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非修饰靶点发现细胞热位移分析技术的变革与应用进展
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作者 刘广苑 李亚慧 +1 位作者 张炜 孔德志 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期25-34,共10页
了解药物的蛋白靶点研究方法对于新药研发、药物的临床应用、药物的作用机制和疾病的致病机制都具有十分重要的意义。细胞热位移分析(cellular thermal shift assay,CETSA)作为无修饰分析的靶点研究方法自开发以来就被广泛应用。经过不... 了解药物的蛋白靶点研究方法对于新药研发、药物的临床应用、药物的作用机制和疾病的致病机制都具有十分重要的意义。细胞热位移分析(cellular thermal shift assay,CETSA)作为无修饰分析的靶点研究方法自开发以来就被广泛应用。经过不断地演化,现在已经出现了多种基于CETSA的技术结合,如基于质谱的细胞热位移分析(mass spectrometry-based cellular thermal shift assay,MS-CETSA)、结合等温剂量反应实验的细胞热位移分析(isothermal dose response-cellular thermal shift assay,ITDR-CETSA)、结合均相光激化学发光免疫分析的细胞热位移分析(amplified luminescent primity homogeneous assay-cellular thermal shift assay,Alpha-CETSA)等。这些技术融合了各自的优势,进一步扩展了CETSA的应用范围,适用于从药物筛选到监测药物在患者体内的靶点结合和脱靶毒性研究的整个药物开发链。本文结合作者的研究经验,综述了近年来CETSA和相关结合技术的原理及其在靶点发现上的应用、数据处理分析的进展,旨在为CETSA的进一步应用提供参考和借鉴。 展开更多
关键词 细胞热位移分析 热蛋白质组分析 靶点发现 技术结合
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非标记小分子药物靶点发现技术及其在中药研究中的应用 被引量:1
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作者 林园园 喻金浩 +3 位作者 卢华秋 陈萱 陈宁波 周建良 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期1117-1127,共11页
药物靶点的发现在药物研发中发挥着至关重要的作用,非标记的药物靶点发现技术因其无需改造药物小分子结构,能更真实反映小分子药物与靶点互作,成为药物靶点发现的新途径。中药(traditional Chinese medicines,TCMs)具有多成分、多靶点... 药物靶点的发现在药物研发中发挥着至关重要的作用,非标记的药物靶点发现技术因其无需改造药物小分子结构,能更真实反映小分子药物与靶点互作,成为药物靶点发现的新途径。中药(traditional Chinese medicines,TCMs)具有多成分、多靶点的特性,其作用靶点及机制的研究备受制约,鉴于非标记的药物靶点发现技术在TCMs化学成分靶点发现研究中的应用潜力,本文综述了非标记的药物靶点发现新技术及其在TCMs研究中的应用,为TCMs化学成分靶点的发现提供参考,为促进TCMs现代化的发展提供新思路。 展开更多
关键词 药物靶点发现技术 非标记 中药 复杂样品 活性成分
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非化学修饰的药物靶点发现技术在中药研究中的应用 被引量:2
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作者 任家乐 韩晓露 +1 位作者 杨珍 张艳军 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2022年第17期5513-5522,共10页
中医药是我国的科学与文化瑰宝,具有数千年的临床用药经验。中医药在复杂疾病及慢性疾病防治方面具有显著优势,在当前全球肆虐的新型冠状病毒肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)防治中也彰显了其优势,但由于作用机制不清楚等问... 中医药是我国的科学与文化瑰宝,具有数千年的临床用药经验。中医药在复杂疾病及慢性疾病防治方面具有显著优势,在当前全球肆虐的新型冠状病毒肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)防治中也彰显了其优势,但由于作用机制不清楚等问题严重限制了其推广应用。化学药治疗疾病作用机制明确,具有成熟的药物靶点发现技术,主要包括化学修饰技术和非化学修饰技术。中药具有多成分、多靶点的作用特点,应用化学修饰技术进行作用靶点的研究具有一定的局限性。因此,主要介绍细胞热位移分析、分子对接技术、药物亲和反应的靶点稳定性和表面等离子共振技术等非化学修饰的药物靶点发现技术的原理、操作流程和应用,并对其在中药作用机制研究中的潜在优势与不足进行讨论,以期探索出一种中药作用靶点发现模式,为中药作用机制的阐明提供参考与借鉴,助推中医药现代化进程。 展开更多
关键词 非化学修饰的药物靶点发现技术 细胞热位移分析 分子对接技术 药物亲和反应的稳定性 表面等离子共振技术
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人工智能在药物靶点的筛选及验证方面的应用进展 被引量:1
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作者 王超 肖辅 +5 位作者 李妙竹 潘颖 丁晓 任峰 Zhavoronkov Alex 王亚洲 《中国药科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期269-281,共13页
近年来人工智能发展迅速,随着算力的提升、算法的迭代,人工智能极大方便了生物信息、化学信息和临床数据的收集及处理,为新药研发注入了新的活力。本综述对人工智能在制药领域的发展历程及其主要算法进行了简要介绍,随后结合具体实例对... 近年来人工智能发展迅速,随着算力的提升、算法的迭代,人工智能极大方便了生物信息、化学信息和临床数据的收集及处理,为新药研发注入了新的活力。本综述对人工智能在制药领域的发展历程及其主要算法进行了简要介绍,随后结合具体实例对人工智能在药物靶点筛选及验证方面的不同阶段进行了详细描述,包括药物靶点发现、蛋白结构预测以及苗头化合物生成与优化等。最后对人工智能平台“端到端”的一次高效应用过程进行了具体讨论。 展开更多
关键词 人工智能 靶点发现 蛋白结构预测 苗头化合物生成 端到端应用
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中药复方的现代基础研究进展述评 被引量:1
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作者 杨洪军 李贤煜 +6 位作者 陈鹏 张晶晶 吴宏伟 郭娜 郭非非 廖星 毕明刚 《中国科学基金》 CSSCI CSCD 北大核心 2024年第3期387-395,共9页
中药复方的现代基础研究是中药现代化发展的必经之路。本文从中药复杂作用模式解析研究策略与方法、中药直接靶点发现技术与应用、系统生物学驱动的中药复杂作用解析三个方面,对中药复方的现代基础研究进行综述,并对其未来发展进行展望。
关键词 中药复方 现代基础研究 靶点发现 系统生物学 复杂作用解析
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可“AI”的药物研发:人工智能赋能药物研发的各环节 被引量:4
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作者 徐江城 唐静 段宏亮 《科学》 CAS 2022年第5期22-25,共4页
药物的研发流程复杂程度极高、未知性极强。近年来,人工智能在药物研发的各个环节展示出极大魅力,重塑、变革着药物研发过程。未来,人工智能赋能药物研发的潜力将不断被发掘。
关键词 人工智能 靶点发现 苗头化合物筛选 先导化合物优化 ADMET性质预测 药物研发
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人工智能在眼科药物研发的契机与挑战
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作者 陈健祺(综述) 刘冬 林浩添(审校) 《眼科学报》 CAS 2022年第7期595-602,共8页
近年来随着人类生活方式的改变、用眼频率的增加,眼科药物的市场需求持续增长,但是目前眼病治疗仍面临“缺医少药”的困境。由于新药研发面临成本高、周期长、成功率低的风险,眼科药物创新迭代的进程日趋缓慢。人工智能(artificial inte... 近年来随着人类生活方式的改变、用眼频率的增加,眼科药物的市场需求持续增长,但是目前眼病治疗仍面临“缺医少药”的困境。由于新药研发面临成本高、周期长、成功率低的风险,眼科药物创新迭代的进程日趋缓慢。人工智能(artificial intelligence,AI)作为一种全新的技术手段,有望赋能眼科药物研发的全过程,包括药物靶点发现、化合物筛选、药物动力学模型创新与临床试验开展等,以期为眼科药物研发“降本增效”。且随着大数据体系的完善、硬件计算力的提升以及生命科学与智能科学的深度融合,AI在眼科药物研发中的作用将进一步得到提升,助力眼科药物研发实现从精准化到智能化的跨越。 展开更多
关键词 人工智能 眼药研发 靶点发现 化合物筛选 药动学模型 临床试验
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人工智能在新药发现中的应用进展 被引量:7
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作者 黄芳 杨红飞 朱迅 《药学进展》 CAS 2021年第7期502-511,共10页
人工智能在新药研发领域中发挥着至关重要的作用。目前,自然语言处理、机器学习、深度学习、知识图谱等人工智能关键技术已广泛应用于新药研发的各个环节,全球多家人工智能企业与制药企业也开启了深度合作模式,为生物医药的发展带来了... 人工智能在新药研发领域中发挥着至关重要的作用。目前,自然语言处理、机器学习、深度学习、知识图谱等人工智能关键技术已广泛应用于新药研发的各个环节,全球多家人工智能企业与制药企业也开启了深度合作模式,为生物医药的发展带来了新的机遇。介绍了机器学习方法和深度学习方法在新药发现领域的应用进展及相关企业,并总结了人工智能应用于新药发现的机遇与挑战,旨在为从事人工智能+新药研发工作的科研技术人员提供思路与参考。 展开更多
关键词 人工智能 大数据 机器学习 深度学习 药物研发 靶点发现 药物筛选
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The proteomic study and the target discovery of W026B, a new compound with brain protective effect 被引量:3
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作者 Siyu Zhao Xiaoyan Liu +2 位作者 Yuanjun Zhu Ye Liu Yinye Wang 《Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences》 CAS CSCD 2019年第6期381-392,共12页
W026B is a new compound that has a protective effect on cerebral ischemia reperfusion(I-R)injury in mice,while its specific mechanism is still unknown.In this study,proteomics was used to observe the effect of W026B o... W026B is a new compound that has a protective effect on cerebral ischemia reperfusion(I-R)injury in mice,while its specific mechanism is still unknown.In this study,proteomics was used to observe the effect of W026B on protein expression in brain I-R tissue,and to reveal its potential target.A total of 42 significantly altered proteins were identified in both brain I-R model and W026B treatment from 4852 proteins detected by proteomics,and most of these proteins were related to immunity and inflammation,metabolism,neuroprotection as well as cell proliferation and cell structure.Western blotting analysis showed that three out of five selected proteins showed consistent alteration with the proteomics.Regulator of G protein signaling 17(RGS17)was selected for further study,and its knockdown by siRNA RGS17 aggravated brain injury and abolished the protective effect of W026B.W026B could bind with RGS17(KD:6.04×10–6 mol/L).The knockdown of RGS17 aggravated Neuro-2 a cell damage induced by group I metabotropic glutamate receptors(mGluRs)agonist,and abolished the protective effect of W026B.In conclusion,W026B protected brain against I-R injury by affecting diverse proteins.RGS17 might be one of its targets and a potential therapeutic target of brain I-R injury.The upstream receptor of G protein,which was regulated by RGS17 and affected by W026B,might be group I m GluRs.This study provided useful evidence for the further R&D and the potential clinical application of W026B. 展开更多
关键词 Brain ischemia Reperfusion injury PROTEOMICS Target discovery W026B
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Therapeutic targets of Traditional Chinese Medicine for colorectal cancer 被引量:18
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作者 Li Weidong Li Chunsheng +2 位作者 Zheng Honggang Chen Guohong Hua Baojin 《Journal of Traditional Chinese Medicine》 SCIE CAS CSCD 2016年第2期243-249,共7页
OBJECTIVE: To explore the role of Traditional Chinese Medicine(TCM) in the prevention and treatment of colorectal cancer and identify possible therapeutic targets of TCM to provide clues for the use of TCM for colorec... OBJECTIVE: To explore the role of Traditional Chinese Medicine(TCM) in the prevention and treatment of colorectal cancer and identify possible therapeutic targets of TCM to provide clues for the use of TCM for colorectal cancer prevention and treatment in the clinic and to find novel directions for new drug discovery for colorectal cancer.METHODS: We used Pub Med and Google to search for and collect scientific publications for a full evaluation of current evidence in the literature indicating the potential role of Chinese herbal medicines and their respective ingredients as effective candidatesforcolorectalcancerpreventionandtreatment.RESULTS: We extracted a detailed description of potential therapeutic Chinese herbal medicines and their constituent ingredients that target different mechanisms in colorectal cancer such as gene mutation, dysregulation of signaling pathways, metabolism disorders, and the inflammatory microenvironment, including both conventional and non-conventional approaches.CONCLUSION: TCM may be a promising complementary and alternative therapy for the treatment of colorectal cancer. 展开更多
关键词 Colorectal neoplasms MEDICINE Chi nese traditional Prevention and control Therapeu tics Drug delivery systems
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