北京黑猪与杜洛克猪肌内脂肪沉积相关基因的筛选

本研究旨在鉴定北京黑猪与杜洛克猪背最长肌(LDM)组织中的差异表达基因(DEGs),筛选影响猪肌内脂肪(Intramuscular Fat,IMF)沉积的关键基因及通路。研究选取北京黑猪和杜洛克猪各6头,采集其背最长肌组织,提取RNA并进行转录组测序。将测序数据进行比对、定量后,利用DESeq2筛选差异表达基因(|log2FC|≥1,P<0.05)并进行GO分析和KEGG分析。结果表明:2个品种猪背最长肌组织中共检测到206个差异表达基因,其中,100个基因在北京黑猪肌肉组织中高表达,106个基因在杜洛克猪肌肉组织中高表达。差异表达基因显著富集在24条通路,其中AMPK信号通路、PPAR信号通路、Wnt信号通路、不饱和脂肪酸的生物合成、脂质和动脉粥样硬化和脂肪酸代谢等通路参与了脂肪生成和代谢的过程。经进一步分析,ELOVL6、FASN、SCD、SQLE和NR4A1等基因在肌内脂肪生成的过程中发挥关键作用。该研究结果为猪肌内脂肪沉积的分子调控机制提供了参考。

不同品系杜洛克、PIC与加系二元母猪杂交后代生长性能及经济效益分析

为了研究猪场引进和选育终端父本以及筛选出符合市场需求的商品猪组合,该试验选取不同品系/品种包括D系杜洛克、F系杜洛克、M系杜洛克和PIC公猪与2~4胎加系长大二元母猪进行杂交,测定母猪繁殖性能、育肥猪日增重、采食量、料肉比、死淘率以及经济效益等指标。结果显示:(1)在繁殖性能方面,D系杜洛克组(DC)总产仔数和产健仔数均显著高于M系杜洛克组(MC)(P<0.05);F系杜洛克组(FC)初生健仔窝重显著高于MC(P<0.05);MC组初生头均重显著高于PIC组(PC)(P<0.05)。(2)商品猪生长性能方面,DC组达校正100 kg日龄最短;MC组170日龄料肉比显著高于PC组(P<0.05);DC组170日龄日增重显著PC组(P<0.05)。DC组出栏重显著高于其他3组(P<0.05);平均日增重显著高于PC组(P<0.05)。MC组出栏料肉比显著高于PC组(P<0.05);FC组出栏死淘率最低为2%。可见,在同等条件下,DC组产仔数最高且在生长速度方面具有明显优势,经济效益最好。

基于转录组测序的巴马香猪和杜洛克猪骨骼肌差异lncRNA分析

【目的】通过对巴马香猪和杜洛克猪背最长肌组织进行转录组测序鉴定差异表达lncRNA,筛选与骨骼肌发育形成相关的候选基因,为明确lncRNA对骨骼肌生长发育的调控机制提供理论基础。【方法】采集12月龄的巴马香猪和杜洛克猪背最长肌组织进行转录组测序,以错误发现率(FDR)<0.05且|log2Fold Change|>1为标准筛选差异表达基因(DEGs)和差异表达lncRNA,并进行实时荧光定量PCR验证,预测差异表达lncRNA靶基因并进行GO功能注释和KEGG信号通路富集分析,选取表达差异最大的lncRNA构建其与靶基因互作网络。【结果】在巴马香猪和杜洛克猪背肌间共鉴定出6316个DEGs和675个差异表达lncRNA;GO功能注释分析结果表明,差异表达lncRNA靶基因主要涉及代谢过程、肌肉组织发育及骨骼肌细胞增殖和分化等生物过程;KEGG信号通路富集分析结果表明,差异表达lncRNA靶基因在Hippo和Wnt信号通路显著富集(P<0.05),说明差异表达lncRNA与骨骼肌细胞的增殖、自噬和分化相关;对表达差异最大的lncRNA-MSTRG.16703进行实时荧光定量PCR验证,发现其在巴马香猪中的相对表达量极显著高于杜洛克猪(P<0.01),与转录组测序结果一致。lncRNA-MSTRG.16703与靶基因互作网络分析结果表明,上调靶基因包括QKI、MBNL1和YBX2,QKI和MBNL1在均与可变剪接相关。【结论】在巴马香猪和杜洛克猪间发现的差异表达lncRNA是调控骨骼肌发育的候选基因,其靶基因主要富集在Hippo和Wnt等骨骼肌发育相关信号通路。lncRNA-MSTRG.16703的表达差异最大且在巴马香猪中上调,其靶基因在骨骼肌细胞增殖分化和肌纤维形成中有重要调控作用。

杜洛克猪剩余采食量的社会遗传效应与其他经济性状的关联分析

本试验旨在探究杜洛克猪剩余采食量(RFI)的社会遗传效应(SGE)对其生长性能、胴体性能和肉品质产生的影响。选用209头杜洛克猪作为试验对象,从平均83日龄(平均体重33.6 kg)开始饲养到平均177日龄(平均体重111.0kg)。选择SGE最小的10头和最大的10头作为LRS组和HRS组,对比2组的生长性能、胴体性能和肉品质。结果表明:在生长性能方面,HRS组的饲料转化率(FCR)和平均日采食量(ADFI)极显著低于LRS组;在胴体性能方面,HRS组的胴体全重和胴体直长显著高于LRS组,而背膘厚显著低于LRS组;在肉品质方面,HRS组腰肌组织屠宰后45min肉色a值显著高于LRS组。此外,HRS组背最长肌的韧性极显著高于LRS组,肌内脂肪含量和大理石纹显著低于LRS组。综上所述,杜洛克猪RFI的SGE对其生长性能、胴体性能和肉品质均产生一定的影响。因此,在对RFI进行选育时需考虑SGE的影响。

杜洛克后备种猪外貌鉴定与选种概要

有不少业内同仁来访咨询，他们从国内外引进大量原种杜洛克种猪，当年当代性能尚可，两代之后退化严重，长速越来越慢，肢蹄病越来越多，公猪性能力越来越差，母猪泌乳力越来越低，仔猪初生重越来越小。这种品种退化的趋势在国内确有一定的代表性，但也非不可避免。进口杜洛克猪种质退化有两个原因：其一，国内杜洛克猪的育种尚未完善到全国联合育种的水平，各场家自立育种群体，势必使血缘狭窄，理想基因频率降低。其二，受短期、局部、片面的市场影响，选种方向偏离了杜洛克原种既定的育种方向。为了投机短期效益而草率改变育种方向的结果必然是原有优良性能的损失殆尽而时髦的新性状又不能稳定遗传。

杜洛克后备猪选种的现代理念

1杜洛克猪的品种文化底蕴杜洛克猪的血缘可以追溯到1493年哥伦布远航北美洲时带去的8头非洲几内亚红毛猪。19世纪上半叶,北美新英格兰地区饲养红毛猪蔚然成风。

新美系杜洛克与金水杜洛克杂交的效果观察

当今养猪生产主要是依据杂种优势和性状间互补性原理进行多品系间综合配套杂交来生产高效优质的商品瘦肉猪，在我国现有优秀商品瘦肉猪配套生产模式中，杜洛克是极为重要的终端杂交父本。湖北省农业科学院畜牧兽医研究所猪育种中心在“十五”国家重大攻关专项（2002BA514A-1-1）及湖北省重大攻关计划（2001AA202A）的资助下，进行了高性能杜洛克猪专门化新品系（即金水杜洛克）的选育及其配套利用研究，并于2005年通过了鉴定验收。为进一步进行本杜洛克的持继选育，适当的开放群体，有效的导入外血，增加育种素材，在2006年初购入了5头来自不同血统的新美系杜洛克公猪，与金水杜洛克进行杂交，进行性能测定与观察，为引入公猪的选择与使用提供依据。现将其测定结果报告如下。

胎次、月份和妊娠期对长白、大约克和杜洛克母猪产仔数的影响

对四川一种猪场的长白、大约克、杜洛克3个瘦肉型品种的2 600窝母猪,在不同品种、胎次、月份和妊娠期下的产仔情况用SPSS软件进行了统计。结果表明:大约克、长白、杜洛克的平均窝产仔数依次为9.96、9.52、9.13头;平均窝产活仔数依次为9.10、8.68、7.74头。通过分析发现这3个品种之间的平均窝产仔数、产活仔数差异不显著(P>0.05)。但是胎次、月份和妊娠期对3个品种平均产仔数的影响均是差异极显著(P<0.01)。

二花脸与杜洛克猪繁殖相关基因表达差异

以二花脸和杜洛克猪种为试验材料,采用real-time定量PCR技术,对猪ESR、RBP4、PRLR、INHA、SPP1、DPP4、P450arom、LHR、FSHR、FSHβ、GnRHR、EGF、PAPP-A、IGF1、NRP2、GDF9和SCG2等17个与繁殖性能相关基因在这2个猪种垂体、卵巢、子宫、输卵管4个组织中的表达差异进行研究.结果显示在17个基因中有15个基因(ESR、RBP4、PRLR、INHA、DPP4、P450arom、FSHR、FSHβ、GnRHR、EGF、PAPP-A、IGF1、NRP2、GDF9和SCG2)在二花脸子宫中表达量均高于杜洛克子宫的表达量,尤以RBP4(相对定量结果为123.35)和ESR(相对定量结果为10.67)表现最为明显;而垂体除了ESR和GDF9在二花脸中表达量(7.15和5.47)明显比杜洛克高之外,其余基因在二花脸中的表达量与杜洛克的基本差不多,甚至表达量还少些(如P450arom、LHR、IGF1、SPP1、RBP4);17个基因在两猪种卵巢及输卵管的表达差异不明显.结果提示二花脸猪高产仔性能是受多个基因综合作用的结果,而且可能主要受子宫内基因表达水平的影响.

大白猪、长白猪和杜洛克猪RBP4基因多态性及其与繁殖性能的相关分析

本试验通过PCR-RFLP技术对大白猪、长白猪和杜洛克猪的视黄醇结合蛋白4(retinol binding protein 4,RBP4)基因第4外显子MspⅠ酶切位点进行多态性分析,并对各基因型母猪的第2、3胎次产仔数、产活仔数、断奶仔猪数、初生窝重、21日龄的窝重及断奶成活率进行测定,进而分析RBP4基因多态性与繁殖性能的关系。结果表明,RBP4基因在3个品种中均存在多态位点;χ2适合性检验表明大白猪在该位点偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05),而长白猪和杜洛克猪在该位点处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。其中,大白猪中优势基因型为BB基因型,而长白猪和杜洛克猪中优势基因型为AA基因型。在繁殖性能上,长白猪BB基因型群体第2胎总产仔数、产活仔数、断奶仔猪数、初生窝重、21日龄断奶窝重分别高于AA基因型0.97头、1.28头、0.92头、1.74kg和4.42kg,高于AB基因型0.92头、1.02头、0.98头、1.43kg和4.98kg;第3胎次中总体上BB基因型也为有利基因型。

梅山猪与杜洛克猪中等卵泡差异表达基因的鉴定

本试验采用抑制性消减杂交技术构建了卵泡期第4天梅山猪和杜洛克猪中等卵泡M2组织差异表达的消减cDNA文库,从中筛选差异表达的基因,并通过实时荧光定量PCR对其进行验证,利用DAVID软件对差异表达的基因进行聚类分析。结果表明,从梅山猪和杜洛克猪M2卵泡消减文库中筛选得到了148和75个差异表达的ESTs,分别含有125和60个已知的基因。实时荧光定量PCR验证结果与筛选结果相符。GO功能分类注释到调控代谢、细胞循环、生物合成、胞内转运、类固醇雌激素受体和刺激等生物学过程。KEGG Pathway分析表明有6个基因参与TGF-beta信号通路,5个基因参与卵母细胞减数分裂信号通路,7个基因参与类固醇雌激素受体信号通路,推测TGF-beta信号通路中的基因可能调控猪卵泡的发育。研究结果为深入探讨卵泡发育机理和对繁殖性状影响的遗传机理奠定了基础。

杜洛克和汉普夏猪及其正反交F_1杂种猪肉质特性的研究

本研究采用二因子多水平有重复的试验设计 ,对 32头国外引进猪种的杜洛克、汉普夏猪及其正反交F1杂种猪 (杜汉、汉杜 )不同性别 (公、母 )的新鲜肌肉的理化性状和食用品质特性进行了深入研究。研究结果表明 :不同品种组成猪的各测定肉质性状中 ,肌肉的大理石纹、pH值、熟肉率、脂肪含量和肉色、失水率存在显著 (P <0 .0 5)和极显著 (P <0 .0 1 )的差异 ,比较而言 ,杜洛克猪的肉色最好 (平均评分为3.3分 ) ,肌肉持水性能最强 (平均失水率仅为 9.85% ) ,肌肉的大理石纹评分最好 (平均 3.1 3分 ) ;不同性别猪的各测定肉质性状中仅干物质一项指标存在显著的差异 (P <0 .0 5)。研究表明 :杜洛克、汉普夏猪及其正反交F1杂种猪的肌肉中脂肪含量较为适中 ,平均为 3.75%。

不同品系杜洛克终端父本三元杂交商品猪生产指标的比较

为了比较不同品系杜洛克公猪三元杂交商品猪的哺乳期生长性能、育肥性能、胴体性状和肉质性状等的差异,试验选择丹系杜洛克、美系杜洛克同美系二元杂交母猪配种生产两种（丹系和美系）三元杂交商品猪,在相同批次分娩且在相同饲喂和饲养管理条件下测定了后代的生长性能、育肥性能、胴体性状和肉质性状。结果表明：哺乳期丹系和美系三元杂交仔猪日增重分别为266,233 g,二者间差异极显著（P〈0.01）,丹系三元杂交商品猪的校正100 kg日龄和校正100 kg背膘厚极显著低于美系三元杂交商品猪（P〈0.001）,校正100 kg眼肌面积和全程日增重极显著高于美系杜洛克三元杂交商品猪（P〈0.001）;两品系间肉质指标差异不显著（P〉0.05）。说明丹系杜洛克公猪配种后代哺乳期间生长性能、育肥性能、屠宰率明显优于美系杜洛克公猪配种后代。

MUC13腹泻抗性纯合杜洛克种群的选育研究

MUC13是控制仔猪大肠杆菌F4ac易感或抗性的主效基因。本研究利用分子育种与常规育种技术、闭锁继代与开放选育相结合的综合方法,对250头杜洛克育种核心群实施连续3个世代的基因检测和性能测定,筛选出MUC13抗性纯合基因型种群。经测试,在相同饲养管理条件下,哺乳期的同胎次20窝育种群母猪与20窝扩繁群母猪相比,断奶前仔猪腹泻发生率分别为8.7%和18.4%(P<0.01),但断奶成活率两组间差异未达到显著水平(P>0.05);对育种群3个世代的测定选育结果分析发现,第一和第三世代间达100 kg体质量日龄差异不显著(P>0.05)、但活体背膘厚相比减少1.46 mm(P<0.05),同时还发现,3个世代中MUC13不同基因型个体间生长速度和活体背膘差异均不显著(P>0.05)。综上说明,MUC13基因抗性纯合有利于防止仔猪腹泻的发生并能有效降低活体背膘,但对生长发育没有明显影响。

连续日称重杜洛克公猪的生长曲线分析

利用14头杜洛克公猪1 596条连续日称重记录,进行了Logistic方程和Compertz方程的生长曲线拟合分析。结果表明:两种方程的拟合度(R2)在0.99以上,拐点体重和日龄差别不显著。但综合杜洛克公猪实际成熟体重考虑,用Compertz方程对杜洛克公猪进行生长曲线的拟合效果更好,更接近实际。

槐猪和杜洛克猪背最长肌差异表达基因的筛选与注释

为了筛选槐猪和杜洛克猪背最长肌中的差异表达基因,对槐猪和杜洛克猪背最长肌进行转录组测序,并进行生物信息学分析.结果表明,槐猪和杜洛克猪分别获得36 177 844和34 496 450条可用读段,且与猪参考基因组的比对率分别为78.71%和80.09%.槐猪和杜洛克猪间共有953个差异表达基因,以杜洛克猪为对照组,槐猪与之相比,有589个上调基因和364个下调基因.槐猪和杜洛克猪的差异表达基因共分类到48个基因本体(GO)条目中,其中,细胞组分13个、分子功能12个和生物学过程23个.显著富集的KEGG通路共计6个,其中,PPAR信号通路是与调节脂类代谢显著相关的通路.

不同储藏条件下杜洛克猪肌肉pH、糖原、乳酸及TBA的变化及相关关系

测定了杜洛克猪屠宰后10 h肌肉pH、糖原、乳酸和脂质氧化的变化,不同储藏温度和时间对肌肉pH值、失水率、糖原、乳酸及脂质氧化的影响及相关关系。结果表明:宰后10 h杜洛克猪背最长肌pH值显著降低,乳酸含量显著升高,肌肉糖原和TBA值含量变化不显著。4℃冷藏条件下,储存时间对杜洛克猪肌肉pH、糖原、乳酸和TBA含量影响不显著,对滴水损失影响显著。-20℃冷冻条件下,储存时间对杜洛克猪肌肉pH影响极显著,对解冻失水率、糖原、乳酸和TBA值含量影响不显著。相关性分析表明,宰后10 h TBA值与糖原呈显著负相关,与乳酸呈显著正相关,pH与乳酸极显著负相关;4℃冷藏条件下,TBA与滴水损失和乳酸呈极显著和显著负相关,pH与滴水损失极显著正相关;滴水损失与乳酸显著正相关,其他相关性不显著。-20℃冷冻条件下,TBA与pH极显著负相关,与解冻失水率显著正相关,pH与解冻失水率极显著负相关,解冻失水率与乳酸呈显著负相关,其他相关不显著。

苜蓿草粉在杜洛克肥育猪日粮中适宜饲喂量研究

体重相近的杜洛克生长猪48头,随机分成4组(每组4个重复),研究苜蓿草粉替代杜洛克肥育猪日粮对其生长性能、养分消化和屠宰性能的影响。结果发现,苜蓿草粉替代组的生长性能均低于对照组,其中10%替代组略低于对照组;15%和25%替代组显著低于对照组。随苜蓿草粉替代率增加,养分消化率逐步降低(P<0.05)。苜蓿替代组的背膘厚均低于对照组,但差异不显著(P<0.05)。苜蓿草粉替代全价日粮对猪消化道发育、屠宰性能、肉质指标影响不大。经济效益分析发现10%替代组的头毛收入比对照组提高12.3%。综合来看,10%的替代率较佳。

YWHAG基因CDS的克隆及其在梅山与杜洛克猪卵泡发育中的差异表达研究

本研究旨在探讨YWHAG(Tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein,gamma polypeptide)基因在猪卵泡发育中的表达规律及其与卵泡发育的关系。从猪卵泡组织中克隆YWHAG基因CDS(Coding region)区全序列,采用半定量RT-PCR和Real-time PCR方法检测YWHAG基因在不同组织中的表达谱信息,并进一步分析了该基因在梅山、杜洛克猪L、M2、M1、S各级别卵泡中的表达变化。结果显示:克隆得到了猪YWHAG基因780bp编码区全序列,通过与人、小鼠、牛YWHAG基因CDS区BLAST比对,其同源性分别为97.72%、96.68%和98.57%。YWHAG基因在肌肉、肝、脂肪、肺、心、脾、肾、子宫、输卵管、小肠、胃、卵巢、垂体、下丘脑等组织中均有表达,尤其在脂肪、小肠和大脑中表达较高。YWHAG基因在不同直径卵泡中的表达量的趋势均为M1卵泡和L卵泡最高,M2卵泡次之,S卵泡最低,并且在M1卵泡和L卵泡中的表达量显著高于M2卵泡和S卵泡(P<0.05)。YWHAG基因在梅山猪各级别卵泡中的表达量均高于杜洛克猪(P<0.05),并且在梅山猪S和M2卵泡的表达量分别极显著高于杜洛克猪(P<0.01),而在M1卵泡及L卵泡中的表达量无显著差异;结果提示,YWHAG基因可能参与猪卵泡发育中的凋亡过程,从而引起梅山与杜洛克猪在排卵数方面存在差异。