鸡含锰超氧化物歧化酶cDNA克隆及序列分析

为弄清鸡含锰超氧化物歧化酶 (manganese containingsuperoxidedismutase ,MnSOD)的cDNA序列 ,以开展动物锰营养学的深入研究 ,根据已知鸡MnSOD的N端氨基酸序列设计简并引物 ,应用 3′RACE(rapidamplificationofcDNAends)技术 ,扩增克隆了鸡心肌MnSOD 990bp的 3′cDNA片段 .再根据 3′RACE片段测序结果设计引物进行 5′RACE ,结果获取了一个与 3′RACE片段相互重叠的鸡心肌MnSOD 52 1bp的 5′RACE片段 ,并对其进行了克隆测序 .最后根据 3′RACE片段和 5′RACE片段序列信息进行拼接 ,从而获取鸡MnSODcDNA的全序列信息 .研究结果表明 :鸡MnSODcDNA全长为 110 8个核苷酸 ,其中 5′非翻译区 2 5个核苷酸 ,编码区 675个核苷酸 ,3′非翻译区 4 0 8个核苷酸 ,编码一个长 2 2 4个氨基酸残基的蛋白质前体 .其中信号肽长 2 6个氨基酸残基 ,成熟肽长 198个氨基酸残基 ,分子量为 2 2kD .与人、大鼠、线虫、果蝇等真核生物MnSOD氨基酸序列的同源性分别为82 4 %、84 .7%、62 .4 %、59.3% .

动物锰营养中含锰超氧化物歧化酶研究进展

锰超氧化物歧化酶(MnSOD)是一种催化超氧阴离子自由基发生歧化反应 ,生成氧和过氧化氢的重要含锰金属酶。本文对MnSOD的分布、结构、活性、基因表达以及动物饲粮锰及其它因素对MnSOD的调节等进行了综述 。

siRNA介导的NFBD1表达沉默对HeLa细胞增殖与凋亡的影响

NFBD1,也称MDC1,是1个参与细胞内DNA损伤后细胞应答反应的重要分子.为探讨NFBD1在细胞增殖和凋亡中的作用及其作为分子靶点用于肿瘤治疗的潜在价值,本研究采用siRNA技术抑制NFBD1的表达,并观察了其对人宫颈癌细胞HeLa细胞增殖和细胞凋亡的影响.半定量RT-PCR和蛋白质印迹分析结果表明,筛选到的短链NFBD1 siRNA能有效抑制内源NFBD1的表达,抑制程度约100%.细胞生长曲线分析结果表明,siRNA介导的NFBD1表达沉默导致HeLa细胞生长增殖的显著抑制.FACS分析结果表明,NFBD1表达抑制导致sub-G1峰的出现,同时蛋白质印迹分析观察到了caspase 3和PARP(poly-ADP-ribose polymerase)的剪接激活,表明NFBD1表达抑制诱发了细胞凋亡.在该凋亡过程中,P53及其下游靶分子Bax和Puma的表达水平均没有发生明显变化,但Noxa的表达在mRNA和蛋白质水平上均显著上调,强烈提示该凋亡过程很可能是1个不依赖P53的凋亡途径,且Noxa的转录激活在该凋亡过程中可能起着重要作用.这些结果表明,NFBD1参与细胞生长增殖和凋亡的调节,是一个潜在的肿瘤治疗新靶点.

人NFBD1启动子的鉴定与初步分析

NFBD1,也称MDC1,是一个参与细胞内DNA损伤后细胞应答反应的重要分子.为了进一步深入研究其转录调控机制,本研究克隆鉴定了NFBD1的启动子.首先应用5′RACE技术鉴定了NFBD1的转录起始位点,首次发现NFBD1至少存在3种丰度和转录起始位点不同的转录变异体.然后,通过PCR定向克隆和酶切亚克隆策略,构建了覆盖NFBD1基因5′侧翼区起始密码子ATG上游5kb区域的一系列NFBD1启动子荧光素酶报告基因重组体.启动子活性分析表明,NFBD1启动子区域定位于主要转录起始位点区域附近1.5kb的区域内.采用转录因子结合位点预测分析软件分析表明,NFBD1启动子缺乏TATA盒,但含有典型的CCAAT盒和GC盒以及其它潜在的转录因子结合位点,提示Sp1和NF-Y等转录因子可能参与NFBD1的转录调控.

新基因功能研究的策略与方法

开展新基因功能研究在当前生物医学研究中变得日益重要.基因功能的研究策略主要包括新基因的生物信息学及体内表达规律分析、功能获得与功能失活策略研究、基因编码产物相互作用蛋白的研究.同时,结合近年来国内外的一些新进展,对与各种策略相关的一些技术方法也进行了介绍.

一个新的人NFBD1启动子的鉴定与分析

目的:鉴定分析NFBD1启动子,为进一步研究其转录调控奠定基础.方法:综合应用生物信息学分析和异构体特异性的巢式RT-PCR技术鉴定NFBD1转录起始位点和转录变异体;高保真PCR方法扩增NFBD1基因启动子区域并分别定向克隆入pGL3-basic和pGL3-enhancer载体,构建NFBD1启动子荧光素酶报告基因重组体;荧光素酶分析检测启动子活性;生物信息学方法预测转录因子结合位点.结果:鉴定了一个新的NFBD1转录起始位点和转录变异体,构建了2个含有长度分别为2.5和1.2kb的NFBD1启动子序列的荧光素酶报告基因重组体以及2个相应的含有外源增强子的NFBD1启动子荧光素酶报告基因重组体.启动子活性分析表明,该启动子区域具有启动子活性,且能被外源增强子有效驱动,是一个新的人NFBD1启动子.转录因子结合位点预测分析表明,该启动子区域缺乏典型的CCAAT盒和GC盒,但含有TA-TA盒以及STAT1,MZF1和MAZ等潜在的转录因子结合位点.结论:鉴定了一个新的NFBD1启动子.

一步3′RACE快速构建鸡MnSOD全长cDNA克隆

将触减PCR与3′cDNA末端快速扩增(rapidamplificationofcDNAends,RACE)技术进行结合,仅用一条特异性引物和一条通用引物,成功地实现了从3′末端cDNA库对鸡含锰超氧化物歧化酶(manganese-containingsu peroxidedismutase,MnSOD)全长cDNA的一步3′RACE快速构建。与常规使用的末端PCR或亚克隆方法相比,该法具有快速、省时、经济和特异性好的优点。

生物化学实验教学改革初探

对近年来国内生物化学实验教学改革的现状进行了回顾，并以此为基础，结合生物化学实验教学中存在的问题，对生物化学实验教学的内容、实验考核办法等进行了初步改革和小范围试点，取得了良好的效果，为进一步建立更为完善的面向21世纪的医学生物化学实验教学新体系奠定了良好的基础。

生物化学与分子生物学教学内容的优化整合

通过对国内外多个著名医学院校的生物化学与分子生物学课程设置和教学内容进行调研与分析,在此基础上对生物化学与分子生物学的教学内容进行了优化整合,以期为推动该课程的进一步教学改革和总体课程体系改革奠定坚实的基础。

基于GMER理念的生物化学与分子生物学教学

首先对国际医学教育专门委员会提出的全球医学教育最基本要求(GMER)及其在中国的实施情况进行了简要的介绍,并以此为基础,对GMER中相关生物化学与分子生物学教学的内容进行了解读,进而对在生物化学与分子生物学教学中如何贯彻GMER的要求和理念进行了思考并提出一些设想,以期为推动生物化学与分子生物学课程的进一步改革和总体课程体系改革奠定坚实的基础。

肉鸡对不同形态锰源的生物利用率研究

目的 : 研究肉仔鸡对不同形态锰源的相对生物学利用率。方法 : 将 62 4只 1日龄肉公鸡随机分为 1 3组 ,分别饲不添加锰的基础饲粮 (对照组 )或以不同锰化合物添加 60、1 2 0、1 80 mg/ kg锰的试验饲粮 2 1 d。结果 : 肉鸡生长性能各指标和腿病发生率以及肉鸡的跖骨灰锰含量、心肌细胞线粒体中 Mn SOD活性均未受到添加锰源以及锰源与锰水平互作的显著影响 ,但受到添加锰水平的显著影响。肉鸡心肌含锰量和 Mn SOD m RNA水平均未受到添加锰源与锰水平互作的显著影响 ,但受到添加锰源及添加锰水平的显著影响。其中中等和强络合强度有机锰源的生物学利用率明显高于无机硫酸锰和弱络合强度有机锰源。结论

人PRR11启动子的结构与功能初步分析

PRR11(proline-rich protein 11,PRR11)是我们最近发现的一个新的肿瘤相关基因.初步研究表明,PRR11参与细胞增殖、细胞周期和细胞癌变等多种生物学过程.为了进一步研究PRR11基因的转录调控机制并全面解析其功能,本研究对PRR11基因的启动子进行了克隆鉴定和初步分析.首先,应用5'RACE(rapid amplification of cDNA ends,cDNA末端快速扩增)技术鉴定了PRR11基因的转录起始位点,发现了其具有多个转录起始位点.通过PCR定向克隆和DNA blunting技术,构建了6个相互重叠并覆盖PRR11基因转录起始位点附近约2.0 kb区域的PRR 11基因启动子荧光素酶报告基因重组体.启动子活性分析表明,PRR 11基因启动子主要定位于转录起始位点附近-563 bp～+341 bp的区域内.采用转录因子结合位点预测分析软件分析表明,PRR 11基因启动子缺乏典型的TATA盒,但含有典型的GC盒、CCAAT盒以及潜在的经典转录因子E2F1和MYB的结合位点,提示Sp1、NF-Y、E2F1和MYB等经典转录因子可能参与PRR 11基因的转录调控.

沉默DEPDC1抑制鼻咽癌细胞HNE-1和CNE-1侵袭迁移

DEPDC1(DEP domain containing 1)是一个新的肿瘤相关基因,在多种恶性肿瘤的发生发展进程中起着重要作用。我们前期工作中在鼻咽癌细胞内沉默了DEPDC1的表达,发现抑制细胞增殖并诱发细胞凋亡。本研究旨在探讨沉默DEPDC1表达后,对鼻咽癌细胞HNE-1和CNE-1侵袭迁移能力的影响及其分子机制。结果显示,siRNA介导DEPDC1表达沉默后,细胞侧向运动能力、侵袭及迁移能力显著降低。qRT-PCR及Western印迹检测发现DEPDC1沉默导致EMT上游关键转录因子Twist1及间质细胞标志分子Vimentin表达显著下调。这些研究表明,鼻咽癌细胞中DEPDC1通过调节Twist1等EMT关键分子的表达在细胞侵袭转移过程中起关键作用。推测DEPDC1在鼻咽癌中高表达可能对于促进其侵袭转移具有重要作用,进而促进肿瘤发生发展,但具体分子机制仍有待更深入研究。

低聚果糖的生物学效应及其安全性研究进展

作为一种应用最早和最为广泛的功能性低聚糖,低聚果糖具有调节肠道菌群、提高机体免疫功能、降低血脂和促进某些营养物质吸收的功能,且对人体无任何生理毒性.通过对其生物学效应与安全性等方面近年来的最新研究进展进行综述,以期推动低聚果糖的进一步深入研究开发和在食品上的广泛应用.

静脉注射不同形态锰源对肉仔鸡生物学活性的影响

【目的】研究经静脉注射途径进入体内的不同形态锰在肉仔鸡体内代谢利用上的差异。【方法】将180只22日龄肉公鸡按体重随机分为5个处理组,分别翅静脉注射生理盐水,或在生理盐水中溶解硫酸锰及弱、中等和强络合强度有机锰源的注射液20d。【结果】静脉注射后第10和20天,各注射锰源组鸡的跖骨灰锰含量、心肌锰含量、心肌细胞线粒体中MnSOD活性和MnSOD mRNA均显著(P<0.03)高于注射生理盐水的对照组,但前3项指标未能恒定一致地反映出不同形态锰对肉仔鸡的生物学活性的差异。注射中等络合强度锰源组心肌细胞线粒体中MnSOD mRNA水平显著高于注射硫酸锰组(P<0.01)和强络合强度锰源组(P<0.09),且注射弱络合强度锰源组心肌细胞线粒体中MnSOD mRNA水平显著高于注射硫酸锰组(P<0.06)。【结论】注射锰在转录水平上显著影响心肌细胞线粒体中MnSOD的基因表达,这一功能性基因表达指标比其酶活性等其它指标更敏感、更恒定地监测出肉仔鸡对不同锰间生物学利用性的差异。经静脉注射途径进入体内的中等和弱络合强度有机锰源对肉仔鸡的生物学活性显著高于无机锰,而强络合强度有机锰源不利于肉仔鸡体组织细胞对其中锰的利用。

沉默Bmi-1基因表达稳定细胞株的建立及其生物学特性的研究

B细胞特异性莫洛尼鼠白血病病毒插入位点1(B-cell-specific moloney murine leukemia virus insertionsite 1,Bmi-1)基因是多梳基因家族成员,参与细胞增殖调控.研究发现Bmi-1基因可能参与肿瘤的形成,可能成为肿瘤潜在的治疗靶点.用RNA干扰(RNA interference,RNAi)沉默Bmi-1基因表达观察其对乳腺癌细胞株MCF-7侵袭和转移等生物学特性的影响,以探讨Bmi-1在乳腺癌发生发展中的作用.PT67细胞包装质粒后产生的逆转录病毒感染MCF-7细胞,嘌呤霉素筛选建立稳定细胞株,稳定抑制Bmi-1的细胞株命名为MCF-7/Bmi-1si.通过RT-PCR和Western blot分别从mRNA和蛋白水平检测Bmi-1的表达量;平板克隆形成实验检测细胞克隆形成能力;Transwell侵袭小室模型检测细胞体外侵袭和转移能力.MCF-7/Bmi-1si组与MCF-7和MCF-7/GFPsi组相比,Bmi-1 mRNA和蛋白表达量明显减少,克隆形成数及形成率也明显减少(P<0.05).侵袭和转移实验表明:与MCF-7和MCF-7/GFPsi组相比,MCF-7/Bmi-1si组细胞在Transwell侵袭小室中24 h穿膜细胞数明显减少(P<0.05).结果表明沉默Bmi-1基因表达稳定细胞株构建成功,Bmi-1基因表达的沉默能显著降低MCF-7细胞的体外增殖及侵袭转移能力.

MOOC背景下生物化学教学的对策与改革

将MOOC的教学理念引入生物化学教学中,与课堂教学相结合,对提升教师教学的质量和效率,调动学生的学习积极主动性,以及建立有效的学习效果评价体系等方面进行探讨及改革,以期适应电子信息化时代对提高人才培养质量的需求。

苛求芽孢杆菌胞外尿酸酶的表征及其在血清尿酸测定中的应用

目的考察苛求芽孢杆菌（ATCC 26904）分泌型尿酸酶的特性和将其应用于直接动力学尿酸酶法测定血清尿酸的有效性。方法苛求芽孢杆菌分泌的尿酸酶经DEAE-cellulose层析纯化后，用于以积分法分析尿酸酶反应曲线预测反应体系本底的直接动力学尿酸酶法测定血清尿酸。结果苛求芽孢杆菌分泌的尿酸酶只含1种肽链，分子量为34．7kD（1kD=0．9921ku），其米氏常数为（0．22±0．01）mmol／L（n=11），黄嘌呤抑制常数为（36±3）μmol／L（n=4）。用此尿酸酶，只要被分析反应曲线终点的底物浓度低于起点的30％，应用积分法就能可靠预测本底；直接测定反应前吸收，可使直接动力学尿酸酶法不受常见血清成分、酶活性变化和15μmol／L黄嘌呤等干扰。监测0．025U／ml尿酸酶反应5min的数据，其线性响应范围为1～50μmol／L；所得临床标本血清尿酸含量（Ct）与过氧化物酶偶联间接终点平衡法（Ce）正相关（Ck=-0．008＋1．046Ce，r=0．996，n=206），但Bland—Altman法分析表明两种方法不一致。结论苛求芽孢杆菌分泌的尿酸酶可用于直接动力学尿酸酶法测定尿酸，并可保障其优势。

以器官系统为中心的基础医学课程改革初探

随着现代医学教育的发展,传统的"以学科为中心"的课程模式存在诸多弊端,而"以器官系统为中心"的课程模式受到诸多好评。重庆医科大学初步探索适应校情的基础医学课程教学体系改革,为全面开展以器官系统为中心的基础医学课程模式,为培养具有创新精神和综合能力的实用型人才打下基础。

有机锰源化学特性研究

测定了5种蛋氨酸锰(Mn-MetA～E)、2种锰蛋白盐(Mn-ProA和Mn-ProB)和5种复合氨基酸锰(Mn-AAA～E)的元素含量、氨基酸组成、溶解度、红外光谱特征、在pH2、0 2mol/LHCl-KCl或pH5、0 1mol/LKH2PO4-K2HPO4缓冲液中的稳定性及络合强度。结果表明,12种有机锰源产品的含锰量为6 48%～17 44%,也含有不同数量的常量元素和微量元素,总氨基酸与锰的摩尔比为0 04∶1～1 83∶1。除Mn-AAD在0 4%盐酸溶液中的溶解度为90 3%、Mn-ProB和Mn-AAD在pH2、0 2mol/LHCl-KCl缓冲溶液中的溶解度分别为74 1%和85 3%外,所测有机锰源产品在0 4%盐酸、2%柠檬酸、中性柠檬酸铵及pH2、0 2mol/LHCl-KCl缓冲液中的溶解度均在95%以上,在水和pH5、0 1mol/LKH2PO4-K2HPO4缓冲液中的溶解度受载体性质影响,变化范围为5 8%～99 8%。所测4种有机锰源产品均具有金属元素络合物的结构特征。未检测到有机锰源产品在pH2、0 2mol/LHCl-KCl或pH5、0 1mol/LKH2PO4-K2HPO4缓冲液中的可溶部分经凝胶过滤后有以络合锰形式存在的锰。有7种有机锰源产品的络合强度低于10,属于弱络合强度络合物;有4种有机锰源产品的络合强度介于10～100之间,属于中等络合强度络合物;有1种有机锰源产品的络合强度介于100～1000之间,属于强络合强度络合物。本研究结果提示。