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基于全基因组重测序评估郏县红牛保种群遗传多样性与群体结构
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作者 张岩 魏稚彤 +10 位作者 虎业浩 张花菊 张曼 付彤 刘贤 李志钢 祁兴磊 王二耀 张子敬 梁栋 高腾云 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期2933-2942,共10页
【目的】了解郏县红牛保种群的群体结构和遗传多样性,从而更好地保护和利用郏县红牛遗传资源。【方法】基于全基因组重测序技术,对30头郏县红牛的全基因组单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)进行检测,并通过分析群体... 【目的】了解郏县红牛保种群的群体结构和遗传多样性,从而更好地保护和利用郏县红牛遗传资源。【方法】基于全基因组重测序技术,对30头郏县红牛的全基因组单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)进行检测,并通过分析群体遗传多样性、群体结构、连续纯合片段(runs of homozygosity,ROH)分布特征和亲缘关系,对郏县红牛保种群的保种效果进行综合评估。【结果】在30头郏县红牛个体中共检测到41215797个高质量SNPs位点;郏县红牛群体遗传多样性丰富,最小等位基因频率为0.13±0.13,多态性标记比例为0.58±0.33,期望杂合度为0.192±0.152,观测杂合度为0.191±0.158,核苷酸多样性为0.003±0.001。郏县红牛群体的有效群体含量呈逐代下降趋势,在1000代前有效群体含量为2716头,在20代前为143头;郏县红牛个体间的遗传距离介于0.80~0.89之间,平均遗传距离为0.83±0.02。聚类分析显示,30头郏县红牛共分为7个家系,15头公牛可分为5个家系;30头郏县红牛个体中共检测到5947个ROH,总长度为2.8 Gb,长度为0~0.5 Mb的ROH占比最多(73.08%),2~4 Mb的ROH占比最少(0.40%),基于ROH的平均近交系数为0.19±0.07,15头公牛的平均近交系数为0.15±0.05。【结论】郏县红牛保种群遗传多样性丰富,群体结构没有出现明显分层,整体上保持了较高水平的近交,出现了一定的近交风险,需加强选种选配工作,以确保郏县红牛遗传资源的可持续发展。 展开更多
关键词 郏县红牛 全基因组重测序 遗传多样性 群体结构
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CRISPR/Cas9系统在畜禽遗传改良中研究进展 被引量:1
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作者 鲍艳春 戴伶俐 +6 位作者 刘在霞 马凤英 王宇 刘永斌 谷明娟 娜日苏 张文广 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期219-231,共13页
CRISPR/Cas9基因编辑技术作为一种高效的基因组编辑方法,在畜牧业遗传改良领域得到了广泛的应用。该技术以高效、精准的特点,为畜牧业发展带来了一场革命。目前,基于CRISPR/Cas9的基因敲除、基因敲入和基因修饰等已被广泛应用,实现了对... CRISPR/Cas9基因编辑技术作为一种高效的基因组编辑方法,在畜牧业遗传改良领域得到了广泛的应用。该技术以高效、精准的特点,为畜牧业发展带来了一场革命。目前,基于CRISPR/Cas9的基因敲除、基因敲入和基因修饰等已被广泛应用,实现了对畜禽物种的重要生产性状进行精准改良。本文介绍了CRISPR/Cas9技术的工作原理及发展历程,重点介绍了该技术在畜禽肌肉生长发育、绒毛纤维生长、乳品质成分、抗病育种以及动物福利中的研究进展,旨在为更深入地了解CRISPR/Cas9技术在畜禽基因编辑上的应用提供参考。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas9 基因编辑 畜禽 遗传改良 经济性状
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生物育种技术及其在畜禽育种中的应用研究进展 被引量:1
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作者 邢生炎 黄永震 +3 位作者 吕世杰 王二耀 雷初朝 梁莎 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期57-65,共9页
随着动物功能基因组研究以及高通量组学技术的发展,畜禽育种已经从基于表型的选择方法过渡到以分子标记技术、基因编辑技术等分子生物学技术手段为主的现代育种新策略上。生物育种是现代生物技术育种的统称,是衡量农业科技竞争力的重要... 随着动物功能基因组研究以及高通量组学技术的发展,畜禽育种已经从基于表型的选择方法过渡到以分子标记技术、基因编辑技术等分子生物学技术手段为主的现代育种新策略上。生物育种是现代生物技术育种的统称,是衡量农业科技竞争力的重要标志,包括标记辅助选择、全基因组选择育种、转基因和基因编辑育种、胚胎工程技术体系等育种手段。生物育种作为畜禽遗传改良的重要手段持续推动着我国的种质资源创新。本文详细介绍了生物育种的关键技术及其特点,包括不同育种方法在畜禽种质开发和遗传改良上的研究进展,探讨分析了当前畜禽育种的现状与问题,以期实现生物育种核心技术的突破与发展。 展开更多
关键词 生物育种 分子育种技术 基因编辑 胚胎工程 应用
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大白猪生长性状影响因素分析及遗传参数估计 被引量:1
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作者 许迪 颜港 +7 位作者 张帅 张坤 江山 邢天琦 王钰滨 王梦影 兰干球 梁晶 《中国畜牧兽医》 CSCD 北大核心 2024年第1期193-202,共10页
【目的】分析初生重、乳头数、测定场区、胎次、出生年份和出生季节等因素对大白猪生长性状的影响,并对主要生长性状的遗传参数进行估计,为大白猪群体的遗传改良提供参考。【方法】收集1024头法系大白母猪的生长测定数据,包括100 kg平... 【目的】分析初生重、乳头数、测定场区、胎次、出生年份和出生季节等因素对大白猪生长性状的影响,并对主要生长性状的遗传参数进行估计,为大白猪群体的遗传改良提供参考。【方法】收集1024头法系大白母猪的生长测定数据,包括100 kg平均日增重(average daily gain to 100 kg,ADG)、达100 kg体重日龄(age at 100 kg live weight,AGE)、达100 kg体重校正背膘厚(backfat adjusted to 100 kg,BF)和达100 kg体重校正眼肌面积(loin muscle area adjusted to 100 kg,LMA),利用一般线性模型分析固定效应对大白猪生长性状的影响;利用DMU软件的单性状动物模型估计生长性状的方差组分和遗传力;利用多性状动物模型估计各生长性状间的遗传相关和表型相关。【结果】大白猪生长性状中ADG、AGE、BF和LMA的群体平均值分别为590.26 g、168.20 d、9.46 mm和33.29 cm^(2),其中AGE(P=0.057)和LMA(P=0.106)符合正态性检验,ADG和BF近似正态分布;测定场区、出生年份和出生季节对大白猪各生长性状影响显著(P<0.05;P<0.01),胎次和初生重对AGE和ADG影响显著(P<0.05;P<0.01)。大白猪生长性状估计遗传力介于0.277~0.422之间,属于中高遗传力性状;遗传相关系数在―0.996~0.346之间。【结论】测定场区、出生年份、出生季节、胎次和初生重对大白猪多个生长性状具有显著影响,生长性状的遗传力和性状间的遗传相关可为大白猪群体后续的育种工作提供一定指导。 展开更多
关键词 大白猪 生长性状 固定因素 遗传参数
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青海高寒地区6种多年生禾本科牧草产量及营养价值比较分析
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作者 刘金平 张楠楠 +7 位作者 赵鑫盛 黄亚宇 杨英魁 周学丽 钟荣珍 赵国君 拜彬强 郝力壮 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期3794-3806,共13页
【目的】试验旨在对青海高寒地区人工栽培禾本科多年生牧草进行营养价值评价,以期为高原畜牧业的发展和家畜饲草需求提供参考。【方法】以高寒地区常见的冰草、黑麦草、小黑麦、麦宾草、冷地早熟禾和草地早熟禾为研究对象,选用3头成年... 【目的】试验旨在对青海高寒地区人工栽培禾本科多年生牧草进行营养价值评价,以期为高原畜牧业的发展和家畜饲草需求提供参考。【方法】以高寒地区常见的冰草、黑麦草、小黑麦、麦宾草、冷地早熟禾和草地早熟禾为研究对象,选用3头成年公牦牛作为瘤胃液供体动物,通过体外产气法结合牧草产草量评定牧草的营养价值。【结果】①小黑麦的鲜草产量和干草产量均显著高于其他牧草(P<0.05)。小黑麦和麦宾草的干鲜比较低,显著低于其他牧草(P<0.05)。②小黑麦的干物质(DM)和粗蛋白质(CP)含量均显著高于冷地早熟禾和草地早熟禾(P<0.05)。草地早熟禾的粗灰分(Ash)、中性洗涤纤维(NDF)和酸性洗涤纤维(ADF)含量均最高。冰草的粗脂肪(EE)含量显著高于其他牧草(P<0.05)。小黑麦的钙(Ca)含量显著高于其他牧草(P<0.05),而磷(P)含量与冰草相同。③小黑麦在24、48和72 h的体外产气量(GP)均显著高于其他牧草(P<0.05),且随时间的推移,各牧草间的产气量呈现上升趋势。④6种栽培牧草体外发酵液的pH范围为6.76~6.98。小黑麦和麦宾草的总挥发性脂肪酸(VFA)、乙酸和丙酸含量与其他牧草间差异显著(P<0.05),小黑麦的丁酸和戊酸含量最高,草地早熟禾的乙丙比显著高于其他牧草(P<0.05)。6种栽培牧草氨态氮(NH 3-N)浓度范围为84.70~112.60 mg/L。冷地早熟禾的体外干物质消化率(IVDMD)显著高于其他牧草(P<0.05)。⑤小黑麦各单位面积营养成分产量最高,均显著高于其他牧草(P<0.05)。【结论】小黑麦的综合生产性能最优,营养价值较高,可以作为青海高寒地区适宜栽培牧草。 展开更多
关键词 高寒地区 体外产气 禾本科牧草 产草量 营养价值
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不同被毛颜色成年斯布牦牛生长性能比较及分子育种潜力分析
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作者 朱勇 阮鹏程 +8 位作者 俄广鑫 信金伟 张强 陈晓英 曹涵文 姜辉 鲜莉莉 陆东祥 张成福 《中国饲料》 北大核心 2024年第5期32-38,共7页
斯布牦牛作为我国青藏高原重要牦牛资源,其种质资源特性挖掘与遗传改良提升对西藏牦牛产业提质增效具有重要意义。本研究旨在通过挖掘不同被毛颜色斯布牦牛类群成年阶段生长性能特点,明确重要经济性状相关联候选标记的优势基因型分布,... 斯布牦牛作为我国青藏高原重要牦牛资源,其种质资源特性挖掘与遗传改良提升对西藏牦牛产业提质增效具有重要意义。本研究旨在通过挖掘不同被毛颜色斯布牦牛类群成年阶段生长性能特点,明确重要经济性状相关联候选标记的优势基因型分布,评估斯布牦牛分子育种潜力。结果显示:5~7岁龄黑色斯布牦牛的管围及体高指标均极显著(P <0.01)高于棕色类群,群体组间体重及体斜长差异不显著(P> 0.05)。然而,棕色牦牛各年段的成年体重均值略优于黑色群体。另外,5个分布于ACSL1、MyoD1及TMEM18基因的已知与牦牛生长和泌乳等经济性状相关的标记在两个斯布牦牛类群中均存在较高比例的优势基因型,特别是TMEM18_C4447T和MyoD1_C1710T位点。两个斯布牦牛群体内各位点均未显著偏离哈代温伯格平衡(P> 0.05),表明斯布牦牛群体在历史上尚未经历强烈的关于经济性状的人工选择。本研究明确了不同被毛颜色斯布牦牛成年生长特性,解析了一系列经济性状相关遗传标记在斯布牦牛种群内的育种潜力,为探索斯布牦牛适时出栏技术及提升斯布牦牛选育进程提供了理论参考。 展开更多
关键词 斯布牦牛 被毛颜色 生长性能 遗传标记 优势基因型
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宁乡猪不同发育阶段肌内脂肪沉积差异表达基因及其调控通路分析
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作者 夏铭隆 肖银涛 +4 位作者 郑塞珍 谭碧娥 印遇龙 陈家顺 尹杰 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期3703-3714,共12页
【目的】分析不同日龄宁乡猪背最长肌组织mRNA表达谱,筛选发育过程中与脂肪沉积相关的差异表达基因及其所参与的信号通路,并确定部分关键基因在肌内脂肪发育过程中的表达特征。【方法】选取30(D30)和250(D250)日龄宁乡猪各3头,采集背最... 【目的】分析不同日龄宁乡猪背最长肌组织mRNA表达谱,筛选发育过程中与脂肪沉积相关的差异表达基因及其所参与的信号通路,并确定部分关键基因在肌内脂肪发育过程中的表达特征。【方法】选取30(D30)和250(D250)日龄宁乡猪各3头,采集背最长肌组织样品提取总RNA进行转录组测序,对测序数据进行比对和处理,筛选参与脂质代谢的差异表达基因进行GO功能、KEGG通路及蛋白互作分析,并随机选取6个差异表达基因进行实时荧光定量PCR验证。【结果】共筛选出30个与脂质代谢相关的差异表达基因,其中9个上调,21个下调。差异表达基因主要富集在脂肪酸氧化、长链脂肪酸代谢等生物过程,线粒体、细胞器膜等细胞组分,酰甘油O-酰基转移酶活性、氧化还原酶活性等分子功能;参与了脂肪酸降解、甘油酯代谢、PPAR等信号通路。蛋白互作分析筛选出ACSL 1、ACAA 2、HADHB、LIPG、GPCPD 1、ALDH 2等关键蛋白基因处于核心位置,通过其mRNA表达量不同参与脂肪沉积调控。ACSL 1、CPT 1 A等6个基因的实时荧光定量PCR验证结果与转录组测序结果一致。【结论】ACSL 1、ACAA 2、HADHB、LIPG、GPCPD 1、ALDH 2等作为核心基因参与宁乡猪肌内脂肪调控,并通过脂肪酸降解、甘油酯代谢等信号通路发挥调控作用。本研究结果为进一步研究猪肌内脂肪沉积相关基因的分子调控机制提供了理论参考。 展开更多
关键词 宁乡猪 肌内脂肪 脂质代谢 转录组测序
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整合转录组测序数据鉴定影响猪肉质性状的差异表达基因
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作者 田祚宁 邢凯 +2 位作者 张银花 包帅 曹永春 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1947-1957,共11页
【目的】整合中国地方猪和瘦肉型猪的转录组测序数据,鉴定中国地方猪和瘦肉型猪背最长肌组织中的差异表达基因(DEGs),找出导致二者肉质性状差异的潜在候选基因,以期为猪肉品质研究提供参考。【方法】整合自测数据以及NCBI-SRA数据库下... 【目的】整合中国地方猪和瘦肉型猪的转录组测序数据,鉴定中国地方猪和瘦肉型猪背最长肌组织中的差异表达基因(DEGs),找出导致二者肉质性状差异的潜在候选基因,以期为猪肉品质研究提供参考。【方法】整合自测数据以及NCBI-SRA数据库下载的中国地方猪和瘦肉型猪的原始测序数据,包括8个中国地方猪品种的32个样本和2个瘦肉型猪品种的14个样本,对数据进行过滤、质控、比对、统计后使用R语言DEseq2包筛选差异表达基因,并进行基因富集及蛋白互作(PPI)分析。【结果】通过差异表达分析共鉴定出191个差异表达基因,其中中国地方猪相较于瘦肉型猪有149个基因表达上调,42个基因表达下调。通过基因富集分析得到9条显著富集通路,差异表达基因可能通过调控脂肪沉积和代谢、糖代谢、胰岛素生成、能量代谢、色素沉积等过程影响肉质性状。通过PPI分析鉴定出21个在调控网络中发挥重要作用的基因,其中FABP3、SLC38A4、KIT、LDHB基因处于PPI网络的核心位置。【结论】试验鉴定出FABP3、CTSL、PLIN5、SLC38A4、KIT、APPL1、IDNK、LDHB、ND6、SLC39A8、GPR27、KCNJ13等基因与中国地方猪和瘦肉型猪肉质性状差异有关,直接或间接地调控了肉质性状。研究结果为新基因的挖掘及调控猪肉质性状基因的探究提供了理论依据。 展开更多
关键词 转录组 差异表达基因 基因富集
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全国家禽遗传参数估计知识图谱解析
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作者 李欣 王晓亮 +4 位作者 蔡霞 侯浩宾 肖长峰 姚俊峰 杨长锁 《上海农业学报》 2024年第3期62-72,共11页
为了从海量的科技文献中筛选出家禽遗传参数估计领域的绝大多数理论、方法和研究成果,以科技文献的聚类分析、热点词分析等方法为基础,借助CiteSpaceⅤ软件和Carrot2软件,直观展示我国高产作者和主要研究机构在该领域的分布情况,并通过... 为了从海量的科技文献中筛选出家禽遗传参数估计领域的绝大多数理论、方法和研究成果,以科技文献的聚类分析、热点词分析等方法为基础,借助CiteSpaceⅤ软件和Carrot2软件,直观展示我国高产作者和主要研究机构在该领域的分布情况,并通过高被引文献和高频关键词分析等手段,绘制出1900—2022年我国家禽遗传参数估计领域的科技文献可视化图谱,同时还对国际遗传参数估计领域的发展概况进行梳理。该结果可帮助研究者及时发现有价值的参考信息,更全面、快速和准确地了解和掌握家禽领域的研究情况,提高研究效率。 展开更多
关键词 家禽 遗传参数 知识图谱 CitespaceⅤ
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陕北白绒山羊角型与生长性状的相关分析
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作者 宋晓越 张杰 +5 位作者 李洋 朱海鲸 冯继英 谢宇杰 姬凯 屈雷 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第13期42-46,共5页
为了研究陕北白绒山羊角型分布规律及角型指标与山羊生长性状的相关性,丰富山羊良种选育的途径,试验对11618只山羊角型数据进行统计和分类,依据羊角特征建立了山羊角的角型分类规则,并对其中3610只陕北白绒山羊的角型指标(角大小、角形... 为了研究陕北白绒山羊角型分布规律及角型指标与山羊生长性状的相关性,丰富山羊良种选育的途径,试验对11618只山羊角型数据进行统计和分类,依据羊角特征建立了山羊角的角型分类规则,并对其中3610只陕北白绒山羊的角型指标(角大小、角形状、角弧度、角尖朝向)与生长性状(体长、体高、十字部高、胸深、胸宽、胸围和管围)进行相关性分析和单因素方差分析。结果表明:母羊的中角、拧角、非螺旋角和角尖向侧是优势角型,公羊的大角、非螺旋角和角尖向侧是优势角型。在公羊中,角弧度与胸宽呈极显著正相关(P<0.01),角尖朝向与体高呈显著正相关(P<0.05);在母羊中,4种角型指标均与生长性状存在相关性。母羊的大角对应的体长、十字部高、胸深、胸围、管围、胸宽均极显著高于中角和小角(P<0.01),大角和中角对应的体高也极显著高于小角(P<0.01);拧角对应的体长极显著高于直角(P<0.01);螺旋角对应的体高、十字部高、胸围和胸宽显著或极显著高于非螺旋角(P<0.05或P<0.01);角尖向上对应的体高、十字部高、胸深、胸围极显著高于角尖向侧(P<0.01)。公羊的螺旋角对应的胸宽极显著高于非螺旋角(P<0.01),角尖向侧对应的体高显著高于角尖向上(P<0.05)。在母羊的体高、十字部高、胸宽、胸围和管围等生长性状方面,角大小、角形状、角弧度和角尖朝向之间存在交互作用(P<0.05);在公羊中均没有交互作用。说明陕北白绒山羊角型与生长性状之间存在相关性,角型指标可作为辅助选育指标。 展开更多
关键词 陕北白绒山羊 角大小 角形状 角弧度 角尖朝向 生长性状
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CRISPR-Cas9基因编辑技术在牛、羊生产中的应用研究进展
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作者 潘东霞 王辉 +1 位作者 熊本海 唐湘方 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期4880-4889,共10页
近年来,基因编辑技术作为一种基因组修饰工具迅速发展,包括锌指核酸酶(zinc-finger nucleases,ZFNs)、转录激活因子样效应物核酸酶(transcription activator-like effector nucleases,TALENs)和成簇规则间隔短回文重复序列相关蛋白(clus... 近年来,基因编辑技术作为一种基因组修饰工具迅速发展,包括锌指核酸酶(zinc-finger nucleases,ZFNs)、转录激活因子样效应物核酸酶(transcription activator-like effector nucleases,TALENs)和成簇规则间隔短回文重复序列相关蛋白(clustered regularly interspaced short palindromic repeats associated protein,CRISPR-Cas)系统在内的基因编辑工具使生物体的基因组DNA靶向修饰成为可能,尤其是CRISPR-Cas9系统的出现,加速了基因编辑技术的发展,成为基础科学和应用科学中的革命性工具。与ZFNs和TALENs技术相比,CRISPR-Cas9系统因其高灵活性、灵敏度、特异性和成本效益而被广泛使用。CRISPR-Cas9基因编辑技术通过靶向特定序列精确地切割DNA,并通过在特定基因组位点产生双链断裂来添加、去除或替换核苷酸等方式在位点引入特异性修饰对畜牧生产的不同方面做出了重大贡献,产生了改善牲畜生产和具有抗病性等多种动物模型,以研究畜禽关键基因功能,加速性状改良。作者主要阐述了CRISPR-Cas9系统的机制与功能及其在牛、羊生产中的应用进展,以期为今后的相关研究提供参考。 展开更多
关键词 CRISPR-Cas9系统 基因编辑 繁殖 泌乳 抗病
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基因编辑技术及其在畜禽遗传育种中的应用研究进展
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作者 曹慧 韩博 孙东晓 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期6-12,共7页
基因编辑是指对生物体基因组特定的DNA进行改造,使生物的性状发生定向的、可遗传的改变。基因编辑技术主要包括锌指核酸酶(Zinc Finger Nucleases,ZFNs)技术、转录激活因子样效应物核酸酶(Transcription Activator-Like Effector Nuclea... 基因编辑是指对生物体基因组特定的DNA进行改造,使生物的性状发生定向的、可遗传的改变。基因编辑技术主要包括锌指核酸酶(Zinc Finger Nucleases,ZFNs)技术、转录激活因子样效应物核酸酶(Transcription Activator-Like Effector Nucleases,TALENs)技术、成簇规则间隔短回文重复序列/Cas9(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats and CRISPR-associated Protein 9,CRISPRs/Cas9)技术。在畜禽中使用高效且精确的基因编辑技术可以提高畜禽产量、品质、抗病力等。本文从基因编辑技术的发展、原理及其在畜禽遗传育种中的应用进行综述,为基因编辑技术应用于畜禽遗传育种的研究提供参考。 展开更多
关键词 基因编辑 畜禽 ZFNs TALENs CRISPR/Cas9
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雷州山羊TBX 15基因多态性及其与体尺性状的关联分析
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作者 周光现 谭嘉泳 +4 位作者 杨健 刘艳芬 甘尚权 赵志辉 康丹菊 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期3930-3938,共9页
【目的】本研究旨在筛查雷州山羊T盒子转录因子15(TBX15)基因潜在的单核苷酸多态性(SNP)位点,并分析其与体尺性状的关联性,为雷州山羊分子选育提供理论支撑。【方法】采集78只雷州山羊血样提取基因组DNA,利用PCR扩增和直接测序法检测TBX... 【目的】本研究旨在筛查雷州山羊T盒子转录因子15(TBX15)基因潜在的单核苷酸多态性(SNP)位点,并分析其与体尺性状的关联性,为雷州山羊分子选育提供理论支撑。【方法】采集78只雷州山羊血样提取基因组DNA,利用PCR扩增和直接测序法检测TBX 15基因SNP位点,并分析其遗传多样性;采用SPSS 23.0软件分析TBX 15基因多态性与雷州山羊体高、体长和胸围等体尺性状的关联性;利用HaploView软件进行TBX 15基因SNP位点的连锁不平衡和单倍型分析。【结果】在雷州山羊TBX 15基因内含子上发现3个SNPs位点:g.96346139 A>G、g.96345894 T>C和g.96330058 G>A,均存在3种基因型,优势基因型分别为GG、CC和AA;卡方检验结果表明,其均处于Hardy-Weinberg平衡状态;多态信息含量(PIC)分别为0.309、0.285及0.294,均为中度多态(0.25<PIC<0.50)。关联分析结果发现,雷州山羊TBX 15基因g.96346139 A>G位点GG基因型个体的体高、十字部高和体斜长均显著高于AA基因型(P<0.05);g.96345894 T>C位点CC基因型个体的体高、十字部高、体斜长和胸深均显著高于TT基因型(P<0.05);g.96330058 G>A位点GG基因型个体的胸深显著低于其他2种基因型(P<0.05)。在单倍型和连锁不平衡分析中发现,3个SNPs位点间存在强连锁关系(R 2>0.33),有5种主要单倍型,其中优势单倍型是ACG,其概率为0.716。【结论】雷州山羊TBX 15基因3个SNPs位点对体高、体斜长等体尺指标具有显著影响,且该3个位点间具有强连锁关系,单倍型ACG可作为雷州山羊选育的候选标记。 展开更多
关键词 雷州山羊 TBX 15基因 体尺性状 多态性 关联性
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庆阳驴mtDNA D-loop区遗传多样性及起源分析
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作者 施海娜 王永杰 +5 位作者 梁万鹏 耿智广 李世恩 徐振飞 刘刚 刘哲 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期601-613,共13页
[目的]研究庆阳驴养殖群体的遗传多样性与母系起源,了解其遗传信息,为保护庆阳驴种质资源、选育和遗传改良工作提供理论依据。[方法]随机选取133头庆阳驴,对其线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)D-loop区序列进行PCR扩增、测序及比对,... [目的]研究庆阳驴养殖群体的遗传多样性与母系起源,了解其遗传信息,为保护庆阳驴种质资源、选育和遗传改良工作提供理论依据。[方法]随机选取133头庆阳驴,对其线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)D-loop区序列进行PCR扩增、测序及比对,并探讨庆阳驴的遗传多样性与母系起源。[结果]在获得的520 bp D-loop碱基序列中,AT含量(57.3%)高于GC含量(42.8%),表现出碱基的偏倚性;检测到38个变异位点,包含8个碱基对的转换;其核苷酸多样性(Pi)、单倍型多样性(Hd)、平均核苷酸差异(K)分别为0.01591、0.895和8.274,与欧洲家驴和中国家驴研究的平均值相比较低,说明该驴品种核苷酸变异较为贫乏。庆阳驴mtDNA D-loop区存在35个单倍型,单倍型之间的遗传距离为0.002~0.042。系统进化结果显示,庆阳驴存在2个线粒体支系,表明其具有2个母系起源,且遗传距离表明,庆阳驴与克罗地亚家驴之间的遗传距离较近。[结论]本研究从分子水平初步揭示庆阳驴核苷酸变异比较贫乏,杂交程度高,mtDNA遗传多态性正逐步丧失,应加强庆阳驴品种的遗传资源保护工作。 展开更多
关键词 庆阳驴 MTDNA D-LOOP区 遗传多样性 起源
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江泉黑猪GPAT 3基因多态性及其与生长性状的关联分析
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作者 刘汇鑫 王文文 +3 位作者 许飞 马小燕 李晓敏 唐辉 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1549-1560,共12页
【目的】探究江泉黑猪甘油-3-磷酸酰基转移酶3(glycerol-3-phosphate acyltransferase 3,GPAT3)基因多态性及其与生长性状的相关性,为江泉黑猪的遗传改良和优化繁殖计划提供理论和技术支持。【方法】采集292头江泉黑猪的耳组织样并提取D... 【目的】探究江泉黑猪甘油-3-磷酸酰基转移酶3(glycerol-3-phosphate acyltransferase 3,GPAT3)基因多态性及其与生长性状的相关性,为江泉黑猪的遗传改良和优化繁殖计划提供理论和技术支持。【方法】采集292头江泉黑猪的耳组织样并提取DNA,PCR扩增GPAT 3基因片段,结合Sanger测序与MassARRAY核酸质谱分析系统检测单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点及基因分型。利用R语言3.6.2、HaploView、PHASE等软件进行GPAT 3基因SNP位点的遗传效应、连锁不平衡和单倍型分析。利用SAS 9.2软件分析GPAT 3基因SNP位点及其构成的单倍型块与江泉黑猪生长性状的相关性。【结果】在GPAT 3基因及其5′-调控区共发现10个SNPs,其中4个为低度多态,6个为中度多态;7个SNPs位点基因型频率分布处于哈代-温伯格平衡状态。关联分析发现,9个SNPs与江泉黑猪生长性状呈显著关联(P<0.05),其中g.134957929 G>A、g.134957930 G>T、g.134958013 G>A和g.134976983 T>C存在极强连锁,构建的AGGT/AGGT双倍型在胸围、体高方面具有显著优势(P<0.05),GTGC/GTGC双倍型和GTGC单倍型在体长方面具有显著优势(P<0.05);g.135002556 C>A、g.135002627 C>T、g.135002680 C>T存在极强连锁,构建的ATC/ATC双倍型在胸围、腹围方面具有显著优势(P<0.05),CCC/ATC双倍型在背膘厚方面具有显著优势(P<0.05),ATT单倍型在腹围方面具有显著优势(P<0.05)。【结论】江泉黑猪GPAT 3基因具有丰富的多态性位点,9个SNPs及其构成的2个单倍型块与江泉黑猪胸围、腹围、体高等有显著关联性,可作为江泉黑猪生长性状选育的分子遗传标记。 展开更多
关键词 江泉黑猪 GPAT 3基因 单核苷酸多态性 生长性状
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剪接体在细胞生命活动领域中的研究进展
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作者 王国庆 特日格乐 +3 位作者 翁雅娟 宋代玲 李蓓 芒来 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第9期22-29,117,共9页
RNA剪接是一种重要的后转录修饰过程,它可以将基因组mRNA前体(pre-mRNA)中的内含子剪切掉,并将外显子连接成一个连续的转录本,该过程涉及数百种蛋白质和几种小核RNA(snRNA)的精确控制以适应细胞生理需要,通过RNA剪切,剪接体活动以基因... RNA剪接是一种重要的后转录修饰过程,它可以将基因组mRNA前体(pre-mRNA)中的内含子剪切掉,并将外显子连接成一个连续的转录本,该过程涉及数百种蛋白质和几种小核RNA(snRNA)的精确控制以适应细胞生理需要,通过RNA剪切,剪接体活动以基因表达调控为手段,对细胞的发育、分化及环境变化的适应等过程产生影响。一些剪接体因子的表达还受到细胞周期阶段的调控,甚至在不同的细胞周期阶段正确地剪接不同的mRNA,当细胞面临各种应激时,剪接体能够调整其活动以适应环境的变化,而异常的剪接体活动还与多种疾病相关,包括癌症、神经系统疾病及遗传性疾病。文章从细胞增殖、凋亡、周期、侵袭和迁移等方面综述了可变剪接和剪接体对细胞生命活动的影响及调控作用,旨在探索剪接体的调控机制,揭示细胞生存奥秘。 展开更多
关键词 剪接体 可变剪接 剪接因子 基因表达调控 MRNA
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BO液-CR1aa体系在鹿体外胚胎生产中的使用效果 被引量:2
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作者 李宁 黄承俊 赵刚 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第3期118-123,共6页
为探索BO液-CR1aa体系是否可用于鹿的体外胚胎生产,试验于5%CO_(2)气态条件(单气条件)下,用BO液-CR1aa体系对梅花鹿和非繁殖季节马鹿进行体外胚胎生产,同时于5%O_(2)、5%CO_(2)、90%N_(2)气态条件(三气条件)下,分别用BO液-CR1aa体系和BO... 为探索BO液-CR1aa体系是否可用于鹿的体外胚胎生产,试验于5%CO_(2)气态条件(单气条件)下,用BO液-CR1aa体系对梅花鹿和非繁殖季节马鹿进行体外胚胎生产,同时于5%O_(2)、5%CO_(2)、90%N_(2)气态条件(三气条件)下,分别用BO液-CR1aa体系和BO液-20%绵羊血清(SS)-SOFaa体系对梅花鹿进行体外胚胎生产,并以SOFaa液-CR1aa体系、SOFaa液体系作为对照,从体外受精开始算起,第48小时检测卵裂情况,第5~7天检测胚胎发育情况。结果表明:单气条件下,将在体外成熟22~24 h的COCs在BO液中受精,在CR1aa培养液及CR1aa-10%FBS-输卵管上皮细胞(OEC)培养液中共培养的卵母细胞中仅有1个发生卵裂并在4-cell阶段停滞,总卵裂率为2%。梅花鹿COCs在BO液-CR1aa体系中的卵裂率为20%,有1个受精卵发育到了4-cell阶段;在SOFaa液-CR1aa体系中的卵裂率为17%,有1个受精卵发育到了2-cell阶段;而在SOFaa液体系中的卵裂率为50%,并有1个受精卵成功发育到了桑囊胚阶段,有2个受精卵在BO液(20%SS)-SOFaa体系中发育到了8-cell阶段,卵裂率提高到33%。用0.02 IU/mL LH代替成熟液中0.001 IU/mL LH使1个非繁殖季节马鹿受精卵发育到了4-cell阶段。说明在单气条件和三气条件下,BO液-CR1aa体系均不能用于梅花鹿体外胚胎生产,在BO液中添加20%SS可以提高梅花鹿卵母细胞的体外受精效果;BO液-CR1aa体系或许可用于我国马鹿的体外胚胎生产,但想要受精卵发育到桑囊胚阶段,还需对BO液-CR1aa体系进行进一步改良。 展开更多
关键词 马鹿 梅花鹿 卵母细胞 体外受精 体外胚胎培养
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干细胞在牛羊遗传改良中的应用研究进展
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作者 王梓玥 孙嘉媛 +4 位作者 金妙函 曹静 丁一格 宋环宇 王小龙 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期66-73,共8页
干细胞技术是当前动物生物技术的热门研究之一,不仅在再生医学和人类疾病治疗方面优势突出,还在动物遗传资源保存及品种改良等方面有着巨大的应用潜力。干细胞作为一种新型实验材料,可以与基因编辑技术、体细胞核移植技术、体外受精技... 干细胞技术是当前动物生物技术的热门研究之一,不仅在再生医学和人类疾病治疗方面优势突出,还在动物遗传资源保存及品种改良等方面有着巨大的应用潜力。干细胞作为一种新型实验材料,可以与基因编辑技术、体细胞核移植技术、体外受精技术及高通量测序等技术相结合,在家畜遗传改良中有着极大的科研潜力和应用价值。本文总结了干细胞分离培养技术,以及近年来干细胞技术在牛、羊遗传育种中的研究进展,并对其应用及发展前景进行了展望。 展开更多
关键词 干细胞 牛羊 干细胞育种 基因编辑 核移植
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宰后猪肉成熟过程中基因表达变化及其与肉品质的相关性分析 被引量:1
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作者 黄永棚 冉雪琴 +3 位作者 牛熙 李升 黄世会 王嘉福 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1573-1581,共9页
【目的】研究宰后成熟对猪肉品质的影响,以及宰后成熟过程中基因表达规律与猪肉品质变化的相关性,以期更好地阐释鲜肉成熟过程中肉品质变化的机理。【方法】以4℃条件下贮藏的大白猪背最长肌为研究对象,测定贮藏0、1、2、4、6、8和10 d... 【目的】研究宰后成熟对猪肉品质的影响,以及宰后成熟过程中基因表达规律与猪肉品质变化的相关性,以期更好地阐释鲜肉成熟过程中肉品质变化的机理。【方法】以4℃条件下贮藏的大白猪背最长肌为研究对象,测定贮藏0、1、2、4、6、8和10 d时肉品质变化状况;利用实时荧光定量PCR测定宰后猪背最长肌中单磷酸腺苷脱氨酶3(AMPD3)、肌球蛋白结合蛋白C2(MYBPC2)、肌球蛋白轻链3(MYL3)、左旋氨基酸转运体(SLC7A8)和原肌球蛋白3(TPM3)等基因的表达变化,并分析其与肉品质指标的相关性。【结果】大白猪宰后背最长肌pH在2 d时达到极限值6.5,显著低于4、10 d(P<0.05);蒸煮损失和滴水损失均呈现先升高后降低的趋势,而贮藏损失在10 d时达到最高值12.52%,显著高于0.5~6 d(P<0.05);剪切力在宰后成熟1~10 d显著低于0~1 d(P<0.05);硫代巴比妥酸反应物(TBARS)值随成熟时间的延长逐渐升高,且8~10 d显著高于其他时间点(P<0.05)。实时荧光定量PCR结果表明,宰后肌肉组织中基因的转录丰度仍然存在,AMPD 3基因在贮藏6 d时表达水平显著高于0、0.5、2和10 d(P<0.05);MYBPC 2、MYL 3和TPM 3基因0~10 d表达量均呈时间依赖性上调,在贮藏10 d时表达水平显著高于0~2 d(P<0.05);SLC 7 A 8基因在贮藏2 d时表达量达到峰值,显著高于其他时间点(P<0.05)。相关性分析表明,AMPD 3基因与猪肉品质指标间没有相关性(P>0.05);MYBPC 2基因表达量与TBARS值和贮藏损失呈显著正相关(P<0.05);MYL 3基因表达量与TBARS值、剪切力、滴水损失及贮藏损失呈极显著或显著正相关(P<0.01;P<0.05),与蒸煮损失呈极显著负相关(P<0.01);SLC 7 A 8基因表达量与pH呈显著负相关(P<0.05);TPM 3基因表达量与TBARS值、滴水损失及贮藏损失呈显著或极显著正相关(P<0.05;P<0.01),与蒸煮损失呈显著负相关(P<0.05)。【结论】宰后猪肉成熟过程中基因表达变化与肉品质指标间存在相关性,基因表达的差异影响着动物屠宰后不同的代谢类型和生理功能,进而影响肉品质。 展开更多
关键词 猪肉 宰后成熟 肉品质 基因表达 相关性
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全基因组选择在山羊育种中的应用研究进展
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作者 赵彦频 韩勇 +3 位作者 粟朝芝 龙勇 肖文 杨晓玲 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期4860-4870,共11页
全基因组选择(genome-wide selection,GS)是一种基于基因组数据的育种方法,通过分析遗传标记和性状的关系,预测个体的遗传值和表型值,从而实现精准选育。随着高通量测序技术的发展,全基因组选择成为了现代畜禽育种的重要手段,在山羊育... 全基因组选择(genome-wide selection,GS)是一种基于基因组数据的育种方法,通过分析遗传标记和性状的关系,预测个体的遗传值和表型值,从而实现精准选育。随着高通量测序技术的发展,全基因组选择成为了现代畜禽育种的重要手段,在山羊育种中展现了巨大的潜力和应用前景。研究人员通过全基因组选择精确地评估山羊的繁殖性能,提高繁殖效率;同时通过筛选优良基因型,改良山羊的生长发育、肉品质等性状,以获得更高的经济效益。作者主要介绍了全基因组选择的原理和方法,并针对山羊的繁殖性能、生长性状和肉品质等关键性状的应用研究展开论述;讨论了全基因组选择在山羊育种中的优势和挑战,并对全基因组选择在山羊育种中的应用与未来发展趋势进行了总结与展望,以期为山羊育种的进一步发展提供一定的参考和理论支撑。 展开更多
关键词 全基因组选择 测序 山羊育种 育种值
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