环境病原微生物研究数据库及数据挖掘方法

环境生物安全与社会稳定、人类健康及国防安全等多个关键领域密切相关。鉴于气候变化以及人类活动对生态系统不断加大的压力,未知病原体从环境中溢出的风险显著增加。当前的研究方法多集中于已知病原体的检测与分析,然而,组学技术及其相关生物信息学技术的快速发展与应用,为识别未知环境病原体及预警潜在的环境健康风险提供了新的机遇与解决方案。这些技术的发展不仅促进了对微生物与动物、人类以及环境之间相互作用关系的理解,更是实现“同一健康(One Health)”理念的重要组成部分。本文概述了全球变化对环境病原体逸出的影响及其引发的健康风险,从数据存储、数据分析到数据挖掘三个维度对生物信息学在环境病原体研究中的应用与进展进行了深入探讨,对当前领域内存在的问题进行了剖析,并对未来利用大数据进行环境病原体检测与风险评估的应用前景进行了展望。

液液萃取—高效液相色谱串联质谱法测定血清中可替宁及3-羟基可替宁含量

目的建立全自动固体介质液液萃取—高效液相色谱串联质谱法(HPLC-MS/MS)同时测定血清中可替宁及3-羟基可替宁含量的检测方法。方法采用液液萃取进行前处理,样品中加入50μL氢氧化钾溶液,50μL同位素内标溶液,混匀加入到固体介质液液萃取96孔板中,先后加入2次750μL萃取溶剂(5%异丙醇二氯甲烷混合液)后,收集萃取液,氮气吹干,100μL纯水复溶后上机测定。以HSS T3液相色谱柱(2.1 mm×100 mm,1.8μm)、0.05%氨水溶液和乙腈为流动相进行梯度洗脱分离目标物。采用正离子电喷雾模式电离,多反应离子监测方式(MRM)检测,保留时间和离子对定性,内标法定量。结果2种目标物在0.1~50、5~300μg/L范围内线性关系好,相关系数(r)均优于0.9990;可替宁与3-羟基可替宁方法检出限分别为0.016与0.023μg/L;2种化合物在添加水平为2.0、15.0、40.0μg/L时,平均回收率为86.4%~117.2%,相对标准偏差(RSD)为2.03%~8.03%。结论该方法样品前处理有机试剂消耗少,可实现自动化操作,准确性、精密度及灵敏度均较好,适用于吸烟及非吸烟人群血清中可替宁及3-羟基可替宁含量的检测。

顶空-气相色谱法与顶空-气质联用法测定饮用水中苯系物的方法建立及比较

目的:建立顶空-气相色谱法及顶空-气质联用法测定饮用水中常用7种苯系物(苯、甲苯、乙苯、间二甲苯、对二甲苯、邻二甲苯和苯乙烯),探讨两种测定方法的一致性。方法:优化了顶空、色谱、质谱等测定条件,对两种方法的检出限、精密度、准确度进行比较。结果:两种方法的回收率均在90.4%~100.2%,相对标准偏差均在1.1%~4.3%,顶空-气相色谱法的最低检出浓度分别为0.03~0.08μg·L^(-1),顶空-气质联用法的最低检出浓度分别为0.002~0.005μg·L^(-1),测定结果无显著性差异。结论:两种方法操作简单、快速,准确度和灵敏度高,均适用于饮用水中苯系物的日常检测。顶空-气质联用法的灵敏性更高,适用于痕量、基质复杂样品的测定;顶空-气相色谱法适用于高浓度样品的测定。

PCR技术分类及其在复杂样本检测中的应用研究进展

聚合酶链式反应(PCR)是分子生物学研究领域极其重要的检测技术,具有较高的精确度与可靠性.根据其检测原理,PCR技术可以分为标准PCR、实时荧光定量PCR、茎环qRT-PCR、5’-核酸外切酶荧光PCR、可变数量的串联重复序列PCR、数字PCR、直接PCR扩增、等温扩增技术等.PCR技术可广泛应用于复杂样本中的DNA/RNA测定,包括血液、粪便、尿液、痰液、水样、土壤、植物、癌症标志物稀有突变基因以及低含量DNA的法医证据等,为复杂环境下生物学样本的检测提供了强大的支持.

检验医学实验室血液样本质量管理的研究

检验医学实验室检测的标本通常以血液样本为主,血液样本的质量决定检测结果的准确性。检验医学中的绝大多数错误通常发生在整个检测过程的分析外阶段,特别是分析前阶段。其中,采集不合格检测的标本(由于体积或质量不合格)是迄今为止所有实验室错误的最常见来源,因此需要采取紧急策略,以提高血液样本质量并管理不合格标本检测产生的数据。关于血液样本的不合格原因通常有以下几点原因,溶血样品是临床实验室标本不合格的最常见原因,其次是样本量不足或不适当,生物样品收集在错误的容器中和不适当的凝血。较为不常见的导致样品质量受损的原因包括输液(即最常见的生理盐水或葡萄糖溶液)的污染,采血管添加剂的交叉污染,不适当的样品储存条件或反复冻融。因此,文章旨在总结目前关于最常见的不合格血液样本类型,以及如何预防和管理这些分析前不合格血液样本的初步建议。

浙江省生物安全实验室智慧化监管实践与展望

为解决实验室监管环节数字化程度低、数据安全保障难度大、监测预警效率低等问题。该文介绍了基于Java EE 11技术规范的生物安全监管矩阵,在MVC架构模式上实现RESTful规范,监管矩阵包括1个平台(生物安全在线监管平台)和4个系统(生物安全眼实验室监管系统、实验室生物安全评价系统、病原微生物样本运输系统、病原微生物实验室备案系统)。该矩阵已在800余家单位完成部署使用,记录异常数据20余万条,帮助相关实验室整改风险点11余万个,帮助实验室管理人员及时发现异常并处置,实现实验室生物安全数字化治理。

两种湿消解法消解-原子荧光法测定尿中总砷

目的比较硝酸、硫酸、高氯酸混酸与过硫酸铵两种消解法-原子荧光测定尿中总砷的方法。方法前处理分别用硝酸、高氯酸、硫酸混酸在310℃下对尿样消解1 h后加硫脲-抗坏血酸还原样品和用饱和过硫酸铵溶液在310℃下对尿样消解1 h后加入硫脲-抗坏血酸还原,进入原子荧光仪检测。结果在1.00~20.00μg/L砷含量范围内,标准曲线回归方程:y=106.587 x-11.979,相关系数优于0.9990,混酸消解法的精密度2.06%~3.03%,平均加标回收率101.2%~104.3%,检出限0.012μg/L;饱和过硫酸铵消解法的精密度3.31%~4.05%,平均加标回收率97.9%~101.6%,检出限0.006μg/L。结论两种方法的准确度、精密度均符合卫生标准《尿中砷的测定氢化物发生原子荧光法》(WS/T 474-2015)的要求,适于大批量尿中总砷含量的检测。

基层检验检测实验室食品安全风险监测内部审核重难点探讨

为提高基层检验检测实验室的管理水平,确保监测结果的真实可靠,进一步夯实数据基础,为各级政府的分析评估、决策建议奠定扎实的理论基础,各实验室应完善质量管理体系,深入研究质量控制的方式方法,细化质量管理准则。本文依据基层检验检测实验室多年内部审核的经验,结合食品安全风险监测实际工作情况,针对内审过程中的重点和难点进行探讨,为全面提升食品安全风险监测实验室的管理水平提供参考。

中国一般人群尿镉含量时空分布特征

镉(Cd)是对人体具有毒害作用的重金属元素,而尿镉是评估镉暴露风险的重要指标。为全面了解我国人群的镉暴露情况,研究基于1980—2022年发表的234篇相关文献资料,综合分析了中国普通人群尿镉浓度的整体状况及时空分布特征。结果显示,我国一般人群尿镉含量平均值为1.30μg·g^(-1)(以尿肌酐计,下同)。不同年龄人群尿镉含量存在显著差异。儿童(≤14岁)的平均尿镉水平为0.72μg·g^(-1),低于青少年及成人(>14岁)的1.44μg·g^(-1);女性尿镉水平(1.34μg·g^(-1))略高于男性(1.21μg·g^(-1));吸烟人群尿镉水平(1.24μg·g^(-1))略高于非吸烟人群(0.97μg·g^(-1))。我国一般人群尿镉水平在时间和空间上均存在显著差异。在时间维度上,尿镉水平整体呈现下降趋势,女性和男性的尿镉含量先升高后下降,非吸烟人群尿镉含量下降速率远高于吸烟人群。不同地区人群尿镉含量主要呈现出南高北低、东高西低的分布特征,并随着时间的变化而改变,湖南、辽宁等部分地区的尿镉含量随着时间的推移呈升高趋势,而江苏、广西等地则有所降低。研究结果强调了加强对高尿镉地区的环境监测、实施土壤修复和绿色农业策略以及提升公众对镉污染认知与防护意识的重要性,为制定有效的镉污染防控措施提供了科学依据。

血栓弹力图联合GRACE评分在急性心肌梗死中的临床应用价值

目的分析血栓弹力图指标(R时间、K时间、MA值)和全球急性冠状动脉事件注册(GRACE)评分与急性心肌梗死(AMI)的相关性,探究AMI发生的危险因素。方法选取2020年9月至2023年2月首次来宣城市中心医院住院治疗的108例AMI患者作为观察组,选取同期70例稳定期冠心病患者作为对照组,收集所有研究对象的临床基础资料、血栓弹力图、GRACE评分和同型半胱氨酸(Hcy)指标结果。统计分析观察组与对照组之间临床基础资料、血栓弹力图、GEACE评分和Hcy水平之间的差异;利用受试者工作特征(ROC)曲线对血栓弹力图指标、GRACE评分和Hcy水平对AMI发生的预测价值进行评价;利用二元Logistic回归模型对差异有统计学意义的指标分别进行单因素和多因素回归分析,确定AMI发生的独立危险因素。结果观察组R时间、K时间、MA值、GRACE评分值、血清Hcy水平、基础疾病比例与对照组比较差异均有统计学意义(P<0.05);ROC曲线结果显示,R时间、K时间、MA值、GRACE评分和Hcy对不同类型AMI的发生均具有较好的预测价值,联合应用价值更高;单因素Logistic回归显示,MA值、GRACE评分值、Hcy水平和基础疾病与AMI发生呈正相关(P<0.05),R时间和K时间与AMI的发生呈负相关(P<0.05);多因素Logistic回归显示,GRACE评分高和Hcy水平上升是AMI发生的独立危险因素(P<0.05),R时间和K时间则是AMI发生的独立保护因素(P<0.05)。结论血栓弹力图、Hcy和GRACE评分可作为临床评估急性冠状动脉综合征人群AMI发生风险的动态监测指标。

基于磁性层状双氢氧化物和核酸外切酶Ⅰ的新型大肠杆菌荧光传感器构建

目的基于磁性层状双氢氧化物(magnetic layered double hydroxide,MLDH)对修饰在单链和双链DNA上的羧基荧光素(6-car-boxyfluorescein,FAM)的高效淬灭,以及核酸外切酶Ⅰ(exonucleaseⅠ,ExoⅠ)对单链DNA的选择性降解作用,建立测定大肠杆菌的荧光传感器。方法将不同浓度的大肠杆菌特征DNA与FAM标记的互补DNA探针杂交,形成FAM-双链DNA,加入Exo I选择性降解剩余探针,再加入MLDH吸附并淬灭FAM-双链DNA。通过磁铁分离上清液与MLDH,测量上清液的荧光强度。结果在最优实验条件下,本法检测大肠杆菌特征DNA的线性范围为0.05~30nmol/L,相关系数(R^(2))为0.997,检测限(3σ)为0.025nmol/L,对江水、自来水和茶饮料中大肠杆菌DNA的回收率为85.4%~118%,相对标准偏差小于5%。结论利用MLDH的荧光淬灭能力和Exo I对单链DNA的选择性水解能力成功构建了测定大肠杆菌的新型荧光传感器,与传统大肠杆菌检测法相比,所建新型传感器灵敏度高、选择性好、准确度高,能实现对大肠杆菌的快速检测。

我国低等级生物安全实验室管理体系探究

我国高度重视生物安全工作的开展,低等级生物安全实验室作为基数最大、应用场景最广、使用人员最多的基础性生物安全研究场所,其管理水平直接关系到生物医药领域的发展以及人民群众的健康安全。因此加强我国低等级生物安全实验室管理体系建设,切实落实生物安全管理制度,完善监管体系,有效防控风险因素,规范管理使用微生物菌(毒)种资源,推动生物安全人才培养尤为重要。本文结合我国现有相关政策,针对我国低等级生物安全实验室管理体系建设、现存问题与对策进行探析。

多功能集成色谱-电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)法快速测定饮用水中砷形态

为准确快速测定饮用水中砷形态,采用多功能集成色谱(prepFAST IC)与电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)联用,采用ICX-As35阴离子色谱柱为分析柱,通过仪器注射器推动改变1 mmol/L碳酸铵(pH=9.7)和100 mmol/L碳酸铵(pH=9.2)洗脱液的混合比,进行浓度梯度洗脱,在105 s内快速分析出甜菜碱(AsB)、亚砷酸盐[As(Ⅲ)]、二甲基砷(DMA)、砷胆碱(AsC)、一甲基砷(MMA)和砷酸盐[As(V)]六种As的形态,建立饮用水中六种砷(As)形态的多功能集成色谱串联ICP-MS分析方法。在0~100μg/L六种As的形态线性关系良好,相关系数均大于0.999,检出限为0.02~0.03μg/L。采用加标回收进行准确性评估,纯水和末梢水低、中、高浓度样本的加标回收率为89.2%~103%,不同浓度砷形态的相对标准偏差(RSD)均优于2.0%。方法灵敏度高、准确可靠、分析效率高,适用于生活饮用水中砷形态的快速测定,提高了工作效率。

血液检测在疾病早期筛查中的应用价值分析

利用血液检测研究疾病早期筛查的应用价值。方法 选择500例患者进行血液检测,其中296例为病例组,204例为对照组。根据不同年龄段与性别进行分类,并对各组别进行了详细的血液检测,同时结合脑血管高危因素暴露情况进行分析。结果 通过分析,病例组的年龄段分布与对照组有显著差异, χ2值在10.024-127.536之间,P<0.05,数据具有统计学意义。在性别分布上,病例组中男性占64.86%、女性占35.14%,对照组中男性占41.67%、女性占58.33%,性别分布差异有统计学意义。在脑血管高危因素暴露情况方面,病例组在高血压、糖尿病、心脏病、高血脂、超重肥胖、肢体麻木、吸烟、饮酒、头痛头晕、中风病史及家族史等脑血管高危因素下的发病率明显高于对照组,P<0.05,具有统计学意义。结论 血液检测在疾病早期筛查中具有重要价值,可以准确发现病例组与对照组在年龄、性别及脑血管高危因素暴露情况等方面的显著差异,以便进行早期干预和治疗。

神经肌肉电刺激疗法对急性脑梗死患者上肢体感诱发电位的影响研究

探讨神经肌肉电刺激疗法(NMES)对急性脑梗死(ACI)患者上肢体感诱发电位(SEP)的影响。方法 按随机排列表法将我院2022.6-2023.6收治的82例ACI患者分为各含41例的对照组(常规疗法)与NMES组(NMES+常规疗法),比较两组SEP测定结果、神经功能及运动功能评分;NMES组另根据电刺激部位的不同分为单侧组(n=20)与双侧组(n=21),比较两组SEP测定结果。结果 治疗前,对照组与NMES组的N9与N20潜伏期与波幅基本一致,P>0.05;治疗后,NMES组N9与N20的潜伏期均短于对照组,波幅均高于对照组,P<0.05。治疗前,NMES单侧与双侧组的N9与N20潜伏期与波幅基本一致,P>0.05;治疗后,NMES双侧组N9与N20的潜伏期均短于单侧组,波幅均高于单侧组,P<0.05。治疗前,两组神经功能与运动功能评分基本一致,P>0.05;治疗后,NMES组神经功能评分低于对照组,而运动功能评分高于对照组,P<0.05。结论 NMES对ACI患者上肢SEP具有良好的调节作用,可显著改善患者的神经功能,促使其上肢运动能力提升,存在较高的应用价值。

肝功能、血生化检验对慢性乙型病毒性肝炎肝硬化诊断的价值

探讨肝功能血生化检验结果对于慢性乙型病毒性肝炎肝硬化临床诊断的参考价值。方法 分析慢性乙型病毒性肝炎肝硬化患者(观察组68例)健康体检者(对照组70例)的肝功能血生化检验检验结果。结果 各组天冬氨酸转氨酶(AST)相比,慢性乙型病毒性肝炎肝硬化患者[(87.16±5.76)U/L]>健康体检者[(34.63±5.22)U/L];各组血清丙氨酸氨基转移酶(ALT)相比,慢性乙型病毒性肝炎肝硬化患者[(91.02±6.39)U/L]>健康体检者[(35.13±3.82)U/L];各组总胆红素(TBIL)相比,慢性乙型病毒性肝炎肝硬化患者[(22.57±6.02)μmol/L]>健康体检者[(14.56±2.13)μmol/L];各组直接胆红素(DBIL)相比,慢性乙型病毒性肝炎肝硬化患者[(10.14±1.52)μmol/L]>健康体检者[(6.23±1.30)μmol/L];各组血清白蛋白(ALB)相比,慢性乙型病毒性肝炎肝硬化患者[(29.57±2.05)g/L]<健康体检者[(39.14±2.63)g/L];各组总胆固醇(CHO)相比,慢性乙型病毒性肝炎肝硬化患者[(2.47±0.54)mmol/L]<健康体检者[(5.10±0.61)mmol/L];各组胆碱酯酶(CHE)相比,慢性乙型病毒性肝炎肝硬化患者[(2254.60±116.72)U/L]<健康体检者[(8296.85±146.73)U/L],P均<0.05。各分级ALT相比,A级<B级<C级;各分级AST相比,A级<B级<C级;各分级TBIL相比,A级<B级<C级;各分级DBIL相比,A级<B级<C级;各分级ALB相比,A级>B级>C级;各分级CHO相比,A级>B级>C级;各分级CHE相比,A级>B级>C级,P均<0.05。结论 在慢性乙型病毒性肝炎肝硬化的临床诊断中,肝功能、血生化检验结果具有重要的参考价值。

血液检测技术在肾功能评估中的应用研究

本研究旨在探讨和评价血液检测技术在肾功能评估中的应用效果。方法 采用血液生化技术对112名受试者的血液样本进行检测,根据检测结果将其分为观察组和对照组,各56名。主要检测指标包括血清视黄醇结合蛋白(RBP)、肌酐(CRP)、糖化血红蛋白(HbAlc)及同型半胱氨酸(Hcy)。结果 观察组的RBP、CRP、HbAlc和Hcy的值显著高于对照组, P<0.05,观察组单独检测的阳性率在51.78%到58.93%之间,联合检测的阳性率达到100%。结论 血液检测在评估肾功能中有显著应用价值。其中RBP、CRP、HbAlc和Hcy具有较好的敏感性和特异性,是评估肾功能的有效指标。联合检测能够大幅提升阳性率,使得诊断结果更为确切,并有助于肾功能病变的早期发现和治疗。

涂片镜检与细菌培养检查在微生物检验中的应用效果分析

针对微生物检验中应用涂片镜检与细菌培养检查的临床价值展开分析。方法 设定本研究的起始时间为2023年1月30日,截止时间为2023年9月30日。参与研究的样本病例主要来源于上述事件段在我院接受微生物检验的患者,共筛选150例。先后为这些患者实施涂片镜检与细菌培养检查,随后记录并比较两种方式的检测结果,分析二者的临床价值。结果 本次筛选的150份标本均为合格,合格率达到100.00%。对比两种检验方法的结果发现,其在各相关标本中的检测阳性率无显著差异,(p>0.05),且两种检验方法的菌株检出情况未见显著差异,(p>0.05)。结论 由于涂片镜检与细菌培养检查各具优缺点,因此,在微生物检验中应视具体情况合理选用某一种方法或联合应用。

HS-SPME-GC/MS法测定生活饮用水中环氧氯丙烷

目的建立自动顶空固相微萃取-气相色谱质谱法测定生活饮用水中环氧氯丙烷。方法采用80μm DVB/Carbon WR/PDMS固相微萃取头,在250 r/min振摇条件下,35℃平衡15 min、顶空萃取15 min,250℃解析5 min,经DB-624色谱柱分离,质谱仪检测,外标法定量。结果环氧氯丙烷在0.2~2.0μg/L范围内线性良好(r=0.9992),方法检出限为0.03μg/L,定量限为0.09μg/L,相对标准偏差为2.2%~4.6%,加标回收率为95.3%~102.8%。结论本法操作简便,可用于生活饮用水中环氧氯丙烷的测定。

离子色谱法在公共卫生检测中的应用

离子色谱法是一种高效的液相色谱分析技术,具有操作简便、检测迅速、灵敏度高等优点。本文综述了离子色谱法的类型与应用优势,重点阐述了其在公共卫生领域的应用。研究表明,离子色谱法可以灵敏地检测各类离子,为公共卫生提供技术支持。然而,离子色谱法也存在一些局限性,如检测对象范围窄、灵敏度有限、方法依赖性大等。当前仍需进行技术创新,以扩大离子色谱法在公共卫生检测中的应用范围,进一步优化检测效果。