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基于GEO芯片和网络药理学探讨康力欣胶囊治疗乳腺癌的作用机制
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作者 柯昌虎 严慧 +1 位作者 吴亚晴 黄慧敏 《湖北医药学院学报》 CAS 2024年第2期169-178,共10页
目的:利用GEO芯片和网络药理学探讨康力欣胶囊治疗乳腺癌的分子机制。方法:通过TCMSP、HERB、Batman-TCM数据库检索药物的化学成分,借助Swiss Target Prediction数据库获取药物成分对应的相关靶点;在GEO数据库中检索乳腺癌的相关靶点;利... 目的:利用GEO芯片和网络药理学探讨康力欣胶囊治疗乳腺癌的分子机制。方法:通过TCMSP、HERB、Batman-TCM数据库检索药物的化学成分,借助Swiss Target Prediction数据库获取药物成分对应的相关靶点;在GEO数据库中检索乳腺癌的相关靶点;利用Venny 2.1.0在线软件获取药物与疾病的共同靶点;由Cytoscape 3.8.2绘制药物-成分-靶点-疾病网络;STRING数据库构建PPI网络;借助DAVID数据库进行GO功能富集和KEGG通路富集分析;运用AutoDock软件对关键的活性成分和靶点进行分子对接验证。结果:康力欣胶囊中59个有效成分通过调控106个靶点和43条通路对乳腺癌产生作用,法尼斯淝醇A、多胶阿魏素、宽叶阿魏酮、山奈酚、法尼斯淝醇B、泽兰黄醇素、槲皮素、宽叶阿魏醇、啤酒甾醇、阿魏种素等成分可以通过EGFR、JUN、PPARG、PTGS2、CCNA2、CHEK1、CDK1、CDK2、MMP9、TOP2A等关键靶点介导癌症的中枢碳代谢、细胞周期、代谢途径、癌症途径、AMPK、松弛素、FoxO、IL-17、Ras、HIF-1、MAPK、钙、胰岛素等信号通路来治疗乳腺癌。分子对接分析发现10个靶点蛋白与10个活性成分具有较好的结合能力。结论:康力欣胶囊可以通过多成分、多靶点、多途径参与乳腺癌的治疗,为其临床应用及治疗乳腺癌的机制深入研究提供了理论依据。 展开更多
关键词 康力欣胶囊 乳腺癌 GEO芯片 网络药理学 分子对接 作用机制
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基于网络药理学和分子对接探讨金银花口服液防治新型冠状病毒感染的作用机制 被引量:1
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作者 柯昌虎 吴亚晴 +2 位作者 丁雪茹 黄慧敏 严慧 《生物技术进展》 2023年第5期807-817,共11页
利用网络药理学和分子对接探讨金银花口服液防治新型冠状病毒感染的分子机制。通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索药物的化学成分,借助... 利用网络药理学和分子对接探讨金银花口服液防治新型冠状病毒感染的分子机制。通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索药物的化学成分,借助Swiss Target Prediction数据获取药物成分对应的相关靶点;在GeneCards、CTD、TTD、DrugBank数据库中检索疾病的相关靶点;利用Venny 2.1.0在线软件获取药物与疾病的共同靶点;由Cytoscape 3.8.2绘制药物-成分-靶点-疾病网络;String数据库构建蛋白互作网络;借助David数据库进行基因本体论(gene ontology,GO)功能富集和京都基因和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;运用AutoDock软件对成分和靶点进行分子对接验证。结果发现,金银花口服液中16个有效成分通过调控88个靶点和108条通路对新型冠状病毒感染产生作用,伞房花耳草素、金圣草素、木犀草素、亚油酸乙酯、山奈酚、槲皮素等成分可以通过AKT1、SRC、EGFR、HIF1A、PPARG、MMP9、ESR1、MAPK1、PTGS2、MMP2等关键靶点调控HIF-1、化学致癌-受体激活、内分泌抵抗、粘着斑、PI3K-Akt、VEGF、松弛素、ErbB、丙型肝炎、乙型肝炎、Rap1等信号通路来治疗新型冠状病毒感染。分子对接结果显示,靶点蛋白与活性成分具有较好的结合能力。结果表明,金银花口服液可以通过多成分、多靶点、多途径参与新型冠状病毒感染的防治,这为其临床应用及深入研究防治新型冠状病毒感染的机制提供了理论依据。 展开更多
关键词 金银花口服液 新型冠状病毒感染 网络药理学 分子对接 作用机制
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基于网络药理学和分子对接探讨丹红注射液治疗急性心肌梗死的作用机制
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作者 柯昌虎 吴亚晴 +1 位作者 黄慧敏 严慧 《中国临床药理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期668-672,共5页
目的 利用网络药理学和分子对接探讨丹红注射液治疗急性心肌梗死的分子机制。方法 通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)检索丹红注射液的化学成分,借助Swiss Target Prediction数据库获取药物成分对应的相关靶点;在人类基因数据... 目的 利用网络药理学和分子对接探讨丹红注射液治疗急性心肌梗死的分子机制。方法 通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)检索丹红注射液的化学成分,借助Swiss Target Prediction数据库获取药物成分对应的相关靶点;在人类基因数据库(GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)和基因疾病关联数据库(DisGeNET)中检索急性心肌梗死的相关靶点;利用Venny 2.1在线软件获取药物与疾病的共同靶点;由Cytoscape 3.8.2绘制药物-成分-靶点-疾病网络;应用STRING数据库构建蛋白相互作用网络;借助注释、可视化和集成发现数据库(DAVID)进行基因本体论(GO)功能富集与京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;运用AutoDock软件对关键的活性成分和作用靶点进行分子对接验证。结果 丹红注射液中63个有效成分通过调控137个靶点和132条通路对急性心肌梗死产生作用,紫丹参素C、木犀草素、黄芩素、香紫苏醇、山柰酚、槲皮万寿菊素等成分可以通过肿瘤坏死因子、外消旋-α丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶、白细胞介素1β、类固醇受体共激活因子、丝裂原活化蛋白激酶3、信号转导和转录激活因子3等关键靶点介导C型凝集素受体、肿瘤坏死因子、内分泌抵抗、催乳素、磷脂酰肌醇-3-激酶-丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶、Janus激酶-信号传导和转录激活因子等信号通路来治疗急性心肌梗死。分子对接结果显示靶点蛋白与活性成分具有较好的结合能力。结论 丹红注射液可以通过多成分、多靶点、多途径参与急性心肌梗死的治疗,为其临床应用及其治疗急性心肌梗死的机制深入研究提供了理论依据。 展开更多
关键词 丹红注射液 急性心肌梗死 网络药理学 分子对接 作用机制
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3种麦芽淀粉主要理化性质的比较 被引量:2
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作者 张黎明 吴亚晴 +3 位作者 刘雪涵 李铮铮 程慧杰 戴玉杰 《食品科技》 CAS 北大核心 2016年第1期68-72,共5页
研究了啤酒麦芽、小麦麦芽和药用麦芽淀粉的理化性质,包括化学组分、颗粒形貌、结晶结构、溶解度、膨胀度、糊透明度和冻融稳定性。通过碘量法测得啤酒麦芽、小麦麦芽和药用麦芽淀粉中直链淀粉的含量分别为28.64%、29.24%和30.30%;3种... 研究了啤酒麦芽、小麦麦芽和药用麦芽淀粉的理化性质,包括化学组分、颗粒形貌、结晶结构、溶解度、膨胀度、糊透明度和冻融稳定性。通过碘量法测得啤酒麦芽、小麦麦芽和药用麦芽淀粉中直链淀粉的含量分别为28.64%、29.24%和30.30%;3种麦芽淀粉颗粒仍保持了未发芽原淀粉的形貌和A型结晶结构,且在衍射角(2θ)为20°附近有直链淀粉-脂类复合物的特征吸收峰。啤酒麦芽淀粉的溶解度、膨胀度和糊透明度最高;其冻融稳定性与药用麦芽相近,优于小麦麦芽淀粉。麦芽淀粉作为一种淀粉新资源,具有一定的开发价值和广阔的发展前景。 展开更多
关键词 啤酒麦芽 小麦麦芽 药用麦芽 淀粉 理化性质
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