川乡黑猪新品种培育

为培育适宜我国生猪生产发展的父本品种,四川省畜牧科学研究院利用我国特有的珍贵遗传资源——藏猪和引进猪种杜洛克猪作为育种素材,采用BLUP或GBLUP法与分子标记辅助选择相结合的现代育种技术,历经12年攻关研究培育出我国第一个父本品种——川乡黑猪。在培育过程中,通过Snapshot技术对不同世代测定群进行毛色SNP位点基因型检测,严格按照川乡黑猪选育方案,逐步剔除群体中黑色杂合基因型个体,实现黑色基因型纯合。其培育经历了育种素材筛选、杂交制种和品种选育三个阶段,同时委托农业农村部种猪质量监督检验测试中心(重庆)进行川乡黑猪质量检测。川乡黑猪达100 kg体重时平均日龄为156.60 d,饲料转化率为2.54,活体背膘厚为10.25 mm,屠宰率为73.78%,瘦肉率为63.78%,眼肌面积为45.74 cm^(2),肌内脂肪含量为3.65%,生产性能和肉质性能优良。

不同日粮蛋白水平及采精频率对川乡黑猪精液品质与血液生化指标的影响

本试验旨在分析不同日粮蛋白水平与采精频率对川乡黑猪精液品质与血液和精液生化指标的影响。选取32头2岁以内、体况相近、正常种用的川乡黑猪公猪,按日粮蛋白水平13.5%、15.0%、16.5%、18%和采精频率3、5 d/次的不同组合随机分为8组,试验期2个月,试验结束时分别采集精液和血液测定指标。结果表明:低日粮蛋白水平(13.5%)下,公猪精液品质和血液、精液生化指标低于正常水平(P<0.05),精子畸形率升高(P<0.05);日粮蛋白水平为15.0%时,精子畸形率降低(P<0.05),促卵泡激素(FSH)、促黄体生成素(LH)、睾酮(T)等血液激素水平和精液中超氧化物歧化酶(SOD)、谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)、总抗氧化能力(T-AOC)均升高(P<0.05),丙二醛(MDA)含量降低(P<0.05);日粮蛋白水平为16.5%时,精液品质没有显著提升;与蛋白水平15%和16.5%相比,日粮蛋白水平达18%时,精液品质不增反减,精子畸形率上升(P>0.05),精子活率降低(P<0.05),血液中FSH、LH、T含量和精液SOD、GSH-Px、T-AOC均下降(P>0.05),MDA含量升高(P>0.05);从采精频率看,相同日粮蛋白水平下,5 d/次的采精频率下公猪精液SOD、GSH-Px、T-AOC、MDA以及血液中FSH、LH、T等指标指标均优于3 d/次(P<0.05),采精量、精液密度、精子活率等也有所提高(P>0.05),精子畸形率下降(P>0.05)。结合试验结果与饲养管理成本,采用日粮蛋白水平15%、采精频率5 d/次组合时,川乡黑猪公猪精液品质和血液生化指标均为最优,能够最大程度发挥川乡黑猪的潜能。

川乡黑猪基因组选择信号分析

本文旨在研究川乡黑猪与杜洛克猪的群体遗传结构,筛选与川乡黑猪重要经济性状相关的基因组选择信号及候选基因。利用“中芯一号”SNP芯片,对286头川乡黑猪和251头杜洛克猪进行了SNP检测、主成分分析、连锁不平衡衰减分析、群体遗传结构分析以及进化树构建;运用FST和θπ方法筛选了川乡黑猪基因组中受选择的信号区域,并挖掘了潜在的候选基因。结果显示,对基因型数据进行质控后共获得31196个SNP位点,在遗传结构和进化树中川乡黑猪与杜洛克可以明显分为2支。2个群体均表现出连锁不平衡随距离升高逐渐衰减的规律,且杜洛克的连锁不平衡强度高于川乡黑猪。选择信号分析筛选到671个在川乡黑猪中受选择的位点,涉及183个候选基因,包括6个可能与脂质代谢相关的基因(ARRDC3、FABP5、GGPS1、GNPAT、LIPA、MEF2C),2个与抗病相关的基因(CD180、IFIT1),3个与心肺发育以及低氧适应相关的基因(NKX2-5、SPRY2、EGLN1)以及3个与繁殖相关的基因(CPEB3、CCNH、CCNB1)。研究结果为川乡黑猪种质资源的保护及利用提供了重要遗传信息,鉴定到的受选择位点和基因也为川乡黑猪的分子标记辅助选择提供了数据依据。

内江猪的遗传结构分析

旨在研究内江猪群体的亲缘关系和遗传结构。采用“中芯一号”芯片检测30头内江猪的单核苷酸多态性(SNP);采用GCTA软件构建G矩阵,PLINK软件构建状态同源(IBS)距离矩阵,分析内江猪群体的亲缘关系;采用Mega X软件构建群体进化树,分析内江猪群体的遗传结构。结果:共检测到57466个SNP位点,29468个SNP位点通过质量控制;内江猪试验群体具有中等程度的亲缘关系;群体进化树将内江猪公猪被分为6个血缘,血缘数量与传统系谱记录的基本相同;基于连续性纯合片段(ROH)的平均近交系数为0.243。综上,内江猪血缘较少,有一定程度的近交,可引入新血缘,提高群体遗传多样性和种群质量。

中外猪种间生长发育相关的差异候选基因筛选

通过对我国地方猪种与国外猪种比较,筛选与生长发育性状相关的差异候选基因,探索猪种之间生长发育差异的分子机制。分别选择5头内江猪和大约克夏猪进行全基因组重测序,以10 kb滑动窗口和1 kb步长计算群体间遗传分化指数(Fst)平均值,并依据Fst筛选差异SNPs。最终在内江猪与大约克夏猪的比较中分别鉴定出48924个非同义SNP,它们高度影响2490个基因。同时,在乙酰辅酶A乙酰转移酶1(ACAT1)、胰岛素样生长因子受体2(IGF2R)和胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白3(IGF2BP3)基因中检测到3个非同义SNP,这可能影响乙酰辅酶A向乙酰乙酰辅酶A的转化和胰岛素信号通路的正常功能。本研究结果将为探索决定猪表型特征的遗传差异提供基础信息。

miR-1307-3p在不同猪种肌肉和脂肪中的差异表达研究与靶基因验证

为研究miR-1307-3p对不同猪种脂肪酸代谢的影响,试验采用RT-qPCR技术对中外7个猪种/类群(成华猪、藏猪、内江猪、青峪猪、丫杈猪、雅南猪和大约克夏猪)的肌肉和脂肪中miR-1307-3p的表达量进行比较分析,利用miRBase、Starbase和RNAhybrid等生物信息学网站对miR-1307-3p进行靶基因预测,并在细胞水平通过双荧光素酶报告系统对其进行靶标关系验证。结果表明:除藏猪以外的其他地方猪肌肉组织中miR-1307-3p的表达量均高于大约克夏猪,丫杈猪的表达量最高。miR-1307-3p在不同猪种脂肪组织中的表达水平相似。生物信息学预测显示硬脂酰辅酶A去饱和酶5(Stearoyl-CoA desaturase 5,SCD5)为miR-1307-3p的潜在靶基因。双荧光素酶活性检测显示,miR-1307-3p与SCD5基因存在极显著靶向调控关系,表明miR-1307-3p可能通过潜在靶基因SCD5调控不同猪种肌内脂肪酸代谢,SCD5可作为影响猪肉质的候选基因。本研究为猪重要经济性状的遗传改良提供了重要基因资源。

丫杈猪生长发育、胴体及肉质性状全基因组关联分析

本研究旨在通过对丫杈猪生长发育、胴体及肉质性状的全基因组关联分析(Genome Wide Association Study,GWAS),挖掘与丫杈猪生长发育、胴体和肉质性状相关的遗传标记和功能基因。以166头丫杈猪为试验材料,通过提取耳组织DNA并采用中芯一号芯片进行单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)检测,采用Plink(V1.90)对获得的基因型数据进行质控,利用GEMMA软件的混合线性模型对质控结果进行生长发育、胴体和肉质性状相关的GWAS分析。结果表明,有1个SNP与日增重在全基因组范围内显著相关,1个SNP与肌内脂肪含量在全基因组范围内显著相关,3个SNPs与瘦肉率在全基因组范围内显著相关,TOX3、DLG5和FAM180A、KIF2B分别是影响丫杈猪日增重、肌内脂肪含量和瘦肉率性状的候选基因。本研究结果为丫杈猪的分子育种提供了一定的理论参考价值。

母猪饲粮能量水平对哺乳仔猪生长性能和粪便菌群的影响

本研究旨在探讨围产期和泌乳期母猪饲喂不同能量水平饲粮对哺乳仔猪生长性能及粪便菌群的影响。试验选择2~3胎川乡黑猪母猪36头,随机分为3组,每组12头猪,分别饲喂代谢能水平为13.26、13.86、14.46MJ/kg的哺乳期饲粮。试验期从产前7d开始,至产后第21天结束。结果表明:饲粮代谢能水平从13.26MJ/kg提高至13.86MJ/kg和14.46MJ/kg对母猪繁殖性能及仔猪生长性能均无显著影响;母猪饲粮能量水平提高至14.46 MJ/kg时母猪初乳免疫球蛋白G含量降低(P<0.05),乳糖含量增高(P<0.05),哺乳仔猪血清甘油三酯、总胆固醇、低密度脂蛋白胆固醇和葡萄糖含量均高于其余2组(P<0.05);哺乳仔猪粪便微生物分析结果显示,当母猪饲粮能量水平提高至14.46 MJ/kg时,哺乳仔猪粪便菌群中厚壁菌门(Fiemicutes)相对丰度降低(P<0.05),变形菌门(Proteobacteria)、γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)等丰富度增加(P<0.05),对维持肠道微生物稳态不利。由此可见,在川乡黑猪哺乳母猪饲粮能量水平为13.26 MJ/kg的基础上提高饲粮能量水平并不能改善哺乳仔猪的生长性能,提高至14.46 MJ/kg时则会影响哺乳仔猪血液脂质代谢和肠道菌群平衡,不利于机体健康。

植物乳杆菌和酿酒酵母复合发酵饲料对川乡黑猪断奶仔猪生长性能、血清抗氧化和免疫功能的影响

本研究旨在探讨植物乳杆菌和酿酒酵母复合发酵饲料对断奶仔猪生长性能、血清抗氧化和免疫功能的影响。试验选取24头川乡黑猪断奶仔猪,随机的分为2组,每组12头猪。对照组饲喂基础饲粮,试验组饲喂75%基础日粮+25%发酵饲料,试验期28 d。结果表明:与基础饲粮相比,发酵饲料粗蛋白质水平显著升高(P<0.05),粗纤维水平和pH值显著降低(P<0.05),乳酸菌活菌数提高至5.15×10^(8)cfu/g,酵母菌活菌数提高至4.58×10^(6)cfu/g,发酵饲料品质显著提高;与对照组组相比,试验组断奶仔猪平均日增重显著增加(P<0.05),料重比显著降低(P<0.05);试验组血清谷胱甘肽过氧化物酶活性显著升高(P<0.05);试验组血清免疫球蛋白G、免疫球蛋白M含量显著上升(P<0.05)。综上可知,饲粮中添加植物乳杆菌和酿酒酵母复合发酵饲料可改善饲料品质,提高川乡黑猪断奶仔猪的生长性能,增强机体抗氧化功能和免疫功能。

生产优质川乡黑猪适宜的日粮能量水平研究

本试验旨在探究以川乡黑猪作为终端父本与四川地方猪杂交生产优质三元商品猪的最佳日粮能量水平。选取生长发育良好、体重相近的川乡黑猪×巴克夏×成华猪三杂商品猪和川乡黑猪×巴克夏×内江猪三杂商品猪各60头,每个品种随机分为3组,每组20头,分别饲喂低、中、高三种不同能量水平的饲料,体重达30kg开始正式试验,记录采食量及体重数据,当每组一半试验猪的体重达60kg时分别更换为对应的育肥后期料,达120kg时测定活体背膘,然后屠宰分割,记录胴体瘦肉率、肌肉pH值,测定剪切力和肌内脂肪含量等指标。结果显示:随着日粮能量水平的提高,试验猪的活体背膘、日增重均逐渐增加,料肉比降低,饲料转化率提高;饲喂高能量日粮,猪胴体瘦肉率显著降低,背最长肌肌内脂肪含量显著增加,猪肉剪切力降低,嫩度更好,但猪肉pH值无明显变化。综合肉质及饲料成本等因素,以川乡黑猪作为终端父本,与四川地方猪种进行三元杂交,其后代商品猪适宜的日粮能量水平为:育肥前期粗蛋白含量16%、消化能13.65MJ/kg,育肥后期粗蛋白含量13.5%、消化能13.46MJ/kg。

菊苣对川藏黑猪配套系商品猪生长性能、胴体品质和肉质的影响

菊苣产草量高，草质优良，富含多种营养物质，尤以抽苔前营养价值最高。据测定，抽苔前刈割的鲜菊苣干物质含量为15％左右，在干物质中粗蛋白质为20％～23％，粗纤维为12．5％，无氮浸出物为35～42％，粗脂肪为4．6％，粗灰分为12．3％，钙为1．3％，

不同能量和蛋白质水平对川藏黑猪配套系商品猪的影响研究

为研究不同能量和蛋白质水平对川藏黑猪配套系商品猪的影响,选择2013年1月出生、生长发育良好、体重20 kg左右的川藏黑猪仔猪24头为研究对象,随机分为3组,每组2个重复,每个重复4头猪,试验1组饲喂低能低蛋白质饲粮,试验2组饲喂中等能量蛋白质饲粮,试验3组饲喂高能高蛋白质饲粮。试验猪体重达90 kg左右时结束饲养试验,每组8头试验猪全部屠宰,测定胴体和肉质性状。结果表明,料重比,低能低蛋白质组为3.38,分别比中等能量蛋白质组和高能高蛋白质组高0.11(P>0.05)和0.22(P<0.05);日增重,低能低蛋白质组为546.11 g,分别比中等能量蛋白质组和高能高蛋白质组低49.89和51.96 g,差异显著(P<0.05);屠宰率,中等能量蛋白质组为73.78%,分别比低能低蛋白质组和高能高蛋白质组高2.03和2.08个百分点,差异显著(P<0.05);低能低蛋白质组肌纤维直径为89.90μm,最大剪切力为5 677.50 g,均显著高于中等能量蛋白质组和高能高蛋白质组(P<0.05)。

川藏黑猪S04系生长发育及肉质性状选育进展研究

选用杜洛克公猪血缘9个(含冷冻精液),母猪50头,组成S04系核心选育群,采用闭锁与开放相结合的选育方法,应用GBS软件进行遗传评估,生长发育主选日增重、肉质主选活体背膘厚。经过5个世代的选育,公猪达100 kg体重日龄165.67 d,活体背膘厚11.16 mm,瘦肉率达64.22%,肌内脂肪含量2.88%;主选性状全面达到或超过育种目标,达配套系审定要求,成功培育了一个棕黑色的高瘦肉率专门化父系(S04系)。

川藏黑猪NR5A2基因克隆及生物信息学分析

NR5A2属于核受体超家族NR5A亚家族,是一孤儿受体,在动物胚胎发育及分化、类固醇激素生成、卵泡发育和排卵中发挥重要作用。经克隆和测序获得川藏黑猪NR5A2基因编码区序列。结果表明:川藏黑猪NR5A2基因编码区序列长1506 bp,编码区序列编码包含了501个氨基酸残基的蛋白质,编码蛋白含有DNA结合域、Ftz-F1盒和配体结合域等保守结构域,推测川藏黑猪NR5A2基因可能在卵泡发育、成熟和排卵等方面具有重要作用。

不同浓度的精液保护剂对公猪精子活力及保存时间的影响

使用不同浓度(0.50%、0.75%、1.00%和2.00%)的精液保护剂——靓精稀释公猪精液,并设立对照组,对各组精液样品采用精液自动分析仪每天进行精子活力检测,直至精子活力低于使用要求,从而计算出精液的有效保存时间,以期找到最合适的靓精使用浓度。结果表明,0.75%浓度的靓精既可以提高精子活力,又可以延长精子有效存活时间;0.50%浓度的靓精对精子活力没有显著的提高作用,但是能够延长精子有效存活时间;1.00%及以上浓度的靓精会杀灭精子,精子活力和保存时间均下降。因此认为添加0.75%浓度的靓精在养猪生产中是安全、有效的。

靓精对母猪繁殖性能的影响研究

靓精作为一种精液稀释液添加剂,0.75%的靓精添加浓度对精子活力和延长保存时间延长效果最好,其作用原理是通过抑制或杀灭精液中的病原微生物,阻断垂直性疾病的传播。但是添加靓精之后对母猪繁殖性能的影响还没有相关研究,本研究就是通过比较靓精是否添加对母猪繁殖性能影响来判定靓精的作用效果。1试验目的验证靓精对母猪繁殖性能的影响。2试验器材2.1试剂精液：按照正常程序采集公猪精液。靓精：成都美强兽医技术服务有限公司提供。

高温季节“湿帘-风机”系统降温效果研究

试验采用“湿帘-风机”系统对妊娠猪舍在高温季节的降温效果进行了分析,探讨高温季节不同降温模式对妊娠猪舍的降温效果。结果表明：舍外热空气经湿帘后,温度可降低7.06℃,湿度上升37.20个百分点。当湿帘与风机距离相同时,风机安装于横墙或纵墙不影响降温效果。距离湿帘越远,舍内温度越高,湿度越低,风机口与湿帘处的温湿度差分别达1.88℃、8.66个百分点。连续监测该猪舍环境参数,舍内温度均在25.33~29.17℃范围之间,且受外界温度变化影响较小;二氧化碳、氨气、硫化氢气体浓度均在各标准范围内。研究结果表明,高温季节采用“湿帘-风机”降温系统,可改善妊娠猪舍内环境。

基于SNP芯片的丫杈猪保种群体遗传结构研究

旨在研究丫杈猪保种群体的遗传多样性、亲缘关系和家系结构。本研究采用“中芯一号”芯片检测了166头丫杈种猪的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP);利用Plink软件计算观察杂合度、期望杂合度、多态信息含量、最小等位基因频率,分析丫杈猪群体的遗传多样性;采用Plink软件构建状态同源(identity by state,IBS)距离矩阵和分析连续性纯合片段(runs of homozygosity,ROH),采用GCTA软件构建G矩阵,分析丫杈猪群体的亲缘关系;采用Mega X软件构建群体进化树,分析丫杈猪群体的家系结构。结果显示,166头丫杈猪共检测到45211个SNPs位点,通过质量控制的SNP位点有36243个;有效等位基因数为1.529,多态性信息含量为0.254,多态性标记比例为0.875,最小等位基因频率为0.233;期望杂合度为0.329,观察杂合度为0.344;状态同源平均遗传距离为0.2595,状态同源距离矩阵和G矩阵结果均表明大部分丫杈猪呈中等程度的亲缘关系;ROH片段共有3226个,其中40.96%的长度在0~100 Mb之间,基于ROH的平均近交系数为0.069;群体进化树结果表明,丫杈猪公猪被分为8个血缘,数量与传统系谱记录的相同,但血缘间有个体差异。综上所述,丫杈猪保种群的有效群体含量偏低,遗传多样性中等偏低,近交程度不严重,可引入或创建新血缘,扩大有效群体含量,提高群体遗传多样性。

川乡黑猪选育研究

本研究采用群体闭锁式核心群选育法,测定川乡黑猪世代种猪生产性能,根据综合指数高低和分子标记辅助选择选留优秀个体;共完成了5个世代的繁殖性能测定,6个世代的生长发育性能测定,旨在研究川乡黑猪的生产性能,为养猪生产提供优秀黑色种猪。结果表明:经过0~5世代选育,川乡黑猪产仔数达10.21头,产活仔数9.59头;达100 kg体重校正日龄公猪、母猪分别为166.99、164.53 d,校正活体背膘厚公猪、母猪分别为10.49、11.36 mm;G5世代肥育性能达100 kg体重日龄、活体校正膘厚、饲料转化率分别为165.93 d、10.63 mm、2.56;G5世代瘦肉率为63.50%,肌内脂肪含量达3.51%,pH值、肉色、嫩度等指标均在正常范围内,肉质性能优良。本研究结果表明,川乡黑猪经世代选育后,生产性能良好,属于优秀的黑色种猪品种。

藏猪和杜洛克猪SCD、CPT1B基因表达差异及其与IMF含量相关性分析

为了揭示脂肪型的藏猪和瘦肉型的杜洛克猪肌内脂肪(IMF)沉积相关基因的表达差异,试验采用荧光定量PCR(qRT-PCR)方法检测了两猪种背最长肌中硬脂酰辅酶A去饱和酶(SCD)基因、肉碱脂酰转移酶Ⅰ(CPT1B)基因在180日龄的表达差异,分析其表达与IMF含量的相关性。结果表明:180日龄藏猪SCD mRNA表达量极显著高于杜洛克猪(P<0.01),而藏猪CPT1B mRNA表达量显著高于杜洛克猪(P<0.05)。相关性分析结果显示,SCD、CPT1B mRNA表达量均与IMF含量呈正相关。