目的通过microRNAs差异分析、网络药理学及分子对接技术,探讨益母草治疗宫腔粘连(intrauterine adhesion,IUA)的潜在作用靶点及相关机制。方法基于GEO(gene expression omnibus)数据库筛选IUA与健康者的差异miRNA,经multiMiR进行靶基因...目的通过microRNAs差异分析、网络药理学及分子对接技术,探讨益母草治疗宫腔粘连(intrauterine adhesion,IUA)的潜在作用靶点及相关机制。方法基于GEO(gene expression omnibus)数据库筛选IUA与健康者的差异miRNA,经multiMiR进行靶基因预测。通过TCMSP(traditional Chinese medicine systems pharmacology)数据库检索益母草有效活性成分及相关靶点,并与miRNA靶基因取交集。利用String平台进行蛋白质互作分析,利用cytoNCA筛选关键靶点。基于R语言进行基因本体(gene ontology,GO)和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析。利用CB-dock2对关键靶点和活性成分进行分子对接。结果共筛选出与IUA相关的差异miRNA 43个,经靶基因预测后与IUA共有13个交集靶点,GO及KEGG富集分析结果显示,益母草治疗IUA作用机制主要与细胞衰老、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信号通路、PI3K-Akt信号通路等有关。益母草3个特征性活性成分是花生四烯酸、山奈酚、槲皮素,可与蛋白互作网络中相对应的靶点蛋白细胞周期蛋白依赖性激酶4(cyclin-dependent kinase 4,CDK4)、芳香烃受体(aryl hydrocarbon receptor,AHR)、原癌基因c-myc编码转录因子、血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)进行分子对接,主要活性成分能够与核心靶点结合,并展现出较好的亲和力。结论益母草治疗IUA是多成分、多靶点、多通路相互作用的结果,进一步证实了益母草治疗IUA的科学性及有效性,为后续实验提供了研究思路。展开更多
文摘目的通过microRNAs差异分析、网络药理学及分子对接技术,探讨益母草治疗宫腔粘连(intrauterine adhesion,IUA)的潜在作用靶点及相关机制。方法基于GEO(gene expression omnibus)数据库筛选IUA与健康者的差异miRNA,经multiMiR进行靶基因预测。通过TCMSP(traditional Chinese medicine systems pharmacology)数据库检索益母草有效活性成分及相关靶点,并与miRNA靶基因取交集。利用String平台进行蛋白质互作分析,利用cytoNCA筛选关键靶点。基于R语言进行基因本体(gene ontology,GO)和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析。利用CB-dock2对关键靶点和活性成分进行分子对接。结果共筛选出与IUA相关的差异miRNA 43个,经靶基因预测后与IUA共有13个交集靶点,GO及KEGG富集分析结果显示,益母草治疗IUA作用机制主要与细胞衰老、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信号通路、PI3K-Akt信号通路等有关。益母草3个特征性活性成分是花生四烯酸、山奈酚、槲皮素,可与蛋白互作网络中相对应的靶点蛋白细胞周期蛋白依赖性激酶4(cyclin-dependent kinase 4,CDK4)、芳香烃受体(aryl hydrocarbon receptor,AHR)、原癌基因c-myc编码转录因子、血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)进行分子对接,主要活性成分能够与核心靶点结合,并展现出较好的亲和力。结论益母草治疗IUA是多成分、多靶点、多通路相互作用的结果,进一步证实了益母草治疗IUA的科学性及有效性,为后续实验提供了研究思路。