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我国华东与华南地区养殖鱼类迟缓爱德华氏菌分离株的多样性分析 被引量:1
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作者 李素一 池洪树 +2 位作者 陈斌 张晓佩 许斌福 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期147-153,共7页
目的对17株来源于我国华东与华南地区的养殖鱼类迟缓爱德华氏菌(Edwardsiella tarda)分离株进行多样性分析。方法通过菌体血清凝集试验及16S rRNA与hsp60部分基因序列的聚类分析。结果菌体血清凝集试验结果显示,鳗源迟缓爱德华氏菌ETY的... 目的对17株来源于我国华东与华南地区的养殖鱼类迟缓爱德华氏菌(Edwardsiella tarda)分离株进行多样性分析。方法通过菌体血清凝集试验及16S rRNA与hsp60部分基因序列的聚类分析。结果菌体血清凝集试验结果显示,鳗源迟缓爱德华氏菌ETY的抗O血清可凝集大部分鱼源迟缓爱德华氏菌;人源迟缓爱德华氏菌标准株ATCC15947的抗O血清仅与鱼源迟缓爱德华氏菌WY37有交叉凝集;鲶鱼爱德华氏菌EIV的抗O血清与鱼源迟缓爱德华氏菌无交叉凝集。2株鱼源迟缓爱德华氏菌AL60306NA1和E29L与以上3种爱德华氏菌抗O血清不发生凝集反应。基于16S rRNA及hsp60部分基因序列构建的系统发育进化树显示,来源于不同地区的绝大部分鱼源迟缓爱德华氏菌分离株进化同源性较高,在基于16S rRNA构建的系统进化树中,山东地区分离自大菱鲆的迟缓爱德华氏菌聚为一支。3株鱼源迟缓爱德华氏菌AL60306NA1、E29L、GK4与人源迟缓爱德华氏菌ATCC15947及人源鲶鱼爱德华氏菌EIV有一定亲缘关系。结论我国华东、华南地区的鱼源迟缓爱德华氏菌分离株普遍具有相似的血清型和较高的进化同源性,并与人源的迟缓爱德华氏菌、人源的鲶鱼爱德华氏菌有明显差异。个别鱼源迟缓爱德华氏菌血清型与分子系统进化分析结果不一致,提示在防控鱼类爱德华氏菌病时,应将菌体表面抗原的免疫原性与分子聚类分析相结合。 展开更多
关键词 迟缓爱德华氏菌 血清型 16S rRNA HSP60 系统进化树
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2014-2018年江苏省人源喹诺酮耐药1,4,[5],12:i:-沙门氏菌的基因组学初步分析 被引量:1
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作者 郑东宇 马恺 +3 位作者 周翌婧 吴高林 霍翔 乔昕 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期739-744,共6页
目的分析江苏省喹诺酮耐药1,4,[5],12:i:-沙门氏菌分子流行病学特征。方法用cgMLST分析江苏省及欧美来源菌株的分子流行病学特征,并初步分析喹诺酮耐药1,4,[5],12:i:-沙门氏菌可能的传播特征。结果13株喹诺酮耐药1,4,[5],12:i:-沙门氏... 目的分析江苏省喹诺酮耐药1,4,[5],12:i:-沙门氏菌分子流行病学特征。方法用cgMLST分析江苏省及欧美来源菌株的分子流行病学特征,并初步分析喹诺酮耐药1,4,[5],12:i:-沙门氏菌可能的传播特征。结果13株喹诺酮耐药1,4,[5],12:i:-沙门氏菌共注释11大类抗性基因(Antibiotic resistance genes,ARGs)。其中氨基糖苷类ARGs检出率最高(100%);12株喹诺酮耐药菌株(92.3%)均携带IncHI2/IncHI2A质粒类型;不同国家/地区来源菌株质粒介导喹诺酮耐药(PMQR)基因携带分析显示美国及欧洲来源菌株携带6类PMQR基因,qnrB19检出率最高。江苏省来源菌株携带3类PMQR基因类型,aac(6′)-Ib-cr检出率最高(11.84%);不同国家/地区来源菌株cgMLST位点差异分析显示形成3个主要流行谱系。结论江苏省人源喹诺酮耐药1,4,[5],12:i:-沙门氏菌分离株与欧美菌株可能具有共同进化来源,PMQR基因携带水平存在国家/地区差异。 展开更多
关键词 1 4 [5] 12:i:-沙门氏菌 喹诺酮耐药 分子流行病学
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全基因组测序分析生畜肉中沙门氏菌血清型、耐药性与毒力因子 被引量:1
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作者 刘靓 李兵兵 +5 位作者 李洁 李双姝 孙敏 杨鹏飞 邢亚东 陈大伟 《肉类研究》 北大核心 2024年第4期23-29,共7页
了解市售生畜肉中沙门氏菌(Salmonella)血清型、序列型(sequence typing,ST)分布、耐药性和毒力因子特征,探讨ST与耐药性和毒力的关系。收集2020—2023年从生畜肉中分离的68株沙门氏菌,用血清凝集法鉴定其血清型,微量肉汤稀释法进行药... 了解市售生畜肉中沙门氏菌(Salmonella)血清型、序列型(sequence typing,ST)分布、耐药性和毒力因子特征,探讨ST与耐药性和毒力的关系。收集2020—2023年从生畜肉中分离的68株沙门氏菌,用血清凝集法鉴定其血清型,微量肉汤稀释法进行药物敏感检测;全基因组测序分析多位点序列分型、耐药基因与毒力因子,并结合系统发育树分析其相关性。结果表明:68株沙门氏菌可分为14种血清型,以鼠伤寒沙门氏菌和肠炎沙门氏菌为主,ST以ST19、ST34和ST11为主;多重耐药菌株占比69.12%(47/68),对氨苄西林(76.47%)、四环素(55.88%)和萘啶酸(52.94%)耐药率较高;68株沙门氏菌均携带菌毛吸附相关因子、镁离子转运相关因子、非菌毛类吸附相关因子、调控相关因子和分泌系统相关因子;生畜肉中污染的沙门氏菌血清型种类多样,耐药性严重且携带多种毒力因子,需要加强畜类养殖和生产销售的管理。 展开更多
关键词 沙门氏菌 全基因组测序 序列型 耐药性 毒力因子
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温州市食源性小肠结肠炎耶尔森氏菌毒力基因分布及遗传多样性研究
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作者 谢爱蓉 李毅 +4 位作者 楼辉煌 谢中必 章乐怡 胡玉琴 吴跃进 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期40-45,共6页
目的了解温州市食源性小肠结肠炎耶尔森氏菌的毒力基因分布及遗传多样性特征。方法对温州市食品及食源性疾病腹泻病人中分离得到的小肠结肠炎耶尔森氏菌进行生物型、血清型和耐药性分析,并基于全基因组测序进行菌株的毒力基因、多位点... 目的了解温州市食源性小肠结肠炎耶尔森氏菌的毒力基因分布及遗传多样性特征。方法对温州市食品及食源性疾病腹泻病人中分离得到的小肠结肠炎耶尔森氏菌进行生物型、血清型和耐药性分析,并基于全基因组测序进行菌株的毒力基因、多位点序列分型(MLST)、核心基因组多位点序列分型(cgMLST)分析。结果71株食源性小肠结肠炎耶尔森氏菌,94.4%(67/71)的分离株为生物1A型,生物血清型以1A/O∶5占比最高(29.6%,21/71)。分离株对14种抗菌药物的敏感率达到95.8%以上。共获得了16种126个毒力基因,其中2株菌株携带pYV质粒和染色体相关毒力基因。分离株以ST3型最常见(31.6%,12/38),cgMLST分析显示除具有相同ST型的菌株外,菌株无明显基因型簇形成。结论温州市食源性小肠结肠炎耶尔森氏菌存在致病性菌株,菌株呈高度遗传多态性,需加强此类菌株的监测,以预防其引起食源性疾病的暴发。 展开更多
关键词 小肠结肠炎耶尔森氏菌 血清型 毒力基因 耐药性 全基因组测序
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武汉地区住院患者克罗诺杆菌感染及其临床分离株分子特征与耐药性研究
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作者 余欢 毛晓丽 费龙 《皖南医学院学报》 CAS 2024年第4期346-350,共5页
目的:研究武汉地区住院患者克罗诺杆菌感染及其临床分离株分子特征与耐药性。方法:选取2021年6月~2022年5月在武汉市第一医院就诊的克罗诺杆菌感染住院患者137例为研究对象,对患者克罗诺杆菌分离株行血清型分型鉴定、脉冲场凝胶电泳(PF... 目的:研究武汉地区住院患者克罗诺杆菌感染及其临床分离株分子特征与耐药性。方法:选取2021年6月~2022年5月在武汉市第一医院就诊的克罗诺杆菌感染住院患者137例为研究对象,对患者克罗诺杆菌分离株行血清型分型鉴定、脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型分析、克隆群结构特征分析与耐药性检验。结果:483例患者检出克罗诺杆菌感染137例,总检出率28.36%。男、女检出率差异无统计学意义(P>0.05),年龄分布以低龄(0~6岁)检出率最高,科室分布以儿科检出率最高,感染后易发疾病类型为脑膜炎(P<0.05);血清型分型鉴定以O 1为主要血清型分型,占比36.50%(50/137),ST型分布以ST4、ST1为主,分别占比40.15%(55/137)和31.38%(43/137),CC结构特征以CC4、CC7为主,分别占比32.85%(45/137)和40.15%(55/137);经内切酶Xba I和Spe I酶切后,分成14个PFGE图谱类型,其中BQ9、BQ11和BQ12相似系数较高(98.0%);耐药性检验结果提示,氨苄西林的耐药性较强(67.15%),对测定的其他抗生素全部敏感,未发现多重耐药菌株。结论:武汉地区住院患者克罗诺杆菌感染血清型分型以O 1型为主,PFGE分子分型具有多样性,其中氨苄西林的耐药性较强。 展开更多
关键词 克罗诺杆菌 临床分离株 分子特征 耐药性 武汉地区
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碳青霉烯耐药肠杆菌目细菌(CRE)定植率及其引起血流感染的危险因素研究
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作者 陈淑娟 《齐齐哈尔医学院学报》 2024年第18期1767-1771,共5页
目的分析碳青霉烯耐药肠杆菌目细菌(CRE)定植率及其引起血流感染的危险因素。方法选择2021年3月—2023年3月本院收治的384例感染高危接受CRE主动筛查患者,经CRE筛查显示阳性结果136例,CRE定植率为35.42%;以住院期间是否发生血流感染为依... 目的分析碳青霉烯耐药肠杆菌目细菌(CRE)定植率及其引起血流感染的危险因素。方法选择2021年3月—2023年3月本院收治的384例感染高危接受CRE主动筛查患者,经CRE筛查显示阳性结果136例,CRE定植率为35.42%;以住院期间是否发生血流感染为依据,将136例CRE筛查阳性患者分为血流感染组(25例)与非血流感染组(111例)。分析CRE感染患者的科室分布、病原学检测情况,并采用单因素、多因素Logistic回归分析法分析CRE血流感染的危险因素。结果136例CRE阳性患者分布于14个科室,其中重症医学科63例,占比最高为46.32%,其次是血液病科27例,占比为19.85%;136例CRE阳性患者检出肺炎克雷伯菌115株,占比最高为84.56%,其次是大肠埃希菌10株,占比为7.35%;血流感染组中性粒细胞缺乏、放化疗、使用免疫抑制剂、使用糖皮质激素、抗生素使用≥2种、碳青霉烯类药物暴露史、中心静脉置管占比高于非血流感染组,气管切开率低于非血流感染组(P<0.05);多因素Logistic回归分析显示,中性粒细胞缺乏、使用糖皮质激素及碳青霉烯类抗生素暴露史是CRE血流感染发生的独立危险因素(P<0.05)。结论中性粒细胞缺乏、使用糖皮质激素及碳青霉烯类抗生素暴露史是CRE血流感染发生的独立危险因素,应早期识别以上危险因素,通过合理使用抗生素、糖皮质激素等,以降低CRE血流感染率。 展开更多
关键词 碳青霉烯耐药肠杆菌 细菌定植 血流感染 危险因素 糖皮质激素
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鸭源肠致病性大肠杆菌的耐药特征及全基因组学分析 被引量:1
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作者 李俊霖 胡家萌 +6 位作者 汪骆 李佳芮 刘淏天 夏静 崔敏 邹立扣 韩新锋 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期701-707,共7页
目的了解鸭源肠致病性大肠杆菌(EPEC)的耐药情况及全基因组特征,探究鸭源EPEC的致病潜力,为临床治疗提供理论基础。方法PCR鉴定出EPEC分离株,采用微量肉汤稀释法进行药敏试验,并对其进行全基因组测序,分析EPEC的血清型、ST型、质粒不相... 目的了解鸭源肠致病性大肠杆菌(EPEC)的耐药情况及全基因组特征,探究鸭源EPEC的致病潜力,为临床治疗提供理论基础。方法PCR鉴定出EPEC分离株,采用微量肉汤稀释法进行药敏试验,并对其进行全基因组测序,分析EPEC的血清型、ST型、质粒不相容群类型及其携带的耐药基因与毒力基因。结果共鉴定出10株EPEC,血清型包括O71∶H40和O3∶H21两种;所有EPEC菌株均表现出多重耐药,对环丙沙星、链霉素、四环素、多粘菌素B最为耐药,耐药率高达100%,对头孢西丁最为敏感,对阿米卡星、亚胺培南较敏感;所有菌株均携带有四环素耐药基因tet(A),以及超广谱β-内酰胺酶(ESBL)耐药基因,包括bla OXA-10、bla TEM-1A、bla TEM-1B;分离株检测到多种毒力基因,与分泌系统相关的毒力基因最多,未检测到bfp基因及perABC基因。结论鸭源EPEC分离株都为非典型EPEC(aEPEC),具有多重耐药性,检测到多种质粒不相容群,携带多种耐药基因与毒力基因,对人具有潜在致病性,需要加强对鸭源EPEC的监测以有效控制鸭源EPEC的传播,防止其对人类健康造成危害。 展开更多
关键词 肠致病性大肠杆菌 耐药性 全基因组测序 耐药基因 毒力基因
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2017-2022年武汉地区儿童食源性疾病监测中沙门氏菌感染情况和耐药性分析 被引量:2
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作者 聂丽 邓颖 +1 位作者 罗万军 唐锋 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期750-757,共8页
目的分析2017-2022年武汉地区食源性疾病主动监测中儿童沙门氏菌感染率、血清型分布及耐药率,为儿童群体的食源性疾病防控工作提供依据。方法收集2017-2022年武汉地区儿童食源性疾病病例和病例粪便标本病原学监测结果,应用SPSS 22.0进... 目的分析2017-2022年武汉地区食源性疾病主动监测中儿童沙门氏菌感染率、血清型分布及耐药率,为儿童群体的食源性疾病防控工作提供依据。方法收集2017-2022年武汉地区儿童食源性疾病病例和病例粪便标本病原学监测结果,应用SPSS 22.0进行统计分析。结果共监测病例1180例,检出281株沙门氏菌,平均检出率为23.81%。沙门氏菌包含27种血清型,以鼠伤寒沙门菌138株(49.11%)和肠炎沙门菌37株(13.17%)为主。沙门氏菌阳性病例中,男女病例比为1.58∶1,检出率最高的年龄组为7~18岁组(34.48%)。可疑暴露食品中乳与乳制品、水果类及其制品、粮食类及其制品的沙门氏菌检出率较高。沙门氏菌在第3季度检出率最高(44.64%),不同季节沙门氏菌样本阳性率差异有统计学意义(χ^(2)=178.483,P<0.05)。沙门氏菌感染患儿主要临床表现为发热(87.19%)和腹泻(96.44%),腹泻以水样便为主,占51.96%。沙门氏菌对14种抗生素均有不同程度的耐药(1.08%~75.99%),耐药率居前3位的抗生素分别是氨苄西林(75.99%)、四环素(68.10%)和头孢唑啉(50.18%)。结论武汉地区儿童食源性疾病沙门氏菌检出存在明显的季节性,各类可疑暴露食品中均有检出,血清型构成呈多态性,沙门氏菌耐药率较高,要继续加强食源性疾病主动监测和沙门氏菌耐药监测。 展开更多
关键词 食源性疾病 沙门氏菌 儿童 耐药性
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肠道菌群:儿童肥胖的重要参与者 被引量:1
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作者 罗宇 罗丹 唐彬秩 《中国全科医学》 CAS 北大核心 2024年第33期4182-4189,共8页
儿童肥胖发病率逐年升高,已成为全球公共卫生领域面临的新挑战。研究表明,生命早期肠道菌群的改变可通过影响机体营养吸收与代谢、诱发炎症反应及肠-脑轴的调控等机制导致儿童肥胖的发展。目前,双歧杆菌和嗜黏蛋白阿克曼菌被发现能够降... 儿童肥胖发病率逐年升高,已成为全球公共卫生领域面临的新挑战。研究表明,生命早期肠道菌群的改变可通过影响机体营养吸收与代谢、诱发炎症反应及肠-脑轴的调控等机制导致儿童肥胖的发展。目前,双歧杆菌和嗜黏蛋白阿克曼菌被发现能够降低体内脂肪含量、发挥抗炎特性及增强肠道屏障功能,而普雷沃氏菌则与膳食纤维诱导的个体糖代谢改善密切相关。针对具有改善机体糖脂代谢作用的部分肠道菌群进行转化应用,将有助于儿童肥胖的早期防治。本文主要介绍了生命早期肠道菌群的组成变化对儿童肥胖的影响以及肠道菌群参与肥胖发病的机制,重点阐述了短链脂肪酸在调节肠道菌群和改善肥胖中的最新研究进展,旨在为从肠道菌群视角干预儿童肥胖的发展提供理论依据。 展开更多
关键词 肠道菌群 儿童肥胖 机制 短链脂肪酸
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特勒凯比尔沙门菌临床血流分离株的毒力研究
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作者 郑恩惠 邱玉锋 +5 位作者 陈建辉 高亚东 黄梦颖 李曲文 林杰 翁顺太 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期31-39,共9页
目的构建ICR小鼠感染模型研究特勒凯比尔血清型沙门菌的致病力,对小鼠分离株进行病原学鉴定。方法通过感染小鼠临床症状、组织病理学、组织细菌载量等的变化,观察排菌周期,评价该血清型沙门菌对小鼠的致病性,计算小鼠LD_(50);通过飞行... 目的构建ICR小鼠感染模型研究特勒凯比尔血清型沙门菌的致病力,对小鼠分离株进行病原学鉴定。方法通过感染小鼠临床症状、组织病理学、组织细菌载量等的变化,观察排菌周期,评价该血清型沙门菌对小鼠的致病性,计算小鼠LD_(50);通过飞行质谱、生化鉴定、血清型鉴定、分子分型等实验,与人分离株进行比对;通过PCR实验、全基因组测序等进行毒力基因分析。结果特勒凯比尔沙门菌LD 50为2.67×10^(8) CFU/mL;感染后0.5 h即可出现临床症状,卷缩、被毛松乱;死亡小鼠解剖发现小肠充血严重,可见较多气泡、积液,盲肠坏死,肝尖点状变性坏死,肾脏表面有坏死灶,脾脏萎缩;小鼠脾脏、肾脏、肺脏、肝脏、空肠细菌载量感染后3 d达到高峰,而心脏第6 d达高峰;高剂量组排菌时间超100 d;组织中CD3含量随剂量增加呈递增状态,炎细胞浸润,心肌毛细血管扩张充血,肝细胞大面积空泡、变性坏死,脾窦扩张明显,分区模糊,肾小球基膜增厚,纤毛上皮部分剥脱,空肠绒毛萎缩、脱落;PCR及全基因组测序发现具有cdtB、pltA、pltB等沙门菌相关毒力基因。结论本研究首次成功建立了特勒凯比尔沙门菌ICR小鼠模型,证明了该血清型沙门菌具有一定的致病力。 展开更多
关键词 特勒凯比尔沙门菌 小鼠模型 病原学鉴定 组织病理学 免疫组化 全基因组序列
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布拉氏酵母菌联合熊去氧胆酸治疗直肠型溃疡性结肠炎的疗效及对肠黏膜屏障功能的影响 被引量:1
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作者 韩轩 韩叙 +1 位作者 程砚儒 代金玉 《实用临床医药杂志》 CAS 2024年第1期73-77,共5页
目的探讨布拉氏酵母菌联合熊去氧胆酸治疗直肠型溃疡性结肠炎(UC)的疗效及对肠黏膜屏障功能的影响。方法将88例直肠型UC患者随机分为观察组和对照组,每组44例。比较2组患者治疗前后主要症状(腹痛、腹泻、脓血便)评分、炎症性肠病问卷(IB... 目的探讨布拉氏酵母菌联合熊去氧胆酸治疗直肠型溃疡性结肠炎(UC)的疗效及对肠黏膜屏障功能的影响。方法将88例直肠型UC患者随机分为观察组和对照组,每组44例。比较2组患者治疗前后主要症状(腹痛、腹泻、脓血便)评分、炎症性肠病问卷(IBDQ)评分、炎性因子指标[白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-1β(IL-1β)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)]水平及肠黏膜屏障功能指标[尿液乳果酸与甘露醇的比值(L/M)、血清D-乳酸(D-LA)、血清二胺氧化酶(DAO)、血清脂多糖(LPS)]水平。比较2组不良反应发生情况。结果治疗后,2组腹痛、腹泻和脓血便评分均较治疗前降低,IBDQ评分高于治疗前,且观察组腹痛、腹泻和脓血便评分低于对照组,IBDQ评分高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。治疗后,2组血清D-LA、DAO、LPS和尿中L/M均降低,且观察组上述指标水平低于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。治疗后,2组血清IL-6、TNF-α和IL-1β水平降低,且观察组上述指标水平低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。观察组治疗总有效率为86.36%,高于对照组的68.18%,差异有统计学意义(P<0.05)。2组下腹部疼痛、过敏、顽固型便秘等不良反应发生率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论布拉氏酵母菌联合熊去氧胆酸治疗直肠型UC患者疗效显著,能够有效改善腹痛、腹泻和脓血便等症状,抑制机体炎症反应,缓解肠黏膜屏障受损。 展开更多
关键词 布拉氏酵母菌 熊去氧胆酸 直肠型溃疡性结肠炎 肠黏膜屏障功能 炎性因子 不良反应
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河南省人源和食源多重耐药致泻大肠埃希氏菌耐药特征与基因组分析
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作者 戚浩彧 李艳芬 +5 位作者 王钰 邱正勇 崔莹 吴玲玲 张濛 李永利 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期723-731,共9页
目的了解河南省临床和食品来源中多重耐药的致泻大肠埃希氏菌的耐药性和基因组特征.方法对2017-2022年河南省分离的101株多重耐药致泻大肠埃希氏菌,通过微量肉汤稀释法进行抗生素敏感性实验.基于全基因组测序结果分析其耐药基因、多位... 目的了解河南省临床和食品来源中多重耐药的致泻大肠埃希氏菌的耐药性和基因组特征.方法对2017-2022年河南省分离的101株多重耐药致泻大肠埃希氏菌,通过微量肉汤稀释法进行抗生素敏感性实验.基于全基因组测序结果分析其耐药基因、多位点序列分型、质粒类型并基于核心基因组单核苷酸多态性位点(cgSNPs)构建系统发育树.结果101株多重耐药的致泻大肠埃希氏菌对氨苄西林、四环素、萘啶酸的耐药率最高,分别为87.1%、79.2%、64.4%;对头孢噻肟的耐药率为38.6%.全基因组测序数据表明:101株分离株可被分为60种ST型,其中ST10、ST1491、ST38是优势型别;101株分离株共预测出23种质粒类型,其中携带率最高的类型为IncFIB.分离株携带喹诺酮类、氨基糖苷类、βG内酰胺酶类、四环素类等多种耐药基因,其中超广谱βG内酰胺酶基因bla_(CTX-M-14)和bla_(CTX-M-55)上下游遗传环境中均存在插入序列(IS26、IS903B、ISECP1).结论河南省人源和食源多重耐药的致泻大肠埃希氏菌具有较高的遗传多样性,整体耐药水平较高,其bla_(CTX-M)基因的传播可能与插入序列(IS)有关. 展开更多
关键词 多重耐药致泻大肠埃希氏菌 全基因组测序 耐药性 bla_(CTX-M)
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2015-2021年CHINET临床分离肠杆菌属细菌耐药性变迁
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作者 闫少珍 孙自镛 +88 位作者 陈中举 杨洋 胡付品 朱德妹 谢轶 康梅 张峰波 季萍 胡志东 李金 郭素芳 沈瀚 周万青 徐英春 张小江 徐雪松 鄢超 王传清 付盼 贾伟 李刚 徐元宏 黄颖 郭大文 赵金英 刘文恩 李艳明 喻华 黄湘宁 单斌 杜艳 王山梅 楚亚菲 倪语星 孙景勇 俞云松 林洁 卓超 苏丹虹 魏莲花 邹凤梅 金炎 邵春红 李继红 张利侠 马娟 褚云卓 田素飞 段金菊 康建邦 汪瑞忠 房华 胡芳芳 胡云建 艾效曼 董方 吕志勇 张泓 王春 赵勇 龚萍 朱镭 孟晋华 马晓波 郑燕萍 吴劲松 卢月梅 郭如意 朱焱 温开镇 张贻荣 岳春雷 刘江山 黄文辉 薛顺虹 胡雪飞 顾洪芹 冯佼 周树平 周艳 陈运生 孟青 俞碧霞 沈继录 窦睿 王世富 贺雯 廖龙凤 姜琳 《中国感染与化疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期309-317,共9页
目的监测2015-2021年中国主要地区53所医疗机构临床分离肠杆菌属细菌分布及耐药性变迁。方法对全国53所医院在2015-2021年临床分离的肠杆菌属细菌按CHINET统一监测方案采用纸片扩散法或商品化药敏试验自动测试仪进行抗菌药物敏感性试验... 目的监测2015-2021年中国主要地区53所医疗机构临床分离肠杆菌属细菌分布及耐药性变迁。方法对全国53所医院在2015-2021年临床分离的肠杆菌属细菌按CHINET统一监测方案采用纸片扩散法或商品化药敏试验自动测试仪进行抗菌药物敏感性试验,依据2021年CLSI M100判读药敏结果,采用WHONET 5.6软件进行数据分析。结果2015-2021年共检出肠杆菌属细菌37966株,七年间,肠杆菌属细菌在所有临床分离菌株中的分布呈波动性变化趋势,占总体菌株的2.5%,在肠杆菌目细菌中占5.7%。肠杆菌属细菌以阴沟肠杆菌为主,为93.7%(35571/37966)。菌株主要分离自呼吸道样本,7年平均为(44.4±4.6)%,其次是分泌物/脓液样本,为(16.4±2.3)%,尿液样本为(16.0±0.9)%。在变化趋势上,阴沟肠杆菌在呼吸道样本的分布呈下降趋势,无菌体液样本的分布呈增长趋势。37966株肠杆菌属细菌主要分离自住院患者,为92.9%,门急诊患者为(7.1±0.8)%。住院患者中以外科病房患者的分离株最多,为(24.4±2.9)%。从药敏结果分析,阴沟肠杆菌对阿米卡星、替加环素、多黏菌素B、亚胺培南、美罗培南的耐药率≤7.9%;阿氏肠杆菌的耐药率则≤5.6%,但对多黏菌素B的耐药率高于阴沟肠杆菌(19.7%对3.9%);日沟维肠杆菌则对阿米卡星、替加环素、亚胺培南、美罗培南的耐药率≤8.1%,但对多黏菌素B的耐药率为10.5%。七年间,碳青霉烯类耐药的肠杆菌属细菌总体检出率为10.0%,呈逐年上升的趋势。不同科室患者分离株对不同抗菌药物的耐药率存在较大差异,成人与儿童患者分离菌株对抗菌药物的耐药率也不尽相同,碳青霉烯类耐药的阴沟肠杆菌以ICU患者样本检出率最高。结论CHINET细菌耐药监测显示2015-2021年肠杆菌属细菌的分布呈现锯齿型变化,并对多种抗菌药物耐药率增加,尤其是对碳青霉烯类的耐药率呈逐年增长的趋势。 展开更多
关键词 肠杆菌属 阴沟肠杆菌 细菌耐药监测 碳青霉烯类耐药
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上海市首次自腹泻患者中检出格隆柏沙门菌的表型和分子特征研究
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作者 王闻卿 黄卫春 +6 位作者 苏靖华 尤舒琪 郑英杰 杨博雯 黄红 郝莉鹏 许学斌 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期732-738,共7页
目的研究上海市首次自腹泻患者中检出格隆柏沙门菌的表型和分子特征,为沙门菌病防控提供依据。方法对格隆柏分离株(2023JD76)进行生化鉴定、血清凝集试验、抗菌药物敏感性试验以及全基因组测序(whole genome sequencing,WGS)。收集全球... 目的研究上海市首次自腹泻患者中检出格隆柏沙门菌的表型和分子特征,为沙门菌病防控提供依据。方法对格隆柏分离株(2023JD76)进行生化鉴定、血清凝集试验、抗菌药物敏感性试验以及全基因组测序(whole genome sequencing,WGS)。收集全球格隆柏沙门菌全基因组序列,进行血清分型、多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)、耐药基因和毒力基因预测,分析2023JD76与全球株的系统进化关系。结果2023JD76血清分型符合抗原式(Salmonella Grumpensis,13,23:d:1,7),对20种抗菌药物均敏感,MLST型预测为2060(ST2060),携带氨基糖甙类药物耐药基因aac(6′)-Iaa和5类毒力基因,包括黏附基因csg、rat,分泌和转运基因sip、inv,伤寒毒素基因cdt、plt,侵袭性基因营养代谢因子mgt和抗菌肽抗性因子mig。36株全球格隆柏菌株共携带10种耐药基因,不同毒力基因携带率为58.33%~100%。进化树将全球格隆柏沙门菌基因组分为2个支系,支系Ⅰ以ST751(88.89%,16/18)为主,支系Ⅱ以ST2060(89.47%,17/19)为主。本次分离菌株2023JD76处于支系Ⅱ内,其序列型与全球人源粪便株和人源脑脊液株全基因组序列密切相关。结论本研究首次分离国内腹泻患者中的格隆柏沙门菌,不同地理来源菌株间耐药表型差异大,应加强监测以防范全球潜在的传播风险。 展开更多
关键词 格隆柏沙门菌 全基因组测序 多位点序列分型 耐药基因 毒力基因
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2015—2021年CHINET临床分离枸橼酸杆菌属细菌耐药性变迁
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作者 李可可 魏莲花 +85 位作者 杨洋 胡付品 朱德妹 徐英春 张小江 张朝霞 季萍 谢轶 康梅 王传清 王爱敏 徐元宏 黄颖 孙自镛 陈中举 倪语星 孙景勇 褚云卓 田素飞 胡志东 李金 俞云松 林洁 单斌 杜艳 郭素芳 张泓 王春 胡云建 艾效曼 卓超 苏丹虹 郭大文 赵金英 喻华 黄湘宁 刘文恩 李艳明 金炎 邵春红 徐雪松 鄢超 王山梅 楚亚菲 张利侠 马娟 周树平 周艳 朱镭 孟晋华 董方 吕志勇 胡芳芳 沈瀚 周万青 贾伟 李刚 吴劲松 卢月梅 李继红 段金菊 康建邦 马晓波 郑燕萍 郭如意 朱焱 陈运生 孟青 王世富 胡雪飞 沈继录 汪瑞忠 房华 俞碧霞 赵勇 龚萍 温开镇 张贻荣 刘江山 廖龙凤 顾洪芹 姜琳 贺雯 薛顺虹 冯佼 岳春雷 《中国感染与化疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期190-197,共8页
目的了解2015—2021年CHINET中国细菌耐药监测网成员单位临床分离枸橼酸杆菌属的分布特点及其耐药性变迁情况。方法按照CHINET统一技术方案,采用纸片扩散法或自动化仪器法进行药敏试验,按CLSI 2021年版标准判读药敏结果,采用WHONET 5.6... 目的了解2015—2021年CHINET中国细菌耐药监测网成员单位临床分离枸橼酸杆菌属的分布特点及其耐药性变迁情况。方法按照CHINET统一技术方案,采用纸片扩散法或自动化仪器法进行药敏试验,按CLSI 2021年版标准判读药敏结果,采用WHONET 5.6软件进行数据分析。结果2015—2021年共分离出枸橼酸杆菌属细菌12855株,其中弗劳地枸橼酸杆菌7925株,占61.65%,克氏枸橼酸杆菌2589株,占20.14%。7年间枸橼酸杆菌属细菌在全部细菌和肠杆菌目细菌中的检出占比呈上升趋势,2015年分别占0.76%和1.76%,2021年分别占0.94%和2.09%。科室来源主要为外科病房(32.33%±5.42%),其次为内科病房(26.92%±3.70%)。标本来源主要分离自尿液(34.15%±1.01%)及呼吸道(22.23%±2.09%)。2015—2021年枸橼酸杆菌属对氨苄西林耐药率有所升高,对其他抗菌药物耐药率均呈下降趋势;对亚胺培南和美罗培南耐药率分别从9.5%和8.3%下降到5.5%和5.8%,对环丙沙星、替加环素以及多黏菌素耐药率波动幅度较小;在所有枸橼酸杆菌属细菌中,弗劳地枸橼酸杆菌对各类抗菌药物耐药率最高。结论枸橼酸杆菌对多数临床常用抗菌药物耐药率呈下降趋势,应继续加强抗菌药物合理应用管理及细菌耐药监测,以遏制细菌耐药率回升。 展开更多
关键词 细菌耐药性监测 枸橼酸杆菌属细菌 抗菌药物
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白喉毒素突变体CRM197在大肠杆菌中优化表达及人群血清抗体水平分析
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作者 陈晓丽 顾一心 +6 位作者 王海瑞 周贵兰 张鑫 刘畅 张建中 邵祝军 张茂俊 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期430-434,共5页
目的 构建白喉毒素突变体CRM197的原核表达载体,在大肠杆菌中表达CRM197蛋白。分析健康人群血清中的CRM197抗体水平。方法 对CRM197基因进行大肠杆菌密码子优化并克隆至pET28a(+)中,经表达条件优化后采用镍柱亲和层析和离子交换层析对... 目的 构建白喉毒素突变体CRM197的原核表达载体,在大肠杆菌中表达CRM197蛋白。分析健康人群血清中的CRM197抗体水平。方法 对CRM197基因进行大肠杆菌密码子优化并克隆至pET28a(+)中,经表达条件优化后采用镍柱亲和层析和离子交换层析对重组蛋白CRM197进行纯化,对纯化的CRM197进行Western blot鉴定。最后,经纯化后的CRM197蛋白与健康人群血清进行反应,检测人群血清中针对该蛋白的抗体水平。结果 CRM197蛋白进行了密码子及表达条件优化后,获得了可溶性表达蛋白。经镍柱亲和层析和离子交换层析后其纯度可达95%以上,Western Blot鉴定后能得到单一的特异性条带。经纯化的CRM197蛋白与不同年龄阶段健康人群血清均发生不同程度的抗原抗体反应。结论 利用本研究的策略,CRM197得到高效的可溶性表达,但人群血清中含有高水平的CRM197抗体,这些抗体的存在可能会影响到应用CRM197结合多糖作为抗原进行特异免疫效果的评价以及作为诊断抗原的应用。 展开更多
关键词 CRM197 可溶性表达 人群血清抗体水平
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肠侵袭性大肠埃希菌噬菌体DK-13的生物学特性及应用
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作者 王梦雅 刘家齐 +3 位作者 姜海霖 李菁华 赵春燕 黄红兰 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期296-304,共9页
【目的】筛选并分离出能裂解肠侵袭性大肠埃希菌噬菌体,分析其生物学特性,并探究其对污染猪肉的杀菌作用。【方法】采用双层平板法分离鉴定噬菌体,并测定其最佳感染复数,一步生长曲线等,对其基因组进行测序分析以及裂解功效的测定。【... 【目的】筛选并分离出能裂解肠侵袭性大肠埃希菌噬菌体,分析其生物学特性,并探究其对污染猪肉的杀菌作用。【方法】采用双层平板法分离鉴定噬菌体,并测定其最佳感染复数,一步生长曲线等,对其基因组进行测序分析以及裂解功效的测定。【结果】从医院污水中分离鉴定能特异裂解肠侵袭性大肠埃希菌(Enteroinvasive Escherichia coli,EIEC)的噬菌体并命名为DK-13,其呈典型的蝌蚪状外形,包含一个正二十面体的头部和一个可收缩的螺旋对称的尾部,属于肌尾噬菌体科(Myoviridae)噬菌体;生物学特性表明:最佳感染复数为0.01,潜伏期约为10 min,裂解期约为70 min,噬菌体DK-13能在50℃,pH 5.0-10.0条件下存活。全基因组测序表明,噬菌体基因组长约172 275 bp,GC含量为40.18%,预测其共有293个开放阅读框(open reading frames,ORF),未发现已知耐药基因和毒力基因。应用试验表明:被污染的猪肉中表现的杀菌效果良好,宿主菌的数量明显减少。【结论】分离并鉴定一株新的烈性噬菌体DK-13,DK-13具有潜伏期短、裂解效率高等优势,在食品安全方面具有很大应用潜力。 展开更多
关键词 肠侵袭性大肠埃希菌 噬菌体 噬菌体疗法 食品安全
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宁德市2018—2020年食源性疾病监测结果分析 被引量:1
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作者 张高敏 尤夏琳 《黑龙江医学》 2024年第5期583-587,共5页
目的:分析宁德市食源性疾病的流行病学特征,为制定宁德市的食源性疾病防控政策提供科学有效的依据。方法:收集整理2018—2020年宁德市食源性疾病监测结果数据,利用描述流行病学的方法进行分析和讨论。结果:宁德市2018—2020年共上报食... 目的:分析宁德市食源性疾病的流行病学特征,为制定宁德市的食源性疾病防控政策提供科学有效的依据。方法:收集整理2018—2020年宁德市食源性疾病监测结果数据,利用描述流行病学的方法进行分析和讨论。结果:宁德市2018—2020年共上报食源性疾病患者9706例,男、女比例为0.94∶1.00,25~34岁年龄组患者数最多(占18.39%),发病高峰期为12月份(占20.10%),患者以农民为主(占34.30%),临床症状以消化系统症状为主(占98.19%),暴露食品种类以水产动物及其制品为主(占31.08%),宁德市2018—2020年食源性疾病暴露场所最多的是家庭(占63.48%)。结论:根据宁德市食源性疾病的流行特点,充分利用多种信息化渠道,并结合现场宣传工作,开展线上线下健康宣传,进一步加强对食源性疾病知识的宣传和健康教育工作,提升居民食品安全意识,预防和减少食源性疾病的发生。 展开更多
关键词 食源性疾病 食品安全 哨点医院
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扬子鳄源粘质沙雷氏菌XCYZE株的分离鉴定及其致病性分析
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作者 朱鹏 周永康 +11 位作者 姜纪 李佳佳 易平四 章松 张雪松 周奎厚 王应超 石涵 陈洪超 卜孝林 王雅婷 徐前明 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期26-30,共5页
目的查明一例源于安徽省扬子鳄管理中心的幼鳄死因。方法从幼鳄脑部组织坏死灶采集病料,进行细菌分离与鉴定,并对其致病性进行分析。结果菌落在血琼脂平板上生长呈红色的革兰氏阴性菌;生理生化试验显示该菌在葡萄糖、甘露醇、乳糖、柠... 目的查明一例源于安徽省扬子鳄管理中心的幼鳄死因。方法从幼鳄脑部组织坏死灶采集病料,进行细菌分离与鉴定,并对其致病性进行分析。结果菌落在血琼脂平板上生长呈红色的革兰氏阴性菌;生理生化试验显示该菌在葡萄糖、甘露醇、乳糖、柠檬酸盐和硫化氢等中均呈阳性;PCR扩增其16S rDNA基因,其大小约1500 bp,经遗传进化树分析,与已报道的粘质沙雷氏菌GRD1株在同一分支;其致病性试验可导致实验鼠在36 h内全部死亡,出现严重肺出血、肝脏肿大、脾脏肿大、腹水现象等。结论从扬子鳄脑内分离的病原是粘质沙雷氏菌,具有较强的致病性,且对多种抗菌药具有一定的耐药性。本试验为野生动物或者人类感染粘质沙雷氏菌的诊断和治疗提供参考意见。 展开更多
关键词 扬子鳄 粘质沙雷氏菌 鉴定 致病性 耐药性
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云南省2016—2022年志贺氏菌分子分型及耐药性分析
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作者 尹艳珠 杨祖顺 +3 位作者 邹颜秋硕 任翔 国译丹 范璐 《昆明医科大学学报》 CAS 2024年第7期79-86,共8页
目的对云南省2016—2022年食源性疾病主动监测分离的志贺氏菌进行血清、分子分型和药敏试验等分析,了解云南省志贺氏菌的病原学特性,为志贺氏菌感染的防控和治疗提供数据支持。方法2016年1月至2022年12月从患者粪便中分离志贺氏菌,采用... 目的对云南省2016—2022年食源性疾病主动监测分离的志贺氏菌进行血清、分子分型和药敏试验等分析,了解云南省志贺氏菌的病原学特性,为志贺氏菌感染的防控和治疗提供数据支持。方法2016年1月至2022年12月从患者粪便中分离志贺氏菌,采用玻片凝集法进行血清学分型,脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分子分型分析,微量肉汤稀释法进行药敏试验。结果共分离志贺氏菌89株,其中福氏志贺氏菌占52.81%,宋内志贺氏菌占47.19%。PFGE分析发现,2种志贺氏菌均分为A和B 2个聚类簇,B簇为优势簇。47株福氏志贺氏菌分为30种PFGE带型,有3组优势带型,42株宋内志贺氏菌分为22种PFGE带型,有4组优势带型,并识别两起疑似暴发事件。志贺氏菌对13种抗生素存在不同程度的耐药,78.65%的菌株为多重耐药菌株。结论云南省志贺氏菌PFGE优势带型明显,部分带型聚集分布。耐药形势严峻,多重耐药现象严重。福氏志贺氏菌和宋内志贺氏菌耐药表型存在差异。 展开更多
关键词 志贺氏菌 血清型 脉冲场凝胶电泳 耐药性
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