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基于GBS测序的湘东黑山羊的亲缘关系及近交系数 被引量:2
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作者 刘海林 江为民 +4 位作者 段洪峰 李昊帮 罗璋 李安定 龚龑 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期78-85,共8页
利用基因分型测序(GBS)对60只湘东黑山羊(9只公羊、51只母羊)进行基因组测序,获得湘东黑山羊染色体上的SNP数据和连续纯合子片段(ROH)数据。通过SNP数据进行基于G矩阵的基因组亲缘关系分析和NJ聚类分析,构建湘东黑山羊的群体家系结构,... 利用基因分型测序(GBS)对60只湘东黑山羊(9只公羊、51只母羊)进行基因组测序,获得湘东黑山羊染色体上的SNP数据和连续纯合子片段(ROH)数据。通过SNP数据进行基于G矩阵的基因组亲缘关系分析和NJ聚类分析,构建湘东黑山羊的群体家系结构,并通过ROH数据得到群体平均近交系数。结果表明,60只湘东黑山羊的平均测序深度为9.15X,与参考基因组比对率平均为99.59%;在SNP检测过程中,3只母羊不符合基因型数据质控标准,将其过滤后获得其他57只黑山羊29条染色体上153046个SNPs位点和1937个ROH片段;构建的湘东黑山羊8个家系,其中9只公羊和6只母羊被分为7个家系,另42只母羊被单独分类;基于ROH片段分析的湘东黑山羊群体中每个个体的近交系数均值为0.047,说明湘东黑山羊公羊在繁育过程中有较大的利用空间。 展开更多
关键词 湘东黑山羊 基因分型测序 单核苷酸多态性 连续纯合子片段 近交系数 亲缘关系
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应用拮抗和ISSR标记鉴定64个金针菇菌株的亲缘关系 被引量:1
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作者 陈珣 肇莹 +3 位作者 龚娜 刘国丽 马晓颖 肖军 《中南农业科技》 2024年第1期16-20,共5页
以16个野生金针菇(Flammulina velutipes)菌株和48个栽培金针菇菌株为材料,评价不同菌株间体细胞不亲和性,并利用ISSR分子标记检测,从细胞学水平和分子水平对金针菇种质资源进行鉴定和遗传多样性分析,明确其亲缘关系。结果表明,64个金... 以16个野生金针菇(Flammulina velutipes)菌株和48个栽培金针菇菌株为材料,评价不同菌株间体细胞不亲和性,并利用ISSR分子标记检测,从细胞学水平和分子水平对金针菇种质资源进行鉴定和遗传多样性分析,明确其亲缘关系。结果表明,64个金针菇菌株基于拮抗试验划分为7个类群,基于ISSR聚类分析划分为5个类群;栽培金针菇菌株之间亲缘关系普遍较近,野生金针菇菌株与栽培金针菇菌株大多具有较远的亲缘性;32号栽培菌株和49号野生菌株可以优先选作金针菇杂交育种亲本。 展开更多
关键词 金针菇(Flammulina velutipes) 体细胞不亲和性 ISSR分子标记 拮抗试验 聚类分析 亲缘关系
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基于SSR的云南野生猕猴桃种质资源亲缘关系分析
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作者 王连润 万红 +4 位作者 陶磅 陈霞 李坤明 沙毓沧 丁仁展 《中国农学通报》 2024年第4期98-102,共5页
为探讨云南猕猴桃属种质资源的亲缘关系,采用SSR分子标记方法对70份云南野生猕猴桃种质资源的亲缘关系进行分析。UPGMA聚类分析结果表明,70份猕猴桃种质资源在遗传相似系数0.17水平上可分为4个类群,类群Ⅰ共6份材料,包括滇东南麻栗坡的... 为探讨云南猕猴桃属种质资源的亲缘关系,采用SSR分子标记方法对70份云南野生猕猴桃种质资源的亲缘关系进行分析。UPGMA聚类分析结果表明,70份猕猴桃种质资源在遗传相似系数0.17水平上可分为4个类群,类群Ⅰ共6份材料,包括滇东南麻栗坡的中越猕猴桃MLP001和MLP010、西畴的中越猕猴桃TSH-1和TSH-4,以及滇南屏边的中越猕猴桃PB001和PB005;类群Ⅱ共31份材料,主要包括滇东北的18份材料,滇西北的3份紫果猕猴桃TC-8、TC-1、TC-10,以及5份贡山猕猴桃CJ-11、CJ-13、CJ-7、CJ-3、CJ-2;类群Ⅲ共14份材料,主要包括滇东北的10份美味猕猴桃和中华猕猴桃系列材料,滇东的JZS-5、JZS-9及JZS-7,以及滇东南西畴的黄毛猕猴桃XPS-1;类群Ⅳ共19份材料,主要包括滇东北的16份材料,滇东南西畴的京梨猕猴桃XCFD-1及革叶猕猴桃XCFD-3,果实无被毛且果皮带斑点,果实较小,与其他类群具有较远的亲缘关系。SSR分子标记反映了云南猕猴桃属70份种质资源间的遗传亲缘关系,其中一些材料按种类、资源分布地及形态学性状特征形成明显有规律的聚类关系。 展开更多
关键词 野生猕猴桃 亲缘关系 云南 种质资源 SSR分子标记
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家族管理权涉入、亲缘关系异质性与企业避税
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作者 谭庆美 林胜男 孙雅妮 《西安电子科技大学学报(社会科学版)》 2024年第1期91-105,共15页
以2008-2020年A股上市家族企业数据为样本,基于家族高管亲缘关系异质性考察家族管理权涉入对企业避税的影响。研究发现,家族管理权涉入与家族企业避税程度之间显著负相关,家族高管亲缘关系异质性增强能够显著削弱家族管理权涉入对避税... 以2008-2020年A股上市家族企业数据为样本,基于家族高管亲缘关系异质性考察家族管理权涉入对企业避税的影响。研究发现,家族管理权涉入与家族企业避税程度之间显著负相关,家族高管亲缘关系异质性增强能够显著削弱家族管理权涉入对避税程度的负向影响。拓展性检验结果表明,延伸型社会情感财富及第一类代理成本在家族管理权涉入与避税程度之间中具有部分中介效应。面临较高社会信任水平、较稳定的经济政策及较强宗族文化氛围的家族企业中,家族管理权涉入对避税程度的负向影响更为显著。研究结论对于理解亲缘关系对家族企业避税决策的影响具有一定借鉴意义,对于税务部门进行税收征管也有一定参考价值。 展开更多
关键词 家族管理权涉入 企业避税 亲缘关系异质性 社会情感财富 代理成本
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谷子四大名米品种群农艺及品质性状评价与亲缘关系分析 被引量:2
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作者 薛亚鹏 王蓉 +5 位作者 柴小娇 王若楠 王倩 刘少雄 王瑞云 刘敏轩 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期544-561,共18页
对谷子四大名米(沁州黄、桃花米、龙山小米及金米)原始地方品种及其同名品种共计179份开展为期两年的农艺性状调查并对其进行基于SNP标记的亲缘关系分析,从中选择51份进行营养品质测定。结果表明:从农艺性状来看,四类名米品种在数量性... 对谷子四大名米(沁州黄、桃花米、龙山小米及金米)原始地方品种及其同名品种共计179份开展为期两年的农艺性状调查并对其进行基于SNP标记的亲缘关系分析,从中选择51份进行营养品质测定。结果表明:从农艺性状来看,四类名米品种在数量性状上具有明显差异,而质量性状在不同类品种间差异不大。相关性分析表明,穗重与穗粒重、草重与穗重呈极显著正相关。主成分分析表明前3个主成分解释了累积变异的89.414%,基于主成分分析结果计算了综合得分F值,菠菜根-30的综合得分最高(F=7.42),阴天旱-27的综合得分最低(F=-9.17)。亲缘关系结果表明,各同名品种间存在多样的进化关系,不同名品种间可能存在基因交流。基于农艺性状对179份材料进行聚类分析,发现材料划归4个类群,同名品种内聚集相对集中,农艺性状相似度较大。从营养品质上看,四类名米间营养品质差异较小,除粗纤维外其余营养品质指标差异均不显著。相关性分析发现粗蛋白与粗脂肪呈现显著的正相关;淀粉与蛋白质、脂肪之间呈现显著的负相关。主成分分析表明前6个主要成分解释了累积变异的88.414%,能够基本涵盖10个营养品质的信息,基于主成分分析,结合不同品种谷子的综合得分,对小米品质进行排名,排名靠前的品种有菠菜根-77、菠菜根-33、菠菜根-44、爬坡糙-15、九根齐-25和阴天旱-13。本研究对四大名米品种群的农艺性状、品质性状和亲缘关系的鉴定和研究,对种质资源保护和利用,以及优异资源的挖掘具有重要意义。 展开更多
关键词 谷子传统名米 农艺性状 营养品质 相关性分析 亲缘关系
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基于GBS测序的全基因组SNP揭示大凉山玉米地方品种资源的亲缘关系与遗传分化 被引量:1
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作者 冷益丰 罗樊 +2 位作者 陈从顺 丁鑫 蔡光泽 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期32-47,共16页
玉米地方品种是玉米育种种质的重要来源,其类型丰富、部分性状田间表现突出,常含有可利用的优良抗性基因。大凉山因其独特的地理位置和光热资源,生产中积累了各具特色的玉米地方品种,但缺乏系统的遗传研究,导致本区域的玉米育种利用进... 玉米地方品种是玉米育种种质的重要来源,其类型丰富、部分性状田间表现突出,常含有可利用的优良抗性基因。大凉山因其独特的地理位置和光热资源,生产中积累了各具特色的玉米地方品种,但缺乏系统的遗传研究,导致本区域的玉米育种利用进展缓慢。本研究利用基因分型测序(genotyping-by-sequencing,GBS)技术,对收集自大凉山不同地方的360份玉米地方品种资源进行亲缘关系与遗传分化分析。通过高通量测序,产生有效数据250.99 GB,所有样本获得1 659 033 712个clean reads,平均reads数量为4 608 427,平均raw base为0.70 GB,clean base为0.67 GB。各样本的Q20平均值大于等于94.57%,Q30平均值大于等于87.14%,平均GC含量48.20%。经过SNP calling并过滤,获得124 342个单核苷酸多态性(SNP)位点、32 063个插入缺失(InDel)位点(其中插入位点15 738个、缺失位点16 325个)。邻接法构建的系统进化树将360份玉米地方品种群体分成A和B两大类群,支持玉米杂优两群学说;结合主成分分析表明,两群亲缘关系较远,呈现遗传分化;群体结构分析进一步把其分成9个亚群。类群A与B之间的群体分化指数(F_(st))为0.462 2,类群A的核苷酸多样性(πA)高于类群B;选择性清除分析得到96个基因组区域,对前5%的基因组区域进一步分析,共检测到418个基因。对候选基因进行基因功能注释,发现富集的基因组区域中包含寒冷响应基因、缺水响应基因、病菌响应基因等与逆境应答相关的基因。研究结果为大凉山玉米地方品种资源的保护和遗传改良提供了参考依据。 展开更多
关键词 玉米 大凉山 地方品种 基因分型测序 亲缘关系
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14种酢浆草属植物花粉形态及其亲缘关系分析
7
作者 陈生煜 唐小云 +3 位作者 肖云 韩茹 翟俊文 吴沙沙 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期682-698,共17页
利用扫描电镜对14种酢浆草属植物花粉形态及表面纹饰进行观测,对其花粉形态进行聚类分析,并基于孢粉学聚类结果,探讨其种间亲缘关系。结果表明:(1)所观测的14种植物花粉粒为近球形或扁球形,极面观均为三裂圆形,多数为3沟花粉粒,稀2沟(... 利用扫描电镜对14种酢浆草属植物花粉形态及表面纹饰进行观测,对其花粉形态进行聚类分析,并基于孢粉学聚类结果,探讨其种间亲缘关系。结果表明:(1)所观测的14种植物花粉粒为近球形或扁球形,极面观均为三裂圆形,多数为3沟花粉粒,稀2沟(星星酢浆草)和4沟(黄花酢浆草);其中,96.3%花粉粒为中等大小,3.7%为小花粉粒;不同花柱类型都表现为长雄蕊花粉比短雄蕊花粉大;外壁纹饰可分为复网状和网状两类。(2)首次发现3种存在异常花粉粒,分别为桃之辉酢浆草、一片心酢浆草及黄花酢浆草,花粉的异常表现为萌发沟数目和排列异常,其外壁纹饰结构与正常花粉粒未有明显不同。(3)根据外壁纹饰可将14种划分为2大类。一类为复网状花粉,仅构巢酢浆草和果香酢浆草为该类纹饰,二者亲缘关系较近。另一类为网状花粉,对12种具网状花粉酢浆草进行聚类分析可划分为4个类型,其中桃之辉酢浆草、双色冰淇淋酢浆草、藤双色冰淇淋酢浆草亲缘关系较近;扁平酢浆草、黄花酢浆草、纳马夸纳酢浆草及兔耳酢浆草亲缘关系较近;大花酢浆草、星星酢浆草、乳白蝴蝶叶酢浆草亲缘关系较近;吉氏酢浆草和一片心酢浆草与其他酢浆草亲缘关系较远。该研究结果表明,花粉形态相近的物种在植株形态上有一定的相似性,花粉形态特征可作为种间亲缘关系研究和分类划分依据,进一步为酢浆草属植物杂交育种亲本选择提供理论基础。 展开更多
关键词 酢浆草属 花粉形态 异型花柱 异常花粉 亲缘关系
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基于叶绿体基因rbcL和trnL-F序列的河北省野生苔草属亲缘关系分析
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作者 周欣莹 董彦娜 +4 位作者 邱玉鹏 孙浩男 刘亚伟 李艳 刘冬云 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期2728-2736,共9页
为研究河北省野生苔草属(Carex)植物的亲缘关系,本研究以43种河北省野生苔草及国外引种的27份苔草种质为试验材料,克隆了叶绿体基因rbcL和trnL-F序列,进行遗传多样性及亲缘关系分析,并构建了系统发育树。结果表明,从70份苔草属植物中成... 为研究河北省野生苔草属(Carex)植物的亲缘关系,本研究以43种河北省野生苔草及国外引种的27份苔草种质为试验材料,克隆了叶绿体基因rbcL和trnL-F序列,进行遗传多样性及亲缘关系分析,并构建了系统发育树。结果表明,从70份苔草属植物中成功克隆到的rbcL和trnL-F序列数量分别为67条、60条,测序成功率分别为95.7%、85.7%,经正反序列拼接对齐获得序列长度分别为716 bp、976 bp,并上传至NCBI获得登录号。二者合并得到59条序列,长度为1692 bp。rbcL,trnL-F以及合并序列分别定义了43,56,58个单倍型。基于合并序列的59份种质间遗传距离为0~0.0421,平均遗传距离为0.0142,整体划分为3大类,与形态学分类基本相符。trnL-F序列有望开发为DNA条形码,以期为苔草属的分类鉴定、系统发育等研究提供依据。 展开更多
关键词 苔草属 RBCL TRNL-F 亲缘关系 遗传多样性
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湖北巴东县野生茶树种质资源遗传多样性及种群结构亲缘关系分析
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作者 崔清梅 梁金波 +8 位作者 马会杰 胡双玲 陈清华 吴立赟 何梦迪 王留彬 谭立才 张强 王丽鸳 《茶叶科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期193-206,共14页
野生茶树种质资源具有较高的遗传多样性,是开展茶树品种选育的优质基因库。收集了来自湖北省巴东县的26份野生茶树资源,利用简单重复序列(Simple sequence repeat,SSR)分子标记并结合对照栽培型茶树品种对野生茶树资源的遗传多样性及种... 野生茶树种质资源具有较高的遗传多样性,是开展茶树品种选育的优质基因库。收集了来自湖北省巴东县的26份野生茶树资源,利用简单重复序列(Simple sequence repeat,SSR)分子标记并结合对照栽培型茶树品种对野生茶树资源的遗传多样性及种群结构等进行分析。结果如下:(1)16对引物在供试材料中共扩增得到82个等位位点,每对引物扩增所得的等位基因范围为3~8个,平均检测出等位位点5.12个,有效位点数量3.65个,香农多样性指数平均值1.378。(2)从16对引物中筛选出6个核心引物位点,可对26份野生茶树进行有效检测并鉴别。(3)UPGMA进化树将48份材料分为7个类别,野生茶树与栽培型茶树能通过SSR标记进行有效划分;进一步种群遗传结构分析发现26份野生茶树可分为2个亚群。(4)依据生化成分含量,筛选得出2份高EGCG含量的茶树种质资源及2份适制红茶的茶树种质资源。研究结果显示,巴东野生茶树多样性丰富,种群内部遗传变异高,为进一步保护、开发和利用巴东野生茶树种质资源奠定了基础。 展开更多
关键词 野生茶树 多样性 简单重复序列 亲缘关系
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藏羚交配群成员间亲缘关系及遗传多样性分析
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作者 赛青高娃 王子涵 +2 位作者 李全邦 王东 连新明 《兽类学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期159-170,共12页
藏羚(Pantholops hodgsonii)是青藏高原特有物种,多集群生活且具有典型的性别分离现象。除交配季节外,雌雄两性个体组成的同性集群分开活动。本研究于2021年12月下旬在三江源国家公园可可西里片区以藏羚集群为单元采集了32个集群共188... 藏羚(Pantholops hodgsonii)是青藏高原特有物种,多集群生活且具有典型的性别分离现象。除交配季节外,雌雄两性个体组成的同性集群分开活动。本研究于2021年12月下旬在三江源国家公园可可西里片区以藏羚集群为单元采集了32个集群共188份新鲜粪便样品,利用多态性较高的10个微卫星位点进行亲缘关系鉴定与遗传多样性分析。结果表明:(1)188份新鲜粪便样品来自145只藏羚个体,其中10只藏羚个体(8只雌羚,2只雄羚)出现更换集群现象,导致前后集群发生变化。结合野外实地记录,推测藏羚交配群的变化存在3种方式:集群解散,雄性个体离开(加入),雌性个体离开(加入)。新加入的藏羚个体与原集群成员间的亲缘关系较远。雄性藏羚更换的集群中雌性个体均多于之前的集群,能够获得更多交配机会。(2)10个微卫星位点的平均等位基因数为16.1,平均多态信息含量为0.766。观测杂合度(Ho)0.607~0.993,平均值为0.819;期望杂合度(He)0.575~0.930,平均值为0.798,表明藏羚种群遗传多样性丰富。(3)经过亲缘关系鉴定,种群内所有亲子关系中14对(43.75%)发生在集群内并且以母女(71.43%)为主,与雄性个体相关的亲子对(母子/父女/父子)有4对(28.57%)。对比集群内及集群间藏羚的平均亲缘系数,结果表明雄性个体对集群内成员间的亲缘关系影响不大。针对集群间藏羚亲缘关系的研究结果也表明,藏羚种群的近交比例处于较低水平。由于藏羚雌性比雄性个体有更多时间和机会组成含有多个雌性成员的集群,因此,集群内雌性个体的亲缘关系较高不仅有利于提高集群的稳定性,还有利于迁徙信息的交流和传递,从而为进一步验证藏羚迁徙的集体记忆猜想提供科学佐证。 展开更多
关键词 藏羚 粪便DNA 交配群 亲缘关系 遗传多样性
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89份香蕉种质资源SRAP分子标记亲缘关系分析 被引量:1
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作者 周海琪 夏玲 +7 位作者 吕顺 曾莉莎 王芳 黄晓彦 陈东仪 刘文清 梁少丽 刘丽琴 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2024年第4期703-711,共9页
香蕉分类是一个难题,利用形态学特征进行分类已无法满足需要。分子标记技术逐渐被应用到香蕉品种(系)的种群鉴定与分类、亲缘关系分析和遗传多样性研究等方面。本研究采用SRAP分子标记技术对89份香蕉种质资源的亲缘关系进行分析。利用1... 香蕉分类是一个难题,利用形态学特征进行分类已无法满足需要。分子标记技术逐渐被应用到香蕉品种(系)的种群鉴定与分类、亲缘关系分析和遗传多样性研究等方面。本研究采用SRAP分子标记技术对89份香蕉种质资源的亲缘关系进行分析。利用10对正反引物两两组合成100对引物组合,从中筛选出扩增条带易于识别、带型清晰、多态性高的13对SRAP引物,共扩增出170条可辨认条带,平均每对引物扩增13.08条,其中表现出多态性的条带有140条,多态性比率为79.00%。89份香蕉种质资源的相似系数的变化范围在0.241~1.000之间,遗传多样性非常丰富,来源于同一个地方或者来源不同地方的同一类型的野生蕉的相似性系数较高。当相似性系数为0.49时可以将这89份香蕉资源分成六大类,包括香牙蕉、贡蕉和龙牙蕉为主的第一大类(AAA、AA、AAB基因型),粉大蕉、粉蕉和BB类野蕉为主的第二大类(ABB、BB基因型),大蕉、阿宽蕉类野蕉为主的第三大类,以及红花蕉、地涌金莲、蝎尾蕉分别所属的第四、五、六类群。其结果与现行的经典分类结论基本一致,只有部分香蕉种质分类地位有差异,说明用SRAP标记对香蕉种质资源进行分类是可行的。同时,栽培类香牙蕉、贡蕉和龙牙蕉具有相同的祖先,与AA基因型野蕉亲缘关系近,粉蕉、粉大蕉与BB基因型的野蕉亲缘关系较近,不同基因组的香蕉种质资源聚到一起,说明香蕉种质资源的起源影响后代的亲缘关系,单一的分类方法无法将香蕉种质资源完全区分。此外,大蕉与阿宽蕉亲缘关系较近,但是无法分辨大蕉是否含有A和B基因组,因此大蕉基因型和遗传背景有待进一步研究。 展开更多
关键词 香蕉 SRAP 聚类分析 亲缘关系
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基于ISSR标记分析连云港地区野生灵芝种质资源遗传多样性及亲缘关系
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作者 纪伟 苏文英 +4 位作者 刘晓梅 王一璞 任立凯 奚小艳 陈克龙 《中国农学通报》 2024年第6期128-134,共7页
为分析连云港地区野生灵芝种质资源之间的亲缘关系和多样性水平,以连云港地区15株野生灵芝为研究对象,采用ISSR分子标记进行遗传多样性及亲缘关系分析。15株野生灵芝中扩增出多态性条带为40条,片段大小在250~2000 bp之间,平均等位基因位... 为分析连云港地区野生灵芝种质资源之间的亲缘关系和多样性水平,以连云港地区15株野生灵芝为研究对象,采用ISSR分子标记进行遗传多样性及亲缘关系分析。15株野生灵芝中扩增出多态性条带为40条,片段大小在250~2000 bp之间,平均等位基因位点1.8个,平均有效等位基因数1.2454,平均Nei's遗传多样性0.1742,平均Shannon信息指数0.2925,有效等位基因数(Ne)的变化范围为1.0000~1.6423,Nei's遗传多样性(He)的变化范围为0.1031~0.3911,Shannon信息指数(I)的变化范围为0.2235~0.5799,根据ISSR分子标记的遗传聚类图,15株灵芝相似系数范围在0.415~0.866之间,相似系数为0.63时,可以将15株野生灵芝分为四组。研究结果为连云港地区灵芝种质资源分类、保护和品种创制提供了参考依据。 展开更多
关键词 灵芝 简单序列重复区间 遗传多样性 聚类分析 亲缘关系
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高温越夏日本大葱种质表型性状差异及亲缘关系研究
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作者 王树勇 李彩霞 +3 位作者 杨文霞 董小暖 肖万里 苗锦山 《蔬菜》 2024年第10期35-41,共7页
为了鉴定、筛选出越夏高产大葱种质并用于耐高温品种改良和选育,以42份日本大葱种质为试材,采用形态鉴定方法,在塑料大棚环境下研究了经高温越夏后种质的表型性状差异和亲缘关系远近,并用隶属函数法对初筛种质进行综合评价。结果表明:4... 为了鉴定、筛选出越夏高产大葱种质并用于耐高温品种改良和选育,以42份日本大葱种质为试材,采用形态鉴定方法,在塑料大棚环境下研究了经高温越夏后种质的表型性状差异和亲缘关系远近,并用隶属函数法对初筛种质进行综合评价。结果表明:42份种质单株质量、株高、假茎质量、假茎长、假茎直径、叶长、叶扁宽、宿存叶片数、假茎指数和叶形指数10个数量性状的变异范围为10.50%~38.60%,平均值为19.62%。其中,假茎质量和单株质量变异系数较高,分别为38.60%和37.23%。经聚类分析将42份种质聚为1个高细类型、1个矮细类型、2个矮粗类型亚组共计4个组群,组群间性状差异显著。采用隶属函数法对高细类型、矮粗类型第1亚组14份种质进行种质综合评价,排名为喜太郎晚抽、玖源晚抽、什全一本、夏力源、成田一本、智荣、玖美、咏秀、荣辉、金春一本、卡曼、盛源泰32号、川田一本和揽胜。该研究从形态学角度解析了越夏日本大葱种质遗传差异,明确了不同资源亲缘关系远近,为越夏大葱种质筛选和优势杂交育种亲本选择提供了依据。 展开更多
关键词 塑料大棚 高温越夏 日本大葱种质 形态性状 隶属函数法 亲缘关系 杂交育种
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分化与融合:晋西南先秦人群颅骨形态的亲缘关系矩阵模型分析
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作者 凌亮优 李楠 《考古与文物》 CSSCI 北大核心 2024年第10期121-128,共8页
本文利用亲缘关系矩阵模型对852例先秦时期颅骨数据进行分析,将晋西南地区人群遗传结构演化划分为三个阶段:西周时期,该地区存在数支不同人群,其中包括来自北方狄人与中原商人的遗传成分;春秋时期,区域人群交融与文化整合同步,狄人遗传... 本文利用亲缘关系矩阵模型对852例先秦时期颅骨数据进行分析,将晋西南地区人群遗传结构演化划分为三个阶段:西周时期,该地区存在数支不同人群,其中包括来自北方狄人与中原商人的遗传成分;春秋时期,区域人群交融与文化整合同步,狄人遗传成分流入增加;战国时期,该地区居民主要延续了本土遗传成分,但在部分遗址也显示出强烈的关中秦人影响,可能与该时期秦人的东扩有关。亲缘关系矩阵模型揭示了晋西南先秦人群演化与历史进程的关联,提供了先秦人群融合的体质人类学证据。 展开更多
关键词 晋西南 先秦时期 亲缘关系矩阵模型 颅骨形态学
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基于GBS测序技术分析云上黑山羊主配公羊亲缘关系及近交系数
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作者 李子健 江炎庭 +4 位作者 兰蓉 朱兰 叶朗惠 龚翔 欧阳依娜 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期3447-3460,共14页
[目的]探究云上黑山羊主配公羊的亲缘关系及近交系数,构建肉羊高效联合育种体系,提升云上黑山羊生产性能和可持续发展力。[方法]采用简化基因组测序(genotyping-by-sequencing,GBS)技术对云上黑山羊5个核心育种场(XD、ZY、ML、SB、TJ)的... [目的]探究云上黑山羊主配公羊的亲缘关系及近交系数,构建肉羊高效联合育种体系,提升云上黑山羊生产性能和可持续发展力。[方法]采用简化基因组测序(genotyping-by-sequencing,GBS)技术对云上黑山羊5个核心育种场(XD、ZY、ML、SB、TJ)的100只主配公羊进行测序,并使用BWA、SAMTOOLS、PLINK v 1.90、Gmatrix v 2、Mega X等软件进行质控后高质量单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点鉴定、主成分分析(PCA)、状态同源距离矩阵(identical by state,IBS)和G矩阵构建、群体进化树分析、亲缘系数计算及近交系数估计。[结果]GBS质控后共获得215926个高质量SNPs位点;共检测到8692条连续性纯合片段(runs of homozygosity,ROH),长度在10.59~591.23 Mb之间,平均长度245.74 Mb。云上黑山羊主配公羊群体平均IBS遗传距离为0.118±0.011,亲缘关系G矩阵结果与IBS距离矩阵结果一致。结合群体进化树和亲缘关系分析,100只云上黑山羊被分为三大支和28个家系,其中家系2、11、13、14、16、17、18、20、23、24、25仅有1只公羊,XD、ZY、ML、SB、TJ核心育种场分别有18、10、8、5和8个家系;基于ROH的群体平均基因组近交系数为0.099641,29只公羊的近交系数<0.0625,39只公羊的近交系数在0.0625~0.125之间,32只公羊近交系数>0.125,存在较大的近交累积。[结论]100只云上黑山羊主配公羊被分为28个家系,其中11个家系仅有1只公羊,应加强繁育防止其血统的流失,配种方案制定中应关注近交系数>0.125的个体,防止近交衰退,同时根据不同的育种目标合理进行种公羊的交换。 展开更多
关键词 云上黑山羊主配公羊 简化基因组测序(GBS) 亲缘关系 近交系数
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凌云牛心李DNA条形码基因筛选及其亲缘关系分析
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作者 滕峥 杨翠凤 +2 位作者 侯宪斌 刘正鲁 冯邦朝 《中国南方果树》 北大核心 2024年第3期200-205,共6页
ITS、mat K及rbc L是植物常用DNA条形码基因(序列)。为筛选适合凌云牛心李的DNA条形码基因,对9份凌云牛心李种质进行ITS、mat K及rbc L序列PCR扩增和序列比对分析。通过序列比对分析,9份凌云牛心李种质ITS序列长度在713~717 bp之间,G+C... ITS、mat K及rbc L是植物常用DNA条形码基因(序列)。为筛选适合凌云牛心李的DNA条形码基因,对9份凌云牛心李种质进行ITS、mat K及rbc L序列PCR扩增和序列比对分析。通过序列比对分析,9份凌云牛心李种质ITS序列长度在713~717 bp之间,G+C含量59.33%~60.95%之间,存在27个变异位点;mat K序列长度为935~937 bp之间,G+C含量33.33%~33.55%之间,存在5个变异位点;rbc L序列长度为743 bp,G+C含量在42.20%~43.07%之间,存在3个变异位点。相对于mat K及rbc L序列,ITS序列进化速率较快,存在更为丰富的遗传变异位点,更适宜用来开展凌云牛心李分子鉴定及亲缘关系分析。基于ITS序列构建了9份凌云牛心李、22份其他地区李种质、5份杏种质和5份梅种质的NJ系统进化树,凌云牛心李与其他李种质亲缘关系较近,其中4份凌云牛心李种质与中国宁波的茄皮李及日本的大石早生李聚为一个类群,另5份凌云牛心李种质与中国嘉兴的槜李、中国山东的玉皇李、中国贵州的九阡李聚为一个分支。凌云牛心李作为地方优质李品种,在长期种植过程中产生了较丰富的遗传变异。 展开更多
关键词 凌云牛心李 DNA条形码 亲缘关系
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基于EST-SSR分子标记的萱草亲缘关系分析
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作者 赵玉帆 储博彦 +3 位作者 刘素素 赵丽红 李金霞 尹新彦 《天津农业科学》 CAS 2024年第2期1-4,10,共5页
萱草是极具观赏价值的多年生宿根草本植物,在我国具有悠久的栽种历史。为了探明36个萱草品种间的亲缘关系,利用毛细管电泳荧光标记技术对36个萱草品种进行了EST-SSR分子标记检测,利用11对多态性良好的引物对36份供试萱草材料进行PCR扩... 萱草是极具观赏价值的多年生宿根草本植物,在我国具有悠久的栽种历史。为了探明36个萱草品种间的亲缘关系,利用毛细管电泳荧光标记技术对36个萱草品种进行了EST-SSR分子标记检测,利用11对多态性良好的引物对36份供试萱草材料进行PCR扩增。结果显示:11对引物共获得40个多态性位点,样本平均有效等位基因数为2.58个,平均Shannon多样性指数为1.00,平均期望杂合度为0.57,平均观察杂合度为0.52;以遗传距离矩阵为分析对象,36个萱草品种间的遗传距离为0.05~0.70,利用NTSYS软件按UPGMA法聚类结果显示,遗传距离0.48为阈值时,36种萱草品种分为2个大类,遗传距离0.414为阈值时,可进一步将第1大类分为4个亚类。综上,供试的36个萱草品种之间具有较高的遗传多样性和较为丰富的遗传背景,为今后培养萱草优良新品种提供了一定的理论依据。 展开更多
关键词 萱草 EST-SSR分子标记 亲缘关系
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“断亲”还是“疏亲”:当代农村青年的亲缘关系状况
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作者 余水 《广西青年发展研究》 2024年第5期26-32,65,共8页
自“断亲”概念被提出以来,青年“断亲”成为近年来网络上热议的话题,但用“断亲”来描述当代青年亲缘关系的准确度有待商榷。“疏”相对于“断”表示程度更浅,既有血缘关系的日渐淡薄,也有渐行渐远、似断非断的意味,更符合青年群体的... 自“断亲”概念被提出以来,青年“断亲”成为近年来网络上热议的话题,但用“断亲”来描述当代青年亲缘关系的准确度有待商榷。“疏”相对于“断”表示程度更浅,既有血缘关系的日渐淡薄,也有渐行渐远、似断非断的意味,更符合青年群体的实际状况。文章结合农村青年亲缘关系现状调查,提出青年“疏亲”是带有乡土特性的、是相对的而非绝对的、是阶段性的而非长期性的、是全年龄段的而非青年独有的等特征,呼吁社会大众对青年“疏亲”给予更多的理解,理性看待这一现象。 展开更多
关键词 农村青年 “断亲” “疏亲” 亲缘关系 社会变迁
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常用亲缘关系指数的通用计算公式
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作者 肖超 黄代新 《法医学杂志》 CAS CSCD 2023年第3期276-282,共7页
目的推导常用亲缘关系指数的通用计算公式。方法通过引入克罗内克符号,将不同基因型组合下同一亲缘关系指数的计算公式归纳为统一表达式。结果成功推导出多种鉴定情形下亲缘关系指数的通用公式,包括单方生母不参与或参与时两个体间的亲... 目的推导常用亲缘关系指数的通用计算公式。方法通过引入克罗内克符号,将不同基因型组合下同一亲缘关系指数的计算公式归纳为统一表达式。结果成功推导出多种鉴定情形下亲缘关系指数的通用公式,包括单方生母不参与或参与时两个体间的亲权指数、全同胞关系指数、半同胞关系指数、叔侄关系指数、祖孙关系指数、一级堂表亲关系指数和二级堂表亲关系指数,生母不参与或参与时祖父母与孩子间的祖孙关系指数,双方生母均参与时两孩子间的半同胞关系指数,三孩子间的全同胞关系指数,以及生母不参与、单方生母参与或双方生母均参与时三孩子间的半同胞关系指数。结论本研究给出的通用公式简化了亲缘关系指数的计算,便于通过编程实现快速准确计算。 展开更多
关键词 法医遗传学 公式 亲缘关系指数 亲缘关系鉴定 亲权指数 克罗内克符号
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萝卜种质亲缘关系的分子标记分析 被引量:3
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作者 刘辰 付卫民 +3 位作者 刘贤娴 徐文玲 郭栋 王淑芬 《山东农业科学》 北大核心 2023年第3期22-29,共8页
本研究以118个分子标记在108份萝卜种质中进行筛选,得到56个带型清晰、多态性好的标记用于亲缘关系分析。用这56个标记共扩增出130条多态性条带,每个标记2~5条,平均2.3条;观测等位基因数的平均值为2.3214,有效等位基因数的平均值为1.864... 本研究以118个分子标记在108份萝卜种质中进行筛选,得到56个带型清晰、多态性好的标记用于亲缘关系分析。用这56个标记共扩增出130条多态性条带,每个标记2~5条,平均2.3条;观测等位基因数的平均值为2.3214,有效等位基因数的平均值为1.8643,Nei基因多样性指数的平均值为0.4573,Shannon多态性指数的平均值为0.6766,PIC值介于0.29~0.55之间。UPGMA聚类和PCA分析结果较为一致,在遗传相似系数为0.61处可将108份种质分为4大类,黑皮白肉萝卜、樱桃萝卜、心里美类型萝卜种质各聚为一类,其余种质聚为一类,表明萝卜种质亲缘关系与肉质根皮色、肉质色、大小的联系较密切。 展开更多
关键词 萝卜 亲缘关系 分子标记 遗传多样性 聚类分析
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