肺泡灌洗液二代测序在儿童社区获得性肺炎诊疗中的应用价值

目的探讨肺泡灌洗液二代测序(NGS)在儿童社区获得性肺炎(CAP)诊疗中的应用价值。方法选取2021年6月至2022年7月九江市妇幼保健院儿童呼吸科收治的116例CAP并行纤维支气管镜肺泡灌洗的患儿为研究对象,采集患儿肺泡灌洗液行NGS检测,同时完善相关的传统病原微生物检测。比较2种方法检测病原体的阳性率、病原学分布情况及检测结果的一致性。结果116例患儿经传统病原微生物检测,共检出阳性94例(81.03%),其中细菌感染4例(3.45%)、病毒感染2例(1.72%)、肺炎支原体感染83例(71.55%)、肺炎衣原体感染5例(4.31%),包含混合感染9例(7.76%);对肺泡灌洗液进行NGS检测,共检出阳性111例(95.69%),其中细菌感染62例(53.45%)、病毒感染58例(50.00%)、肺炎支原体感染99例(85.34%)、真菌感染5例(4.31%),包含混合感染63例(54.31%)。肺泡灌洗液NGS对细菌、病毒与肺炎支原体检出率高于传统病原微生物检测,差异有统计学意义(P<0.05);NGS检测与传统病原学检测检出率一致性不佳(Kappa=-0.079,P=0.017);NGS与临床综合诊断符合率为95.69%(114/116),高于传统病原微生物检测的81.03%(94/116),差异有统计学意义(P<0.05)。结论NGS在CAP病原体检测中应用价值较高,能够提高病原体阳性检出率,可将其作为传统病原微生物检测的有效补充,指导临床调整治疗方案,以期更好地改善患儿预后。

急性淋巴细胞白血病的免疫分型和基因的研究

目的:回顾性分析30例急性淋巴细胞白血病(ALL)患者的免疫分型,融合基因及基因突变的分子生物学检测结果,并探讨其与临床治疗效果及预后的关系。方法:选取哈尔滨市第一医院血液肿瘤研究中心2015年8月到2016年6月经过骨髓细胞形态学、免疫表型、细胞遗传学、分子生物学等检查确诊的ALL患者30例,按照FAB标准分类,27例为B系ALL,3例为T系ALL。分析ALL患者白血病细胞膜表面及胞浆内分化抗原,并且对所有患者都进行43种融合基因定性筛查(BCR-ABL,AML1-ETO,PML-RARα等)和ALL基因突变(IKZF1,TP53,PAX5,JAK1,JAK2,CRLF2,PHF6,NOTCH1,FBXW7,PTEN)的二代测序(NGS)检测。结果:30例ALL患者中男性14例,女性16例,年龄2-74岁,中位年龄11.5岁。30例ALL中B-ALL发病率(90.00%)明显高于T-ALL(10.00%)。27例B-ALL患者主要表达CD19、CD22、CD10和CD34等。CD19和CD22是B-ALL最具有诊断价值的抗原;3例T-ALL主要表达cCD3、CD7、CD10和cTDT等,CD7和cCD3是T-ALL最具有诊断价值的抗原。30例ALL患者的43种融合基因定性筛查发现,BCR-ABL、TEL-AML1、E2A-PBX1、MLL-AF6、MLL-AF4和SIL-TAL融合基因阳性各1例,ALL相关基因突变的NGS检测结果表明,3例B-ALL患者发生TP53突变,1例B-ALL患者发生TET2 I1762V突变;3例患者(2例T-ALL,1例B-ALL)发现NOTCH1基因突变。1个疗程后成人B-ALL的治疗效果(28.57%)明显差于儿童B-ALL(95.00%),截止至2017年7月10日儿童B-ALL的生存率明显优于成人B-ALL,其差异都具有显著性意义。结论:白血病免疫分型技术及分子生物学检测技术在白血病的诊断、治疗方案的选择及疗效评价方面具有重要指导作用,是骨髓细胞形态学诊断的补充。

儿童右肺中叶综合征临床分析

目的分析儿童右肺中叶综合征的病因及病原类型方法对经肺部CT诊断为右肺中叶综合征的38例患儿进行电子支气管镜检查,镜下行支气管肺泡灌洗,观察电子支气管镜下表现,对炎症性因素所致的右肺中叶综合征将肺泡灌洗液进行宏基因二代测序检测,分析其检测结果结果电子支气管镜下检查:炎症引起33例,异物5例33例炎症引起的RMLS患儿肺泡灌洗液的病原微生物宏基因二代测序检测结果中,细菌阳性22例,占66.7%,病原分别为肺炎链球菌(9例)、流血嗜血杆菌(8例)、卡他莫拉菌(3例)、肺炎克雷伯菌(1例)、大肠埃希菌(1例);肺炎支原体5例,占15.2%;腺病毒6例,占18.5%;真菌5例,占15.2%。结论炎症是导致儿童RMLS的主要因素,细菌是主要的病原体,其中以肺炎链球菌及流感嗜血杆菌多见。

急性髓系白血病克隆演化与微小残留病的检测

急性髓系白血病(AML)是具有高度异质性的血液系统恶性肿瘤,其表现为髓系肿瘤细胞在外周血、骨髓、髓外组织的克隆性扩增,导致患者贫血、出血、发热,直至死亡。微小残留病(MRD)是检测AML肿瘤负荷最有效的手段,常用的方法包括多参数流式细胞术和RT-PCR。但二代高通量测序(NGS)技术更适合检测AML患者克隆演化过程,因为其可以同时检测高通量的突变基因。本文就AML克隆演化及NGS检测AML的MRD的最新进展做一综述。

AIDS合并诺卡氏菌病、铜绿假单胞菌感染、巨细胞病毒脑炎1例并文献复习

本文报道1例艾滋病合并多重感染病例。患者为中年男性AIDS患者,因出现咳嗽、咳痰及发热等症状而前往当地医院就诊,经过HIV初筛及确诊阳性后转入贵阳市公共卫生救治中心。患者经相关检查,初步诊断为AIDS合并肺部感染,经抗菌等治疗后病情并未见好转。经多次痰培养、纤维支气管镜等检查,并送检肺泡灌洗液宏基因组二代测序(metagenomics next-generation sequencing,mNGS)检测,最终明确诊断为AIDS合并诺卡氏菌病(脓肿诺卡菌)、铜绿假单胞菌感染、巨细胞病毒脑炎。调整抗感染治疗方案和抗逆转录病毒治疗方案,患者病情好转并出院。该病例凸显了HIV对人体器官的侵害能力,是导致患者合并多重感染以及病情加重的重要原因。对于AIDS患者来说,合并其他感染的情况并不罕见,因此,准确的诊断和及时的治疗至关重要。通过本例患者治疗经历回顾,希望能够提高临床医生对AIDS患者合并多重感染的诊断、治疗水平,延长患者生命。

DTAS基因突变对初诊急性髓系白血病患者预后的影响

目的探讨DTAS基因(DNMT3A基因、TET2基因、ASXL1基因、SRSF2基因)突变对初诊急性髓系白血病(AML)患者生存期的影响。方法收集2018年1月1日至2021年10月31日于徐州医科大学附属医院血液科接受二代测序检测(NGS)的163例AML患者的临床一般资料,包括患者的身高、体重、性别、年龄、骨髓原始细胞比例、诱导缓解方案、是否移植、外周血指标等进行回顾性分析。其中男88例,女75例,年龄48(33,59)岁。根据患者二代测序资料,将有上述4个基因任一突变者分为DTAS基因突变组,反之为无DTAS基因突变组。同时纳入40名健康对照研究DTAS基因突变与粒淋比和淋单比之间的关系。通过Kaplan-Meier法及Cox回归模型分析生存与预后指标。结果163例患者中,检出DTAS基因突变的患者50例(30.7%),未检出DTAS基因突变的患者113例(69.3%)。在50例DTAS基因突变的患者中,其中≥2个突变的患者有8例(16%),DTAS基因中有任一基因突变的患者有42例(84%)。DTAS基因突变组患者年龄较大、欧洲白血病网预后分层较差、缓解持续时间较短、诱导化疗后28 d重度骨髓抑制程度所占比例[21(61.8%)比31(34.8%)]较高(χ^(2)=7.313,P=0.007),治疗后达完全缓解时,淋单比值较低,且低于健康对照组(Z=4.935,P<0.001)。Kaplan-Meier生存分析结果显示,DTAS基因突变组的总生存时间和无事件生存时间均低于无DTAS基因突变组(P均<0.01)。DTAS基因突变组的中位OS时间为21(95%CI 16.63~25.37)个月,低于无DTAS基因突变组的43(95%CI 33.01~52.99)个月(P=0.003,HR=2.041)。多因素Cox回归分析显示,DTAS基因突变是影响总生存时间的独立危险因素(HR=2.041,95%CI 1.285~3.244,P=0.003)。结论DTAS基因突变不影响AML患者诱导化疗后血象恢复时间,但DTAS基因突变患者缓解持续时间较短。DTAS基因突变提示预后不良,是影响OS的独立危险因素。