够较好地体现出它们在量上的差异。