白喉棒杆菌核酸检测试剂用国家参考品的研制

目的:研制白喉棒杆菌核酸检测试剂用国家参考品。方法:将6株白喉棒杆菌和10株非白喉棒杆菌代表性菌株在各自适宜的环境下培养,经菌株鉴定后,制备灭活菌液,对候选参考品进行均匀性和稳定性的评估以及准确性、特异性、重复性和最低检出限的验证研究,并组织3家实验室进行协作标定。结果:研制出白喉棒杆菌核酸检测试剂用候选参考品,由6个阳性参考品、10个阴性参考品、最低检出限参考品和重复性参考品组成。证实该候选参考品均匀性及稳定性良好,准确性、特异性及重复性好,最低检出限可达1.0×10~3~1.0×10~4个菌·m L^(-1)。协作标定结果也进一步表明阳性、阴性、重复性和最低检出限候选参考品均符合国家参考品的各项要求。结论:研制出的白喉棒杆菌核酸检测试剂参考品,可用于相关试剂盒的质量控制和评价。

20株中国医学细菌保藏管理中心标准肺炎克雷伯菌分子生物学特征分析

目的对中国医学细菌保藏管理中心收集保藏的肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae,KP)进行分子生物学特征分析。方法对20株保藏KP菌株采用16S rRNA扩增及测序和质谱技术进行菌种鉴定验证;拉丝试验确定黏液表型;PCR筛查6种常见高毒力荚膜血清型(K1、K2、K5、K20、K54和K57);采用多位点序列分型(MLST)对菌株进行分子分型。结果20株菌种均扩增出预期大小的16S rRNA基因片段,与KP模式菌株参考序列的相似性均>99%;质谱技术检测均为KP,其中有4株鉴定到亚种;拉丝试验阳性率30%(6/20);共检出K2型3株(15%)、K5型4株(20%)、K54型1株(5%)、K57型4株(20%)和未分型8株;20株菌种分为10个ST型。结论该研究完善了KP菌株的分子生物学方面的质控指标。

检测人血清中肺炎球菌10A型荚膜多糖IgG抗体的包被抗原适用性研究

目的 确定用于23价肺炎多糖疫苗免疫后临床血清样本检测的包被用10A型肺炎球菌荚膜多糖(Pn10A)。方法 根据WHO推荐的检测人血清中肺炎球菌荚膜多糖IgG抗体含量的ELISA(PnPSELISA),包被不同来源(ATCC、A公司、B公司、5个公司混合)的10A多糖[Pn10A(ATCC)、Pn10A(A)、Pn10A(B)、Pn10A(mix)],检测38份血清中Pn10AIgG抗体的几何平均浓度(GMC)和相同样本免疫前、后的阳转率(免疫后/免疫前≥2为阳转),确定用于临床血清检测的包被Pn10A。结果 用Pn10A(ATCC)、Pn10A(A)、Pn10A(B)包被检测38份相同样本免疫前、后血清中Pn10AIgG抗体的GMC和阳转率,Pn10A(A)与Pn10A(ATCC)包被的检测结果差异无统计学意义(P>0.05),数据一致性好(r>0.9);Pn10A(B)与Pn10A(ATCC)包被的检测结果差异有统计学意义(P<0.05),数据一致性差(r<0.8);再以Pn10A(A)、Pn10A(ATCC)、Pn10A(mix)包被检测另46份相同样本免疫前、后血清中Pn10AIgG抗体的GMC和阳转率,Pn10A(A)、Pn10A(mix)与Pn10A(ATCC)包被的检测结果差异无统计学意义(P>0.05),数据一致性好(r>0.9),免疫前、后GMC值相近,阳转率相近,差异无统计学意义(P>0.05)。结论 Pn10A(A)、Pn10A(mix)与Pn10A(ATCC)均可以作为包被多糖用于检测人血清中肺炎球菌Pn10AIgG抗体;但从长久使用相同抗原检测大批量临床样本的需求考虑,Pn10A(mix)更具有足量、经济的优势。

家蚕谷胱甘肽-S-转移酶E4基因的组织表达和序列特征及重组蛋白的酶活性分析

昆虫体内的谷胱甘肽-S-转移酶(GSTs)主要行使对异生或内源有毒物质进行代谢解毒的功能。选择家蚕谷胱甘肽-S-转移酶E4的编码基因Bmgste4为靶标,研究其组织表达谱、序列结构特征及原核表达重组蛋白的酶活性。RT-PCR检测不同组织表达特征的结果显示,Bmgste4基因在家蚕5龄第3天幼虫的头部、触角、下颚须、表皮、脂肪体、丝腺以及雄性个体的马氏管和雌性个体的卵巢中均有表达,而在血细胞、中肠以及雄性个体的精巢和雌性个体的马氏管中不表达。多序列比对结果显示BmGSTE4具有完整和保守的GST二级结构特征,N端氨基酸残基保守,特别是谷胱甘肽结合位点。构建插入Bmgste4基因开放阅读框片段的重组表达质粒p28-Bmgste4,并转化E.coli Rosetta(DE3)感受态细胞进行原核表达后,利用分光光度法测定重组蛋白对通用底物1-氯-2,4-二硝基苯的酶活参数:Km=0.58 mmol/L,Vmax=24.55μmol/(mg.min)。这些结果为进一步研究家蚕体内解毒和抗药性机制以及开发鳞翅目害虫新型生物防治药剂提供了基础信息。

金黄色葡萄球菌核酸检测试剂盒用国家参考品的研制

目的研制金黄色葡萄球菌核酸检测试剂盒用国家参考品。方法将10株金黄色葡萄球菌和10株阴性对照代表性菌株分别在适宜条件下复苏培养,制备合适浓度的菌悬液,并加热灭活和分装。随机抽样不同候选参考品样品10支进行均匀性分析,并将样品分别置于2~8、25、37℃条件下保藏以及反复冻融,评价标准物质的稳定性。同时对候选参考品的准确性、特异性、重复性、最低检出限进行分析,并组织8家实验室进行协作标定。结果制备了由阳性、阴性、重复性和最低检出限样品组成的金黄色葡萄球菌核酸检测试剂盒用候选参考品。不同候选参考品不同样品间的Ct值的变异系数在1.23%~3.86%之间,表明制备候选参考品均匀性良好。同时证实P1~10阳性和最低检出限候选参考品样品在反复冻融及加速破坏条件下稳定性良好。应用3个不同厂家生产试剂盒进行重复性验证实验显示,样本的Ct值均小于5.0%,表明候选参考品的重复性良好。除P6阳性候选参考品样品不能被部分试剂盒检出,其余阳性参考品样品均能成功检测、最低检出限为1.0×10^(3)个/m L。协作标定结果进一步表明阳性、阴性、重复性和最低检出限候选参考品均符合国家参考品的各项要求。结论研制的金黄色葡萄球菌核酸检测试剂盒用国家参考品已获得批准,可用于金黄色葡萄球菌核酸检测试剂盒的质量控制和评价。

淋球菌核酸检测试剂盒的质量评价

目的对12种淋球菌核酸检测试剂盒进行质量评价。方法应用12种淋球菌PCR试剂盒质控参考品，按照各试剂盒说明书的方法提取模板及核酸扩增，检测各试剂盒的阳性参考品符合率、阴性参考品符合率、批内精密度及最低检测限，并进行比较分析。结果12种试剂盒的阳性参考品符合率及阴性参考品符合率均为100％；批内精密度：各试剂盒检测结果D值的变异系数均小于5．0％；12种试剂盒中有10种试剂盒的最低检出限能达到1×10^3个菌／mL，其中3种能达到1×10^2个菌／mL，但另外2种试剂盒的最低检出限仅达到1×10^4个菌／mL。结论12种淋球菌核酸检测试剂盒质量均较好，性能可靠。

家蚕光泽小眼(varnished eye)突变基因的精细定位

家蚕（Bombyx mori）光泽小眼（varnished eye，ve）突变体是家蚕突变品种中少数关于家蚕复眼形态异常的自然隐性突变品种之一，表现为成虫复眼小，表面富有光泽，有瘤状突起；小眼数量少且不规则。经典遗传学连锁图谱将ve基因定位在第6连锁群32.2座位，但到目前为止，该突变性状的形成机理仍不清楚。文章以突变品种ve和对照品种Dz为亲本，杂交产生的F1代雄个体与轮回亲本ve雌个体回交产生的BC1代为材料进行ve基因的精细定位。通过对ve低密度连锁图谱分析发现，ve基因被定位在SNP3~SNP6之间，物理图谱距离大约为1.2 Mb。利用1563个BC1代个体构建ve高密度连锁图谱，最终将ve基因定位在SNP5~SNP61之间，物理图谱距离大约为221.8 kb。通过家蚕基因数据库对ve最终定位区域内进行预测基因检索，发现有6个预测基因。对6个预测基因进行生物信息学分析和测序，这些候选基因都有可能参与家蚕复眼形成，但在编码区没有发现ve特异的突变位点；对这些候选基因进行表达分析，发现编号为BGIBMGA013642的候选基因在ve复眼形成过程中的表达量明显比正常对照Dz低，推测该基因为最佳候选基因。

淋病奈瑟菌核酸检测试剂盒国家参考品的制备

目的：制备淋病奈瑟菌（ Neisseria gonorrhoeae,NG）核酸检测试剂盒国家参考品。方法分别将10株NG和10株非NG参考菌株在各自适宜的培养基和温度下培养,收获新鲜无污染培养物,用比浊法和显微计数法将不同的培养物制备成10份NG菌悬液阳性参考品、5份精密性参考品和10份非NG菌悬液阴性参考品以及最低检出限参考品,然后利用5种不同来源的NG核酸检测试剂盒验证各种参考品,并考察参考品在不同处理条件下的稳定性。结果每株菌在各自适宜的培养基和温度下培养后,均生长良好,无杂菌污染。经5种试剂盒验证检测,10份阳性参考品的检测结果均为阳性,10份阴性参考品的检测结果均为阴性,精密性参考品检测结果为Ct值的CV均小于5.0%；5种试剂盒的最低检出限均能达到1000/mL,其中试剂盒B和E的最低检出限达100/mL。参考品在2-8℃放置7 d、37℃放置3 d的热稳定性及反复冻融5次以内的稳定性良好。结论制备的NG核酸检测试剂盒国家参考品的准确性、特异性及精密性均符合要求,可用于NG核酸检测试剂盒的质量评价。

粪肠球菌核酸检测试剂国家参考品的研制

目的研制粪肠球菌核酸检测试剂的国家参考品。方法将9株粪肠球菌和8株非粪肠球菌参考品候选菌株分别在各自适宜的培养条件下培养,收集新鲜培养物进行计数、灭活、稀释和分装,并对参考品进行均匀性和稳定性评估。组织3家实验室对研制的参考品进行了协作标定。结果研制了由9份阳性候选参考品、8份阴性候选参考品、重复性参考品和最低检出限参考品组成的粪肠球菌参考品。阳性参考品、最低检出限参考品和重复性参考品循环阈值(cycle threshold, Ct)的变异系数(coefficient of variation, CV)均在5.0%以内,分装均匀性良好;参考品各成分的稳定性良好(P值均小于0.05);协作标定结果显示阳性参考品符合率及阴性参考品符合率均为100%,重复性参考品检测Ct值的CV均在5.0%以内,参考品最低检出限为1.0×10^(3)个/mL。结论研制的参考品可用于粪肠球菌核酸检测试剂的质量评价。

铜绿假单胞菌核酸检测用试剂盒国家参考品的研究

铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)为假单胞菌属的一种革兰氏阴性菌,也被称为绿脓杆菌。在自然界水、土壤与空气中均广泛存在[1]。铜绿假单胞菌污染常见于凉拌菜、熟肉制品、饮用水等食品领域。例如在水源水或成品水中检出铜绿假单胞菌,甚至多批次样品的检出率大于10%,为一种重要的水源和食源性致病菌[2-4]。因此在我国饮用天然矿泉水(GB 8537-2016)[5]和包装饮用水(GB 19298-2014)[6]的国家标准中均明确规定不得检出铜绿假单胞菌。此外,在2015年我国颁布的《化妆品安全技术规范》也要求化妆品中不得有铜绿假单胞菌检出[7]。铜绿假单胞菌作为医院内感染的主要病原菌之一,在机体免疫力低下时,例如术后和恶性肿瘤的患者容易感染本菌,且铜绿假单胞菌的耐药性强,在治疗时往往需要使用多种抗生素进行联合用药[8-9]。因此,快速而准确地鉴定出铜绿假单胞菌对保障食品安全和人民健康具有重要的意义。

流感嗜血杆菌核酸检测试剂盒国家参考品的建立

目的建立流感嗜血杆菌(HI)核酸检测试剂盒国家参考品。方法将10株流感嗜血杆菌和10株非流感嗜血杆菌参考菌株分别在各自适宜的培养基和温度下培养,收获新鲜的无菌培养物,计数并灭活后制备成10份阳性参考品、10份阴性参考品、1份最低检出限参考品和3份重复性参考品,使用两家试剂盒对参考品进行确证,考察参考品分装的均匀性以及在不同处理条件下的稳定性,并组织7家相关企业进行协作标定。结果本参考品具有良好的准确性、特异性、重复性以及分装均匀性;反复冻融3、5次和分别于2~8℃、室温、37℃放置3、7、14天后均不影响参考品的稳定性;协作标定结果显示7家企业的试剂盒准确性、特异性和重复性均符合规定;最低检出限结果显示2家为10^(2)个/mL、3家为10^(3)个/mL、2家在10^(4)个/mL仍未检出。结论建立了HI核酸检测试剂盒国家参考品,可用于相关试剂盒的质量评价。

产气荚膜梭菌核酸检测试剂国家参考品的研制

目的研制产气荚膜梭菌(CP)核酸检测试剂国家参考品。方法通过对5株产气荚膜梭菌和7株非产气荚膜梭菌的菌种检定、培养、灭活及分装,组建产气荚膜梭菌核酸检测试剂国家参考品。对参考品进行样品均匀性以及稳定性评估验证,组织3家实验室协作标定。结果参考品由5份阳性参考品、7份阴性参考品、3份重复性参考品以及1份最低检出限参考品样本组成,均匀性和稳定性良好。协作标定结果显示:5份阳性参考品检测结果均为产气荚膜梭菌阳性;7份阴性参考品检测结果均为产气荚膜梭菌阴性;重复性参考品检测结果全部为气荚膜梭菌阳性(n=10,CV≤5.00%);参考品最低检出限为1.0×10^(3)个菌/mL。结论建立了产气荚膜梭菌核酸检测试剂国家参考品,建立的国家参考品可用于产气荚膜梭菌核酸检测试剂盒的质量控制。

家蚕绵茧突变性状调查

家蚕绵茧(Flossy)突变系二化性、单基因显性突变,表型为茧形浮松、多分层,是几个较为重要的蚕茧突变之一。本文选取夏芳、大造作为对照,对绵茧的茧层率、含胶率、茧丝显微镜观察、丝胶蛋白SDS-PAGE进行调查比较。实验结果显示,夏芳、大造、绵茧茧层率为23.476%、12.919%、15.551%;含胶率依次为24.980%、33.765%、28.399%;夏芳、大造、绵茧茧层显微镜观察结果未显示明显差异;丝胶蛋白成分分析结果显示,绵茧和对照之间没有明显不同。就目前结果来看,丝胶蛋白含量有可能是致使绵茧表型的原因,但与对照的差异不明显,因而绵茧突变性状形成的真正原因有待进一步研究。本研究为家蚕绵茧基因的克隆及功能研究提供参考信息。

脑膜炎奈瑟菌核酸检测试剂国家参考品的研制

脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm),又名脑膜炎双球菌或脑脊髓膜炎双球菌,是一种革兰氏阴性菌,根据荚膜多糖可分为A、B、C、D、X、Y、Z、29E、W135、L、H、I、K等13个血清群,主要寄居在人体鼻咽部,可通过飞沫传播。人感染脑膜炎奈瑟菌可引起败血症或流行性脑脊髓膜炎(简称流脑)等急性呼吸道传染病,常伴随着较高的死亡率[1-3]。建立高效的Nm检测方法对流脑的临床诊断有重要的意义。

质控血清09CS中13个肺炎球菌荚膜多糖抗体IgG含量检测范围的确定

目的 建立09CS作为质控血清用于13价肺炎球菌多糖蛋白结合疫苗(13PCV)临床血清样本检测中的检测值范围。方法 用WHO推荐的检测人血清中抗肺炎球菌荚膜多糖抗体IgG的定量ELISA,以国际人肺炎球菌标准血清007sp为标准,将09CS作为待测血清,检测其在13个血清型(1、3、4、5、6A、6B、7F、9V、14、18C、19A、19F、23F型)中抗荚膜多糖抗体IgG含量的值。连续检测09CS血清100余次,计算99%置信区间的各血清型几何平均抗体浓度、标准偏差(SD)和变异系数(CV)。结果 检测得到09C中13个血清型抗荚膜多糖IgG抗体含量以及在99%置信区间(CI)下±2.58倍SD的检测值范围;13个血清型检测结果的CV分别为10.86%、12.52%、13.96%、14.98%、28.77%、11.16%、14.96%、9.31%、10.43%、7.28%、10.86%、12.52%、13.96%,除6A型外,各型CV均低于15%,表明试验间精密度良好;检测次数异常率低于10%。结论 09CS可作为质控血清,用于13价肺炎球菌结合疫苗临床血清中抗荚膜多糖抗体IgG含量的ELISA检测。

肺炎链球菌核酸检测试剂国家参考品的研制及验证

目的研制肺炎链球菌核酸检测试剂国家参考品,并进行适用性验证。方法选择10株肺炎链球菌和10株非肺炎链球菌细菌制备成阳性参考品、阴性参考品、重复性参考品和最低检出限参考品。对参考品的分装均匀性和稳定性进行评估。采用4家企业生产的肺炎链球菌核酸检测试剂盒对制备的肺炎链球菌国家参考品进行准确性、特异性、重复性和最低检出限验证。结果参考品的分装均匀度良好,循环阈值的变异系数均在5.00%以内。2~8℃、室温(25℃)和37℃放置3、7 d及反复冻融3、5次都不影响参考品的稳定性。4家企业的试剂盒的准确性、特异性及重复性检测结果均符合要求。1家企业的试剂盒的最低检出限为1.0×104个/mL,其他3家企业的试剂盒的最低检出限为1.0×103个/mL。结论研制完成一套肺炎链球菌核酸检测试剂国家参考品,能够用于肺炎链球菌核酸检测试剂盒的质量控制和评价。

家蚕狭胸(narrow breast,nb)突变性状观察及基因的精细定位

狭胸(narrow breast,nb)是家蚕少数几个体型突变种之一,其表型为胸部狭小,位于19号染色体的31.2位点,该突变为自然隐性突变。到目前为止,其突变基因还未被分离克隆,突变机理未知。为了分离克隆nb的突变基因,阐释其突变机理,本研究首先对nb蚕的突变性状进行观察。发现3龄时,nb狭胸表型开始明显,并维持到蛹期。5龄期的nb与野生型的体重没有明显差异,但nb体长明显的比正常表型短。5龄5d解剖观察发现nb和野生型个体前肠存在差异,nb前肠在食道处收缩,而正常个体是逐渐变大且呈漏斗状。同时,本研究还采用大造和nb为亲本构建BC_1群体,通过筛选合适的SNP标记对nb突变基因进行了精细定位,其结果为:利用10 SNP个标记和92个BC_1代个体进行连锁分析,将nb突变相关基因位于标记3和8之间的区域内,遗传距离为7.8cM,物理距离约为1.7Mb。利用13个可用于定位的标记和1794个BC_1代个体,nb突变基因位于标记31和38之间区域内,该区域物理跨度约为1Mb,基因预测结果显示定位区域内含有44个基因。本研究为nb突变基因的定位及机理的阐释提供了参考信息。

2、9N、17F及20型肺炎链球菌荚膜多糖血清IgG抗体定量检测ELISA法的验证

目的验证2、9N、17F及20型肺炎链球菌荚膜多糖血清IgG抗体定量检测ELISA法。方法采用ELISA法检测2、9N、17F及20型肺炎链球菌荚膜多糖血清Ig G抗体含量,并验证该方法的准确性、精密性、特异性、线性、最低检测限及检测范围。结果 3次加标回收测定各型肺炎链球菌多糖IgG抗体回收率为77.47%~99.33%;连续11次测定质控血清2009S、QC5及QC6各型别多糖抗体的CV值为8.97%~18.38%;随着多糖浓度的增高,对抗体的抑制率也增高,呈浓度依赖性,相应其他22型多糖混合物对抗体的抑制率较低;线性R^2均>0.99;2、9N、17F及20型肺炎链球菌荚膜多糖血清IgG抗体的检测限分别为0.630、0.592、0.478及0.594 ng/ml,检测范围分别为0.125~30.6、0.08~19.425、0.104~25.325及0.089~21.825 ng/ml。结论该方法具有良好的准确性、精密性及特异性,可用于肺炎球菌疫苗临床血清的检测。

4、6B、9V型肺炎链球菌荚膜多糖血清IgG抗体定量ELISA检测方法的初步验证

目的 对4、6B、9V型肺炎链球菌荚膜多糖血清IgG抗体定量ELISA检测方法进行初步验证。方法 以国际参考血清007sp为标准,测定4份国际质控血清的4型、6B型及9V型IgG抗体值,绘制标准曲线,确定检测范围、线性（R2）、检测限及定量限;连续测定该4份国际质控血清的4、6B、9V型IgG抗体各10次,计算回收率,验证该方法的准确性;在同一次试验内连续测定3份本室制备的质控血清的4、6B、9V型IgG抗体各10次,计算变异系数（CV）,验证方法的试验内精密性;在不同次试验间连续测定15份质控血清的4、6B、9V型IgG抗体各10次,计算CV值,验证方法的试验间精密性;利用3份本室制备的质控血清进行抑制试验,验证方法的特异性。结果 该方法检测4、6B、9V型IgG抗体的范围分别为0.034～8.325、0.093～22.625和0.066～16.400 ng/ml,R2均大于0.99,检测限分别为0.41、0.64和0.77 ng/ml,定量限分别为1.60、2.66和2.80 ng/ml;该方法检测4份国际质控血清的4、6B、9V型IgG抗体,除96/728和96/770质控血清的4型抗体测定值远远超出理论值外,其他检测结果准确性均良好;该方法的试验内变异系数均小于15%,试验间变异系数绝大多数小于20%;多糖抗原与血清抗体的反应具有特异性,其中,检测4型抗体的特异性最高,检测6B型抗体的特异性略差。结论 该方法的检测范围、线性、检测限和定量限均达到可接受标准,准确性、精密性和特异性良好,可用于肺炎球菌疫苗临床血清的检测。

淋病奈瑟球菌国家参考品菌株的分子生物学特征分析

目的对中国医学细菌保藏管理中心收集保藏的淋病奈瑟球菌(NG)国家参考品菌株进行分子生物学特征分析。方法对13株NG国家参考品菌株进行16S rRNA和隐蔽性质粒cppB基因扩增和分析,并采用多位点序列分型(MLST)、NG多抗原序列分型(NG-MAST)技术对菌株进行分子分型。结果 13株菌种均扩增出预期大小的16S rRNA基因片段,与NG模式菌株参考序列(X07714.1)的相似性均>99%;13株菌种均扩增出预期大小的cppB基因;MLST结果显示,13株菌种共分为10个ST型,其中含7个新的ST型;NG-MAST结果显示,13株菌种含9个por等位基因和9个tbpB等位基因,配对后是10个不同的ST型,其中含6个新的ST型。结论该研究完善了NG国家参考品菌株的分子生物学方面的质控指标,为今后NG参考品候选菌株的选择提供了新的技术手段。