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本刊1987年12月,经江苏省教委批准,创办了《盐城工业专科学校学报》,创刊号出版于1988年3月,盐城工业专科学校建校30周年、复校10周年之际。时任江苏省副省长、江苏省教委主任的杨泳沂同志,江苏省教委副主任袁克昌同志,副主任、省高教局局长叶春生同志,国家建材局人才开发司前副司长、盐城工业专科学校高级顾问张付汉同志,江苏省建材工业总公司总经理徐怀荫同志以及原武汉建材工业学院(武汉工业大学)院长、盐城工业专科学校名誉教授塞风同志,为创刊号题词。《盐城工业专科学校学报》,是以自然科学为主、兼及高等工程教育研究的综合性学术刊物。1996年盐城工学院成立后,《盐城工业专科学校学报》更名为《盐城工学院学报》,1998年7月经国家新闻出版署批准,《盐城工学院学报》取得正式刊号,刊号为CN32-1499/C。更名后的《盐城工学院学报》仍是以自然科学研究为主的综合性学术刊物。2001年12月,经国家科委批准,创办了《盐城工学院学报(自然科学版)》,刊号为CN32-1650/N。原《盐城工学院学报》变更为《盐城工学院学报(社会科学版)》。 《盐城工学院学报(自科版)》主要刊载机电工程、化学工程、材料工程、建筑工程、纺织工程、汽车工程、海洋工程、计算机应用等专业学术论文。