自转录活性调节区测序技术在增强子发现研究中的应用

自转录活性调节区测序(self-transcribing active regulatory region sequencing,STARR-seq)是一种可发现并同时验证全基因组增强子活性的高通量测序方法。其原理为:将待验证序列插入质粒载体并电转入细胞中,该序列在作为增强子提高靶基因转录的同时,其本身也作为靶基因被增强转录。通过对转录组进行测序,并对比未插入片段的测序结果,可获得增强子在基因组位置及活性的信息。在传统增强子研究方法中,通过对染色质开放区域和转录活性区域进行测序以预测增强子,但只能逐一验证预测结果,无法高通量验证增强子活性。STARR-seq技术解决了上述缺陷,可在对全基因组增强子高通量挖掘的同时,对其活性进行可靠的验证。自STARR-seq技术发明以来,已被广泛运用于不同物种与细胞中的增强子发现及活性验证研究。本文对传统增强子预测方法以及STARR-seq技术的基本原理、发展历史和具体运用进行了介绍,并对其发展前景进行展望,以期为后续增强子相关领域研究人员提供参考。

广西在校大学生人芽囊原虫分离株基因型的初步研究

为了解广西在校大学生人芽囊原虫分离株基因型构成,于2012年收集53例广西医科大学人芽囊原虫感染者粪便,分离虫体,经体外培养后抽提基因组DNA,用已知的7对STS引物进行PCR扩增。结果显示,53株人芽囊原虫分离株中共发现5种已知基因型。其中,1型(351 bp)4株,占7.6%;3型(526 bp)17株,占32.1%;4型(338 bp)4株,占7.6%;6型(317 bp)1株,占1.9%;7型(487 bp)5株,占9.4%。未见基因2型、5型和混合基因型。22株无特异性条带出现,初步认定为未知基因型。

广西10例人芽囊原虫基因型和同工酶谱的研究

目的分析广西10个人芽囊原虫(Blastocystis hominis)分离株基因型,及其乳酸脱氢酶(LDH)和酯酶(EST)的同工酶谱特征。方法从感染者粪便中分离到的10个人芽囊原虫(BhGX1～BhGX10),体外培养并提取基因组DNA。用已知的7对特异性序列标记位点(sequene tagged sites,STS)引物PCR扩增,来鉴定基因型。采用十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE),分别进行乳酸脱氢酶和酯酶2种同工酶染色,比较分析10个分离株的酶谱。结果 10个人芽囊原虫分离株中有8个为基因Ⅰ型;另外2个分离株(BhGX4和BhGX7)经7对引物扩增均为阴性,为未知基因型。10个人芽囊原虫分离株在LDH谱中共出现10条酶带,常见酶带为Rm37、Rm49、Rm57、Rm68和Rm92;在EST谱中共出现12条酶带,其中Rm14、Rm18、Rm23、Rm27、Rm45、Rm50和Rm77酶带较常见。各分离株之间的LDH和EST同工酶谱均存在差异。结论广西10个人芽囊原虫分离株以基因Ⅰ型为主,但各分离株之间的LDH和EST同工酶谱存在差异。

广西人芽囊原虫分离株同工酶谱的初步分析

目的观察广西人芽囊原虫分离株的苹果酸脱氢酶(MDH)和碱性磷酸酶(ALP)同工酶谱特征。方法从感染者粪便中分离人芽囊原虫,体外培养,收集虫体,制备电泳样品。采取不连续性聚丙烯酰胺凝胶垂直板状电泳分离同工酶的不同区带,以苹果酸钠和1-萘磷酸钠盐为特异性底物,氯化硝基四氮唑蓝(NBT)和固蓝RR盐为染色剂,分别对MDH和ALP染色,以相对迁移率标记酶带。结果人芽囊原虫10个分离株在MDH酶谱中,共出现7条酶带,常见的酶带有Rm34、Rm47、Rm51、Rm55和Rm59,10个分离株完全一致的酶带有Rm34和Rm51;在ALP酶谱中共出现5条酶带,Rm22、Rm25、Rm28、Rm35和Rm38。各分离株之间的MDH和ALP同工酶谱均存在差异。结论MDH和ALP同工酶谱能反映人芽囊原虫各分离株之间的遗传差异。

以本科医学教育标准为航标的《人体寄生虫学》教学改革探索

依据《本科医学教育标准—临床医学专业(试行)》,结合广西寄生虫病流行的实际情况,从教学内容、教学方法、教学手段和学生成绩评价方法等四方面着手,对《人体寄生虫学》进行教学改革与探索,以提高学生自主学习和终身学习的能力。

趣味教学法在医学寄生虫学教学中的应用——以寄生虫之歌为例

为尊重学生在学习中的主体地位,将趣味性教学融入传统教学中,达到提高学生的学习兴趣并促进其自主学习的目的。本研究将广西医科大学2012级临床医学专业4个班级随机分成实验组和对照组。对照组采用传统教学方法,实验组将趣味活动融入传统教学。采用成绩统计分析和设计问卷调查等方式进行教学效果评估。发现学生对趣味教学法的满意度优于传统教学法(P<0.01),并且实验组考试成绩也高于对照组(P<0.01)。说明趣味教学更能激发学生的学习兴趣,促进学生自主学习,提高教学效果。

Th9细胞与肝纤维化的研究进展

Th9细胞是近年新发现的Th细胞亚群。这种细胞亚群的诱导分化受到多种细胞因子与转录因子的影响,且与其他亚群间存在相互影响。IL-4和转化生长因子β是诱导Th9分化的关键细胞因子,PU.1和干扰素调节因子4为其特异的转录因子。Th9细胞主要通过分泌大量IL-9细胞因子在自身免疫性疾病、过敏性疾病以及抗寄生虫感染等过程中发挥重要作用。近年来的研究发现Th9细胞可能促进肝纤维化的发生,本文就Th9细胞与肝纤维化关系的研究现状做一综述。

“一中心二驱动三目标四融合”的“人体寄生虫学”课程教学改革

为顺应学校培养德医兼修、理论扎实、技能突出、创新引领、担当有为,具有大健康理念和国际视野的高素质人才的培养目标,通过升级教学内容、更新教学模式,转变教学方法,优化教学评价,构建以学生为中心,以激发学生兴趣和引导学生思考为驱动,以专业与思想政治教育、线上与线下学习、传统与智慧教学、终结性和过程性评价相融合,以知识、能力、素质提升为目标的“人体寄生虫学”教学新模式。经过多个学期的运行实践,取得了一系列教学改革成果。

HIF-1α、COX-2在疣状胃炎患者胃黏膜组织中的表达及临床意义

目的:研究低氧诱导因子-1α(hypoxia-inducible factor-1α,HIF-1α)、环氧化酶-2(cyclooxygena se-2,COX-2)在疣状胃炎患者胃黏膜组织中的表达情况及临床意义.方法:采用免疫组织化学的方法检测HIF-1α、C O X-2在成熟型疣状胃炎标本,未成熟型疣状胃炎标本及慢性浅表性胃炎标本中的表达情况.结果:慢性浅表性胃炎、未成熟型疣状胃炎及成熟型疣状胃炎标本中的HIF-1α和COX-2阳性表达率均具有统计学意义(P<0.05),且疣状胃炎标本中HIF-1α、COX-2阳性表达率显著性高于慢性浅表性胃炎标本(42.5%vs18.2%,χ2=12.777,P<0.05;46.4%vs 13.0%,χ2=23.991,P<0.05).结论:HIF-1α与COX-2在疣状胃炎标本中呈高表达.

重视输入性寄生虫病 迎接“一带一路”建设

丝绸之路经济带,是由国家主席习近平于2013年9月在哈萨克斯坦纳扎尔巴耶夫大学演讲时提出的,是在古丝绸之路概念基础上形成的一个新的经济发展区域。同年10月,为进一步深化中国与东盟的合作,国家主席习近平访问印度尼西亚时提出21世纪海上丝绸之路的合作倡议。“一带一路”就是丝绸之路经济带和21世纪海上丝绸之路的简称。

台湾棘带吸虫囊蚴感染SD大鼠动物模型的构建

目的:探讨灌胃法构建台湾棘带吸虫感染SD大鼠动物模型,观察台湾棘带吸虫寄生部位及对宿主肠道造成的病理变化。方法:按不同密度活囊蚴分别灌胃SD大鼠,于大鼠粪便查到虫卵后,解剖所有大鼠,查找不同部位寄生成虫数,并进行统计学比较分析;解剖大鼠十二指肠组织制作切片,作病理检查。实验设置未感染对照组。结果:囊蚴灌胃SD大鼠感染6d后粪检可查出虫卵,各密度囊蚴感染SD大鼠的成虫成活率差异无统计学意义(P>0.05);在大鼠十二指肠、空肠内成虫检获条数分别为110,3条,差别明显;与对照组相比,实验组SD大鼠出现精神萎靡、腹泻症状、解剖可见炎性反应等。结论:用灌胃法能够成功构建台湾棘带吸虫感染SD大鼠动物模型;台湾棘带吸虫成虫主要寄生在SD大鼠的十二指肠部;台湾棘带吸虫短时间在大鼠消化道可引起急性期炎性反应。

广西圆圃棘口吸虫扫描电镜观察

目的:观察广西圆圃棘口吸虫的形态结构,为明确广西圆圃棘口吸虫的虫种分类打下基础。方法:从病人体内驱出而获取成虫虫体,应用电镜扫描观察圆圃棘口吸虫。结果:该虫具有27个头棘且腹角棘左右各4枚,体棘多呈鱼鳞状分布在头冠下方凹陷区以下的区域,生殖孔位于腹吸盘前缘,似火山状突起,虫体的头冠、头冠下方凹陷区、体表、吸盘、生殖孔等处均有点状或花蕊状乳头。结论:该虫属圆圃棘口吸虫,广西圆圃棘口吸虫镜下观察在体棘的腹、背侧密度、生殖孔、乳头等结构和分布的方面与国内外文献报道存在差异。

非酒精性脂肪性肝病不伴糖尿病患者铁负荷与病情的相关性研究

目的探讨非糖尿病患者其铁负荷水平与非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的相关性。方法选取2016年1月～2017年12月广西医科大学第三附属医院(以下简称"我院")募集的不伴糖尿病的NAFLD患者152例为观察组;选取同期我院体检健康者80名为对照组。记录或检测两组一般资料、生化指标、血清铁蛋白(SF)、血清铁(SI)、血清铁调素(HEPC)水平,并通过氢质子磁共振波谱测定肝脏脂肪含量(LFC);分析铁负荷指标与其他指标的关系。结果观察组SF、SI明显高于对照组,HEPC明显低于对照组,差异有统计学意义(P <0.05)。校正年龄、性别后,SF、SI均与LFC呈正相关(r=0.461,P <0.001;r=0.275,P=0.001),HEPC与LFC呈显著负相关(r=-0.479,P <0.001)。SI升高是肝功能损伤的独立危险因素(OR=1.074,P <0.05,95%CI:1.022～1.130)。SF、SI及HEPC与NAFLD活动度积分呈弱相关(r=0.172,P=0.036;r=0.192,P=0.019;r=-0.236,P=0.004),但上述相关系数均较低,缺乏临床实际意义。结论非糖尿病患者铁负荷水平上升与LFC增加、肝功能损伤有关,但其与患者肝脏炎症程度无明显相关性。

2019—2021年柳州市尿路感染患者病原菌的临床分布及耐药变迁分析

探讨2019年—2021年柳州市人民医院临床尿路感染患者病原菌分布及其耐药变迁,为临床尿路感染的诊疗提供参考依据。方法 运用WHONET 5.6软件对2019年1月-2021年12月患者的临床资料和分离菌株药敏结果进行分析,用SPSS 17.0软件进行统计学分析。结果 三年内收集到我院尿路感染病原菌共1266株,其中革兰阴性菌(G-)、革兰阳性菌(G+)、真菌分别为847株(69.1%),301株(24.5%),78株(6.4%);泌尿外科为我院尿培养阳性菌株的首位科室(21.9%);排在前5位的病原菌为大肠埃希菌(46.7%)、肺炎克雷伯菌(6.6%)、屎肠球菌(13.0%)、粪肠球菌(6.0%)和念珠菌属(6.4%)。其中主要革兰阴性菌对AMC、TZP、AMK、ETP、IPM耐药率均较低,且ETP耐药率呈下降趋势;所有革兰阳性菌株均未对VAN、LNZ和TGC产生耐药性,屎肠球菌对所测试抗菌药物的耐药率高于粪肠球菌。结论 革兰阴性菌是我院收治尿路感染患者的主要病原菌,细菌耐药形势严峻,应加强对尿路感染的细菌耐药监测,根据药敏结果选择适当抗菌药物,给予患者个体化治疗。

阻断白细胞介素9对日本血吸虫感染小鼠免疫病理损伤及肠道菌群的影响

目的研究阻断白细胞介素9(IL-9)对日本血吸虫(Sj)感染小鼠肝组织免疫损伤以及肠道菌群的影响,探讨阻断IL-9改善血吸虫病免疫病理损伤的机制。方法将15只实验小鼠随机分成正常对照组、Sj组和IL-9阻断组。Sj组和IL-9阻断组小鼠分别感染(15±1)条日本血吸虫尾蚴,IL-9阻断组小鼠每周腹腔注射IL-9抗体2次,Sj组小鼠每周腹腔注射IgG抗体2次作为同型对照。感染9周后处死小鼠,收取肝脏组织进行苏木精-伊红(HE)染色、Masson染色及免疫组化;收取小鼠结肠内容物,对肠道微生物进行宏基因组测序。结果HE、Masson染色显示,单个肉芽肿面积百分比,Sj组(58.6±4.9)%>IL-9阻断组(37.0±2.1)%,差异有统计学意义(F=678.4,P<0.001)。胶原沉积面积百分比,Sj组(35.5±2.0)%>IL-9阻断组(16.2±0.3)%>正常对照组(0.4±0.1)%,差异有统计学意义(F=1314.0,P<0.001)。免疫组化染色显示,IL-9阻断后小鼠肝组织α-平滑肌动蛋白(α-SMA)、胶原Ⅰ和胶原Ⅲ蛋白的表达水平显著降低。α-SMA蛋白表达百分比,Sj组(29.9±4.0)%>IL-9阻断组(14.9±1.4)%>正常对照组(1.4±0.4)%,差异有统计学意义(F=267.9,P<0.001);胶原Ⅰ蛋白表达百分比,Sj组(33.9±1.2)%>IL-9阻断组(16.2±0.7)%>正常对照组(1.3±0.2)%,差异有统计学意义(F=3112.0,P<0.001);胶原Ⅲ蛋白表达百分比,Sj组(14.5±3.0)%>IL-9阻断组(5.3±0.6)%>正常对照组(1.4±0.2)%,差异有统计学意义(F=131.1,P<0.001)。小鼠肠道微生物宏基因组测序显示,与正常对照组比较,Sj组和IL-9阻断组小鼠肠道菌群的多样性和物种丰富度均降低,其中IL-9阻断组与正常对照组差异有统计学意义(P=0.002),温生菌、巴恩斯氏菌、未分类肠杆菌、埃希氏菌属等的丰度发生显著变化。结论体内阻断IL-9可改变日本血吸虫感染小鼠肠道菌群的物种结构、多样性,并且这种改变可能与日本血吸虫病免疫病理的发生发展密切相关。

翻转课堂在《人体寄生虫学》教学中的应用

目的探讨翻转课堂在《人体寄生虫学》教学中的应用。方法将五年制临床医学专业430名学生分为实验组（212人）和对照组（218人）。实验组实施翻转课堂教学，对照组实施传统教学。通过问卷调查及答题考核评价教学效果，采用SPSS17．0对组间数据行t检验。结果实验组学生人体寄生虫学期考成绩优于对照组学生[（68．2±8．6）VS．（66．6-／-11．0），P=O．032]，差异有统计学意义；实验组学生综合性试题成绩优于对照组学生[（16．4±3．2）VS．（16．1±3．9），P=O．038]，差异也具有统计学意义。210名实验组学生问卷显示，191名（90．95％）学生认为翻转课堂教学能够提高自主学习的能力，199名（94．76％）学生认为能增加学习兴趣，185名（88．10％）学生认为能增加师生的沟通，178名（84．76％）学生认为能促进同学合作，186名（88．57％）学生认可小组讨论学习，165名（78．57％）学生认为没有增加学习负担。结论翻转课堂教学有利于提高医学生自主学习能力以及培养学生独立思考、团结协作、批判创新和分析、解决问题的能力，值得推广。

Sandwich教学法在医学寄生虫学教学中的体会

为引导学生自主学习，将Sandwich教学法引人医学寄生虫学教学。sandwich教学法通过老师与学生、学生与学生之间的不断交流沟通，使学生发挥主观能动性，从而达到自主学习的目的。笔者将这种方法用于《医学寄生虫学》教学中，既能有效引导学生主动学习，又能培养学生分析问题和解决问题的能力。

网络化考试用于《医学寄生虫学》考试改革的尝试

传统的考试从出卷、组织考试到阅卷是一个庞大的工程,费时费力,形式呆板,极大地占用了精力和财力,不能适应教学改革的需要.网络化考试可使组卷、阅卷、成绩分析等过程都由计算机完成,大大节省了人力和物力,并有效避免人为主观差异和杜绝作弊现象,从而解决传统考试的弊端,符合未来发展的新趋势.

白细胞介素9促进日本血吸虫感染小鼠肝星状细胞激活

目的 探讨小鼠感染日本血吸虫后,白细胞介素-9(interleukin-9, IL-9)在小鼠肝星状细胞活化中的作用。方法采用肝脏原位灌注消化结合密度梯度离心法,分离日本血吸虫感染7周后小鼠原代肝星状细胞(hepatic stellate cells, HSCs)并进行体外培养。将HSCs分为PBS对照组和IL-9刺激组(浓度20 ng/mL)。分别于刺激后48、72 h收集细胞,采用免疫印迹试验检测HSCs中α平滑肌肌动蛋白(α-smooth muscle actin, α-SMA)、Ⅰ型胶原蛋白(typeⅠcollagen,ColⅠ)和Ⅲ型胶原蛋白(typeⅢcollagen, ColⅢ)表达水平。结果 经20 ng/mL IL-9刺激48 h后,IL-9刺激组HSCs中α-SMA [(0.87±0.02)vs.(0.69±0.01);t=17.39,P <0.01]、ColⅠ[(0.74±0.02)vs.(0.65±0.01);t=9.56,P <0.01]、ColⅢ蛋白[(0.94±0.04)vs.(0.75±0.03);t=6.15,P <0.01]表达水平均显著高于PBS对照组;刺激72 h后,IL-9刺激组HSCs中α-SMA蛋白水平显著高于PBS对照组[(0.76±0.02)vs.(0.58±0.02);t=12.52,P <0.01],但两组间ColⅠ[(0.68±0.02)vs.(0.66±0.02);t=1.15,P> 0.05]和ColⅢ蛋白[(0.75±0.01)vs.(0.72±0.02);t=2.22,P> 0.05]表达水平差异均无统计学意义。结论 IL-9可促进日本血吸虫感染小鼠HSCs激活。