循环游离DNA在食管癌早期诊断中的价值分析

目的探究循环游离DNA(cfDNA)在食管癌早期诊断中的应用价值。方法选择2019年8月至2022年8月武汉科技大学附属天佑医院收治的49例食管癌患者作为研究对象(设为食管癌组),另选择同期在该院进行健康体检的40名志愿者设为对照组。采用ELISA法测定血清CA19-9、细胞角蛋白片段19抗原21-1(CYFRA21-1)、鳞状细胞癌抗原(SCC-Ag)和cfDNA水平,并分析血清cfDNA与食管癌患者临床病理特征的关系。采用Pearson相关性分析探究血清cfDNA水平与CA19-9、CYFRA21-1、SCC-Ag水平的相关性。采用ROC曲线分析血清cfDNA、CA19-9、CYFRA21-1、SCC-Ag水平对食管癌的诊断价值。结果食管癌组血清cfDNA、CA19-9、CYFRA21-1、SCC-Ag水平均高于对照组(P均<0.05)。食管癌患者血清cfDNA与CA19-9、CYFRA21-1、SCC-Ag水平均呈显著正相关(P均<0.05)。肿瘤最大径>3 cm、低分化和有淋巴结转移的食管癌患者血清cfDNA水平分别高于肿瘤最大径≤3 cm、中/高分化和无淋巴结转移者,差异均有统计学意义(P均<0.05)。血清cfDNA、CA19-9、CYFRA21-1和SCC-Ag联合检测诊断食管癌的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、AUC均分别高于任一项指标单独检测,差异均有统计学意义(P均<0.05)。结论食管癌患者血清cfDNA高表达,且其与肿瘤大小、分化程度及淋巴结转移均密切相关。血清cfDNA、CA19-9、CYFRA21-1、SCC-Ag联合检测有助于提高食管癌的早期诊断率,具有临床推广价值。

细胞游离DNA检测在儿童血液肿瘤性疾病诊断应用中的研究进展

细胞游离DNA(cf DNA)多用于实体肿瘤的治疗与预后的评估,在血液系统肿瘤的诊断、临床治疗与预后评估方面也有重要价值。本文综述了cf DNA的检测方法、靶基因及其在儿童白血病、淋巴瘤和朗格罕细胞组织细胞增生症中的研究进展,以加强临床医生对该诊断方法在临床应用中的认识。

供者来源游离DNA在肝移植领域相关研究与应用进展

肝移植是根治性治疗终末期肝病的唯一手段。肝移植术后患者必须接受长期的免疫抑制治疗,并适时调整免疫抑制剂方案以维持移植物功能稳定。病理穿刺是诊断排斥的金标准,但因价格昂贵,具有创伤性等缺点应用较少,因此需要另一种方法代替病理穿刺。供体来源细胞游离DNA(donor-derivedcell-freeDNA,ddcfDNA)是一种来源于移植器官细胞的游离胞外DNA。肝移植术后,ddcfDNA可在受体血液、尿液中检测到,研究发现ddcfDNA含量在肝移植患者发生急性排斥反应时甚至经活组织检查诊断数周前已发生实质性增高,表明其作为一种非侵入性、早期诊断移植物损伤的生物标记物具有一定的临床应用价值。本文探讨关于ddcfDNA在肝移植相关领域的研究现状及进展。

游离DNA在肝脏疾病中的应用进展

体液活检与传统侵入性检查相比具有许多独特的优势,尤其在产前诊断、器官移植后免疫排异反应、肿瘤早期诊断和肝脏疾病诊疗方面展现出巨大潜力。在肝脏疾病领域,游离DNA参与机体内在的炎性反应和凝血过程。基于表观遗传学的研究,游离DNA片段的甲基化分析对肝脏恶性肿瘤的早期诊断和治疗大有帮助。在器官移植后,游离DNA有望成为监测免疫排异反应的重要标志物,为关于免疫排异反应机制的研究提供了新角度。文章对游离DNA的来源、提取方法、检测方法,以及其在肝移植、肝癌、肝衰竭等疾病中的研究应用进展进行综述。

循环游离DNA在肾脏疾病中的研究进展

肾脏疾病是一类严重威胁人类健康的疾病,其发病率及死亡率高,寻求高灵敏度的生物学指标有助于早期诊断和改善预后。循环游离DNA是一类存在于血浆、尿液及其他体液中游离于细胞外的双链DNA片段。循环游离DNA参与机体内在的炎症反应和凝血过程,在肾脏疾病中显著升高,可作为肾脏疾病的潜在生物标志物,对疾病的诊断和预后有重大意义。本文对循环游离DNA的生物学特性、在肾脏疾病中的作用及应用进展进行综述,以期为肾脏疾病的早期诊断及预后提供参考。

HBV相关慢加急性肝衰竭患者血清巨噬细胞移动抑制因子和游离DNA水平变化及其临床价值

目的:观察乙型肝炎病毒(HBV)相关慢加急性肝衰竭(ACLF)患者血清巨噬细胞移动抑制因子(MIF)、游离DNA(cf-DNA)水平变化,并分析MIF、cf-DNA在肝衰竭中的作用。方法:选取HBV相关ACLF患者60例(肝衰竭组),体检健康者30例(对照组),收集临床资料,试剂盒检测各组患者血清MIF、cf-DNA水平,Pearson相关或Spearman秩相关分析法分析MIF、cf-DNA与临床炎症指标的相关性。结果:与对照组相比,肝衰竭组患者血清MIF和cf-DNA水平升高(P<0.05)。血清MIF与cf-DNA(r=0.482)、降钙素原(PCT)(r=0.566)、超敏C反应蛋白(r=0.285)呈正相关(P<0.05);cf-DNA与PCT(r=0.526)、超敏C反应蛋白(r=0.336)呈正相关(P<0.05)。结论:HBV相关ACLF患者血清MIF、cf-DNA水平升高,MIF和cf-DNA在肝衰竭炎症过程中发挥重要作用。

基于甲基化特异性PCR的外周血循环游离DNA甲基化检测对乳腺癌诊断价值的荟萃分析

目的通过Meta分析系统评估基于甲基化特异性PCR(MSP)的外周血循环游离DNA(cfDNA)甲基化检测对乳腺癌的诊断价值。方法检索PubMed、Embase、Cochrane数据库,检索时间为2011年1月至2021年12月,以“Breast neoplasms”“Breast cancer”“Methylation”“Cell-free DNA”等为检索词,检索有关血液循环cfDNA甲基化用于乳腺癌诊断的文献,根据纳入及排除标准筛选文献。使用QUADAS-2对纳入文献进行质量评价,提取研究数据并使用Stata 16.0对各效应量进行合并,分析异质性及来源,以Deek’s法检验发表偏倚。结果共检索318篇文献,最终纳入12篇文献的27项研究进行Meta分析,患者2195例,纳入研究存在高度异质性(I^(2)>50.00%)。采用随机效应模型合并灵敏度为0.43[95%CI(0.31~0.56)],合并特异度为0.97[95%CI(0.94~0.99)],合并阳性似然比(LR+)为16.30[95%CI(7.00~37.80)],合并阴性似然比(LR-)为0.59[95%CI(0.47~0.73)],合并诊断比值比(DOR)为28.00[95%CI(11.00~70.00)],合并AUC为0.85[95%CI(0.82~0.88)]。结论基于MSP的外周血cfDNA甲基化检测对乳腺癌有较高的辅助诊断价值。

胸腔积液游离DNA检测在结核性胸膜炎中的诊断价值

结核性胸膜炎(tuberculous pleurisy,TP)是肺部胸膜下结核性干酪样病灶破裂导致结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)及其裂解后的蛋白质进入胸膜腔引起过敏反应,进而产生的胸膜炎症^([1])。结核性胸腔积液是TP最常见的表现形式^([2])。TP可导致严重的并发症,包括胸膜增厚、胸膜结核瘤、脓胸、钙化和长期肺功能障碍^([3]),但由于胸腔积液中含菌量不高,目前常用的病原学方法检出效果均不理想,结核分枝杆菌/利福平耐药实时荧光定量核酸扩增检测技术(Xpert)分枝杆菌培养的阳性检出率仅为20%~30%左右^([4]),涂片的阳性检出率不到6%^([5])。

游离DNA最新研究进展及法医学应用展望

近年来,随着DNA提取和检测技术的不断进步,游离DNA(cell-free DNA,cfDNA)已经在生命科学领域得到了广泛应用,在法医学鉴定领域中的潜在应用价值也越来越明显。本文回顾了cfDNA概念、形成机制与分类等,并阐述了cfDNA在法医学现场接触检材的个体识别和无创产前亲缘关系鉴定应用中的最新研究进展,同时总结了cfDNA在损伤推断中的应用潜力,并探讨了常用cfDNA分析方法和技术的优缺点及应用展望,为cfDNA在法医学领域的广泛应用提供新思路。

多发性骨髓瘤血浆循环游离DNA定量检测和完整性分析

目的:研究血浆循环游离DNA(cf-DNA)在初诊多发性骨髓瘤(MM)患者筛查诊断中的作用,并探讨经化疗后患者的cf-DNA含量和完整性的变化在疾病评估中的作用。方法:收集35例初诊MM患者和18例健康志愿者的外周血标本,另选取MM患者中完成规范诱导化疗3个疗程的13例患者作为随访组。以ALU247片段及ALU115片段为目的基因,用荧光定量PCR检测患者及健康志愿者血浆中的cf-DNA含量,并以ALU247/ALU115比值计算cf-DNA的完整性。结果:MM患者ALU247、ALU115片段浓度和cf-DNA完整性均显著高于健康志愿者(均P<0.05)。经3个疗程诱导化疗的患者治疗后的ALU247和ALU115片段浓度以及cf-DNA的完整性均较治疗前显著降低(均P<0.05),且治疗前后cf-DNA完整性与血清M蛋白含量及骨髓异常浆细胞比例之间均存在较强正相关关系(r_(M蛋白)=0.703,r_(骨髓浆细胞)=0.705)。结论:cf-DNA对于MM的筛查诊断具有一定的积极意义。cf-DNA或许可以协同或者替代血清M蛋白含量及骨髓异常浆细胞比例评估患者的病情、疗效及预后。

循环游离DNA在常见肿瘤中的临床应用进展

循环游离DNA (cell-free DNA, cfDNA)容易采集和无创的优点使其在肿瘤早期诊断、良恶性鉴别、疗效检测、预后评价等临床应用中受到广泛的关注。此外,cfDNA还可以反映肿瘤大小、肿瘤转移等。为此,本文综述了cfDNA的临床应用,以期为临床疾病的诊断、疗效分析提供帮助。

磁共振动态增强结合血循环肿瘤细胞、循环游离DNA对乳腺癌的临床诊断研究

目的探讨磁共振动态增强(DCE-MRI)结合血循环肿瘤细胞(CTCs)、循环游离DNA(cfDNA)对乳腺癌的诊断价值。方法选取沧州市人民医院2020年6月至2021年11月符合纳入标准的乳腺癌病人82例(乳腺癌组)。另选同期65例乳腺良性病变且未合并其他疾病者作为良性组。比较两组DCE-MRI定量参数、CTCs、cfDNA水平,对比MRI特征,分析DCE-MRI结合CTCs、cfDNA诊断乳腺癌的价值。结果乳腺癌组DCE-MRI定量参数速度常数(K^(trans))值、速率常数(K_(ep))值、Alu247/115水平及CTCs计数分别为(0.18±0.04)min、(1.32±0.27)min、(12.97±2.14)个/毫升、0.97±0.32,比良性组高(0.05±0.01)min、(0.51±0.11)min、(10.15±1.45)个/毫升、0.55±0.12(P<0.05)。良性组边缘多光滑,形状规则,内部强化以均匀为主,时间-信号强度曲线(TIC)以Ⅰ型多见,早期增强率<60%;乳腺癌组边缘毛刺征、形状不规则,内部不均匀强化为主,以TIC分型Ⅲ型多见,早期增强率<60%占比高。两组MRI形态表现比较差异有统计学意义(P<0.05)。淋巴结转移、Ⅲ~Ⅳ期者CTCs数量、Alu247/115水平明显高于无淋巴结转移、Ⅰ~Ⅱ期者(P<0.05)。受试者操作特征(ROC)曲线分析结果显示,三者联合(DCE-MRI+CTCs+cfDNA)诊断乳腺癌的曲线下面积(AUC)、灵敏度、特异度分别为0.86、0.93、0.84,诊断效果优于单一检测CTCs、cfDNA检测(P<0.05)。结论乳腺癌病人CTCs、cfDNA存在异常表达,可能与病人临床分期、淋巴结转移有关,相对单一实验室检测,DCE-MRI结合CTCs、cfDNA检测能获取更多可靠信息。

游离DNA甲基化在非肿瘤性疾病中的应用研究进展

游离DNA已成为新兴的、非侵入性的重要临床样本类型,游离DNA甲基化具有组织特异性,可以反映来源细胞的DNA甲基化状态,在临床疾病诊疗中可能成为重要的潜在标志物。该文旨在综述近年常用的游离DNA甲基化检测技术,以及游离DNA甲基化在神经退行性疾病、精神性疾病、心血管疾病、糖尿病和出生缺陷等非肿瘤疾病中的应用研究进展。

尿游离DNA的液体活检有望成为泌尿系疾病诊治的重要方向

尿液由泌尿系统直接产生,其中的游离DNA(cfDNA)携带了来源于泌尿系的基因组DNA,并且尿液样本具有非侵入性、数量不受限及获取方便等优点,因此尿cfDNA是诊治泌尿系疾病的一种很有潜力的生物标志物,对尿cfDNA进行液体活检在泌尿系疾病的诊治中具有重要的临床应用价值。本文就尿cfDNA在泌尿系疾病临床诊治中的应用研究作一综述。

母体循环中胎儿游离DNA在单基因病产前诊断的研究进展

单基因病是引起胎儿出生缺陷的主要原因之一,其种类多,病情复杂,缺乏有效治疗方法,且预后差。目前,无创产前检测(NIPT)已成为筛查胎儿非整倍体的主要手段,在临床上广泛应用。基于母体循环中胎儿游离DNA(cffDNA)的发现及高通量测序技术的发展,单基因病的NIPT成为研究热点,且检测技术及其检测的疾病种类也在不断增加,但是单基因病的检测存在难度大、成本高等问题。目前胎儿单基因病的NIPT仍然处于研究阶段,尚未在临床应用。因此,深入研究母体循环中cffDNA的NIPT对单基因病产前诊断具有重要意义。

循环游离DNA在早期肝细胞癌筛查中的研究进展

肝细胞癌(HCC)是全球最常见恶性肿瘤之一,是肝硬化患者死亡的最常见原因。我国是一个乙型肝炎病毒(HBV)感染高发国家,每年全球新发肝癌病例中大约50%来自我国,尽管目前HCC治疗手段层出不穷,由于缺乏有效的早期筛查方法,70%~80%的患者就诊时已经处于晚期,失去了手术切除及肝移植等根治性治疗机会,患者5年总生存率仅为14.1%[1]。因此,如何实现HCC早期诊断是当前研究的热点和难点问题。目前多项实验表明,循环游离DNA(cfDNA)含有特异性的肿瘤相关基因特征,检测cfDNA可提高早期HCC诊断的敏感性和特异性。本文就cfDNA在HCC早期诊断中的临床应用及前景作一综述。

无创产前检测中胎儿游离DNA浓度的影响因素及临床应用研究进展

无创产前检测(Non-Invasive Prenatal Testing, NIPT)自临床应用以来,因其方便快捷、无需侵入的特点于全球迅速开展。胎儿游离DNA浓度(Fetal Fraction, FF)是NIPT的质控参数,同时也可作为预测不良妊娠结局的重要指标。本文旨在分析总结FF的影响因素及与胎盘相关性不良妊娠结局的关系,以期发挥FF在临床应用中的价值。Non-invasive prenatal testing (NIPT) has been rapidly developed worldwide due to its characteristics, including convenience and non-invasive. Fetal fraction (FF) is a parameter of sample quality control for NIPT and can also be used as an important indicator for predicting adverse pregnancy outcomes. This article aims to analyze and summarize the influencing factors of FF and the relationship between FF with placenta-related adverse pregnancy outcomes, in order to exert the value of FF in clinical application.

血浆循环游离DNA水平及其完整性用于肺结节良恶性的诊断研究

目的 探讨血浆循环游离DNA(cfDNA)水平及其完整性对肺结节良恶性的诊断价值。方法 选取110例肺结节患者作为研究对象,根据病理诊断结果分为良性肺结节组60例与恶性肺结节组50例,另选取同期健康体检者30例设为对照组。采用酶联免疫吸附试验检测血浆癌胚抗原(CEA)、细胞角蛋白19片段抗原21-1(CYFRA21-1)水平,采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测血浆cfDNA水平和cfDNA完整性;绘制受试者工作特征(ROC)曲线,分析并比较血浆cfDNA水平、cfDNA完整性、CEA、Cyfra21-1单独和联合应用对恶性肺结节的诊断效能。结果 恶性肺结节组血浆cfDNA、CEA、Cyfra21-1水平依次为1 154.83(452.85,1 642.31)、7.93(3.21,10.31)、5.75(2.85,8.12) ng/mL,分别高于良性肺结节组的385.43(176.45,704.55)、2.67(1.36,5.45)、2.74(1.43,3.96) ng/mL,差异有统计学意义(P<0.001);恶性肺结节组患者cfDNA完整性为0.68(0.47,0.91),高于良性肺结节组的0.37(0.26,0.59),差异有统计学意义(P<0.001)。血浆cfDNA水平和cfDNA完整性与恶性肺结节患者性别、年龄、是否吸烟、肿瘤直径、病理类型、TNM分期、肿瘤分化程度、淋巴结转移均无相关性(P>0.05)。ROC曲线显示,血浆cfDNA水平、cfDNA完整性诊断恶性肺结节的曲线下面积、敏感度、特异度均大于或高于CEA、Cyfra21-1;血浆cfDNA、CEA、Cyfra21-1水平和cfDNA完整性联合诊断恶性肺结节的敏感度、特异度均高于四者单独检测,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 血浆cfDNA水平和cfDNA完整性对恶性肺结节具有一定的诊断价值,可作为肺结节良恶性辅助诊断的分子生物学指标。

孕妇血中胎儿游离DNA是双胎妊娠无创DNA筛查的关键

越来越多的数据显示无创DNA筛查技术在双胎中具有良好的应用效果,并且被一些指南和文献推荐为双胎妊娠胎儿染色体非整倍体的一线检测方案。无创DNA筛查的关键是胎儿游离DNA浓度,如果浓度达不到检测阈值,将出现假阴性的结果。双胎妊娠孕妇血中的胎儿游离DNA虽然总体比单胎高,但是每个胎儿的DNA比单胎低,因此双胎妊娠的无创DNA筛查更容易出现检测失败和假阴性的结果。另外,临床上双胎一胎消失的情况又增加了假阳性的结果,这些都导致无创DNA筛查在双胎妊娠的筛查中效果不如单胎。基于SNP的无创DNA筛查技术可以准确评估孕妇和每个胎儿的游离DNA浓度,可以有效地保证无创DNA检测的效果,也可以解决消失胎儿对存活胎儿游离DNA干扰的问题。本文将对双胎妊娠胎儿游离DNA在无创DNA筛查中的关键作用进行阐述,以期为双胎的无创DNA筛查在临床上的应用和遗传咨询提供理论依据。

孕妇血浆游离DNA无创产前筛查检测失败及相关妊娠结局

孕妇血浆游离DNA(cell-free DNA,cfDNA)无创产前筛查(noninvasive prenatal screening,NIPS)是胎儿常见染色体非整倍体最有效的一种产前筛查方法,国内外已广泛开展。值得注意的是,该技术存在无法避免的检测失败,且近几年的一些研究报道发现,这种检测失败可能与胎儿染色体非整倍体和妊娠相关并发症发生存在一定相关性。目前,这方面的报道文献还相对有限,临床意义尚未完全明确。本文将回顾研究报道,探讨无创产前筛查检测失败原因及与胎儿染色体非整倍体、妊娠并发症相关性,探索在检测失败后对孕妇进行临床咨询和妊娠管理指导的理论依据。