期刊文献+

脯氨酸顺式肽键的神经网络筛选

Filtrating of the cis Conformation of Prolines by Neural Networks
下载PDF
导出
摘要 运用神经网络的方法,试图揭示脯氨酸局部序列、肽链氨基酸组分对于顺式脯氨酸形成与否的影响,构造基于局部序列和基于氨基酸组分的最优结构的神经网络,同时对顺式脯氨酸进行筛选。结果表明,脯氨酸采取顺式还是反式构象与其局部的序列以及整条肽链的氨基酸组分均有较强的关联。 In this paper,neural network (NN) method was used to investigate the effects of cis proline forming of the local amino acid sequence,the amino acid component in peptide chain,and constructed the optimal neural network structure based on local sequence and amino acid component.The results showed that formation of cis proline was significantly related to the local sequence and amino acid component.
出处 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期446-450,共5页 Journal of Anhui Agricultural University
基金 工业生物技术教育部重点实验室访问学者基金资助。
关键词 脯氨酸顺式肽键 神经网络 结构 预测 氨基酸组分 proline cis peptide bond neural network structure prediction
  • 相关文献

参考文献8

二级参考文献20

  • 1王化军,陈润生,倪向善,石秀凡,凌伦奖.预测蛋白质二级结构的人工神经元网络方法[J].生物物理学报,1989,5(4):422-427. 被引量:4
  • 2孙之荣.蛋白质中频繁发生的超二级结构模式[J].科学通报,1994,39(24):2260-2263. 被引量:2
  • 3孙之荣.α螺旋和β折叠连接短肽的构象分析──蛋白质超二级结构模块(MOTIF)研究(Ⅰ)[J].生物物理学报,1994,10(2):289-296. 被引量:4
  • 4周明 孙树栋.遗传算法原理及应用[M].北京:国防工业出版社,1996..
  • 5[1] Abola E E,Bernstein F C,Bryant S H,et al.Protein data bank [A].In:Allen FH,Bergerhoff G,Sievers R,eds.Crystallographic databases-information content,software systems,scientific applications [C].Data Commission of the international Union of Crystallography,Bonn,Germany,1987.107~132.
  • 6[2] Maiorov V,Abagyan R.Energy strain in three-dimensional protein structures [J].Folding & Design,1998,3:259~269.
  • 7[3] Janin J.Errors in three dimensions [J].Biochimie,1990,72:705~709.
  • 8[4] Laskowski R A,MacArthur M W,Moss D S,et al.PROCHECK:a program to check the stereochemical quaility of protein structure [J].J.Appl.Crytallogr,1993,26:283~291.
  • 9[5] Soppl M J.Recognition of errors in three-dimensional structures of proteins [J].Proteins,1993,17:355~362.
  • 10[6] Cornell W D,Cieplak P,Bayly C I,et al.A second generation force field for the simulation of proteins,nucleic acids,and organic molecules [J].J.Am.Chem.Soc.,1995,117:5 179~5 197.

共引文献29

相关作者

内容加载中请稍等...

相关机构

内容加载中请稍等...

相关主题

内容加载中请稍等...

浏览历史

内容加载中请稍等...
;
使用帮助 返回顶部