目的:运用网络药理学方法和分子对接技术探讨当归-白芍治疗肾病综合征的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库挖掘当归-白芍的主要活性成分,通过Pubchem数据库和Swiss Target Prediction数据库进行预测并筛...目的:运用网络药理学方法和分子对接技术探讨当归-白芍治疗肾病综合征的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库挖掘当归-白芍的主要活性成分,通过Pubchem数据库和Swiss Target Prediction数据库进行预测并筛选出当归-白芍活性成分的潜在靶点。将“Nephrotic syndrome”作为关键词输入Disgenet、Genecards和Drugbank数据库进行检索,获取疾病作用靶点。使用Cytoscape软件和STRING数据库,构筑“药物-成分-疾病-靶点”网络图和蛋白相互作用网络,用R软件对关键靶基因进行基因本体论(GO)生物过程富集与京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析,并绘制关键靶基因GO及KEGG条形图及气泡图,最后使用分子对接技术将活性成分和靶点进行对接验证。结果:筛选得到当归-白芍有效活性成分15个,涉及作用靶点360个,通过疾病靶点(肾病综合征)与药物靶点(当归-白芍)的重叠,获得与疾病靶点有关的潜在靶点为137个。当归-白芍主要涉及氧化应激过程、炎症反应等生物过程,通过调节磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(Phosphatidylinositol 3-kinase-Akt,PI3K/Akt)、缺氧诱导因子(Hypoxia Inducible Factor,HIF)-1、程序性死亡受体1(Programmed Cell Death Protein 1,PD-1)/程序性死亡配体1(Programmed Deathligand-1,PD-L1)、丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-Activated Protein Kinase,MAPK)、Janus激酶2(Janus Kinase 2,JAK2)/信号转导及转录激活蛋白(Signal Transducer and Activator of Transcription,STAT)3等信号通路来发挥治疗肾病综合征的作用。分子对接结果证实阿魏酸、山柰酚与基质金属蛋白酶(Matrix Metallopeptidase,MMP)9、Toll样受体(Toll-like Receptor,TLR)4、STAT3具有较好的结合活性。结论:当归-白芍治疗肾病综合征的机制可能是通过抑制肾脏炎症反应及氧化应激反应,调节PI3K/Akt、HIF-1、PD-1/PD-L1、MAPK、JAK2/STAT3等信号通路的多途径、多信号通路,共同协调作用。展开更多
文摘目的:运用网络药理学方法和分子对接技术探讨当归-白芍治疗肾病综合征的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库挖掘当归-白芍的主要活性成分,通过Pubchem数据库和Swiss Target Prediction数据库进行预测并筛选出当归-白芍活性成分的潜在靶点。将“Nephrotic syndrome”作为关键词输入Disgenet、Genecards和Drugbank数据库进行检索,获取疾病作用靶点。使用Cytoscape软件和STRING数据库,构筑“药物-成分-疾病-靶点”网络图和蛋白相互作用网络,用R软件对关键靶基因进行基因本体论(GO)生物过程富集与京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析,并绘制关键靶基因GO及KEGG条形图及气泡图,最后使用分子对接技术将活性成分和靶点进行对接验证。结果:筛选得到当归-白芍有效活性成分15个,涉及作用靶点360个,通过疾病靶点(肾病综合征)与药物靶点(当归-白芍)的重叠,获得与疾病靶点有关的潜在靶点为137个。当归-白芍主要涉及氧化应激过程、炎症反应等生物过程,通过调节磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(Phosphatidylinositol 3-kinase-Akt,PI3K/Akt)、缺氧诱导因子(Hypoxia Inducible Factor,HIF)-1、程序性死亡受体1(Programmed Cell Death Protein 1,PD-1)/程序性死亡配体1(Programmed Deathligand-1,PD-L1)、丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-Activated Protein Kinase,MAPK)、Janus激酶2(Janus Kinase 2,JAK2)/信号转导及转录激活蛋白(Signal Transducer and Activator of Transcription,STAT)3等信号通路来发挥治疗肾病综合征的作用。分子对接结果证实阿魏酸、山柰酚与基质金属蛋白酶(Matrix Metallopeptidase,MMP)9、Toll样受体(Toll-like Receptor,TLR)4、STAT3具有较好的结合活性。结论:当归-白芍治疗肾病综合征的机制可能是通过抑制肾脏炎症反应及氧化应激反应,调节PI3K/Akt、HIF-1、PD-1/PD-L1、MAPK、JAK2/STAT3等信号通路的多途径、多信号通路,共同协调作用。
