藏猪、川乡黑猪妊娠期子宫体繁殖功能相关lncRNA鉴定和功能预测

[目的]探讨长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在藏猪、川乡黑猪繁殖过程中的调控机理,筛选相关lncRNA。[方法]采集具有不同产仔数的藏猪和川乡黑猪妊娠期的子宫体组织作为样本,建立特异性猪子宫mRNA文库,利用Illumina PE150 HiSeq平台进行测序,测序结果经过质控、比对与拼接后,筛选出差异表达lncRNA并预测其靶基因,对靶基因进行GO功能和KEGG通路富集分析。随机选取7个差异表达lncRNAs进行实时荧光定量PCR验证。[结果]在藏猪和川乡黑猪子宫体中存在32个共同差异表达lncRNAs,共得到168个靶基因。GO功能分析显示,不同繁殖能力的样本共同差异表达lncRNA的靶基因主要富集于分子代谢、转录活性调节、细胞增殖调节、子宫体修饰、微量元素代谢等条目中;KEGG通路分析显示,共同差异表达lncRNA的靶基因主要富集在糖酵解过程、卵母细胞分裂、细胞寿命调节、Ras信号通路、RIG-Ⅰ信号通路、FoxO信号通路、HIF-1信号通路、调控稳态过程等。实时荧光定量PCR结果显示,7个差异表达lncRNAs的表达与转录组测序结果一致。[结论]本研究在藏猪和川乡黑猪子宫体中发现了32个可能通过调控潜在靶基因参与母猪妊娠过程的lncRNAs,为进一步研究lncRNA在母猪繁殖过程中的调节机制提供了参考依据。这些lncRNA可作为新的繁殖性状生物标记用于猪的育种过程中。

长白猪和藏猪在不同日龄、种间的代谢物差异分析

通过对地方品种猪及外种猪的不同生长阶段代谢组学进行比较研究,以此了解地方品种猪与外种猪代谢组差异与耐粗饲性状的关系。采用UPLC-MS技术对7日龄和30日龄的长白猪和藏猪的粪便样品开展代谢组学研究,分析代谢物的变化情况,筛选差异代谢物的情况。结果显示,长白猪不同日龄代谢物VI P≥1的总共有99种,其中38种代谢物的比例是上升的,另61种代谢物主要存在下降趋势;藏猪不同日龄代谢物VIP≥1的总共有90种,其中31种代谢物的比例是上升的,另59种代谢物存在下降趋势;7日龄的长白猪和藏猪代谢物对比发现VIP≥1的总共有59种,其中29种代谢物的比例主要是上升趋势,另30种是下降趋势;30日龄的长白猪和藏猪代谢物对比VI P≥1的总共有66种,其中32种代谢物的比例是上升的,另34种代谢物存在下降趋势。说明不同种间、日龄代谢物含量存在差异,其中同种不同日龄猪的代谢物差异最多,说明随着年龄的增长猪对粗纤维等粗饲料的消化代谢能力有所差异。通过对代谢通路的分析显示,主要存在差异的代谢通路为Metabolic pathways、ABC transporters,参与差异代谢通路的代谢物主要是有机酸、核苷酸、氨基酸等相关代谢物,说明藏猪和长白猪在耐粗饲的特性上与粗饲料对肠道的影响有一定的关联性。此研究为解释在代谢组学方面藏猪耐粗饲特性提供了一定的理论基础。

巴克夏猪、藏猪和巴藏杂交猪的胴体性能及肉品质分析

本实验旨在比较巴克夏猪、藏猪及巴藏杂交猪同体重下的胴体性能及肉品质,以确定杂交对藏猪的改良效果。选用初始体重在30 kg左右的巴克夏猪、藏猪、巴藏杂交猪各16头,公母各半,在同等饲养条件下,对率先达到110 kg左右的巴克夏猪进行屠宰,待巴藏杂交猪和藏猪达到110 kg左右时再分别进行屠宰,测定胴体性能以及肉品质指标。结果表明:巴藏杂交猪瘦肉率高于藏猪(P<0.01),巴克夏屠宰率和眼肌面积高于藏猪(P<0.05);整体来看巴克夏猪与巴藏杂交猪和藏猪均没有出现PSE肉和DFD肉,测定的全部指标处在正常优质猪肉品质范围;巴克夏猪肉的必需氨基酸中赖氨酸、蛋氨酸、亮氨酸含量低于巴藏杂交猪(P<0.05);巴克夏猪肉中亚油酸含量高于巴藏杂交猪和藏猪(P<0.01),藏猪猪肉中油酸含量高于巴克夏和巴藏杂交猪(P<0.01)。由此可见,巴克夏猪、藏猪、巴藏杂交猪均属于优质猪肉。巴克夏猪在杂交改良中是优秀的父本,是拥有着高瘦肉率眼肌面积以及高亚油酸的优质猪肉品种,而藏猪肉质肥美营养丰富,培育出的巴藏杂交猪进一步改善了肉品质,但仍有待进一步选育。

迪庆州藏猪ASFV的流行现状及实验室诊断技术

非洲猪瘟(ASF)是由非洲猪瘟病毒引起的高度接触性、急性、热性传染病,病程短,死亡率高。藏猪养殖业历史悠久,特别是云南省迪庆州香格里拉市,当地自然生态环境适宜藏猪生长。然而当地大规模传统养殖的方式导致了高污染和高浪费,并加速了非洲猪瘟的传播,危及猪群健康,对当地造成了巨大的经济损失。针对这一现状,就需要建立完善的非洲猪瘟诊断技术,减少本病对藏猪养殖业带来的经济损失,推动藏猪养殖产业的健康可持续发展。该文是通过对迪庆州藏猪进行非洲猪瘟的病原学、流行病学等方面进行分析,对实验室常用的荧光PCR诊断技术进行阐述。

基于16S rRNA基因及宏基因组测序解析藏猪肠道菌群组成特征

【目的】旨在通过分析藏猪肠道菌群组成及其功能注释,探讨藏猪肠道菌群与其耐粗饲和抗逆性能的关系。【方法】以66头藏猪粪便微生物为试验材料,提取DNA样本,利用16S rRNA基因测序技术分析在门水平和属水平藏猪的肠道菌群组成,构建共有核心菌的菌群互作网络,结合27头藏猪肠道微生物宏基因组测序数据,进行KEGG通路和碳水化合物代谢酶(CAZymes)数据库注释分析,以期阐明与藏猪纤维代谢能力强和抗病力等优良特性相关的功能通路。【结果】(1)16S rRNA测序分析结果显示,拟杆菌门(Bacteroidetes)(39.34%~60.72%)和厚壁菌门(Firmicutes)(24.65%~38.5%)在藏猪肠道微生物门水平上占优势,而在属水平则依次是普雷沃氏菌属(Prevotella)、密螺旋体属(Treponema)和琥珀酸弧菌属(Succinivibrio)的丰度最高;(2)利用Cytoscape软件构建藏猪肠道样品中共有的26个核心菌属之间的互作网络,各菌群在网络中存在合作关系和竞争关系,证明藏猪肠道菌群结构比较稳定;(3)宏基因组鸟枪法测序结果显示,在KEGG功能注释中藏猪肠道主要富集营养物质合成代谢和遗传信息处理相关通路,包括氨基酸的生物合成、碳代谢、群体感应通路等。此外,使用CAZymes数据库注释显示藏猪肠道中的糖基转移酶(GTs)基因家族相对丰度最高,主要为GT2、GT4和GT41基因,其次是糖苷水解酶基因家族(GHs)的GH13、GH2和GH3基因。【结论】藏猪具有丰富且独特的微生物组成和功能通路,与免疫和抗病相关的疣微菌门(Verrucomicrobia)和阿克曼氏菌(Akkermansia)是藏猪肠道特有的高丰度菌属,可能与藏猪适应高海拔低氧低温的环境及其抗病性能有关;与粗纤维代谢相关的密螺旋体属Treponema、Sphaerochaeta、纤维杆菌属Fibrobacter在藏猪肠道中富集,能够帮助藏猪降解饲粮中的粗纤维,适应半放牧的饲养模式。研究结果有助于了解肠道微生物在藏猪耐粗饲和抗逆性中的作用机制,为今后对藏猪优良特性的开发利用提供新的思路。

不同藏猪类群全线粒体基因组群体多样性与系统发育研究

本试验旨在研究藏猪4个类群的全线粒体基因组的群体多样性与系统发育关系。研究共收集120头分布在4个地区的藏猪进行重测序,组装线粒体基因组并对其进行分析。结果表明:西藏藏猪拥有相对高的遗传多样性(Pi=0.00111);四川藏猪与西藏藏猪的遗传距离相对更近(0.045)。构建系统发育树发现,甘肃藏猪与云南藏猪群体内部相对独立。单倍型分析发现4个藏猪群体存在27个单倍型,西藏藏猪拥有高于其他群体的单倍型分布(12/27)。综上所述,4个地理分布不同的藏猪群体全线粒体基因组存在差异,甘肃藏猪与云南藏猪的系统发育关系揭示了群体内部可能存在近交进而导致遗传距离降低。本研究为进一步更新藏猪类群遗传多样性与遗传结构提供了理论支持,并为藏猪的保种与利用奠定了基础。

四川省甘孜州部分地区藏猪消化道寄生虫感染情况调查

为了解四川省甘孜州部分地区藏猪消化道寄生虫感染情况,通过饱和盐水漂浮法结合形态学对采自该地区7个养殖场的176份藏猪新鲜粪便样品中的寄生虫虫卵和卵囊进行鉴定。结果显示,检测样品中猪蛔虫虫卵、猪毛尾线虫虫卵、食道口线虫虫卵以及猪囊等孢球虫卵囊的阳性率分别为42.04%(74/176)、25.57%(45/176)、5.11%(9/176)和43.18%(76/176),总感染率达75%(132/176);腹泻粪便样本寄生虫感染率80.88%(55/68),显著高于非腹泻粪便样本71.29%(77/108)(P<0.05);放牧藏猪寄生虫感染率85.06%(74/87),显著高于圈养藏猪65.17%(58/89)(P<0.05)。表明四川省甘孜州部分地区藏猪消化道寄生虫的感染较为严重,为该地区藏猪消化道寄生虫病的防控提供了依据。

藏猪促炎因子(IL-1β、IL-6、TNF-α)多态性及其表达与免疫性状的关联分析

本研究以约克夏猪为对照,旨在分析藏猪和约克夏猪的血液生理指标和免疫相关器官组织表达谱方面的差异,结合藏猪外周血淋巴细胞在LPS刺激下,促炎因子IL-1β、IL-6和TNF-α的表达情况,探究IL-1β、IL-6及TNF-α对藏猪免疫性状的影响。试验选择180日龄的藏猪和约克夏猪各40头按品种分为两个试验组,采集新鲜血液用于检测血液生理指标;采集猪外周淋巴血用于培养外周血淋巴细胞。随机选取藏猪和约克夏猪各8头按品种分为两个试验组,前腔静脉采集新鲜血液、屠宰后采集黄豆样大小的肝脏、脾脏、下颌淋巴结组织Trizol法提取RNA。每个个体样品设置3个重复,借助RT-qPCR和一代测序技术检测IL-1β、IL-6、TNF-α基因表达情况和基因多态性。设置4组浓度的LPS(0、1、10、100μg·mL^(-1)),每组设置3个重复去刺激外周血淋巴细胞,于0、24、36、48、72 h收集细胞,用RT-qPCR检测促炎因子mRNA的表达情况。结果表明:1)藏猪的WBC、RBC、HGB、HCT和PLT水平极显著高于约克夏猪(P<0.01),同时,平均MCV和PCT也在藏猪中显著高于约克夏猪(P<0.05)。2)RT-qPCR结果表明,在藏猪的血液、脾脏和肝脏组织中,IL-1β、IL-6和TNF-α基因的mRNA表达量也均显著高于约克夏猪(P<0.01);在藏猪的下颌淋巴结中,IL-1β和TNF-α基因的表达量显著高于约克夏猪(P<0.05),IL-6基因的mRNA表达量极显著高于约克夏猪(P<0.01)。3)SNP位点筛选结果发现,在IL-1β基因3′侧翼区存在5个突变位点,其中G^(690)T、C^(1383)G、C^(1480)T、A^(1497)G位点在藏猪和约克夏猪群体间存在极显著差异(P<0.01),C^(1454)T位点在藏猪和约克夏猪群体存在显著差异(P<0.05);IL-6基因3′侧翼区存在1个有义突变位点C^(265)T,两品种间呈显著差异(P<0.05),在5′侧翼区存在1个有义突变位点A-72G,两品种间呈极显著差异(P<0.01);TNF-α基因在5′侧翼区存在1个有义突变位点,但两品种间差异不显著(P>0.05)。4)不同浓度LPS刺激藏猪外周血淋巴细胞试验结果表明,10μg·mL^(-1)浓度的LPS对藏猪外周血淋巴细胞的增殖效应最为显著。在1、10μg·mL^(-1)浓度LPS刺激下,IL-1β基因作出较明显应答,在100μg·mL^(-1)浓度LPS刺激下,IL-6基因作出较强应答。综上所述,和约克夏猪相比,藏猪在血液生理指标、免疫组织器官中促炎因子表达以及基因多态性方面表现出更强的抗病能力。其中IL-6基因的A-72G位点可能与免疫性和抗病能力密切相关。在藏猪外周血淋巴细胞培养试验中,IL-1β和IL-6基因对LPS的显著应答突显了它们在免疫调控中的关键作用。

藏猪与杜长大三元猪免疫器官和组织中Toll样受体与抗菌肽基因的表达差异分析

【目的】在哺乳动物中,Toll样受体和抗菌肽基因是先天免疫系统的重要组成部分,在对抗病原体侵袭过程中起至关重要的作用。针对藏猪和杜长大三元猪的Toll样受体和抗菌肽基因在不同免疫器官或组织中的表达差异进行探索,以揭示这些基因对于抗病能力和免疫反应的潜在贡献,为筛选抗病分子标记提供理论支撑。【方法】通过qPCR对6月龄藏猪和杜长大三元猪肺脏、肠系膜淋巴结、腹股沟淋巴结、颌下淋巴结和脾脏中Toll样受体基因(TLR1~TLR9)和两种抗菌肽基因(PBD-1和PR-39)的mRNA丰度进行检测。【结果】在藏猪的免疫器官或组织中Toll样受体与抗菌肽基因的m RNA表达大多数显著高于杜长大三元猪。其中,肺脏中TLR1、TLR2的m RNA表达量均提高50%左右,PR-39提高2.6倍;肠系膜淋巴结中TLR4的表达提高40%,TLR1、PR-39的表达分别提高88%和3倍;腹股沟淋巴结中TLR1、TLR2的表达提高约2倍,TLR9、PR-39的表达提高70%,PR-39的表达更是提高了7倍多;颌下淋巴结中TLR1、TLR2、TLR4、TLR7的表达均高出2倍以上,PR-39的表达也高出近7倍,它与腹股沟淋巴结中的水平相近;脾脏中TLR1的表达上升3.5倍,与在颌下淋巴结中的表达结果相似。TLR4、TLR9的表达上升50%左右,PR-39的表达上升2.5倍。【结论】藏猪相对于杜长大三元猪,在多个免疫器官或组织中的Toll样受体和抗菌肽基因表现出更高的表达水平。暗示藏猪可能拥有更强大的先天免疫能力,能够产生更有效的局部或系统免疫反应对抗病原微生物的感染。研究结果为识别抗病分子标记提供了重要的理论支持,有望为进一步改良藏猪和其他猪种的抗病性提供科学依据。

藏猪与DLY猪结肠消化酶活性、菌群结构及短链脂肪酸含量差异研究

【目的】探究藏猪和DLY猪结肠的消化酶活性、菌群结构和短链脂肪酸含量的差异,为2种猪的生产和理论研究提供参考。【方法】分别选取5头同一天分娩的藏仔猪和杜洛克×长白×约克三元杂交猪(DLY猪),饲养至210日龄,称量藏猪和DLY猪的体质量,并计算2种猪的平均日增质量。将藏猪和DLY猪屠宰后采集结肠粪便样品,分别利用Elisa试剂盒、高通量测序技术和气相色谱法测定藏猪和DLY猪结肠消化酶(纤维素酶和半纤维素酶)活性、菌群结构和短链脂肪酸(乙酸、丙酸、异丁酸、丁酸、异戊酸和戊酸)含量,分析2种猪结肠中以上差异指标之间的相关性。【结果】DLY猪的平均日增质量显著高于藏猪(P<0.05)。藏猪与DLY猪结肠中纤维素酶和半纤维酶的活性均无显著差异(P>0.05);藏猪结肠的6种Alpha多样性指数均显著高于DLY猪(P<0.05)。在门分类水平上,相较于DLY猪,藏猪结肠中拟杆菌门、疣微菌门和蓝细菌门的相对丰度显著升高,而厚壁菌门、梭杆菌门和浮霉菌门的相对丰度显著降低(P<0.05);在科分类水平上,藏猪的普雷沃氏菌科、月形单胞菌科、红螺菌科、弯曲菌科、阿克曼氏菌科和紫单胞菌科相对丰度显著高于DLY猪,而瘤胃球菌科、梭菌科、消化链球菌科、肠杆菌科和浮霉状菌科相对丰度显著低于DLY猪(P<0.05)。在属和种分类水平上,共有8个菌属和4个菌种在藏猪和DLY猪中存在显著差异,其中藏猪的月形单胞菌属、阿克曼氏菌属、弯曲杆菌属、马赛菌属、布劳特氏菌属以及纤维杆菌、普拉梭菌和罗伊氏乳杆菌相对丰度显著高于DLY猪,而梭菌属、艰难梭菌属、埃希氏菌属和大肠埃希氏菌相对丰度显著低于DLY猪(P<0.05)。藏猪结肠中乙酸、丙酸和丁酸含量显著低于DLY猪(P<0.05)。在藏猪和DLY猪结肠中,拟杆菌门与厚壁菌门相对丰度和丁酸含量存在极显著负相关性,而厚壁菌门相对丰度与丁酸含量存在极显著正相关性(P<0.01);厚壁菌门和梭菌属相对丰度与乙酸含量具有显著正相关性,而月形单胞菌属相对丰度与丙酸含量具有显著负相关性(P<0.05)。【结论】在本试验条件下,藏猪和DLY猪结肠菌群结构及短链脂肪酸含量均存在差异,表明藏猪和DLY猪结肠微生物对营养物质消化影响可能不同。

藏猪源细环病毒的全基因组测序和分析

为了解四川省甘孜藏族自治州藏猪群体内猪细环病毒(TTSuV)的流行情况和遗传变异特点,本试验从该地区17个藏猪养殖场采集呼吸道症状明显的猪鼻拭子、肺脏组织和肺泡灌洗液样本共计101份进行宏基因组测序、TTSuV PCR检测和鉴定、全基因组和ORF1基因遗传演化和遗传变异分析以及ORF1蛋白氨基酸遗传变异分析和ORF1蛋白预测分析。结果显示,TTSuV总阳性率为19.8%(20/101),其中,TTSuV1总阳性率为6.93%(7/101),TTSuVk2总阳性率为15.84%(16/101),TTSuV1和TTSuVk2混合阳性率为2.97%(3/101);获得3株TTSuV全基因组序列,分别命名为Scgz-1(2 815 bp)、Scgz-2(2 578 bp)和Scgz-3(2 757 bp);3株毒株均属于TTSuVk2型,其中Scgz-1毒株属于TTSuVk2b亚型,Scgz-2和Scgz-3毒株属于TTSuVk2a亚型;3株毒株全基因组序列彼此之间的相似性为56.2%~74.9%,其中ORF1基因核苷酸序列相似性为53.6%~73.6%;3株毒株ORF1蛋白氨基酸序列与参考毒株氨基酸序列相似性为43.2%~98.5%,序列之间差异性均较大;3株毒株的ORF1蛋白均为不稳定蛋白且复杂。本试验对川西高原地区藏猪的TTSuV开展调查分析,发现藏猪群中流行TTSuV毒株基因变异较大,可为该地区藏猪呼吸道疾病的防控提供参考。

藏猪肝脏脂质组的高通量鉴定与解析

本研究旨在揭示藏猪肝脏的脂质组成,营养特性,以及响应高海拔环境的生理机制。通过液相色谱-质谱联用的高通量脂质组学分析技术,探究西藏林芝地区约3000 m海拔下的藏猪肝脏中脂质组谱。结果显示:在藏猪肝脏中鉴定到1101种脂质分子,主要包括272种甘油三酯(TG)、91种甘油二脂(DG)和87种磷脂酰胆碱(PC)等28种脂质类别;PC是含量最丰富的磷脂类分子,达到总磷脂的38.73%;游离脂肪酸(FFA)中含有38.60%的多不饱和脂肪酸。

藏猪和大约克猪INHBA基因多态性及差异表达分析

为探究INHBA基因在藏猪与大约克猪中的多态性与表达差异。在DNA水平上对藏猪、大约克猪INHBA基因5'侧翼区和CDS区进行了单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点筛选,同时在mRNA水平上用荧光定量PCR(qRT-PCR)方法检测INHBA基因在卵巢组织中的相对表达量。结果发现:INHBA基因在5'侧翼区存在一个突变位点A-1589T,并在藏猪与大约克猪2个品种间存在极显著差异(P<0.01);经转录因子预测,发现该突变位点与繁殖性能相关,并推测消失的转录因子结合位点可能是导致藏猪繁殖力低的主要原因之一。INHBA基因在卵巢中,藏猪表达量极显著高于大约克猪(P<0.01),推测INHBA基因可能与猪繁殖性能有关,并对提高猪的繁殖性能起到积极作用。本研究结果为进一步探究INHBA基因在猪繁殖性能的作用机制提供理论支撑。

不同育肥期对松潘藏猪生长性能及肉品质的影响

该试验旨在探索不同育肥期对松潘藏猪生长性能及肉品质的影响。选用3月龄体重相近的松潘藏猪24头,随机分为试验组和对照组,测定生长性能及肉品质相关指标。结果表明,全期头均日增重试验组相比对照组下降7.20%(P<0.05)。全期料重比试验组比对照组下降42.13%(P<0.01)。对照组的屠宰率、背膘厚和眼肌面积分别比试验组高8.26%(P<0.05)、29.43%(P<0.01)和7.58%(P>0.05)。与对照组相比,试验组水分、粗灰分和粗蛋白分别增加1.97%(P>0.05)、4.32%(P>0.05)和9.54%(P<0.05),肌内脂肪下降13.28%(P<0.05)。在该试验条件下,松潘藏猪按传统“放牧+半舍饲”育肥方式,以育肥360d(15月龄)左右完成育肥屠宰可取得较好的生长效率及肉品质。

人工模拟条件下藏猪猪粪对土壤pH值及重金属影响的研究

本研究旨在探究藏猪猪粪有机肥施用田间后对土壤中pH值及铜、锌、砷、铬和镉等重金属含量的影响,于个体农户中搜集藏猪猪粪,经厌氧发酵后配制成粪水作为有机肥料,以林芝市巴宜区百巴镇百巴村农田周围土壤作为供试原始土壤,采用模拟试验方法,以0 cm、10 cm、20 cm、40 cm、80 cm、150 cm和300 cm处土层土壤为样本,测定施用藏猪猪粪有机肥30 d后土壤中pH值及铜、锌、砷、铬和镉等重金属含量的变化情况。结果表明:施用藏猪猪粪后,土壤pH值显著提高,表明藏猪猪粪对改善土壤pH值,抑制土壤酸化或修复酸化土壤具有良好效果;施用藏猪猪粪后,土壤中铜、锌、砷、镉和铬等重金属元素含量未见有显著变化,表明藏猪猪粪施用于田间对土壤重金属含量无明显影响,藏猪猪粪可以作为有机肥料参与到农业生产活动中。目前关于藏猪猪粪对土壤的影响未见报道,本研究填补了藏猪猪粪对土壤重金属含量影响的研究空白,同时也为西藏地区农牧民在农业生产活动过程中合理利用藏猪猪粪有机肥资源提供了理论依据。

基于转录组测序的藏猪睾丸组织性成熟相关基因鉴定

【目的】基于转录组测序分析筛选出藏猪睾丸组织中的性成熟相关基因,为提高藏猪的繁殖育种性能提供参考依据。【方法】以性成熟前(2月龄)和性成熟后(24月龄)的藏公猪为研究对象,通过人工阉割法采集藏猪睾丸组织进行转录组测序,依据错误发现率(FDR)<0.05且|log_(2)FoldChange|>1的标准筛选差异表达基因(DEGs),综合GO功能注释分析和KEGG信号通路富集分析筛选出藏公猪性成熟相关候选基因,并通过实时荧光定量PCR验证转录组测序结果的准确性。【结果】经转录组测序,从性成熟前后藏猪睾丸组织样品中筛选出5929个DEGs,其中有3822个DEGs呈上调表达、2107个DEGs呈下调表达。筛选获得的5929个DEGs主要注释到生精过程、纤毛运动、鞭毛精子运动、运动纤毛、精子主块、精子顶囊、动力蛋白轻链结合、动态蛋白中间链结合等与精子发生和精子运动等有关的GO功能条目;KEGG信号通路富集分析发现,DEGs主要富集于受体相互作用通路、轴突引导通路、神经活性配体—受体相互作用通路、钙信号通路等;综合DEGs的GO功能注释分析和KEGG信号通路富集分析结果,共筛选出9个与藏公猪性成熟相关的基因,分别是BAX、DMRT1、FSHR、IGF1R、IZUMO1、LYZL4、LYZL6、SYCP3和TNP2。实时荧光定量PCR检测结果显示,BAX、DMRT1、FSHR、IGF1R等4个基因在性成熟后藏猪睾丸组织中的相对表达量较性成熟前呈明显的下降趋势,且下降幅度均在50%以上;IZUMO1、LYZL4、LYZL6、SYCP3、TNP2等5个基因的相对表达量较性成熟前上升了1.07~30.25倍,其中IZUMO1、LYZL4和LYZL6基因的上升倍数达极显著水平(P<0.01),与转录组测序结果基本一致。【结论】基于转录组测序分析从藏猪睾丸组织中筛选获得9个与性成熟相关的DEGs,即BAX、DMRT1、FSHR、IGF1R、IZUMO1、LYZL4、LYZL6、SYCP3和TNP2,可作为研究藏猪繁殖育种能力的主要候选基因。

藏猪与大约克猪CES1基因多态性与差异表达分析

本研究旨在探究CES1基因在藏猪与大约克猪不同日龄中背部脂肪组织mRNA表达水平及CES1基因单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP),通过Sanger测序对藏猪与大约克猪CES1基因起始密码子上游2 kb区域筛选SNP及分析其基因型频率。通过荧光定量PCR试验(RT-qPCR)分别对30日龄、90日龄和180日龄的藏猪和大约克猪背部脂肪组织中CES1基因mRNA表达量进行检测。结果显示:在CES1基因起始密码子上游2kb区域发现了4个单核苷酸多态性位点,分别为:G-1156A、C-998A、C-844T和T-552C,且这些突变位点均符合哈迪-温伯格定律。RT-qPCR试验中发现CES1基因在不同猪种、不同日龄阶段的猪中均存在差异表达,值得注意的是,不管在30日龄、90日龄或180日龄中,藏猪背脂组织中CES1基因的mRNA表达水平均极显著高于大约克猪,推测CES1基因与脂质代谢呈负相关,从而促进了藏猪体内的脂肪沉积。本研究结果为下一步深入开展CES1基因功能研究奠定了基础。

西藏藏猪养殖模式下非洲猪瘟防控措施建议

藏猪作为高原特有的原始地方畜类资源及主要的生猪养殖品种,具有非常重要的经济、生态和科学研究价值。根据西藏藏猪养殖模式及非洲猪瘟的流行病学特点,深入分析西藏藏猪非洲猪瘟疫情主要传播原因,旨在提出切实有效的防控措施,扎实做好西藏藏猪非洲猪瘟的防控工作。

2021-2022年林芝市藏猪PRRS血清学调查与分析

为了解猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)在西藏林芝市藏猪群中的流行情况,本研究于2021年6月至2022年6月从各区县散养户和养殖场采集没有接种PRRS疫苗的藏猪血清样品共计359份,采用ELISA方法进行PRRSV抗体检测,并统计分析。结果显示,采集的359头份藏猪血清中PRRSV抗体阳性率为10.86%(39/359),其中地区II阳性率最高(14.49%,10/69),其次是地区I(14.29%,7/49);分性别统计,雌性藏猪与雄性藏猪PRRSV抗体阳性率分别11.98%(26/217)、9.15%(13/142);分种类统计,能繁母猪、种公猪、仔猪、育肥猪PRRSV抗体阳性率分别为12.03%(16/133)、9.76%(4/41)、13.64%(15/110)、5.33%(4/75);分养殖方式统计,养殖场、散养户藏猪PRRSV抗体阳性率分别为11.56%(26/225)、9.70%(13/134)。表明藏猪群中存在PRRSV感染,不同性别、种类、养殖方式的藏猪PRRSV感染差异性不显著(P>0.05),不同区县、猪场(养殖户)的藏猪PRRSV感染差异性显著(P<0.05)。本研究可为林芝市藏猪PRRS的防控提供一定参考依据。

藏猪仔猪育肥技术及饲养管理

该研究深入探讨了藏猪仔猪育肥问题及策略,旨在通过科学的方法提高藏猪育肥效率和肉质,同时确保可持续发展。该文分析藏猪仔猪的生物学特性及育肥阶段的重要性,指出育肥期对藏猪生长效率的显著影响,进一步讨论了育肥管理中存在的问题,包括饲养管理不足、疾病防控缺失和环境管理问题。针对这些问题,提出了相应的改进策略:在饲养管理方面,强调了科学配制饲料和高效管理模式的重要性;在疾病预防与控制方面,建议建立健全的疾病监测体系和实施有效的疫苗接种计划;在环境管理方面,提出了优化温湿度控制、通风和卫生条件的建议。该文为藏猪育肥提供了一套综合的管理策略,不仅能提高育肥效率和肉质,还有助于藏猪产业的可持续发展。