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OLFM1蛋白的生物信息学分析及其多克隆抗体制备与鉴定 被引量:3
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作者 王笑英 杜培革 +1 位作者 吴春风 韩笑 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第8期721-723,共3页
目的:利用生物信息学分析OLFM1蛋白,并制备其多克隆抗体。方法:根据生物信息学分析预测OLFM1蛋白的二级结构、亲水性、抗原性等理化特性,以这些分析预测为依据,经过同源性检索后设计出一段由20个氨基酸组成的多肽,免疫家兔,获得的多克... 目的:利用生物信息学分析OLFM1蛋白,并制备其多克隆抗体。方法:根据生物信息学分析预测OLFM1蛋白的二级结构、亲水性、抗原性等理化特性,以这些分析预测为依据,经过同源性检索后设计出一段由20个氨基酸组成的多肽,免疫家兔,获得的多克隆抗体经Western blot和ELISA方法鉴定其特异性和效价。结果:制备的兔抗人OLFM1多克隆抗体效价为1∶32000,蛋白质印迹证实该抗体具有较好的反应性和特异性。结论:利用生物信息学软件成功地预测出OLFM1蛋白的抗原性,并制备了效价较高的特异性抗人OLFM1多克隆抗体。 展开更多
关键词 olfm1 生物信息学分析 多克隆抗体
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Analysis of large datasets for identifying molecular targets in intestinal polyps and metabolic disorders
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作者 SHAN OU YUN XU +6 位作者 QINGLAN LIU TIANWEN YANG WEI CHEN XIU YUAN XIN ZUO PENG SHI JIE YAO 《BIOCELL》 SCIE 2024年第3期415-429,共15页
Background:The interrelation between intestinal polyps,metabolic syndrome(MetS),and colorectal cancer(CRC)is a critical area of study.This research focuses on pinpointing potential molecular targets to understand the ... Background:The interrelation between intestinal polyps,metabolic syndrome(MetS),and colorectal cancer(CRC)is a critical area of study.This research focuses on pinpointing potential molecular targets to understand the link between intestinal polyp formation,metabolic irregularities,and CRC progression.Methods:We examined clinical samples from patients with intestinal polyps coexisting with MetS and compared them with samples from patients with standard intestinal polyps.Transcriptome sequencing and public database analysis were employed to identify significant pathways and genes.These targets were then validated through immunohistochemistry(IHC).Following the RNA interference of key target expression,a series of experiments,including the cell counting kit-8 assay,colony formation,wound healing,and Transwell assays,were conducted.Results:Comparative analysis revealed 75 up-regulated and 61 down-regulated differentially expressed genes(DEGs)in the MetS polyp group vs.the control.Kyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG)pathway enrichment suggested these DEGs were primarily associated with cell cycle and mitosis.Integration with comparative toxicogenomics database(CTD)and the cancer genome atlas(TCGA)databases highlighted 44 key CRC-related genes.Protein interaction networks indicated connections of purkinje cell protein 4(PCP4),olfactomedin 1(OLFM1),fibronectin 1(FN1),and transforming growth factor beta 3(TGF-β3)with the mitogen-activated protein kinase(MAPK)pathway.Tumor correlation studies suggested higher risk associations with FN1,PCP4,and TGF-β3,while OLFM1 was identified as a lower risk gene.Immunohistochemical analysis revealed a decrease in OLFM1 in MetS-associated intestinal polyps.Upon interference with OLFM1 in polyp epithelial cells,there was a significant enhancement in cell proliferation,colony formation,and cell migration and invasion capabilities.Conclusion:Our study highlights a significant decrease in OLFM1 expression in MetS-associated intestinal polyps.And,this reduction in OLFM1 is associated with enhanced cell proliferation,colony formation,and increased cell migration and invasion capabilities.These findings underscore the reduced OLFM1 expression in MetS-associated intestinal polyps may play a crucial role in promoting tumorigenic processes in colorectal pathology.Further research on OLFM1 may provide valuable insights into understanding and targeting MetS-associated intestinal polyps. 展开更多
关键词 Colorectal cancer Metabolic syndrome Intestinal polyp olfm1 EXOSOME
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嗅素结构域基因家族在眼科领域的研究进展
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作者 孟博 李彬 《眼科新进展》 CAS 北大核心 2012年第8期798-800,共3页
嗅素结构域家族是近几年研究比较多的基因家族,因该家族成员蛋白含有嗅素结构域而得名。越来越多的证据表明该家族在神经起源、细胞黏附、细胞周期调节和肿瘤发生发展中发挥有重要作用,而且很可能是许多重要的信号通路(如Wnt信号通路)... 嗅素结构域家族是近几年研究比较多的基因家族,因该家族成员蛋白含有嗅素结构域而得名。越来越多的证据表明该家族在神经起源、细胞黏附、细胞周期调节和肿瘤发生发展中发挥有重要作用,而且很可能是许多重要的信号通路(如Wnt信号通路)的调节者,与眼组织正常发育和病理过程有关。本文就近几年来关于该家族成员在眼科的研究进展作一综述。 展开更多
关键词 嗅素结构域家族 olfm1 OLFM2 Optimedin PAX6
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嗅球蛋白1在肺癌组织中的表达及可能意义
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作者 吴玲玲 余永伟 +4 位作者 谭晓洁 常文军 苏彤 曹付傲 曹广文 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期269-273,共5页
目的通过对比嗅球蛋白1(OLFM1)基因及其蛋白在肺癌组织及其配对的正常肺组织中的表达情况,探讨其表达与肺癌发生的相互关系。方法分别采用半定量RT-PCR法和荧光实时定量PCR检测21例肺癌患者的原位肺癌组织及其配对正常肺组织中OLFM1基... 目的通过对比嗅球蛋白1(OLFM1)基因及其蛋白在肺癌组织及其配对的正常肺组织中的表达情况,探讨其表达与肺癌发生的相互关系。方法分别采用半定量RT-PCR法和荧光实时定量PCR检测21例肺癌患者的原位肺癌组织及其配对正常肺组织中OLFM1基因的相对表达变化和相对表达量,应用免疫组织化学染色观察OLFM1蛋白在组织中的表达。结果OLFM1基因在8例肺鳞癌原发灶中的表达相对于其配对正常组织中的表达显著下调约2.2倍(P=0.028);OLFM1蛋白定位于肺腺癌细胞胞质,仅在肺腺癌表达(P<0.001),其表达在不同年龄、性别、肿瘤分期、分化程度间差异均无统计学意义(P>0.05)。结论OLFM1基因肺鳞癌中表达下调,可能是一个潜在的分子标志;而OLFM1蛋白仅在肺腺癌表达,在肺鳞癌和正常组织中均不表达,这提示不同病理组织类型肺癌的发生可能有不同的发生机制和途径。 展开更多
关键词 肺肿瘤 腺癌 鳞状细胞癌 OLFM基因 免疫组织化学染色 肺癌组织 蛋白表达 肺鳞癌 肺癌患者 正常组织
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