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鸡胫长和胫围的全基因组关联分析 被引量:18
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作者 孙艳发 刘冉冉 +6 位作者 郑麦青 赵桂苹 张磊 吴丹 胡耀东 李鹏 文杰 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期358-365,共8页
为了揭示影响鸡胫生长的遗传基础和分子机制,本试验以中国农业科学院北京畜牧兽医研究所昌平试验基地鸡场鸡F2资源群体为基础,测定了F2代个体93日龄的体重、胫长和胫围,并利用60KSNP芯片对个体基因组DNA进行分型,进行胫长和胫围的全基... 为了揭示影响鸡胫生长的遗传基础和分子机制,本试验以中国农业科学院北京畜牧兽医研究所昌平试验基地鸡场鸡F2资源群体为基础,测定了F2代个体93日龄的体重、胫长和胫围,并利用60KSNP芯片对个体基因组DNA进行分型,进行胫长和胫围的全基因组关联分析(GWAS)。结果表明,与鸡胫长和胫围达到5%全基因组水平显著关联位点分别为1个和4个(P<2.98×10-6),潜在关联位点分别为4个和25个(P<5.96×10-5)。其中1个SNP位点位于13号染色体上的NKX2-5基因的下游138 834bp,另一个SNPs位于8号染色体ELAVL4基因的下游52 248bp处。4号染色体14.93Mb(71.01~85.94Mb)区域多个SNPs位点与胫围显著或潜在关联。该区域内含有的LDB2、BOD1L1和QDPR等基因。这些基因和区域可作为影响胫长和胫围的重要候选区域和基因,为揭示胫生长的遗传基础和分子机制以及后期的分子标记辅助选择奠定了基础。 展开更多
关键词 胫围 全基因组关联分析
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桂香鸡胫长、胫围与体重的相关性分析 被引量:2
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作者 蒋世远 陈小萍 +1 位作者 吴鹏飞 张跟喜 《畜牧与饲料科学》 2016年第10期20-21,27,共3页
以3个批次的桂香鸡为研究对象,分析120日龄时桂香鸡的胫长、胫围以及体重之间的相关性。研究结果表明,第3批桂香鸡的120日龄体重和胫围显著高于第1批(P<0.05),第2批和第3批桂香鸡的120日龄胫长显著高于第1批(P<0.05)。相关分析表... 以3个批次的桂香鸡为研究对象,分析120日龄时桂香鸡的胫长、胫围以及体重之间的相关性。研究结果表明,第3批桂香鸡的120日龄体重和胫围显著高于第1批(P<0.05),第2批和第3批桂香鸡的120日龄胫长显著高于第1批(P<0.05)。相关分析表明,第1批桂香鸡120日龄体重和胫长以及胫围之间存在极显著的相关(P<0.01),相关系数分别为0.583和0.623;120日龄胫长和胫围之间存在极显著的相关(P<0.01),相关系数为0.369。第2批和第3批数据合并分析表明,桂香鸡120日龄体重和胫长以及胫围之间存在极显著的相关(P<0.01),相关系数分别0.605和0.726;120日龄胫长和胫围之间存在极显著的相关(P<0.01),相关系数为0.463。研究结果为桂香鸡胫长、胫围与体重性状的选择,尤其是桂香鸡胫长、胫围与体重性状的综合选择提供了参照。 展开更多
关键词 桂香鸡 体重 胫围 相关性
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番鸭胫围双向选择效果初步研究
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作者 姜自琴 徐振强 +2 位作者 张燕 李丽莹 张德祥 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第2期128-132,共5页
为了探讨番鸭胫围对腿病发生的影响,试验以温氏白羽番鸭N101品系公鸭为研究对象,通过统计N101品系第6世代公鸭腿病发生情况和体重变化研究公鸭腿病发病增长率与体重增长速度的关系;测定N101品系第10世代家系鸭群存栏个体30周龄时的胫围... 为了探讨番鸭胫围对腿病发生的影响,试验以温氏白羽番鸭N101品系公鸭为研究对象,通过统计N101品系第6世代公鸭腿病发生情况和体重变化研究公鸭腿病发病增长率与体重增长速度的关系;测定N101品系第10世代家系鸭群存栏个体30周龄时的胫围,组建大、小胫围家系及普通家系,分别统计各家系后代公鸭在第10周龄时的腿病发生情况及大、小胫围家系后代公鸭在第10周龄时的胫围。结果表明:N101品系第6世代家系公鸭腿病发生率和体重均随着周龄增加而提高,且发病增长率与体重增长速度的趋势相似。大胫围家系亲本公鸭胫围极显著高于普通家系和小胫围家系公鸭(P<0.01);普通家系亲本公鸭胫围极显著高于小径围家系公鸭(P<0.01);大胫围家系亲本母鸭胫围显著高于普通家系母鸭(P<0.05),极显著高于小径围家系母鸭(P<0.01);普通家系亲本母鸭显著高于小径围家系母鸭(P<0.05)。大胫围家系后代公鸭的腿病发生率较低,两批次分别为0.7%和0.8%;小胫围家系后代公鸭腿病发生率较高,两批次分别为3.6%和4.5%;普通家系后代公鸭腿病发生率分别为1.3%和0.9%,介于小胫围家系和大胫围家系之间。大胫围家系后代公鸭的胫围极显著高于小胫围公鸭(P<0.01)。说明番鸭胫围具有较强的遗传特性,番鸭公鸭腿病的发生与体重增长速度和胫围均有一定的关系。 展开更多
关键词 番鸭 腿病 胫围 发病率 体重增长速度
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全基因组关联分析筛选文昌鸡体尺性状相关分子标记
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作者 骆娜 安炳星 +2 位作者 魏立民 文杰 赵桂苹 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期2046-2060,共15页
【目的】体尺是评价禽类生长特性的主要指标,通过筛选与文昌鸡体尺性状相关的分子标记及候选基因,为解析体尺性状的遗传机制及分子育种提供理论支撑。【方法】利用海南省文昌鸡品系3个世代(n=2024)群体作为研究对象,测定每只鸡在上市日... 【目的】体尺是评价禽类生长特性的主要指标,通过筛选与文昌鸡体尺性状相关的分子标记及候选基因,为解析体尺性状的遗传机制及分子育种提供理论支撑。【方法】利用海南省文昌鸡品系3个世代(n=2024)群体作为研究对象,测定每只鸡在上市日龄的胫长、胫围、体斜长、龙骨长及胸宽等5个体尺性状。采集血液进行鸡“京芯一号”55 K芯片测序及基因分型,使用GEMMA软件与PLINK软件进行全基因组关联分析,鉴定与体尺性状相关的SNP位点和候选基因,通过LD分析鉴定与体尺性状显著相关的单倍型。【结果】表型结果显示,113日龄文昌鸡公鸡平均胫长8.64 cm,胫围0.46 cm,体斜长19.73 cm,龙骨长12.32 cm,胸宽6.81 cm;母鸡平均胫长6.98 cm,胫围0.40 cm,体斜长17.79 cm,龙骨长10.45 cm,胸宽6.24 cm。经过质控后,共保留42206个SNPs和2024个个体用于后续研究。使用Plink软件进行PCA主成分分析,结果发现3个世代群体存在一定的分散情况,因此在GWAS关联分析中加入了前3个主成分作为协变量,以校正群体结构对关联分析的影响。GWAS结果研究共鉴定出19个SNPs位点与胫长性状显著或建议性显著相关(P值分别为2.17789E-06和4.35578E-05),23个SNPs位点与胫围性状显著或建议性显著相关,7个SNPs位点与体斜长性状显著或建议性显著相关,2个SNPs位点与龙骨长性状显著或建议性显著相关,未鉴定出与胸宽性状或建议性显著相关的SNPs位点。通过对显著性位点进行注释,结果共鉴定到16个体尺性状相关的候选基因,包括羧基末端LIM结构域结合蛋白2(LIM domain binding 2,LDB2)、染色体缩合蛋白G(non-SMC condensin I complex subunit G,NCAPG)、序列相似家族184成员B基因(family with sequence similarity 184 member B,FAM184B)、A型钾离子通道调节蛋白4(potassium voltage-gated channel interacting protein 4,KCNIP4)等。通过LD单倍型分析结果显示,GGA4存在3个显著关联的单倍型,对于胫长性状,rs316943436和rs313978573两个位点位于单倍型区块中;对于胫围性状,rs313196946AA、rs316242963、rs315796839、rs313978573、rs734365522共5个位点位于单倍型区块中;对于体斜长性状,只有1个位点(rs313978573)位于单倍型区块中,其中候选基因LDB2和NCAPG在显著的block区块中被注释到。【结论】经GWAS方法筛选出SEPSECS、LGI2、DHX15、KCNIP4、NCAPG、FAM184B、LDB2、CC2D2A作为胫长性状潜在的候选基因;FH、TBC1D1、DTHD1、SEPSECS、LGI2、SOD3、PPARGC1A、KCNIP4、NCAPG、FAM184B、CLRN2、LDB2、TAPT1、CC2D2A作为胫围性状潜在的候选基因,KCNIP4、LDB2、TAPT1、NRXN3作为体斜长性状潜在的候选基因,FAM184B作为龙骨长性状潜在的候选基因。总之,本文确定了LDB2、NCAPG和FAM184B等作为胫长、胫围、体斜长和龙骨长等体尺性状的潜在功能基因。为文昌鸡体尺性能的分子标记辅助选择育种提供理论支撑。 展开更多
关键词 全基因组关联分析 体尺性状 胫围
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朗德鹅胫部发育规律及与肥肝重的相关关系分析
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作者 王惠影 刘毅 +2 位作者 李光全 龚绍明 何大乾 《中国家禽》 北大核心 2019年第21期72-74,共3页
试验旨在研究朗德鹅胫长和胫围等胫部指标发育规律及其与肥肝重的相关关系。随机选择同批同条件饲养的朗德鹅60只,测定其第4、6、8、10周龄胫长和胫围等指标,分析第10周龄胫部指标与其他周龄的相关关系,并分析开填前朗德鹅胫长和胫围与... 试验旨在研究朗德鹅胫长和胫围等胫部指标发育规律及其与肥肝重的相关关系。随机选择同批同条件饲养的朗德鹅60只,测定其第4、6、8、10周龄胫长和胫围等指标,分析第10周龄胫部指标与其他周龄的相关关系,并分析开填前朗德鹅胫长和胫围与肥肝重的相关性。结果显示:①朗德鹅胫长和胫围的快速发育期在6周龄以前。②10周龄胫长与8周龄胫长相关度最大,10周龄胫围与6周龄胫围相关度最大。③胫长和胫围与肥肝重呈现正相关关系。研究表明:朗德鹅胫长和胫围影响填成率,与肥肝重呈现一定程度正相关,因此,根据其发育规律,加强朗德鹅饲养管理,保证其胫部健康发育在朗德鹅养殖和填饲过程中非常重要。 展开更多
关键词 朗德鹅 胫围 肥肝重
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天山雪鹅早期生长发育规律的研究
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作者 赵洁 李海英 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期364-368,共5页
研究以天山雪鹅核心群N3代为试验材料,对其早期生长发育规律进行研究。以动物生长模型(用Gompertz模型进行拟合,其拟合精度为r=0.99965)为实验手段进行分析。建立天山雪鹅的早期生长标准。探索能用于天山雪鹅的早期选种及某些性状... 研究以天山雪鹅核心群N3代为试验材料,对其早期生长发育规律进行研究。以动物生长模型(用Gompertz模型进行拟合,其拟合精度为r=0.99965)为实验手段进行分析。建立天山雪鹅的早期生长标准。探索能用于天山雪鹅的早期选种及某些性状活体的检测方法,为天山雪鹅肉用品系的进一步选育和配套指标的制定提供理论依据。研究结果表明:天山雪鹅1—3周龄生长强度最大;4~8周龄体重增加较快;6周龄左右是胫长和胫围生长发育的旺盛时期;8周龄以后随着增重的减少,饲料转化率降低。 展开更多
关键词 天山雪鹅 胫围 饲料转化率
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关于优质鸡胫大小测定方法的探讨
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作者 魏国辉 张德祥 张细权 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2010年第19期69-71,共3页
研究以广东温氏南方家禽育种有限公司培育的广西三黄鸡品系为试验材料,先后就鸡胫大小测定方法的问题开展了3个试验。结果表明:由跖骨中间最窄处测得的胫围胫宽相关程度最高,并在育成期几个主要周龄(10~16周)均维持较高的相关水平,熟... 研究以广东温氏南方家禽育种有限公司培育的广西三黄鸡品系为试验材料,先后就鸡胫大小测定方法的问题开展了3个试验。结果表明:由跖骨中间最窄处测得的胫围胫宽相关程度最高,并在育成期几个主要周龄(10~16周)均维持较高的相关水平,熟手员工测定的重复性明显比生手员工好。可以预测,从跖骨中间最窄处测得的胫宽能代替胫围作为衡量优质鸡胫大小的指标。 展开更多
关键词 胫围 相关性 优质鸡
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番鸭部分生长性状遗传参数估计
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作者 季从亮 张德祥 +1 位作者 李昂 罗庆斌 《养禽与禽病防治》 2013年第5期2-4,共3页
本研究以广东温氏南方家禽育种有限公司的番鸭N103品系第5世代公鸭为材料,测定77日龄时的体重、胫长和胫围等指标,结合第4世代、第5世代的系谱资料,估计体重、胫长和胫围等性状的遗传参数。结果显示,体重、胫长和胫围这3个性状属于中等... 本研究以广东温氏南方家禽育种有限公司的番鸭N103品系第5世代公鸭为材料,测定77日龄时的体重、胫长和胫围等指标,结合第4世代、第5世代的系谱资料,估计体重、胫长和胫围等性状的遗传参数。结果显示,体重、胫长和胫围这3个性状属于中等遗传的性状,遗传力估计值分别为0.292±0.075、0.309±0.081和0.322±0.075,体重与胫长、体重与胫围和胫长与胫围之间的遗传相关分别为0.537±0.174、0.458±0.156和0.484±0.165。 展开更多
关键词 遗传参 数体重 胫围
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Internal fixation and bone grafting for intraarticular nonunion of tibial plateau: a report of four cases 被引量:4
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作者 Ramesh K Sen Ashwani Soni Uttam Chand Saini Daljit Singh 《Chinese Journal of Traumatology》 CAS 2011年第6期371-375,共5页
Intraarticular nonunion of tibial plateau is rare. In the literature, only 9 patients were found to be treated for intraarticular tibial plateau nonunion and they got varying results. Internal fixation along with bone... Intraarticular nonunion of tibial plateau is rare. In the literature, only 9 patients were found to be treated for intraarticular tibial plateau nonunion and they got varying results. Internal fixation along with bone grafting was done as a standard treatment in all cases. We treated 4 different profile cases of intraarticular tibial plateau nonunion in our institution by 4 different methods. We treated these cases with plaster of paris cast, internal fixation along with bone graft, arthrodesis with K-nail and total knee replacement. Case 1 was treated with plaster of paris (POP) cast as the patient refused surgery. The fracture was united and the patient was fully satisfied with full range of motion despite valgus malalignment. Case 2 was managed with open reduction internal fixation along with bone grafting. Thepatient had a good union and got full range of motion at the knee joint. Case 3 was treated with total knee arthroplasty due to her old age and got satisfactory result. Case 4 was an infected nonunion. Arthrodesis was done and the patient could walk with full weight bearing independently. We conclude that internal fixation along with bone grafting may not be suitable in all cases of intraarticular nonunion of tibial plateau. Causes of nonunion, present condition and range of motion of the knee joint, as well as the age of patient should be all considered and the treatment should be individualised according to each patient's situation. 展开更多
关键词 Intra-articular fractures ARTHRODESIS Fracture fixation internal
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