耐多药结核分枝杆菌对利福平耐药的基因多态性研究

Rifampin resistance-associated gene polymorphism in multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis strains

目的 探讨耐多药结核分枝杆菌(MDR-MTB)对利福平耐药的基因多态性,为合肥地区结核分枝杆菌对利福平耐药进行快速诊断提供依据,并为其流行病学研究提供有价值的信息.方法 收集2013年1月至2016年6月合肥地区分离的102株MDR-MTB菌株,提取其基因组DNA,应用PCR扩增rpoB基因编码区全长测序,选择H37Rv作阴性对照.使用SeqMan Pro 7.1软件进行PCR测序结果分析.结果 102株MDR-MTB中98株检测到rpoB基因突变,突变率为96.08％ (98/102),突变在rpoB基因耐药决定区域(RRDR)内占95.10％(97/102).其中单点突变为94株,突变率为92.16％(94/102);联合突变为4株,突变率为3.92％(4/102).共有16个突变位点,19种突变类型.最常见位点突变的密码子是531、526和516,突变频率分别为27.45％(28/102)、20.59％ (21/102)和7.84％(8/102).突变类型最多的突变密码子是526.结论 合肥地区MDR-MTB对利福平耐药基因最常见的突变密码子为531、526和516,可基于这些突变位点建立MDR-MTB对利福平耐药的快速诊断方法.