肾脏移植受者非结核分枝杆菌病临床诊疗指南

近年来,非结核分枝杆菌(NTM)感染呈快速增多趋势,受到广泛关注。肾脏移植受者由于免疫抑制药物等因素的影响,其NTM的感染率升高更为明显,但是由于缺乏充分的研究基础,肾脏移植术后NTM的诊治缺乏规范指引。为进一步规范我国肾脏移植受者NTM病的诊断和治疗,提高我国器官移植领域医务工作者对NTM病的认识和诊治水平,中华医学会器官移植分会组织相关专家,参考美国胸科协会及欧洲呼吸协会发布的最新版《非结核分枝杆菌病治疗指南》,我国《非结核分枝杆菌病诊断与治疗专家共识》《器官移植受者非结核分枝杆菌病临床诊疗技术规范(2019版)》等,结合肾脏移植受者的特点,进行指南制订。

非结核分枝杆菌肺病的临床研究进展

非结核分枝杆菌（non-tuberculous Mycobacteria,NTM）是指除MTB、牛分枝杆菌、非洲分枝杆菌和田鼠分枝杆菌等MTB复合群及麻风分枝杆菌以外的分枝杆菌总称。迄今为止,共发现NTM菌种154种和13个亚种,其中大部分为腐物寄生菌,仅少部分NTM对人体致病,可侵犯肺脏、淋巴结、骨骼、关节、皮肤和软组织等组织和器官,并可引起全身播散性疾病。

从血液中分离出一株偶发分枝杆菌

非结核分枝杆菌（nontuberculous mycobacteria,NTM）是指除了MTB复合群和麻风分枝杆菌以外的分枝杆菌。到目前为止,共发现154种NTM,且有增加趋势。Runyon根据菌落色素与生长速度将NTM分为四组,其中Ⅳ组在固体培养基上生长7d内可见菌落,为快速生长分枝杆菌（rapidly growing mycobacteria,RGM）,包括脓肿分枝杆菌、龟分枝杆菌、偶发分枝杆菌、耻垢分枝杆菌和草分枝杆菌等。

肺外非结核分枝杆菌病的临床特点和诊断

非结核分枝杆菌（non-tuberculosis mycobacteria,NTM）是分枝杆菌属内除结核分枝杆菌（mycobacterium tuberculosis,MTB）复合群和麻风分枝杆菌以外的其他分枝杆菌。可以侵犯人体肺脏、淋巴结、骨骼、关节、皮肤和软组织等组织器官,并可引起全身播散性疾病。发生于肺部以外组织器官的NTM病统称为肺外NTM病。近年来,随着NTM病呈快速增多趋势,肺外NTM病的报道也日益增多。

肺部非结核分枝杆菌感染

非结核分枝杆菌(NTM)代表已被从土壤和水中分离出的一群广泛的生物体,暴露于这些细菌被认为是人类感染的源泉。过去的10年里,由于新的、更敏感的分子生物学实验技术应用于NTM菌种鉴定,不仅新的NTM物种显著的增加,而且NTM的分离频率也有所增加。目前有超过140种NTM,其中至少40种与肺内感染相关(表1)1。随着NTM分离率的增加和新物种的丰富,当1个病人呼吸道样本的中有NTM菌种生长时,临床医生越来越多的面临着确定怎样的临床治疗方案。这篇文章将会试图讨论我们几乎每天都会被我们的同事(往往是我们的病人)问及的3个重要问题:1)NTM感染在增长吗,如果是,原因是什么?2)如果我的病人真的有NTM肺病,我如何知道?3)我需要治疗我的病人吗?如果需要,怎么治疗?通过阐述上述每一个问题,我们希望用一些有用的信息武装临床医生,让他们更好理解并与治疗感染的困难斗争。

四川省2022年入学新生结核分枝杆菌潜伏感染与肺结核患病情况分析

目的:对2022年四川省入学新生结核病体检情况进行汇总和分析,了解全省入学新生结核分枝杆菌潜伏感染(latent tuberculosis infection,LTBI)与结核病患病情况,为学校新生入学结核病检查工作开展提供理论依据。方法:从四川省学籍管理系统中获得2022年全省各级各类学校入学新生基本信息,制作《2022年秋季新生入学结核病体检信息表》,建立数据库,采用描述性统计分析方法,分析新生入学结核病检查中结核病患者及LTBI者检出情况及其流行病学特征,追踪LTBI者接受预防性治疗及完成情况。结果:2022年四川省各级各类学校入学新生2787900名规范开展结核病体检,占全部新生的97.69%(2787900/2853817),发现活动性肺结核患者247例,检出率为8.86/10万(247/2787900)。其中,女性患病率为10.11/10万(145/1434131),高于男性[7.18/10万(102/1419686)],差异有统计学意义(χ^(2)=7.058,P<0.01)。四川省1790830名入学新生开展了LTBI检测,感染率为3.09%(55313/1790830)。符合预防性治疗条件的单纯结核菌素皮肤试验强阳性/重组结核分枝杆菌融合蛋白(EC)或γ-干扰素释放试验阳性者8104例中,13.73%(1113/8104)接受了预防性治疗,925例完成了全疗程,完成治疗率为83.11%,未完成治疗的新生中有2例在治疗期间转为活动性结核病。结论:四川省2022年入学新生体检率高,但LTBI检出率较低,接受预防性治疗率不高。

β-内酰胺酶抑制剂联合不同β-内酰胺类抗生素对耐多药结核分枝杆菌临床菌株体外活性研究

目的体外评估5种β-内酰胺类抗生素和不同β-内酰胺酶抑制剂组合对耐多药结核分枝杆菌(MDR-TB)活性的影响,以期发现针对耐多药结核病最有效的β-内酰胺类抗生素和β-内酰胺酶抑制剂组合。方法选取2021年河南省耐药监测项目收集的MDR-TB菌株,使用最小抑菌浓度(MIC)法测定5种β-内酰胺类抗生素或联合β-内酰胺酶抑制剂对临床MDR-TB的MIC值,并采用聚合酶链式反应(PCR)和DNA测序法分析菌株的bla C突变情况。结果共纳入105株MDR-TB,MIC检测结果显示,多尼培南对MDR-TB抗菌活性最高,其MIC 50值为16μg/mL。与β-内酰胺酶抑制剂联合后,大部分β-内酰胺类抗生素的MIC值明显下降。共有13.33%(14株)的菌株存在bla C基因的突变,主要为3种核苷酸替代突变,分别为AGT333AGG、AAC638ACC、ATC786ATT。BlaC蛋白Ser111Arg和Asn213Thr与同义单核苷酸突变相比,增强了克拉维酸/舒巴坦与美罗培南对MDR-TB的协同作用。结论多尼培南和舒巴坦组合对MDR-TB具有最强的抗菌活性。而BlaC蛋白Ser111Arg和Asn213Thr的替代突变使MDR-TB对美罗培南的敏感性在克拉维酸/舒巴坦协同时增强。

重组结核杆菌融合蛋白在肺结核密切接触者中筛查结核分枝杆菌感染效果分析

目的:探讨重组结核杆菌融合蛋白(recombinant mycobacterium tuberculosis fusion protein,EC)皮肤试验在筛查肺结核患者密切接触者结核分枝杆菌感染中的实用性和有效性,为进一步优化结核感染检测提供技术建议,了解密切接触者结核分枝杆菌潜伏感染(LTBI)现状。方法:2023年10月23日至11月14日在上海市奉贤区和金山区共选取140名肺结核密切接触者作为研究对象,对每名研究对象同时采用γ-干扰素释放试验(IGRA)和EC皮肤试验进行结核感染检测,采用Kappa值检验两种方法结果一致性,采用χ^(2)检验比较两组检测方法之间的差异,以P<0.05为差异有统计学意义。结果:140名研究对象,包括男性55例,女性85例;IGRA阳性率为15.00%(21/140),EC皮肤试验阳性率为14.29%(20/140),两种试验方法一致性检验Kappa值为0.857,差异无统计学意义(χ^(2)=0.029,P=0.866),两种检测方法检测结果为高度一致性;以IGRA作为结核感染的参考标准,EC皮肤试验的敏感度为85.71%(18/21)、特异度为98.32%(117/119)、阳性预测值为90.00%(18/20)、阴性预测值为97.50%(117/120);男性EC阳性率(32.73%,18/55)明显高于女性(2.35%,2/85),差异有统计学意义(χ^(2)=17.983,P<0.001)。结论:EC皮肤试验具有较强的特异性,可用于肺结核密切接触者结核分枝杆菌感染筛查,但受限于使用年龄和接种禁忌证,可采用IGRA对无法进行EC皮肤试验者进行补充检测。

tNGS在分枝杆菌病诊断中的价值

目的 探讨tNGS检测技术在诊断分枝杆菌病中的应用价值。方法 对137例疑诊分枝杆菌病的患者行纤支镜检查,支气管肺泡灌洗液BALF样本送检tNGS检测、分枝杆菌培养+菌种鉴定检查,比较两种检测方法的阳性率。结果 通过tNGS检测圣乔治诺卡菌3例。134例分枝杆菌病患者,tNGS对分枝杆菌检测阳性率86.57%,分枝杆菌培养阳性率78.36%,差异没有统计学意义(P>0.05)。对于NTM病检测的tNGS阳性率80.53%,分枝杆菌培养阳性率83.19%;对于活动性结核病,tNGS检测阳性率为100%,分枝杆菌培养阳性率47.6%。tNGS与分枝杆菌培养菌种鉴定应用于分枝杆菌病、NTM病检测报告一致或为同一分枝杆菌复合群仅分别占比58.4%及61.9%,单独应用tNGS对病患做出病原学诊断仍存在假阳性或假阴性可能。结论 tNGS技术逐渐成熟,在临床广泛使用,在鉴定分枝杆菌菌种、鉴别“涂片抗酸染色阳性”的病原体,有较高的参考价值,在确定病原体的诊断时应结合患者病史、临床症状、检查结果等综合分析。

4种实验室检测技术对肺外结核病成人患者非呼吸道标本中结核分枝杆菌检出率对比观察

目的 对比观察结核菌荧光染色、环介导等温扩增技术(LAMP)、利福平耐药实时荧光定量核酸扩增技术(Xpert MTB/RIF)、全自动分枝杆菌液体培养检测技术(BACTEC MGIT 960)诊断成人肺外结核病非呼吸道标本结核分枝杆菌(MTB)的效能。方法 收集2019年1月—2021年12月确诊为肺外结核病患者的非呼吸道标本317例份(组织155例份、尿液52例份、胸水47例份、脓液41例份、脑脊液22例份),分别采用荧光染色、LAMP、BACTEC MGIT 960、Xpert MTB/RIF检测,比较各检测技术检测同一种非呼吸道标本的MTB检出率。结果 LAMP、Xpert MTB/RIF、BACTEC MGIT 960、荧光染色的MTB检出率分别为72.6%、70.3%、48.3%、22.7%。在组织标本中的MTB检出率差异具有统计学意义(P<0.05),表现为LAMP和Xpert MTB/RIF检出率最高,其次为BACTEC MGIT960,荧光染色检出率最低;在尿液标本中的MTB检出率差异具有统计学意义(P均<0.05),表现为LAMP和Xpert MTB/RIF检出率最高,其次为BACTEC MGIT 960和荧光染色;在胸水标本中的MTB检出率差异具有统计学意义(P均<0.05),表现为LAMP和Xpert MTB/RIF检出率较高,其次为BACTEC MGIT 960,荧光染色最低;在脓液标本中的MTB检出率差异具有统计学意义(P均<0.05),表现为LAMP和Xpert MTB/RIF检出率较高,其次为BACTEC MGIT960,荧光染色最低;在脑脊液标本中的MTB检出率差异具有统计学意义(P均<0.05),表现为LAMP、Xpert MTB/RIF和BACTEC MGIT 960检出率较高,荧光染色最低。245例荧光染色阴性的标本中,LAMP、BACTEC MGIT 960和Xpert MTB/RIF的MTB检出率分别为66.1%、39.2%和63.7%,LAMP和Xpert MTB/RIF在涂阴标本中的检出率差异无统计学意义,但均高于BACTEC MGIT 960(P均<0.05)。126例标本为Xpert MTB/RIF和BACTEC MGIT 960同时阳性,两种方法检测利福平耐药性统计分析发现,Kappa值为0.829,P<0.05。结论 LAMP和Xpert MTB/RIF诊断人肺外结核病非呼吸道标本MTB灵敏度和特异度高,同时具有检测速度快的优势;荧光染色特异度高,但灵敏度低;BACTEC MGIT 960和Xpert MTB/RIF对利福平药敏的一致性强,但培养时间长,后续能得到药物种类多,对临床治疗在药物选择性上高。

耻垢分枝杆菌致慢性化脓性中耳炎1例

耻垢分枝杆菌(Mycobacterium smegmatis)是快速生长的非结核分枝杆菌(nontuberculous mycobacteria,NTM),可引起皮肤软组织感染、导管相关性血流感染、整形和美容术后感染等。该文报道1例耻垢分枝杆菌致慢性化脓性中耳炎患者的临床诊疗经过,以提高临床医师及其检验人员对其认识与掌握水平,及时明确病原学诊断。

云南省昭通地区结核分枝杆菌临床分离株遗传多样性和耐药分子特征

目的调查云南省昭通地区结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)临床分离株的遗传多样性和耐药分子特征。方法2022年9月—2023年8月从昆明医科大学附属昭通医院收治的298例涂阳肺结核患者中共采集了MTB 298株,用MeltPro TB测定法通过荧光聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)熔解曲线法鉴定所有分离株。用多色熔解曲线分析技术进行间隔区寡核苷酸分型(interval oligonucleotide typing,Spoligotyping)。用分枝杆菌散布重复单元(mycobcterial interspersed repetitive units,MIRU)-可变数目串联重复序列分型(variable number of tandem repeat typing,VNTR)(MIRU-VNTR)24位点分型法进行基因分型。使用PCR和靶向测序检测耐药基因突变。结果北京菌株占所有MTB菌株的69.80%(208/298)。其他谱系包括T、LAM、MANU2、CAS、NEW-1和SITVITWEB数据库中未发现的孤儿型,分别占5.70%(17/298)、3.36%(10/298)、0.67%(2/298)、0.34%(1/298)、8.39%(25/298)及11.74%(35/298)。北京菌株对左氧氟沙星的耐药率略高于非北京菌株(P=0.042),而北京菌株与非北京菌株2种基因型菌株对异烟肼、利福平、乙胺丁醇、链霉素、吡嗪酰胺、卡那霉素耐药率差异无统计学意义(P>0.05)。MIRU-VNTR 24位点分型分析结果显示,33个菌株可分为13株聚类,其聚类率为39.39%。每个等位基因的Hunter-Gaston指数在0~0.814之间,其中18个位点对非北京菌株具有中高鉴别能力。但只有10个位点对北京菌株具有中高鉴别能力。结论MTB菌株在中国云南省昭通地区表现出较高的遗传多样性,北京菌株是MTB和耐药结核病菌株的优势谱系。

高负担地区肺结核密切接触者中结核分枝杆菌潜伏感染者预防性治疗接受意愿及影响因素研究

目的:了解高负担地区肺结核密切接触者中结核分枝杆菌潜伏感染者预防性治疗接受意愿情况及其影响因素,为新疆维吾尔自治区结核分枝杆菌潜伏感染者预防性治疗工作的政策制定提供依据。方法:采用横断面调查研究,选取2021年8月1日至2022年12月31日新疆维吾尔自治区阿克苏地区阿瓦提县、乌什县确诊的肺结核患者3023例作为指示病例,对指示病例的6407名密切接触者进行结核分枝杆菌潜伏感染筛查,判定结核分枝杆菌潜伏感染者529例,对其进行预防性治疗接受意愿问卷调查,收集人口特征、生活习惯、居住环境、接触信息、健康状况及接受意愿等信息,回收有效问卷516份。以预防性治疗接受意愿为因变量构建binomial-logit链接广义线性模型,分析预防性治疗接受意愿情况的影响因素。结果:497例愿意接受预防性治疗,接受率为96.32%(497/516)。与指示病例不共同居住的结核分枝杆菌潜伏感染者更容易接受预防性治疗(OR=5.713,95%CI:1.477~22.097),除指示病例外未接触其他结核病患者的结核分枝杆菌潜伏感染者更容易拒绝预防性治疗(OR=0.142,95%CI:0.039~0.516)。结论:高负担地区肺结核密切接触者的结核分枝杆菌潜伏感染者对预防性治疗的接受意愿较高,其接受意愿受自身经济水平和与肺结核患者接触情况影响。

结核分枝杆菌游离DNA检测在肺外结核诊断中的价值

目的探讨结核分枝杆菌(MTB)游离DNA(cfDNA)检测技术在肺外结核诊断中的应用价值。方法选取2021年7月至2022年12月该院收治的高度疑似肺外结核患者266例作为研究对象,根据临床诊断结果,分为肺外结核组117例和非结核组149例。所有患者均采集脑脊液、胸腔积液、尿液及血液标本,并同时进行MTB cfDNA检测、结核分枝杆菌及利福平耐药快速检测(GeneXpert MTB/RIF)、涂片抗酸染色及血液标本结核感染T细胞γ干扰素释放试验(TB-IGRA)。通过分析4种检测方法的效能指标评估MTB cfDNA检测技术在肺外结核病诊断中的临床价值。结果MTB cfDNA检测法对脑脊液、胸腔积液、尿液中MTB的检出率均显著高于涂片抗酸染色(χ^(2)=5.714、9.289、9.226,P=0.017、0.002、0.002)。虽然MTB cfDNA检测法对脑脊液、尿液中MTB的检出率高于GeneXpert MTB/RIF,但差异无统计学意义(χ^(2)=0.143,P=0.705;χ^(2)=0.648,P=0.421);MTB cfDNA检测法对胸腔积液中MTB的检出率显著高于GeneXpert MTB/RIF(χ^(2)=4.222,P=0.040)。在肺外结核组,MTB cfDNA检测法的MTB检出率为26.50%(31/117),显著高于GeneXpert MTB/RIF[15.38%(18/117)]和涂片抗酸染色[3.42%(4/117)],差异均有统计学意义(χ^(2)=4.362,P=0.037;χ^(2)=24.492,P<0.05);而TB-IGRA的MTB检出率为72.65%(85/117),显著高于MTB cfDNA检测(χ^(2)=49.850,P<0.001)。MTB cfDNA检测法的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值分别为26.50%、100.00%、100.00%、63.40%,其灵敏度显著高于GeneXpert MTB/RIF(15.38%)和涂片抗酸染色(3.42%),但低于TB-IGRA(72.65%),差异均有统计学意义(P<0.05)。结论MTB cfDNA检测在肺外结核诊断中具有较高的灵敏度及特异度,故MTB cfDNA检测在肺外结核诊断中具有较好的应用前景。

非结核分枝杆菌肺病患者的临床特征及治疗转归相关因素分析

目的分析台州市非结核分枝杆菌肺病(nontuberculous mycobacterial pulmonary disease,NTM-PD)患者的临床特征及治疗转归相关因素,为NTM-PD的管理和诊治提供参考依据。方法回顾性分析于2016年1月至2021年12月在浙江省台州医院确诊的167例NTM-PD患者的临床特征。比较分析83例鸟分枝杆菌复合群肺病(Mycobacterium avium complex pulmonary disease,MAC-PD)患者治愈组和失败组在临床特征上的差异。结果167例NTM-PD患者中检测到的主要为MAC-PD,占94.6%,其中88例得到治疗,治愈率47.7%。与治愈组比较,失败组患者在体质量指数(body mass index,BMI)≤18.5kg/m^(2)、抗酸涂片阳性、合并结核病史、有纤维空洞和未规范治疗等方面差异有统计学意义(P<0.05)。结论台州市NTM-PD患者以MAC-PD最为常见,BMI≤18.5kg/m^(2)、抗酸涂片阳性、合并结核病史、有纤维空洞和未规范治疗的MAC-PD患者的治疗难度更大。

风湿免疫病患者结核分枝杆菌潜伏感染率及相关影响因素的多中心横断面研究

目的:以结核感染T细胞斑点试验(T-SPOT.TB)检测作为筛查结核分枝杆菌潜伏感染(latent tuberculosis infection,LTBI)的工具,调查我国风湿免疫病患者结核分枝杆菌潜伏感染率,并分析影响T-SPOT.TB检测结果的相关因素。方法:纳入自2014年9月至2016年3月我国东、中、西部13家三级甲等综合医院接诊的风湿免疫病患者作为研究对象,共计3715例。应用T-SPOT.TB对研究对象进行LTBI筛查。收集研究对象的基本信息,包括性别、年龄、地区、体质量指数、病程、吸烟史、基础疾病、结核病患者密切接触史、结核病既往史,以及糖皮质激素、免疫抑制剂及生物制剂的使用情况,实验室化验结果,风湿免疫病诊断结果等。采用单因素及多因素logistic回归模型分析影响T-SPOT.TB检测结果的因素。结果:3715例研究对象T-SPOT.TB检测阳性者有672例(18.1%,95%CI:16.9%~19.3%)。不同风湿免疫病病种患者T-SPOT.TB检测阳性率差异有统计学意义(χ^(2)=79.003,P<0.001),白塞综合征患者检测阳性率最高(44.4%,32/72),混合性结缔组织病患者检测阳性率最低(8.9%,4/45)。男性风湿免疫病患者T-SPOT.TB检测阳性率为23.6%(168/711),明显高于女性(16.8%,504/3004),差异有统计学意义(χ^(2)=18.213,P<0.001)。不同年龄组风湿免疫病患者T-SPOT.TB检测阳性率差异有统计学意义(χ^(2)=67.189,P<0.001),51~60岁组检测阳性率最高(24.8%,143/577),16~20岁组检测阳性率最低(8.1%,13/160)。多因素logistic回归分析显示:年龄≥41岁(aOR=1.81,95%CI:1.48~2.23),吸烟≥21支/d(aOR=1.66,95%CI:1.15~2.40),有结核病既往史(aOR=3.88,95%CI:2.71~5.57),患白塞综合征(aOR=3.00,95%CI:1.70~5.28)是T-SPOT.TB检测阳性结果的独立相关因素;使用大剂量激素(aOR=0.67,95%CI:0.47~0.96)或生物制剂(aOR=0.55,95%CI:0.36~0.84),淋巴细胞计数偏低(aOR=0.39,95%CI:0.25~0.62),低蛋白血症(aOR=0.72,95%CI:0.52~0.99),以及患多发性肌炎/皮肌炎(aOR=0.54,95%CI:0.29~0.99)、系统性红斑狼疮(aOR=0.75,95%CI:0.57~0.99)是T-SPOT.TB检测阴性结果的独立相关因素。结论:风湿免疫病患者总体结核分枝杆菌潜伏感染率为18.1%,各病种T-SPOT.TB检测阳性率差异明显。当患者有大剂量糖皮质激素、生物制剂的使用,淋巴细胞计数偏低,低蛋白血症,以及罹患系统性红斑狼疮时警惕假阴性结果。

四种重要致病性分枝杆菌DHPLC检测鉴别方法的建立

目的运用多重核酸扩增（PCR）联合变性高效液相色谱（denaturing high-performance liquid chromatography,DHPLC）分析技术原理,针对结核分枝杆菌、牛分枝杆菌、禽分枝杆菌以及副结核分枝杆菌建立多重PCR-DHPLC快速检测方法,实现同时检测鉴别四种重要致病性分枝杆菌。方法根据四种分枝杆菌特异基因序列分别设计菌种特异核酸扩增引物,通过筛选优化试验建立四重核酸扩增体系,对核酸扩增产物采用DHPLC设备进行检测分析,每一菌种的核酸扩增产物分别形成DHPLC特征峰图。对结核分枝杆菌等51株分枝杆菌标准株和分离株样品以及沙门氏菌等22株常见微生物样品进行特异性检测试验 对四种分枝杆菌特异的核酸扩增产物分别制备克隆质粒,通过对梯度稀释的阳性质粒的检测试验,进行多重PCR-DHPLC灵敏度测试 对疑似病人痰液样品和疑似发病牛的组织样品进行检测,并与细菌分离培养法进行比较以验证临床检测效果。结果该方法能快速检测鉴别上述四种分枝杆菌,检测灵敏度达到102~103基因拷贝,从131份疑似病人临床样品中检出91份结核分枝杆菌阳性,从40份来自疑似发病牛群的临床样品中检出31份牛分枝杆菌阳性,检出率均高于细菌分离培养法。结论研究表明所建立的多重PCR-DHPLC方法能快速检测鉴别四种重要致病性分枝杆菌,为人畜结核、副结核病诊断提供一种新型分子生物学技术手段。

河南省胞内分枝杆菌临床分离株耐药特征及基因分型

目的:分析河南省胞内分枝杆菌临床分离株的耐药及基因分型。方法:收集68株2019年河南省部分地市结核病专科医院痰标本分离的胞内分枝杆菌,采用微孔板法测定其对16种药物的敏感性,用16位点VNTR方法进行基因分型,并用BioNumerics软件对分型数据进行聚类分析。结果:68株对克拉霉素、利福布汀和甲氧苄啶/磺胺甲恶唑的耐药率分别为11.76%(8/68)、5.88%(4/68)、8.82%(6/68)。克拉霉素、利福布汀和甲氧苄啶/磺胺甲恶唑的抑制50%胞内分枝杆菌的最低抑菌浓度(MIC 50)和MIC 90分别为2和32 mg/L、0.5和2 mg/L以及0.25/4.75和2/38 mg/L。16位点VNTR将68株分为45个基因型,包括来自11个簇的34株和34个独特模式的分离株,Hunter-Gaston分辨力指数为0.978。成簇菌株利奈唑胺和阿米卡星耐药率高于非成簇菌株(58.82%vs 23.53%;44.12%vs 14.71%)(P<0.05)。结论:克拉霉素、利福布汀和甲氧苄啶/磺胺甲恶唑等对河南省胞内分枝杆菌临床分离株具有较好的抗菌活性。VNTR分型方法对胞内分枝杆菌具有较好的分型能力。成簇菌株中利奈唑胺和阿米卡星的耐药率高于非成簇菌株。

结核分枝杆菌潜伏感染者外周血单个核细胞转录组学研究

目的:通过对比分析结核分枝杆菌潜伏感染(latent tuberculosis infection,LTBI)者和健康人的外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMC)经结核特异性抗原刺激后的转录组,寻找LTBI人群中结核抗原特异的免疫应答重要基因及可能发挥功能的信号通路,绘制LTBI基因表达谱。方法:应用微阵列芯片检测2009年12月在首都医科大学附属北京胸科医院招募的4例LTBI者(LTBI组)和4名健康人(健康对照组)经结核抗原刺激后的PBMC转录组,并对部分差异基因进行qPCR检测以验证芯片数据。应用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)筛选与LTBI最相关模块,并对模块中的基因分别进行基因本体论(geneontology,GO)分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encylopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析。通过基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)从全转录组水平筛选信号通路。通过免疫浸润分析寻找与LTBI相关的免疫细胞。通过STRING数据库蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络分析绘制两模块中差异基因相互作用网络图。结果:LTBI组与健康对照组间共发现393个差异表达基因(差异倍数>2或<0.5,P<0.05),LTBI中112个表达下调,281个表达上调。针对10个差异基因的实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)检测证实基因表达趋势与芯片数据一致,即CAMK1G、IL2、SPINK1、SUCNR1、HCAR3、IL18BP、CHI3L1、TNF均上调;RASGRP2、TPM2均下调。通过WGCNA分析确定与LTBI最相关的正相关蓝色模块(cor=0.88,P=0.004)和负相关蓝绿色模块(cor=―0.93,P=0.001)。对上述模块内基因进行KEGG富集分析,并行基于全转录组的GSEA分析,发现趋化因子信号通路(P<0.001)和凋亡信号通路(P=0.003)在两种分析中均明显富集。对两模块中的差异基因通过STRING数据库构建PPI网络图,通过内置插件计算得到每个模块中的前10个关键基因,即蓝色模块中的PTPRC、CD40、IL10、IRF8、CCR1、CD80、TLR8、CLEC7A、CD83和CD274;蓝绿色模块中的TNF、ICAM1、TNFRSF4、HAVCR2、CD276、CCL4、CD33、IL1RN、NCF1和FGR。免疫浸润分析发现,M1型巨噬细胞(P=0.029)和M2型巨噬细胞(P=0.001)等固有免疫细胞的比例在LTBI组和健康对照组间存在明显差异。结论:经结核特异性抗原刺激后的PBMC转录组在LTBI人群和健康人群间存在明显差异,这些差异基因主要聚集于凋亡信号通路和趋化因子信号通路,其中巨噬细胞介导的免疫应答在其中发挥了重要作用,揭示了固有免疫应答在LTBI中的重要作用。