中山市2014-2016年6株Ⅱ型登革病毒E基因分子特征分析

Molecular characteristics of envelope gene sequences of six strains of type 2 dengue virus isolated in Zhongshan City,2014-2016

目的分离鉴定中山市2014-2016年Ⅱ型登革病毒,从分子水平进行分析其地域来源和系统进化情况。方法选取中山市2014-2016年核酸阳性血清6份,用C6/36细胞培养分离登革病毒,RT-PCR扩增毒株E基因并进行序列测定,分析其与不同区域流行株和国际标准株的同源性和系统进化情况。结果成功分离培养出2株2014年登革Ⅱ病毒、2株2015年登革Ⅱ病毒、2株2016年登革Ⅱ病毒。ZS2014-02、ZS2014-03与2014年广州分离株D14115在进化关系上最近,2014年的3株病毒氨基酸和核苷酸同源性均达到91. 3%以上;2015年ZS2015-01与广州分离株D14115在进化关系上最近,2015年2株病毒氨基酸和核苷酸同源性分别为98. 8%和92. 8%;2016年ZS2016-01与2010年巴布新几内亚分离株JN568270. 1进化关系较近,2016年2株病毒氨基酸和核苷酸同源性分别为91. 4%和88. 8%。结论 6株毒株与国际标准株New Guinea C登革Ⅱ型比较均存在氨基酸位点的差异。2014年2株毒株为广州输入病例,2015年的2株毒株ZS2015-01为广州输入,ZS2015-02为中山市本地二代病例,2016年的ZS2016-01为巴布新几内亚输入,而ZS2016-02为菲律宾输入病例。