基于SLAF-seq简化基因组技术的疆岳驴遗传进化分析

畜禽资源是中国种业创新、打赢种业翻身仗的根基。疆岳驴是陕西关中驴(大型驴)和新疆驴(小型驴)经过半个多世纪杂交改良、横交固定、选育提高、培育而成的良种驴,旨在基因组水平上揭示疆岳驴的遗传进化,解析疆岳驴的遗传结构及遗传多样性。该研究利用SLAF-seq简化基因组测序鉴定疆岳驴SNP标记,构建125头样品群体进化树并进行分析。共鉴定SNP标记4887196个;通过MEGA 5软件neighbor-joining算法,构建的群体进化树显示,125头疆岳驴聚集为2个大的分支:一个分支46头聚集在一起,亲缘关系较近;另一分支79头聚集在一起,亲缘关系较近。这2个分支间亲缘关系较远。通过admixture软件、EIGENSOFT软件、SPAGe⁃Di软件进一步佐证了125头疆岳驴可分为2个群体,利用SLAF-seq简化基因组测序能全面准确地揭示疆岳驴的遗传多样性和遗传结构,为疆岳驴的关联遗传学研究和重要性状QTL定位提供依据,为争取在第3次全国畜禽遗传资源普查申报新培育品种(配套系)和疆岳驴重要性状QTL定位奠定基础。

宏基因组技术在开发极端环境未培养微生物中的应用

人类对自然环境中约99%的微生物不能用传统的方法进行纯培养,对于极端环境中的微生物更是知之甚少。随着宏基因组技术的出现,人们可对这一庞大的未知世界进行多方面研究。目前研究者利用这一技术已经对地球上的多种极端生境进行了研究,并取得了很多新的成就。简要概述这一技术在极端环境未培养微生物研究中的应用。

宏基因组技术构建土壤宏基因组文库研究进展

土壤中大部分的微生物不能被培养,从而限制了对土壤微生物的开发利用,宏基因组技术可以解决这一难题,成为开发微生物资源的一种工具。阐述了宏基因组文库的构建、土壤宏基因组文库的特点及筛选文库获得的一些成果,并分析了构建土壤宏基因组文库存在的问题。

宏基因组技术研究进展

微生物支撑着地球上的物质循环和生命延续，除了自身可作为新基因资源的重要来源外，还可产生对人类有价值的活性物质。然而，传统纯培养方法严重限制了人们对微生物资源的认识和开发。一方面，随着对微生物活性产物研究的深入，微生物往往被重复培养和筛选，从传统方法来筛选新活性物质的几率不断下降。另一方面，多达99％的微生物在现有实验条件和技术下尚未得到纯培养，其中蕴含着大量潜能微生物和基因资源。近年来，随着基因组学在各个领域的渗入和现代分子技术的逐渐成熟，

宏基因组技术在耐药细菌研究中的应用

多重耐药病原菌(multidrug-resistant pathogens)和超级细菌(superbugs)的不断出现,给人类健康带来了严重的威胁,研究表明,环境中细菌自然具有耐药基因,通过宏基因组(metagenome)技术可以对环境中的耐药菌株及其生存环境和代谢产物进行研究,以发现新基因和新活性物质,本文对宏基因组技术在耐药细菌研究中的应用进行了综述,希望为解决抗菌药物耐药性问题提供解决办法。

宏基因组技术及其在厌氧消化研究中的应用

在介绍基因(组)富集、基因(组)DNA提取、文库构建及筛选等宏基因组技术的基础上,论述了宏基因组技术在厌氧消化研究中应用的重要性,认为该技术可成为研究微生物群落多样性的首选技术之一,有助于了解厌氧消化微生物的多样性、生态功能和动态变化,揭示厌氧消化微生物学机理,提高厌氧消化效能等.同时宏基因组技术为微生物资源的深层次开发利用提供了技术平台,并在工业、农业、海洋等领域具有广泛的应用前景.

宏基因组技术在环境微生物资源开发中应用的探索

环境中约有99%的微生物在现有的条件下不能被培养,这使微生物资源的开发利用受到了限制.宏基因组是指某一特定的环境中全部微生物的总DNA,宏基因组技术是将样品中的总DNA提取出来后,利用适宜的载体克隆到宿主细胞中以构建成宏基因组文库,再筛选新的活性物质或基因,该技术在微生物资源的开发利用上将会有巨大的发展潜力.

宏基因组技术及其在海洋微生物研究中的应用

宏基因组技术理论上能够覆盖了环境样品中包括的全部微生物,将它应用到海洋微生物研究可以更加全面真实地反映海洋微生物群落组成,同时大大拓展筛选新的基因或生物活性物质的来源。本文综述常规宏基因组学的研究方法,并重点介绍了目前国内外将宏基因组技术应用在海洋微生物研究中的进展和应用前景。

宏基因组技术在新型生物燃料生产酶制剂开发中的应用

随着石化燃料的日益减少,以植物生物质为原料的可再生生物燃料成为石化燃料的理想替代品。然而微生物降解生物质效率低下,是生物燃料生产过程中一大难题,因此开发效率高、稳定性强的微生物酶制剂显得尤为重要。近年来,宏基因组技术的发展为生物燃料的生产提供了多种新型酶制剂。宏基因组技术是直接提取环境样品中的总DNA,通过构建文库,筛选目的基因或功能基因的方法,在用于燃料生产的新型酶制剂的开发中发挥着重要作用。本文概述了宏基因组技术的实施策略,总结了包括纤维素酶、蛋白酶、酯酶、脂肪酶等多种酶资源开发的最新研究进展,并综合和讨论了通过酶法将木质纤维素等生物材料有效转化为生物燃料的途径,为新酶的开发提供了新思路。

宏基因组技术在抗生素抗性基因筛选中的初步研究

【背景】抗生素被过度滥用的情况十分普遍,细菌耐药问题越渐成为人们的焦点。【目的】构建广东省珠江淇澳岛红树林湿地土壤宏基因组文库并进行抗生素抗性基因的功能筛选。【方法】采集土壤标本并提取总DNA构建宏基因组文库,利用梯度平板筛选法筛选新型抗生素抗性基因,对筛选到的基因进行生物信息学分析。【结果】构建了片段多样性良好、阳性克隆率高、插入片段平均长度为5kb的红树林土壤宏基因组文库。筛选获得硫酸链霉素抗性基因strr719,并对新基因strr719进行了生物信息学分析。【结论】建立起一种可对生态系统进行潜在抗生素抗性基因污染的健康评估手段,为今后对抗生素抗性基因这种新型的污染物进行进一步的研究奠定了一定的基础,有助于对抗生素抗性基因污染问题的解决。

航空材料工业发展材料基因组技术的思路及实践

航空材料要求具有高性能、高可靠性、高技术成熟度，因此相对于其他工业领域，航空材料研发的周期更长（图1）。早在1955年，钱学森就指出，飞机材料要能经受住长期的服役考验，发展航空飞机的的难点在于材料，而材料问题不是一下子就能解决的，得靠经验积累。经过多年的发展，我国航空材料经历了从无到有，从小到大的发展过程，取得了许多关键性技术的突破和大量研究成果，正在不断创新航空结构材料、发动机材料等关键材料技术。材料基因组技术的出现及发展，为更好地推动航空材料的发展和应用提供了新的思路和途径。

人工授精和基因组技术提高全球猪生产的前景(续)

4．能够提高人工授精潜力的遗传生物工程 4．1猪的最新基因图谱 由于微卫星标记的发现（Weber J．L．和May P．E．，1989）和全世界对猪基因图谱研制的重视，猪基因图谱的研制在上世纪九十年代早期得到迅速发展。截至1994年，大约已经绘制了500个遗传标记（Ellegren，等1994；Rohrer等，1994；Archibald等，1995）。

宏基因组技术的研究问题分析

随着人们思维模式的转化与生物技术学科的发展,宏基因组学这门新型的学科诞生,引起了世界各国的关注,这一学科代表着生命学科的研究方向。主要针对宏基因组技术的研究问题进行分析。

宏基因组技术在生物医药领域的应用探讨

指出了宏基因组技术可以从环境中直接提取DNA,不需要实验室培养。宏基因组学相关技术的应用范围广泛,包括生物群落中的微生物多样性、新基因的发掘以及生物活性物质的研究。从宏基因组学的概念和技术出发,探讨了其在生物医药领域的应用,主要包括药物开发、人体微生物群落的研究以及疾病的诊断和治疗等方面。

宏基因组技术在环境保护及污染改善中的应用

宏基因组学是现代微生物生态学研究中分子生物学技术的一个新理论,它以环境中没有培养的微生物为研究媒介,通过获取环境中全部微生物的DNA,形成宏基因组的库,利用基因组学的研究方法分析环境中全部微生物的遗传分组和他们各自群落的功能。自1999年以来,这项技术已经在很多领域有广泛的应用,如,工业、医疗、农业等。本文将从宏基因组的基本理论,现阶段的研究方法,以及潜在的问题这几个方面为基础并提出解决问题的方法,解析它在环境保护及污染改善中的应用。该项技术的应用对于环境中微生物的变化有很大的帮助,而且为环境中的各项指标和改善提供理论依据。

美国加州大学戴维斯分校利用新一代基因组技术开展抗病、抗热应激型鸡的培育

美国加利福尼亚大学戴维斯分校正在开展一项世界领先的鸡全基因组育种项目，将首先鉴定与耐热和抗新城疫病相关的关键基因及分子标记，该项目对世界家禽业具有重要意义及深远影响。

科学家用基因组技术首次从感染细胞清除HIV

[导读]美国坦普尔大学研究人员21日说，他们利用基因组编辑技术，首次成功地把艾滋病病毒从培养的人类细胞中彻底清除。 新华网华盛顿7月21日电 美国坦普尔大学研究人员21日说，他们利用基因组编辑技术，首次成功地把艾滋病病毒从培养的人类细胞中彻底清除。“这是朝着永久治愈艾滋病方向迈出的重要一步，”参与研究的卡迈勒·哈利利教授在一份声明中说，“这是一项令人激动的发现，但不是说目前就能进入临床应用，它只是概念性地证明，我们走在正确的方向上。”

新基因组技术可促进糖尿病的研究

研究人员发明一种可通过对人类全基因组的扫描而成功定位一些关键基因调控因子的方法；已知这些调控基因的突变形式会引发2型糖尿病。该项研究标志着首次应用全基因组扫描方法对人体器官(如胰腺和肝脏)进行分析，同时亦为类似的其他器官系统和疾病的研究开辟了道路。

美国:基因组技术对奶牛遗传进展意义重大

荷斯坦网3月5日讯2009年,美国政府正式将基因组技术应用到奶牛遗传评估,这对奶牛遗传进展将有重大意义。这是美国环球育种公司副总裁麦克.瑞克斯（Mike Rakes）在北京举行的美国奶牛育种及群体遗传改良论坛上的发言中指出。