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含Ds转座因子的T-DNA在水稻染色体上的分布研究 被引量:1

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摘要 应用农杆菌介导的方法获得了有Ds因子插入的3000多株水稻转化群体,用Inverse PCR方法,从部分独立转化植株中分离了590条含Ds因子的T-DNA插入位点处的右侧旁邻水稻染色体序列.根据旁邻序列中T-DNA右边界与侧翼水稻序列之间的插入序列的特征可分成6个主要类别,其中类型Ⅰ是主要类型,为通常的T-DNA整合,即T-DNA右边界序列与水稻染色体序列相连,或者其间插入小于50 bp的序列片段;类型Ⅱ为T-DNA右边界旁先接T-DNA载体序列,再与水稻序列相接的重组类型.340个类型Ⅰ和Ⅱ的旁邻序列通过与已知的水稻染色体序列数据库一致性比较分析,确定了它们在水稻染色体上的分布位置,构建了一个Ds因子在水稻12条染色体插入的框架结构.这340个有Ds因子插入的位点在整个染色体上平均相距0.8 Mb.分析在第1条染色体上T-DNA(Ds)插入情况显示有21%的频率插入到预测基因的外显子中.T-DNA(Ds)在染色体上分布位置的确定,使我们可以选择合适的Ds因子插入株作为起始株系,导入Ac转座酶基因后,使Ds发生转座,从而获得新的Ds插入突变株,为进一步利用Ds转座标签法分离水稻基因创造了条件.
出处 《中国科学(C辑)》 CSCD 北大核心 2004年第1期14-22,共9页 Science in China(Series C)
基金 国家重点基础研究发展规划资助项目(批准号:G1999011601)
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参考文献1

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同被引文献20

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