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利用蛋白质组学方法筛选及确定喉癌诊断的标志分子 被引量：18

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摘要 采用蛋白质芯片和生物信息学方法从喉癌患者血清中筛选标志蛋白.采用SELDI(surfaced enhanced laser desorption/ionization)蛋白质芯片技术对33例喉癌(12例声门癌,18例声门上癌,3例声门下癌)病人血清和31例正常人血清蛋白质谱图进行了检测.PBSⅡ-C型蛋白质芯片阅读机读取数据,获得的结果采用Ciphergen公司的Biomarker Wizard和BiomarkerPattern软件分析.结果显示与正常人血清蛋白质谱相比时,喉癌病人血清中有16个差异蛋白,其中8个标志分子在病人血清中高表达,8个标志分子在病人血清中低表达.Biomarker Pattern软件在设定条件下自动选取上述标志分子中的两个蛋白质8153和2035 Da用于建立喉癌诊断的分类树模型.此分类树具有两层3个叶结点,可将96.9％的喉癌病人和96.7％正常人正确划分出来.实验证明利用蛋白质组学和生物信息学方法可从血清中筛选出喉癌相关的标志蛋白,而且蛋白质芯片技术对于发现和筛选血清中的喉癌标志蛋白是一种有效、快速的工具.
作者 肖雪媛 赵小冬 刘剑凯 郭福政 刘丹慧 何大澄
机构地区 北京师范大学生命科学学院细胞研究所高等学校蛋白质组学研究院 吉林大学附属第三临床医院耳鼻喉科-头颈外科 吉林大学基础医学院生化
出处 《中国科学（C辑）》 CSCD 北大核心 2004年第1期49-53,共5页 Science in China(Series C)
基金 教育部科学技术重点项目(批准号:272006) 国家"973"项目(批准号:G1999053901) 国家"863’’项目(批准号:200AA232031)资助
关键词 蛋白质芯片 喉癌 标志分子 生物信息学 诊断
分类号 R739.62 [医药卫生—肿瘤]
  • 相关文献

参考文献2

二级参考文献18

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共引文献73

同被引文献171

引证文献18

二级引证文献124

中国科学（C辑）
2004年 第1期

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