[目的]运用系统药理学探讨半夏-天南星药对调控铁死亡、细胞自噬和细胞凋亡治疗原发性肝癌的作用机制。[方法]利用中药系统药理学分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)...[目的]运用系统药理学探讨半夏-天南星药对调控铁死亡、细胞自噬和细胞凋亡治疗原发性肝癌的作用机制。[方法]利用中药系统药理学分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)数据库获取半夏-天南星活性成分和靶点,人类基因综合数据库(Human Gene Comprehensive Database,GeneCards)和基因疾病关联数据库(Gene-Disease Association Database,DisGeNET)获取原发性肝癌靶点,构建“半夏-天南星-化合物-靶点”网络;利用铁死亡数据库(Ferroptosis Database,FerrDb)、人类自噬数据库(Human Autophagy Database,HADb)和GeneCards获取铁死亡、细胞自噬、细胞凋亡的相关基因,将半夏-天南星治疗肝癌的潜在靶点与铁死亡靶点、细胞自噬靶点、细胞凋亡靶点及三者交集靶点分别映射,并分别进行蛋白互作(protein-protein interactions,PPI)网络、基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析;利用癌症基因组图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库分析共有靶点在肝癌组织的表达水平,以及与肝癌分期和预后的关系。[结果]共得到半夏-天南星核心成分13个,靶点75个,肝癌靶点1890个,半夏-天南星治疗肝癌的潜在靶点31个,其与铁死亡、细胞自噬、细胞凋亡相关靶点分别有7、11、21个重复靶点,其中丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(serine/threonine-protein kinase 1,AKT1)、血管内皮生长因子A(vascular endothelial growth factor A,VEGFA)、细胞肿瘤抗原p53(tumor protein p53,TP53)、转录因子p65(transcription factor p65,TF65/RELA)和低氧诱导因子-1α(hypoxiainducible factor-1α,HIF-1α)为共有靶点;且其表达水平在肝癌组织中存在差异,也与肝癌分期和预后存在相关性。[结论]半夏-天南星可能通过AKT1、VEGFA、TP53、RELA和HIF-1α等靶点调控铁死亡、细胞自噬和细胞凋亡,从而发挥治疗肝癌的作用。展开更多
景东天南星 新种 图1 伞叶组 Arisaema jingdongense H. Peng et H. Li, sp. nov. (Sect. Sinarisaema) Species nova A. erubescenti (Wall) Schott affinis, sed spatha sulphurea, non vittata,spadicis appendice aurantiaca differt.
文摘[目的]运用系统药理学探讨半夏-天南星药对调控铁死亡、细胞自噬和细胞凋亡治疗原发性肝癌的作用机制。[方法]利用中药系统药理学分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)数据库获取半夏-天南星活性成分和靶点,人类基因综合数据库(Human Gene Comprehensive Database,GeneCards)和基因疾病关联数据库(Gene-Disease Association Database,DisGeNET)获取原发性肝癌靶点,构建“半夏-天南星-化合物-靶点”网络;利用铁死亡数据库(Ferroptosis Database,FerrDb)、人类自噬数据库(Human Autophagy Database,HADb)和GeneCards获取铁死亡、细胞自噬、细胞凋亡的相关基因,将半夏-天南星治疗肝癌的潜在靶点与铁死亡靶点、细胞自噬靶点、细胞凋亡靶点及三者交集靶点分别映射,并分别进行蛋白互作(protein-protein interactions,PPI)网络、基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析;利用癌症基因组图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库分析共有靶点在肝癌组织的表达水平,以及与肝癌分期和预后的关系。[结果]共得到半夏-天南星核心成分13个,靶点75个,肝癌靶点1890个,半夏-天南星治疗肝癌的潜在靶点31个,其与铁死亡、细胞自噬、细胞凋亡相关靶点分别有7、11、21个重复靶点,其中丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(serine/threonine-protein kinase 1,AKT1)、血管内皮生长因子A(vascular endothelial growth factor A,VEGFA)、细胞肿瘤抗原p53(tumor protein p53,TP53)、转录因子p65(transcription factor p65,TF65/RELA)和低氧诱导因子-1α(hypoxiainducible factor-1α,HIF-1α)为共有靶点;且其表达水平在肝癌组织中存在差异,也与肝癌分期和预后存在相关性。[结论]半夏-天南星可能通过AKT1、VEGFA、TP53、RELA和HIF-1α等靶点调控铁死亡、细胞自噬和细胞凋亡,从而发挥治疗肝癌的作用。
文摘景东天南星 新种 图1 伞叶组 Arisaema jingdongense H. Peng et H. Li, sp. nov. (Sect. Sinarisaema) Species nova A. erubescenti (Wall) Schott affinis, sed spatha sulphurea, non vittata,spadicis appendice aurantiaca differt.
文摘目的:基于网络毒理学及分子对接技术分析天南星神经毒性的作用机制。方法:应用中药系统药理数据库(TCMSP)搜索天南星的活性成分,通过比较基因组学毒理数据库(CTD),筛选天南星的有效毒性成分,采用Swiss Targets Prediction数据库获得有效毒性成分的3D结构和毒性靶点,接着运用Cytoscape软件构建天南星的毒性成分、靶点和信号通路的关系网络和其Mcode插件筛选网络中的核心靶点,之后利用Metascape数据库进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,再利用Discovery Studio 2019软件对核心毒性化合物和核心作用靶点进行分子对接和可视化,最后通过文献分析进一步验证毒性成分和靶点。结果:得到天南星有效毒性成分6种,作用靶点353个,核心靶点57个,GO细胞组分238条,分子功能245条,生物学途径2385条,KEGG信号通路40条,核心毒性成分1-乙酰-β-咔啉与核心毒性靶点结合良好。结论:天南星的主要毒性成分为1-乙酰-β-咔啉,神经活性配体受体相互作用信号通路参与了天南星的神经毒性作用,ADRA2A受体可能是天南星发挥神经毒性的核心作用靶点,研究结果可为探究天南星的毒性机制提供新的思路。