为了阐释致病性多重耐药性鸡源大肠杆菌分离株的基因组信息及其耐药和致病机制,试验通过第二代测序技术,基于Illumina Nova Seq测序平台,对大肠杆菌JC78株进行基因组测序,利用CRISPRCasFinder软件预测基因序列信息,并通过GO(gene ontolo...为了阐释致病性多重耐药性鸡源大肠杆菌分离株的基因组信息及其耐药和致病机制,试验通过第二代测序技术,基于Illumina Nova Seq测序平台,对大肠杆菌JC78株进行基因组测序,利用CRISPRCasFinder软件预测基因序列信息,并通过GO(gene ontology)、KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)、COG(cluster of orthologous groups of proteins)、NR(non-redundant protein)、Pfam、TCDB(transporter classification database)、Swiss-Prot、碳水化合物活性酶(carbohydrate-active en ZYmes,CAZy)、病原与宿主互作(pathogen host interactions,PHI)、致病菌毒力因子综合性(virulence factors of pathogenic bacteria,VFDB)、抗生素耐药性综合(the comprehensive antibiotic resistance database,CARD)数据库进行基因功能分析。结果表明:大肠杆菌JC78株基因组大小为5316974 bp,GC含量为50.38%,预测到的蛋白质编码基因有5111个,包含4个rRNA(1个23S r RNA、1个16S rRNA、2个5S r RNA)、65个t RNA基因及80个其他RNA;预测出5个CRISPR序列,59个串联重复序列;NR、COG、Swiss-Prot、GO、KEGG、TCDB、PHI、CAZy数据库注释到5099,4577,4476,3894,3173,1260,1225,141个基因;VFDB数据库注释筛选出的毒力基因主要包括鞭毛、菌毛、K1荚膜、Ⅱ型分泌系统等;CARD数据库注释筛选出的耐药基因与链霉素、四环素、β-内酰胺类、氟喹诺酮类、大环内酯类及利福平等药物相关。说明大肠杆菌JC78株具有较强毒力且为多重耐药株,并携带大量毒力基因与耐药基因。展开更多
为研究细胞毒性物质对成骨细胞的影响,采用 24 h 内乳鼠头盖骨,对国外现行报道方法进行了改进,建立了适合我国同类试验室条件下的骨组织细胞培养方法——酶消化分离培养法,并用该新方法培养出了具有典型特征的成骨细胞系。研究结果表明...为研究细胞毒性物质对成骨细胞的影响,采用 24 h 内乳鼠头盖骨,对国外现行报道方法进行了改进,建立了适合我国同类试验室条件下的骨组织细胞培养方法——酶消化分离培养法,并用该新方法培养出了具有典型特征的成骨细胞系。研究结果表明,此法具有耗时短、消化充分和对细胞损伤小的特点,能够满足试验的要求。镜下细胞形态不规则,多呈三角形、多角形,有突起,胞质丰富、清晰。应用特异性染色方法,胞质中呈现相应的特征性染色。培养过程中,成骨细胞经历静止期、指数成长期和滞后期等三个阶段。培养 14 d 后,出现矿化结节。展开更多
文摘为了阐释致病性多重耐药性鸡源大肠杆菌分离株的基因组信息及其耐药和致病机制,试验通过第二代测序技术,基于Illumina Nova Seq测序平台,对大肠杆菌JC78株进行基因组测序,利用CRISPRCasFinder软件预测基因序列信息,并通过GO(gene ontology)、KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)、COG(cluster of orthologous groups of proteins)、NR(non-redundant protein)、Pfam、TCDB(transporter classification database)、Swiss-Prot、碳水化合物活性酶(carbohydrate-active en ZYmes,CAZy)、病原与宿主互作(pathogen host interactions,PHI)、致病菌毒力因子综合性(virulence factors of pathogenic bacteria,VFDB)、抗生素耐药性综合(the comprehensive antibiotic resistance database,CARD)数据库进行基因功能分析。结果表明:大肠杆菌JC78株基因组大小为5316974 bp,GC含量为50.38%,预测到的蛋白质编码基因有5111个,包含4个rRNA(1个23S r RNA、1个16S rRNA、2个5S r RNA)、65个t RNA基因及80个其他RNA;预测出5个CRISPR序列,59个串联重复序列;NR、COG、Swiss-Prot、GO、KEGG、TCDB、PHI、CAZy数据库注释到5099,4577,4476,3894,3173,1260,1225,141个基因;VFDB数据库注释筛选出的毒力基因主要包括鞭毛、菌毛、K1荚膜、Ⅱ型分泌系统等;CARD数据库注释筛选出的耐药基因与链霉素、四环素、β-内酰胺类、氟喹诺酮类、大环内酯类及利福平等药物相关。说明大肠杆菌JC78株具有较强毒力且为多重耐药株,并携带大量毒力基因与耐药基因。
文摘为研究细胞毒性物质对成骨细胞的影响,采用 24 h 内乳鼠头盖骨,对国外现行报道方法进行了改进,建立了适合我国同类试验室条件下的骨组织细胞培养方法——酶消化分离培养法,并用该新方法培养出了具有典型特征的成骨细胞系。研究结果表明,此法具有耗时短、消化充分和对细胞损伤小的特点,能够满足试验的要求。镜下细胞形态不规则,多呈三角形、多角形,有突起,胞质丰富、清晰。应用特异性染色方法,胞质中呈现相应的特征性染色。培养过程中,成骨细胞经历静止期、指数成长期和滞后期等三个阶段。培养 14 d 后,出现矿化结节。
