ARID1A基因变异所致Coffin-Siris综合征2型1例胎儿的遗传学分析

目的探讨1例Coffin-Siris综合征2型(CSS 2)胎儿的遗传学病因。方法选取1例于2023年7月因"停经17+1周,发现胎儿畸形4 d"就诊于洛阳市妇幼保健院的超声异常胎儿作为研究对象,回顾性分析相关的临床资料。对胎儿的组织样本及其父母的外周血样进行核心家系全外显子组测序分析,对候选变异进行致病性分析,并通过Sanger测序进行家系验证。本研究通过洛阳市妇幼保健院医学伦理委员会的审查(伦理号:LYFY-YCCZ-2023011)。结果胎儿胎龄16+周时彩色多普勒超声提示双侧侧脑室扩张、小脑发育不良。全外显子组测序检测发现其ARID1A基因存在c.553C>T(p.Gln185Ter)杂合变异,Sanger测序验证为新发变异。根据美国医学遗传学与基因组学学会相关变异指南与标准被判定为致病性变异(PVS1+PS2+PM2_Supporting)。结论ARID1A基因c.553C>T(p.Gln185Ter)杂合变异可能是胎儿脑发育畸形的遗传学病因。

ARID1A基因突变体的构建及其在肝癌细胞中的过表达鉴定

目的 构建人类染色体重塑复合物SWI/SNF（Switch/Sucrose NonFermentable）中重要组份ARID1A（A-T rich interaction domain）的突变过表达载体,并检测野生型ARID1A基因及突变型ARID1A基因在肝癌细胞株HepG2中的表达情况.方法 采用overlap PCR技术构建在野生型质粒pcDNA6-ARID1A基础上构建结构域缺失突变体pcDNA6-ARID1A/△ARID以及pcDNA6-ARID1A/△DUF3518;利用脂质体转染技术将野生型质粒以及构建的突变型质粒转染到肝癌细胞HepG2中进行过表达;通过Real-time PCR以及Western blot技术对野生型及突变型ARID1A在肝癌细胞中的表达情况进行鉴定.结果 经双酶切后SDS-PAGE分析以及测序验证,成功构建了真核表达载体pcDNA6-ARID1A的突变型质粒pcDNA6-ARID1A/△ARID以及pcDNA6-ARID1A/△ DUF3518;通过Real-time PCR以及Western blot的方法验证,ARID1A及ARID1 A/△ARID在肝癌细胞株HepG2中成功过表达,而ARID1A/△ DUF3518蛋白可能降解.结论 成功构建ARID1A功能域缺失型突变体,并在肝癌细胞株HepG2中稳定过表达ARID1A及ARID1A/△ARID;ARID1A/△ DUF3518蛋白的缺失暗示DUF3518结构域可能起着稳定蛋白结构的功能.

染色质重塑基因ARID1A在妇科肿瘤中的研究进展

在真核细胞中,遗传信息储存于染色质,这是一种由DNA、组蛋白及非组蛋白通过高度浓缩机制而形成的复杂结构,但在DNA复制、修复、重组及转录等过程中需动态变化以促使相关因子与DNA结合,这种作用称为染色质重塑。而染色质重塑包括DNA复制、转录、修复、甲基化和重组,对于细胞核活动至关重要,染色质重塑复合物的分子基因型改变是癌症发病的一个新机制。

潜在类别模型在ARID1A基因低频变异与原发性肝癌遗传关联中的应用

目的应用潜在类别模型分析ARID1A基因低频变异与原发性肝癌的关系。方法根据基因的不同功能区域将ARID1A基因低频变异进行合并,应用潜在类别模型分析合并后的ARID1A基因低频变异得到分类潜变量,采用logistic回归分析ARID1A基因低频变异与肝癌发生之间的关系。结果潜在类别模型将ARID1A基因低频变异人群分为3类,类别1主要为基因未突变人群,占比94.2%(2452/2603);类别2主要为基因转录调控功能区突变人群,占比4.8%(124/2603);类别3主要为基因外显子突变人群,占比1.0%(27/2603)。以类别1人群作为参照,转录调控功能区基因突变可降低肝癌的发生风险(OR为0.601,95%CI为0.364-0.992,P=0.046)。结论潜在类别模型可识别肝癌相关基因低频变异,潜在类别模型可推广应用于更多复杂疾病相关低频变异的遗传关联研究。

AT丰富结合域1A基因在恶性肿瘤中的作用

AT丰富结合域1A(ARID1A)基因是染色质重塑复合物SWI/SNF的重要亚基,是一种抑癌基因,在多种肿瘤中存在突变或缺失,其突变或缺失可能与恶性肿瘤的增殖、侵袭、转移、高分期、不良预后等有关。对ARIDIA抑癌作用机制深入研究,能进一步了解癌症发生发展机制,有望为癌症患者提供治疗靶点。本文对近年来ARID1A在恶性肿瘤中的表达、功能调节及其在肿瘤中的作用做一综述。

ARID1a及性激素受体在子宫内膜增生病变组织中的表达及意义

目的探讨ARID1a基因在子宫内膜增生病变组织中的表达及与性激素受体表达的相关性,为子宫内膜增生症的防治提供新的思路。方法采用免疫组化SP(streptavidin peroxidase-biotin,SP)法,检测132例子宫内膜病变组织(单纯性增生40例,复杂性增生40例,不典型增生52例)及28例增殖期子宫内膜组织中ARID1a、雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)、雄激素受体(AR)的阳性表达率。结果 (1)在子宫内膜组织中,普遍存在ER、PR、AR受体的表达。ER、PR阳性表达率各组间比较,差异无统计学意义(P>0.05);AR在不典型增生症组中表达率最低,与其余各组间比较,差异有统计学意义(P<0.05),增殖期内膜组、单纯性增生组、复杂性增生组各组间比较,差异无统计学意义(P>0.05)。(2)ARID1a基因在子宫内膜腺上皮和间质细胞核中普遍表达,在不典型子宫内膜组织中表达丢失率为19.2%,与其余各组间比较,差异有统计学意义(P<0.05);增殖期内膜组、单纯性增生组、复杂性增生组间,差异无统计学意义(P>0.05)。(3)ARID1a基因的表达与ER、PR、AR之间无相关性。结论雄激素及其受体与子宫内膜病变风险显著相关,ARID1a基因突变和表达缺失是子宫内膜增生恶变中的一个早期事件;对于雄激素受体阳性患者采用联合降低雄激素的治疗,将有可能成为子宫内膜增生症患者治疗的新思路。

ARID1A在浸润性乳腺癌中的表达及临床意义

探讨ARID1A基因在浸润性乳腺癌中的表达及与浸润性乳腺癌患者临床病理学特征之间的关系。收集兰州市妇幼保健院病理诊断为浸润性乳腺癌的患者101例,用免疫组织化学SP法定性检测ARID1A基因在浸润性乳腺癌、乳腺纤维腺瘤、浸润性乳腺癌癌旁正常组织中的表达情况,统计并分析ARID1A基因在浸润性乳腺癌、乳腺良性病变及癌周正常乳腺组织中的表达及与乳腺癌患者临床病理参数间的关系。(1)ARID1A在乳腺癌中的表达阳性率显著低于癌旁正常组织和纤维腺瘤,差异具有统计学意义(P<0.05)。(2)ARID1A在乳腺癌的表达与患者的年龄、肿瘤大小、组织学分级和TNM分期均无关系(P>0.05),而与患者是否发生淋巴结转移有关(P<0.05)。(3)ARID1A在正常乳腺组织、纤维腺瘤组织以及乳腺癌组织中的阳性表达依次减弱。结论:(1)ARID1A在正常乳腺组织中呈阳性表达,在纤维腺瘤组织和乳腺癌组织中的表达逐渐减弱,提示ARID1A是一种肿瘤抑制因子,从而抑制了乳腺癌的发生。(2)ARID1A在乳腺癌组织中表达缺失,且其表达缺失与乳腺癌组织的侵袭、转移有关,提示ARID1A是一种保护性因子,其突变或缺失可导致乳腺癌的发生,并与乳腺癌不良预后相关。(3)乳腺组织中ARID1A基因检测有助于乳腺癌的早期诊断、预防和治疗。

过表达ARID1A对胶质母细胞瘤细胞侵袭的影响

目的探讨AT丰富结合域1A(ARID1A)在胶质母细胞瘤侵袭中的作用及机制。方法体外培养人胶质瘤细胞U87,用Lipofectamin脂质体法将重组pCDNA3.1(+)-ARID1A转染至U87细胞为ARID1A过表达组,转染空质粒至U87细胞为vector组,未作处理的为空白对照组,qRT-PCR和Western blot验证其转染效率。采用Transwell侵袭实验检测细胞的侵袭能力;Western blot技术检测c-myc、MMP-2、MMP-9表达的变化。结果转染ARID1A真核表达质粒48 h后,ARID1A过表达组、vector组、空白对照组的细胞侵袭能力分别为(42.2±11.5)%、(98.6±4.8)%、(100.0±5.1)%,ARID1A过表达组与另外两组相比,差异有统计学意义(P<0.01);ARID1A过表达组c-myc、MMP-2、MMP-9蛋白的表达均低于vector组和空白对照组(P<0.01)。结论ARID1A可以通过抑制MMP-2/MMP-9表达来抑制胶质母细胞瘤的侵袭,可以作为潜在的胶质瘤治疗靶点。

子宫内膜异位症恶变研究进展

子宫内膜异位症（EMs）是育龄妇女最常见的疾病之一。该病有多种临床表现,近年来发病率占育龄妇女的15%,有明显升高的趋势。EMs虽然在组织学上属于良性病变,但却具有增生、浸润、转移及复发等恶性行为,并且有一定比例发生组织学改变,转变为癌瘤[1]。1925年,Sampson首次报道恶性肿瘤与异位子宫内膜并存于同一病变,认为EMs可以发生恶变。目前研究认为,EMs的恶变率约为0.7%~1%,其中80%发生在卵巢,

慢性萎缩性胃炎内镜表现与病理诊断胃癌前病变的相关性

目的:探讨慢性萎缩性胃炎内镜表现与病理诊断胃癌前病变的相关性。方法:选取2018年5月—2020年5月接受胃镜检查的患者组织样本,其中胃癌60例,高级别上皮内瘤变60例,低级别上皮内瘤变60例,慢性萎缩性胃炎伴肠上皮化生60例,慢性萎缩性胃炎60例,检测各组组织样本中ARID1A、E-钙黏蛋白(E-cadherin)以及EphA2的表达情况及相关性。结果:胃癌、高级别上皮内瘤变、低级别上皮内瘤变、慢性萎缩性胃炎伴肠上皮化生以及慢性非萎缩性胃炎组织中ARID1A、E-cadherin、EphA2表达组间差异有统计意义(P<0.05),且ARID1A、E-cadherin表达逐级递减,EphA2表达逐级递增;在胃癌、高级别上皮内瘤变、低级别上皮内瘤变、慢性萎缩性胃炎伴肠上皮化生以及慢性非萎缩性胃炎组织中,ARID1A与E-cadherin的表达呈正相关(P<0.05)性,EphA2与E-cadherin、ARID1A的表达均呈负相关性(P<0.05)。结论:胃癌患者存在ARID1A、E-cadherin表达明显降低的情况,而EphA2表达逐级递增,且其表达可互相影响,其中ARID1A可直接影响EphA2、E-cadherin的表达,可将ARID1A作为胃癌治疗的新靶点。