基于RNA-Seq技术对不同品种猪排卵前卵泡差异表达基因的筛选与注释

[目的]筛选淮猪和大约克猪排卵前卵泡组织差异表达基因。[方法]采集淮猪和大约克猪各3头的排卵前卵泡,提取RNA,个体独立建库。采用RNA测序技术以及GO和pathway方法对所获序列进行显著性富集分析。[结果]测序后,获得的淮猪clean reads数分别为85958912、91701082、84448828,其中有效Reads数分别达到98.39%、98.59%、96.04%;获得的大约克猪clean reads数分别为87914166、80480542、85994612,其中有效reads数分别达到98.61%、96.95%、98.80%,测序饱和度良好(证明测序数据真实可靠)。结果表明,筛选到上调基因67个,下调基因54个。GO和Pathway分析发现,差异表达基因富集在繁殖过程、生长过程和代谢过程及WNT信号通路、卵巢类固醇生成通路和类固醇生物合成通路等。[结论]获得了猪排卵前卵泡基因表达谱,并筛选到与繁殖性状相关的关键候选基因。

猪环指蛋白4基因在3个猪群中与繁殖性状关联分析

环指蛋白4(RNF4)是一种转录因子,在小鼠的睾丸中表达很高,可与雄激素受体互作。有研究者研究显示,RNF4蛋白作为一种转录协调子,在颗粒细胞、卵细胞及精细胞的发育过程中发挥着重要的调控作用。因此选择RNF4做为影响繁殖性状的候选基因。

在不同猪群体中检测OVGP1基因的多态性分布

输卵管特异性糖蛋白(Oviduct-specific glycoprotein,OVGP1)基因,主要在输卵管中表达。OVGP1基因定位于猪4q22-23,并发现存在可控制排卵率的QTL。OVGP1基因是由输卵管上皮细胞合成和分泌,其合成受卵巢类固醇激素的调控,还可以与移动的输卵管中的卵子或受精卵相结合。总之,OVGP1基因在繁殖过程中起着重要作用。

猪ALAS1基因5’侧翼区在淮猪中的关联分析

猪5-氨基酮戊酸合酶1基因(猪ALAS1基因)在卵泡发育和黄体时期存在瞬时表达的情况,并且还参与这个过程中的类固醇激素的产生,可能在排卵过程中发挥重要作用。因此选择ALAS1基因作为影响猪产仔数性状的候选基因。1材料与方法1.1材料猪的耳组织统一放在-20℃保存备用。

黟县黑猪微卫星遗传多样性分析

选择55头黟县黑猪的血液样品,采用PCR(聚合酶链式反应)和PAGE(聚丙烯酰胺凝胶电泳)法对14个微卫星标记进行分型,分析黟县黑猪群体的遗传多样性。结果表明:在黟县黑猪群体中,14个微卫星位点共检测出171个等位基因,平均每个位点约12个,有效等位基因数为3.11-12.37,观测杂合度范围为0.31-1;14个微卫星位点多态性含量为0.65-0.91,均具有高度多态性,累积排除概率达99.9%,说明选择的14个微卫星标记能够对黟县黑猪的亲缘关系进行鉴定。

猪MMP9基因的多态性与产仔数性状的关联分析

通过比较序列测定法,在MMP9基因第10内含子发现C/T突变,建立了PCR-Sma I-RFLP分型技术,并在淮猪新品系Ⅱ猪种中进行多态性分型,分析其基因型频率和等位基因频率,检测该位点的多态性并与产仔数性状进行关联分析。结果表明,在淮猪新品系Ⅱ猪群中,所有胎次产仔数呈TC>CC>TT的趋势,TC型个体的所有胎次产仔数显著高于CC型个体0.776头(P<0.05)。因此,MMP9基因在淮猪新品系Ⅱ猪群中与产仔数性状显著相关,为提高猪产仔数性状提供一个有用的分子标记。

川中龙女寺—合川栖霞组碳酸盐岩储集层特征及主控因素

四川盆地龙女寺—合川区块中二叠统栖霞组气藏是川中地区薄储集层、强非均质碳酸盐岩气藏的典型代表,该气藏储层具有低孔隙、低渗透的物性特征。仅依据静态资料对储集层精细表征存在的不确定性,制约了气藏井位目标部署及科学、高效开发。利用岩心、岩屑、薄片、地球物理等资料,在明确储集层基本特征基础上,依据物性参数和孔隙结构参数,结合气藏地球物理响应和生产动态特征,形成了储集层分类评价体系。进而刻画了不同类型储集层分布和储集层发育模式,明确了储集层发育主控因素。研究结果表明:(1)龙女寺—合川区块栖霞组气藏储集岩以晶粒云岩、颗粒云岩、灰质云岩为主,主要储集层类型为裂缝-孔洞型和孔洞型;(2)以物性参数和孔喉结构参数作为主要的储集层分类评价指标,形成了具有针对性的储集层分类评价标准,明确了研究区优质储集层类型主要为Ⅰ类和Ⅱ类储集层,以及不同储集层类型的空间展布特征;(3)气藏发育5个储集层厚值区,栖二上亚段储集层发育优于栖二下亚段,优质储集层纵向呈薄层叠置,平面连片分布,形成了“准同生期滩体+岩溶”与“准同生期滩体+岩溶+断裂”两类优质储集层发育模式;(4)沉积前古地貌斜坡为有利的滩体发育区,滩相沉积作用控制储集层分布,岩溶作用是优质储集层形成的关键,构造作用改善栖霞组储渗能力,有利于优质储集层的形成。

猪NR4A1基因的克隆、序列分析及表达模式研究

【目的】克隆猪核受体4A1(Nuclear receptor subfamily 4,group A,member 1,NR4A1)DNA序列全长,并对CDS序列及其表达模式进行分析。【方法】以未成年长大母猪的卵巢为材料,采用电子克隆技术,对猪NR4A1DNA序列进行分离和测序,并对猪NR4A1基因序列进行生物信息学分析;利用性腺激素(人绒毛膜促性腺激素(Human chorionic gonadotropin,HCG)和孕马血清促性腺激素(Pregnant mare serum gonadotropin,PMSG))处理卵巢颗粒细胞,采用RT-PCR方法分析猪NR4A1基因的表达模式。【结果】获得猪NR4A1基因4 870bp的DNA序列,其中CDS全长序列为1 734bp,共编码572个氨基酸;猪NR4A1基因编码的氨基酸序列与人的对应氨基酸序列的相似性最高(97%),其次为小鼠(94%);Expasy软件预测结果表明,NR4A1蛋白的氨基酸序列非常保守,其中包含2个锌指特征(NR C4-type),一个是激素受体超家族,另一个是Zf-C4超家族;猪卵巢颗粒细胞在性腺激素处理后,可诱导猪NR4A1基因在卵泡发育和排卵时期瞬时表达。【结论】猪NR4A1基因的CDS区在物种间保守性较强,推测猪NR4A1基因调节卵泡的发育和排卵过程。

杜长大猪肉品质性状间相关性分析

为了探讨猪肉品质性状间的相关关系,试验选取86头杜长大猪的背最长肌进行部分肉质性状测定。结果表明:大理石纹与肉色有极显著正相关关系(P<0.01),与肌内脂肪有显著正相关关系(P<0.05);拿破率与失水率有显著负相关关系(P<0.05),与pH24有极显著正相关关系(P<0.01)。结论:研究发现测定的猪肉品质的指标间相互存在着重要联系,为更好地提升猪肉的品质提供新的思路和依据。

丹霞地貌景观调查的遥感技术应用研究

以江西省丹霞地貌景观为研究对象,介绍了遥感和地理信息系统技术在丹霞地貌景观旅游资源调查中应用的原理和方法;根据已知丹霞地貌景观的遥感影像、地质背景、三维地形模型、地形坡度等多元信息特征,总结了丹霞地貌景观的解译标志;利用这些解译标志对江西省丹霞地貌景观进行详细解译。结果表明,江西省有丹霞地貌景观123处,其中新发现的有78处。为江西省的旅游发展规划和丹霞地貌景观旅游资源的开发评价提供了重要依据。

猪ADAMTS1基因的多态性与产仔数性状的关联分析

通过比较序列测定法,在ADAMTS1基因第7外显子发现C/G突变,建立了PCR-PvuⅡ-RFLP分型技术,并在淮猪新品系Ⅱ猪种中进行多态性分型,分析其基因型频率和等位基因频率,检测该位点的多态性并与产仔数性状进行关联分析。结果表明,在淮猪新品系Ⅱ猪群中,所有胎次产仔数呈现AB>BB>AA的趋势,AB型个体的所有胎次产仔数显著高于BB型个体0.665头(P<0.05)。因此,ADAMTS1基因在淮猪新品系Ⅱ猪群中与产仔数性状显著相关,可能为提高猪产仔数性状提供一个有用的分子标记。

猪NR4A1基因的多态性与产仔数性状的关联分析

通过比较序列测定法,在NR4A1基因第5内含子发现A/G突变,建立了PCR-DdeI-RFLP分型技术,并在3个中外猪种中进行多态性分型,分析其基因型频率和等位基因频率,还在长白猪猪群中检测该位点的多态性并与产仔数性状进行关联分析。结果表明,在长白猪猪群中,所有胎次产仔数呈现GG>AG>AA的趋势。其中,GG型个体和AG型个体的所有胎次产仔数分别显著高于AA型个体(P<0.05)。因此,NR4A1基因在长白猪猪群中与产仔数性状显著性相关,可能为提高猪产仔数性状提供一个有用的分子标记。

江山市城区岩溶塌陷研究的遥感应用

应用计算机图像增强处理技术对江山市城区陆地卫星遥感图像数据和航空相片进行多种增强处理,为识别与岩溶塌陷有关的各种地质信息提供了有效的技术手段。利用各种增强处理的遥感图像,并结合实际调查资料,对岩溶塌陷的地质条件、时空分布规律进行了综合判读。通过判读基本查明了岩溶塌陷的地质条件和时空分布规律,并对岩溶塌陷的成因类型进行了分析,提出了相应的防治措施。对江山市城区工程和经济建设具有重要的现实意义。

浙江江山地区地质影像特征

以1976年的航空相片为主要工作图像及1997年的陆地卫星TM图像为参考图像,研究了浙江江山地区岩石地层、地质构造的影像特征。对厘定的17个岩石地层单位,以上横塘、伍家弄、藕塘底三个典型地层剖面位置为样区,分析和总结了各地层单位的影像特征。实践证明,运用60、70年代的航空相片和90年代的陆地卫生TM图像资料,对当前江山地区植被覆盖度高、土壤发育或地形地貌复杂,地质工作者难以涉足的地区进行1∶5万区域地质填图,特别是填制"组图"具有明显的应用效果。通过对各种地质体影像特征的认真分析和总结,并结合野外实地检查验证,可在遥感图像上划分地层单元,勾绘地层界线和解译地质构造。这对加快我国1∶5万区域地质填图工作步伐,提高填图质量具有重要的实际意义。

遥感技术在高放废物处置库场址预选中的应用

运用遥感图像地质解译方法对高放废物处置库场址预选区内断裂构造特征及其活动性进行了解译，并结合地貌特征和新构造运动的分析对预选区稳定性进行了划分。确定Ⅲ－２地区为稳定区。该区符合高放废物处置库场址预选的基本地质条件，可作为进一步进行库址筛选的重，点地区。

在淮猪新品系中检测黑皮质素受体-4基因多态性分布

通过PCR-RFLP方法对70头淮猪新品系猪进行了MC4R基因型检测。结果表明,MC4R基因中的TaqⅠ酶切位点在淮猪新品系猪群体中A等位基因和G等位基因频率分别为0.75和0.25。该结果为能更好地对淮猪新品系的选育和推广扩繁提供有力依据和重要参考。

疏勒河断裂中段新构造应力场的遥感分析

本文利用陆地卫星ＭＳＳ，ＴＭ和航天飞机ＳＩＲ—Ａ遥感图像资料，对疏勒河断裂中段活动性构造进行了解译。通过对活动性断裂和活动性盆地力学特征的分析，确定了区内新构造应力场的主压应力方向为北东—南西向。根据断层地震的成因和地质力学理论，对活动性断裂所处的应力状态和发震的力学条件作出了概略估计，指出了疏勒河断裂东、中、西各段的应力状态各异，不具备发震的力学条件，发生较大地震的可能性很小。因而对甘肃北山预选的高放废物地质处置库址。

论广告行业自律

广告行业自律是广告行业的自我管理,也是广告监督管理工作的必要补充.行业自律对于树立广告行业正气、增强广告业的社会责任感、抵制不正当竞争、促进广告事业的健康发展均起到重要作用.

从遥感图像看桃溪环形构造及其对铀矿分布的控制

笔者利用遥感图像，并结合野外调查对武夷山西南段桃溪环形构造进行了解译分析，认为该环形构造是一个呈多层偏心式展布的中型环形构造，是在不同时期地壳局部隆起和旋转上升运动的相继作用下形成的。它对铀矿化的空间分布起着重要的控制作用，已知铀矿床（点）或矿化异常区、片有９７％以上分布在环形构造各层环及其边缘地区，并受其与线性构造带交切复合部位的控制。研究探索这类环形构造的特征，尤其是环形构造与矿产产出的关系．对指导矿产预测有较大的实际意义。

核废物处置场岩体断裂的遥感分析

本文利用ＴＭ和ＳＩＲ－Ａ遥感图像对甘肃北山区４个预选的核废物处置场址的岩体断裂进行了解释和编图。并运用线性构造统计分析方法，对岩体断裂发育程度进行了统计分析。通过对岩体断裂的解释与分析，基本查明了各预选场址岩体断裂的发育程度和分布规律，为核废物处置场地的筛选提供了定量或半定量分析数据。文中指出，岩体断裂的主要方位组数、长度系数、发育程度乃占预选场（岩体）面积的比例等是场址筛选的重要依据；旧井和前红泉岩体是核废物处置场址选择的两个首选岩体。