【目的】全基因组水平鉴定并解析玉米Dof(DNA binding with one finger)基因家族。【方法】基于玉米V3基因组数据鉴定玉米Dof基因家族,并从基因的结构、系统发育关系、染色体的位置分布、玉米不同组织和不同生理发育阶段基因的表达谱以...【目的】全基因组水平鉴定并解析玉米Dof(DNA binding with one finger)基因家族。【方法】基于玉米V3基因组数据鉴定玉米Dof基因家族,并从基因的结构、系统发育关系、染色体的位置分布、玉米不同组织和不同生理发育阶段基因的表达谱以及在充足氮(sufficient nitrogen,SN)和低氮(limiting nitrogen,LN)条件下V3期叶组织基因的差异表达5个方面分析玉米Dof基因家族。【结果】玉米参考基因组中存在46个Dof结构域基因,命名为Zm V3Dof1—Zm V3Dof46。通过系统发育关系和序列相似性将该基因家族分为8个亚类(Subgroup)S1—S8,每个亚类有3—8个Dof基因。通过分析该家族染色体分布,发现玉米10条染色体,除Chr.9外,均有Dof基因的分布,其中,在Chr.1上分布最为密集,有12个Zm V3Dofs;在Chr.5和Chr.3上分布次之,分别为8和7个Zm V3Dofs;在其他染色体上则分布较少,此外,Dofs在Chr.1的底部、Chr.5的顶部和底部分布密度相对较高。表达谱分析结果表明,Dof基因家族成员在不同组织及不同发育阶段均有差异表达,预示不同Dof基因功能的多样性以及在植物发育过程中扮演着不同角色,且同一亚类Dof基因表达模式存在一定程度的相似性。此外,玉米Dof基因家族对氮响应较为敏感,充足氮(SN)和低氮(LN)条件下,V3期叶组织基因的RNAseq表达结果显示35个Dof基因在2种氮处理下表达量存在差异,其中13个基因表达量差异较大。值得注意的是21个Dof基因在低氮处理下表达量上调,其中8个基因只在低氮条件下表达。【结论】基于最新版基因组数据鉴定玉米在自交系B73基因组中存在46个Dof基因,Dof基因家族成员参与玉米不同生理发育过程中,部分基因可能在氮代谢调控中发挥积极作用。展开更多
太赫兹时域光谱(Terahertz time domain spectroscopyr,THz-TDS)是基于飞秒超快激光的远红外波段光谱测量新技术。我们利用该技术对苯甲酸及其单甲基取代物进行测量,得到了它们在0.1-2.0THz波段的吸收谱图。4种物质的吸收谱有明显的特征...太赫兹时域光谱(Terahertz time domain spectroscopyr,THz-TDS)是基于飞秒超快激光的远红外波段光谱测量新技术。我们利用该技术对苯甲酸及其单甲基取代物进行测量,得到了它们在0.1-2.0THz波段的吸收谱图。4种物质的吸收谱有明显的特征,可以将这几种化合物区分开来,这表明THz-TDS技术可以分辨化合物结构上的微小差异,可以应用于物质检测与分析。展开更多
文摘太赫兹时域光谱(Terahertz time domain spectroscopyr,THz-TDS)是基于飞秒超快激光的远红外波段光谱测量新技术。我们利用该技术对苯甲酸及其单甲基取代物进行测量,得到了它们在0.1-2.0THz波段的吸收谱图。4种物质的吸收谱有明显的特征,可以将这几种化合物区分开来,这表明THz-TDS技术可以分辨化合物结构上的微小差异,可以应用于物质检测与分析。