与含卫星DNA的烟草曲茎病毒伴随的nanovirus类DNA分子鉴定

利用已报道的两种粉虱传双生病毒DNA1分子的全长特异性引物进行PCR扩增 ,在含有卫星DNAβ的烟草曲茎病毒 (TbCSV)Y35和Y1 1 5分离物中扩增到一种单链环状DNA小分子(命名为DNA1 ) ,而在不含有卫星DNAβ的TbCSVY1和Y1 2 1分离物中没有扩增到DNA1分子 .免疫捕获PCR表明DNA1分子包裹在双生病毒粒子中 .Southernblot检测进一步证实仅在含卫星DNAβ的TbCSVY35和Y1 1 5分离物中存在DNA1分子 .序列分析表明 ,Y35和Y1 1 5DNA1序列全长分别为 1 36 7和 1 36 8nt ,各有一个较保守的开放阅读框 (ORF) ,编码类似nanovirus的Rep蛋白 .两个DNA1分子与辅助病毒DNA A序列无同源性 .Y35和Y1 1 5DNA1全长核苷酸序列同源性为 92 % ,ORF编码的氨基酸同源性为 96 % ,而与已报道的胜红蓟黄脉病毒和木尔坦棉花曲叶病毒的DNA1的核苷酸序列同源性为 70 %～ 79% ,氨基酸序列同源性为 87%～ 90 % .将DNA1与nanovirusesDNA比较后发现 。