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不同杂交组合鸡蛋品质的比较分析 被引量:1
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作者 蒋一秀 邹明阳 +6 位作者 薛倩 周成浩 张会永 殷建玫 夏树立 李国辉 韩威 《中国家禽》 北大核心 2024年第2期113-118,共6页
试验旨在研究以芦花鸡H系作为亲本的杂交组合蛋品质的差异,为地方鸡种的利用与开发提供理论依据。试验选择萧山鸡(X)、狼山鸡(L)、隐形白羽肉鸡(Y)、来航鸡(H),分别与芦花鸡H系(B)进行正反杂交(F1代),共7个试验组和2个对照组(B、L),每... 试验旨在研究以芦花鸡H系作为亲本的杂交组合蛋品质的差异,为地方鸡种的利用与开发提供理论依据。试验选择萧山鸡(X)、狼山鸡(L)、隐形白羽肉鸡(Y)、来航鸡(H),分别与芦花鸡H系(B)进行正反杂交(F1代),共7个试验组和2个对照组(B、L),每组15个重复。每个组合分别留取同期8 d的受精蛋F2代,孵化后在同一饲养条件和营养水平下饲养至43周龄,每个试验组分别收取30个鸡蛋测定蛋品质。结果显示:各试验组蛋重与对照组B差异不显著(P>0.05);试验组XB蛋黄重极显著高于对照组L(P<0.01);试验组BL、LB蛋黄比率与对照组B、L无显著差异(P>0.05);各试验组及对照组蛋白高度差异不显著(P>0.05);试验组BX、BL、XB、YB蛋壳强度极显著高于对照组L(P<0.01),与对照组B差异不显著(P>0.05);试验组BX、BL、BH、XB、YB蛋壳厚度均极显著高于对照组B和L(P<0.01);蛋黄色泽与蛋重、蛋黄重、蛋黄比率极显著相关(P<0.01),与蛋壳强度显著相关(P<0.05);主成分分析选取5个主成分,特征根累计贡献率为82.852 0%,包含所有杂交组合蛋品质的基本信息。由此可见,芦花鸡H系在与其他地方品种或引进品种杂交时,可较好地保持地方品种蛋品质特性,在选育过程中是优良的亲本素材。 展开更多
关键词 芦花鸡H系 杂交组合 蛋品质 相关性分析 主成分分析
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“酉芯一号”在地方鸡遗传多样性和结构分析中的应用效力研究
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作者 王梦燏 周成浩 +5 位作者 薛倩 殷建玫 蒋一秀 张会永 李国辉 韩威 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期640-648,共9页
我国地方鸡品种资源丰富,且在长期的选择进化过程中形成了各异的种质特性。科学评估群体遗传多样性,明确品种间遗传结构,对地方鸡品种资源的保护与创新利用具有重要价值。为了评估23K SNP芯片“酉芯一号”在地方鸡遗传多样性和遗传结构... 我国地方鸡品种资源丰富,且在长期的选择进化过程中形成了各异的种质特性。科学评估群体遗传多样性,明确品种间遗传结构,对地方鸡品种资源的保护与创新利用具有重要价值。为了评估23K SNP芯片“酉芯一号”在地方鸡遗传多样性和遗传结构分析中的应用效力,本文利用RADseq鉴定21个地方鸡种基因组遗传变异,并研发23K芯片“酉芯一号”。基于两组SNP数据集计算各品种的遗传统计量,开展相关性、拟合及系统发育分析,以评估芯片的应用效力。结果表明,基于两组SNP数据集计算的观察杂合度(Ho)、多态信息含量(PIC)、近交系数(F_(ROH))和遗传分化系数(F_(st)),在21个地方鸡种中趋势基本一致。琅琊鸡(LA)、瓢鸡(PJ)、文昌鸡(WC)的遗传多样性较为丰富;边鸡(BJ)、狼山鸡(LS)、固始鸡(GS)、东乡绿壳蛋鸡(DX)和北京油鸡(BY)的遗传多样性相对匮乏,两组Ho、PIC、F_(ROH)和平均Fst的相关系数分别为0.794、0.901、0.926和0.984,均达到极显著水平(P<0.01),且拟合度较高(P<0.001),R^(2)分别为0.644、0.827、0.916和0.927。针对两组SNP数据集,采用邻接法(NJ)和极大似然法(ML)构建的进化树较为合理,将21个地方鸡种总体上分为6大类,与品种的形成历史和地理分布相吻合;23K芯片对5个新增品种亦实现有效聚类,没有出现个体偏离。利用不同密度的SNP估算遗传统计量会存在一定差异,需要进行数据和分析方法的标准化,23K芯片在地方鸡遗传多样性和结构分析中具有较好的效力。 展开更多
关键词 RADseq SNP芯片 遗传多样性 遗传结构
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汶上芦花鸡CDKN2A基因序列变异、生物信息学及组织表达分析
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作者 薛倩 李国辉 +3 位作者 周成浩 蒋一秀 邢伟杰 韩威 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2024年第5期219-230,共12页
为检测汶上芦花鸡CDKN2A基因SNP位点,并对该基因进行生物信息学及其在皮肤组织中的表达规律分析。研究基于江苏省家禽科学研究所资源保护与评价课题组前期组装的汶上芦花鸡高质量染色体水平基因组,将其与鸡参考基因组(GRCg7b)比对获得CD... 为检测汶上芦花鸡CDKN2A基因SNP位点,并对该基因进行生物信息学及其在皮肤组织中的表达规律分析。研究基于江苏省家禽科学研究所资源保护与评价课题组前期组装的汶上芦花鸡高质量染色体水平基因组,将其与鸡参考基因组(GRCg7b)比对获得CDKN2A基因SNP位点,采用MassARRAY核酸质谱技术对其进行多态性检测和基因分型;运用生物信息学软件预测CDKN2A基因调控序列,及其编码蛋白质理化性质和结构特征;采用转录组和实时荧光定量方法分析该基因在汶上芦花鸡不同时期皮肤组织中的表达情况。结果表明,汶上芦花鸡CDKN2A序列总长度为9.854 kb,CDS全长183 bp,共编码60个氨基酸,在该基因及其上下游1 kb序列范围内共发现41个SNP,其中4个为新发现的SNP,分别位于基因下游和内含子区,第1外显子上发现2个错义SNP:V9D和C10R,41个SNP中34个SNP在汶上芦花鸡群体中检出率在91%以上,但基本均为纯合突变型,无多态存在;汶上芦花鸡CDKN2A基因上游2 kb区域内预测到8个启动子和5个CpG岛,启动子区包含Sp1、MEB-1、YY1、C/EBPα和AP-2α等12种转录因子结合潜在位点,该基因编码蛋白分子质量为7.30 ku,理论等电点为12.82,为带正电荷的、不稳定亲水性蛋白,亚细胞定位主要在线粒体中,无信号肽区域和信号肽剪切位点,共存在8个潜在磷酸化位点,不存在糖基化位点,含有典型的TRP_2(瞬时受体电位离子通道Ⅱ)保守结构域,其二级和三级结构主要以α-螺旋和无规则卷曲为主,并与MDM2、NPM1、USP36蛋白存在相互作用;汶上芦花鸡1~35日龄CDKN2A基因在其背部皮肤中的表达呈上升趋势。 展开更多
关键词 汶上芦花鸡 CDKN2A SNP变异位点 生物信息学分析 组织表达
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农村振兴与农业发展政策制定中的社会经济因素分析
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作者 赵迪 赵欣 +1 位作者 霍正然 周成浩 《农机使用与维修》 2024年第9期86-88,共3页
农村振兴和农业发展是推动社会经济发展的重要战略。在政策制定过程中,社会经济因素的分析至关重要。该研究通过探讨农村振兴与农业发展政策制定中的社会经济因素,分析农村地区的经济结构、人口流动、教育水平、基础设施建设及社会保障... 农村振兴和农业发展是推动社会经济发展的重要战略。在政策制定过程中,社会经济因素的分析至关重要。该研究通过探讨农村振兴与农业发展政策制定中的社会经济因素,分析农村地区的经济结构、人口流动、教育水平、基础设施建设及社会保障体系等方面内容,揭示这些因素如何影响政策的制定与实施,提出农村振兴与农业发展不仅依赖于经济投入和技术进步,更需要综合考虑社会经济因素,强调政策制定过程中应注重区域差异和因地制宜并总结一系列政策建议,旨在提升农村居民生活质量、促进农业现代化和推动农村经济全面发展。 展开更多
关键词 农村振兴 农业发展 社会经济因素 政策制定 产业链条
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蛋鸡开放式鸡舍光照管理研究 被引量:2
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作者 殷建玫 张会永 +5 位作者 李国辉 薛倩 周成浩 蒋一秀 韩威 苏一军 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期304-311,共8页
光照对蛋鸡的生产性能有重要影响。蛋鸡开放式鸡舍所用的自然光照时长随季节变化而变化,要达到精准化管理,方法比较繁琐。本研究利用软件Origin9在高斯函数下求出光照时长表达式y=y_(0)+A/w√π/2e^-2(x-x_(c)^(2)/w^(2)))的4个参数值(y... 光照对蛋鸡的生产性能有重要影响。蛋鸡开放式鸡舍所用的自然光照时长随季节变化而变化,要达到精准化管理,方法比较繁琐。本研究利用软件Origin9在高斯函数下求出光照时长表达式y=y_(0)+A/w√π/2e^-2(x-x_(c)^(2)/w^(2)))的4个参数值(y_(0)、w、x_(c)、A),此表达式计算出的光照时长与实际自然光照时长高度吻合,拟合度达0.99923。根据不同饲养阶段对光照时长的需求,利用卡西欧fx-CG2CN计算器编程,制定4种用光方案(育雏、育成期自然光照时长渐增、先增后减、渐减和先减后增),有利于发挥蛋鸡生产性能,并为我国家禽业的智能化发展提供参考。 展开更多
关键词 蛋鸡开放式鸡舍 自然光照时长 高斯函数 卡西欧fx-CG2CN计算器编程
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基于RAD-Seq简化基因组测序分析琅琊鸡的遗传进化 被引量:2
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作者 殷建玫 朱云芬 +6 位作者 李国辉 张会永 薛倩 周成浩 蒋一秀 苏一军 韩威 《中国家禽》 北大核心 2023年第5期19-23,共5页
为在基因组水平上探讨琅琊鸡的遗传进化,试验以琅琊鸡与其他22个地方鸡品种资源及2个国外引进品种为研究对象,利用简化基因组测序(RAD-seq)鉴定25个品种基因组SNP,计算琅琊鸡的遗传统计量,分析遗传多样性和遗传结构,基于Fst选择信号检... 为在基因组水平上探讨琅琊鸡的遗传进化,试验以琅琊鸡与其他22个地方鸡品种资源及2个国外引进品种为研究对象,利用简化基因组测序(RAD-seq)鉴定25个品种基因组SNP,计算琅琊鸡的遗传统计量,分析遗传多样性和遗传结构,基于Fst选择信号检验方法,筛选受选择基因并进行功能富集分析。结果显示:在琅琊鸡群体中鉴定出299648个SNPs,琅琊鸡的平均杂合度(Ho)为0.220,核苷酸多样度为0.266,近交系数为0.173;琅琊鸡与汶上芦花鸡、元宝鸡、天津猴鸡和狼山鸡聚为一类,亲缘关系较近。共筛选出113个受选择基因,受选择基因主要富集在谷氨酸受体活性、钙黏蛋白结合、4铁,4硫团簇结合、G蛋白偶联谷氨酸受体信号通路等生物学过程,主要参与柠檬酸循环(TCA循环)、代谢、类固醇激素生物合成等信号通路。研究表明,选择作用主要影响琅琊鸡的繁殖性状、适应性免疫和代谢等,结果为琅琊鸡的品种保护、鉴定评价及开发利用提供分子理论支撑。 展开更多
关键词 琅琊鸡 简化基因组测序 遗传进化 选择信号
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基于PacBio三代测序的高质量汶上芦花鸡基因组的组装 被引量:1
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作者 薛倩 邢伟杰 +6 位作者 李国辉 周成浩 张会永 殷建玫 蒋一秀 朱云芬 韩威 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期3869-3881,共13页
【目的】汶上芦花鸡为中国唯一的芦花羽地方鸡品种资源,芦花基因可伴性遗传,芦花羽性状可用于雏鸡的自别雌雄。试验旨在丰富家鸡基因组信息,获取汶上芦花鸡全基因组序列,为鸡伴性芦花羽分子机制研究提供材料。【方法】以汶上芦花鸡为试... 【目的】汶上芦花鸡为中国唯一的芦花羽地方鸡品种资源,芦花基因可伴性遗传,芦花羽性状可用于雏鸡的自别雌雄。试验旨在丰富家鸡基因组信息,获取汶上芦花鸡全基因组序列,为鸡伴性芦花羽分子机制研究提供材料。【方法】以汶上芦花鸡为试验动物,基于BGI MGISEQ构建小片段文库进行基因组特征评估,利用PacBio三代测序技术、Hi-C技术组装及构建汶上芦花鸡全基因组信息数据库,利用生物信息学方法对获得的基因组序列进行组装和功能注释。【结果】试验共获得BGI二代测序数据量59.70 Gb;获得PacBio三代测序数据量31.13 Gb,reads平均长度为15362 bp;获得Hi-C数据量95.37 Gb;拼接和初步组装得到基因组大小为1.12 Gb,经Hi-C辅助组装后,共有1.07 Gb的序列挂载到41条染色体上,挂载率95.62%,基因组contigs N50为9.61 Mb,scaffold N50为91.29 Mb,BUSCO评估为98.50%,基因组连续性和完整度良好;预测基因组有22.57%的重复序列,有426个tRNAs、56个rRNAs、260个miRNAs和308个snRNAs;共预测得到蛋白编码基因17338个,其中96.00%的基因在数据库中得到了功能注释;组装获得汶上芦花鸡Z染色体长度约88.23 Mb,预测并注释到蛋白编码基因742个,这些基因显著富集于氨基酸、脂肪等代谢相关通路,在汶上芦花鸡Z染色体上准确定位了TYRP 1、CDKN 2 A、SLC 45 A 2等羽色相关基因。【结论】研究获得了汶上芦花鸡高质量染色体水平基因组,丰富了家鸡基因组遗传信息,准确定位了Z染色体上一些羽色相关基因。研究结果可为从全基因组水平挖掘汶上芦花鸡优异性状调控机制奠定基础。 展开更多
关键词 汶上芦花鸡 基因组组装 PacBio三代测序技术 基因组注释 Z染色体 伴性芦花羽
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白光诱导大鼠视网膜病变模型的条件探索
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作者 周成浩 陈文培 +4 位作者 覃莫涵 陈迪新 郭秋平 林宝琴 桑传兰 《实验动物科学》 2023年第2期35-41,共7页
目的建立稳定的光诱导大鼠视网膜病变模型。方法SD大鼠在夜间和白昼接受相同时程光照损伤、不同性别大鼠同一时间接受相同时程光照损伤、大鼠散瞳后接受光照损伤,通过检测闪光视网膜电图(FERG)评估视网膜功能。大鼠分别接受4、8、12、16... 目的建立稳定的光诱导大鼠视网膜病变模型。方法SD大鼠在夜间和白昼接受相同时程光照损伤、不同性别大鼠同一时间接受相同时程光照损伤、大鼠散瞳后接受光照损伤,通过检测闪光视网膜电图(FERG)评估视网膜功能。大鼠分别接受4、8、12、16、20和24 h光照损伤后,分别于7、14和21 d后,进行FERG检测和视网膜组织病理学检查。结果昼间光照6 h对大鼠视网膜功能没有明显损伤,但是夜间光照6 h可以使大鼠视网膜功能显著下降。光照损伤后,雄性和雌性大鼠视网膜功能无明显差异,散瞳组和不散瞳组大鼠视网膜功能无明显差异。光照结束后14和21 d,光照8~20 h的大鼠视网膜功能损伤30%~50%,视网膜外核层厚度减少约40%;而光照24 h的大鼠视网膜功能几乎完全丧失,内核层和外核层细胞明显丢失,外核层厚度减少约80%。结论建立白光诱导大鼠视网膜损伤模型用于评价药物对视网膜功能和组织结构的作用。 展开更多
关键词 光照时程 视网膜病变 闪光视网膜电图 外核层 SD大鼠
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芦花鸡H系开产性状的遗传参数和育种值估计
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作者 薛倩 李国辉 +7 位作者 殷建玫 周成浩 郭军 张会永 蒋一秀 朱云芬 邢伟杰 韩威 《中国家禽》 北大核心 2023年第9期20-24,共5页
试验旨在进行芦花鸡H系开产性状遗传参数和育种值估计,为芦花鸡H系选育提供依据。收集芦花鸡H系2016—2020年系谱信息和开产性状表型数据,利用DMU软件以平均信息约束最大似然法(AIREML)剖分表型方差,以单性状动物模型分析各性状遗传力,... 试验旨在进行芦花鸡H系开产性状遗传参数和育种值估计,为芦花鸡H系选育提供依据。收集芦花鸡H系2016—2020年系谱信息和开产性状表型数据,利用DMU软件以平均信息约束最大似然法(AIREML)剖分表型方差,以单性状动物模型分析各性状遗传力,以多性状动物模型分析性状间的遗传相关系数和表型相关系数,并基于系谱-加性效应模型(PBLUP_A)对所有个体开产性状进行育种值估计,计算遗传进展。结果显示:芦花鸡H系开产日龄、开产体重和开产蛋重遗传力分别为0.42、0.40和0.27,开产日龄与开产体重、开产蛋重间的遗传相关分别为0.17、0.31,表型相关分别为0.11、0.18,开产体重和开产蛋重间遗传相关和表型相关系数分别为0.56和0.38;开产日龄、开产体重和开产蛋重年遗传进展分别为-0.014 d、1.14 g、0.018 g。结果表明:芦花鸡H系各开产性状均为中等遗传力性状,开产蛋重与开产日龄呈中等遗传正相关,与开产体重呈高遗传正相关,开产日龄与开产体重遗传相关较低,经过5个世代的选育,芦花鸡H系开产性状有了一定的遗传进展。对芦花鸡H系开产性状遗传参数和育种值的确定与分析研究结果,为芦花鸡H系选育制定适宜的综合选择指数、选育方案以及加快选育进程提供科学依据。 展开更多
关键词 芦花鸡H系 开产性状 遗传参数 育种值 遗传进展
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大鼠被动皮肤过敏反应实验条件的优化 被引量:11
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作者 陈文培 张子扬 +4 位作者 周成浩 刘涵 胥彤 郭宇琳 林宝琴 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期747-753,共7页
目的通过卵白蛋白(OVA)致敏大鼠优化被动皮肤过敏反应(PCA)的实验条件。方法 1-2月龄SD大鼠ip给予OVA(每只0.2,1.0和5.0 mg)与弗氏完全佐剂的混合乳液,隔日1次,共3次,进行致敏。分别于末次致敏后1,3,5,7,10,12,14,16和18 d用ELIS... 目的通过卵白蛋白(OVA)致敏大鼠优化被动皮肤过敏反应(PCA)的实验条件。方法 1-2月龄SD大鼠ip给予OVA(每只0.2,1.0和5.0 mg)与弗氏完全佐剂的混合乳液,隔日1次,共3次,进行致敏。分别于末次致敏后1,3,5,7,10,12,14,16和18 d用ELISA检测血清总Ig E(T-Ig E)水平和OVA特异性Ig E(OVA-s Ig E)水平。大鼠致敏后12-16 d制备致敏血清。大鼠皮内注射致敏血清被动皮肤致敏后,于0.5,1.5,3,6,12,24,36,48和60 h后iv给予同等剂量OVA和伊文思蓝激发,于激发后10,30和60 min测量大鼠皮肤蓝斑直径。结果 OVA致敏大鼠血清T-Ig E和OVA-s Ig E水平分别于末次致敏后3-7 d和12-16 d达高峰;在OVA 0.2-5.0 mg剂量范围内,OVA-s Ig E与T-Ig E水平无明显关联性;OVA 1.0和5.0 mg致敏大鼠血清能诱发大鼠PCA;皮内注射致敏血清0.5-3 h后激发的皮肤蓝斑形态规则,范围最大;激发后30-60 min检测的皮肤蓝斑范围大,界线清晰,形状规则,且着色较深。结论 PCA优化条件为1-2月龄大鼠隔日每只ip给予OVA 1.0-5.0 mg,共致敏3次,致敏后12-16 d制备致敏血清。在被动皮肤致敏0.5-3 h后,进行激发,30-60 min后检测皮肤内层蓝斑直径。 展开更多
关键词 卵白蛋白 Ⅰ型过敏反应 IGE 被动皮肤过敏反应 大鼠
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水蛭提取物结肠迟释微丸与普通微丸的抗血栓作用比较 被引量:10
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作者 周成浩 陈文培 +4 位作者 张子扬 姚小兰 林俊粒 关世侠 林宝琴 《中药新药与临床药理》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期568-572,共5页
目的比较水蛭提取物结肠迟释微丸(colon delayed-release pellets,CDP)和水蛭提取物普通微丸(regular pellets,RP)的抗凝血和抗血栓形成作用。方法采用毛细管法检测新西兰兔凝血时间,考察CDP和RP对大鼠动-静脉旁路血栓、狭窄法诱导的下... 目的比较水蛭提取物结肠迟释微丸(colon delayed-release pellets,CDP)和水蛭提取物普通微丸(regular pellets,RP)的抗凝血和抗血栓形成作用。方法采用毛细管法检测新西兰兔凝血时间,考察CDP和RP对大鼠动-静脉旁路血栓、狭窄法诱导的下腔静脉血栓和三氯化铁(FeCl_3)诱导颈动脉血栓形成的作用。凝血时间测定实验为单次给药,设3个组:正常组,CDP组(64 mg·kg^(-1)·d^(-1))和RP组(43.7 mg·kg^(-1)·d^(-1));动-静脉旁路血栓实验为单次给药,设6个组:模型组,CDP低、高剂量组(87,174 mg·kg^(-1)·d^(-1)),RP低、高剂量组(59.4,118.8mg·kg^(-1)·d^(-1)),阿司匹林组(7.8 mg·kg^(-1)·d^(-1));狭窄法诱导大鼠下腔静脉血栓实验设8组:假手术组,模型组,CDP低、高剂量组,RP低、高剂量组,阳性药华法林组(2.0 mg·kg^(-1)·d^(-1))和活血通脉胶囊组(312.5 mg·kg^(-1)·d^(-1)),每天给药1次,连续给药7 d;FeCl_3诱导颈动脉血栓实验为单次给药,设8组:假手术组,模型组,CDP低、高剂量组,RP低、高剂量组,阳性药氯吡格雷组(30 mg·kg^(-1)·d^(-1))和活血通脉胶囊组。称量动-静脉旁路血栓湿重和干重以及静脉血栓质量和长度,计算血栓形成抑制率;对动脉血栓进行半定量病理学分析,计算血栓形成百分比和血栓形成抑制率。结果与正常组比较,CDP组和RP组分别在给药后4 h和0.5 h显著延长新西兰兔凝血时间(P<0.05),抗凝作用分别维持4 h和1 h。CDP组和RP组能剂量依赖性抑制大鼠动-静脉旁路血栓和下腔静脉血栓形成,抑制动脉血栓形成,与模型组比较,差异有统计学意义(P<0.01)。此外,在抑制大鼠动-静脉旁路血栓和下腔静脉血栓作用上,CDP强于RP。结论 CDP抗血栓形成作用显著优于RP,且CDP抗静脉血栓的作用比抗动脉血栓明显。 展开更多
关键词 宽体金线蛭 结肠迟释微丸 凝血时间 动-静脉旁路血栓 下腔静脉血栓 动脉血栓
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五个地方鸡种蛋品质的比较研究 被引量:7
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作者 郝子悦 张琴 +4 位作者 周成浩 张会永 殷建玫 薛倩 李国辉 《中国家禽》 北大核心 2021年第12期120-124,共5页
为探讨藏鸡、茶花鸡、北京油鸡、狼山鸡和汶上芦花鸡5个地方鸡种的蛋品质差异,挖掘地方鸡种蛋用性能,研究对5个地方鸡种的蛋品质性状进行方差分析及相关性分析。结果显示:汶上芦花鸡的平均蛋重显著高于藏鸡和茶花鸡(P≤0.05);藏鸡和茶... 为探讨藏鸡、茶花鸡、北京油鸡、狼山鸡和汶上芦花鸡5个地方鸡种的蛋品质差异,挖掘地方鸡种蛋用性能,研究对5个地方鸡种的蛋品质性状进行方差分析及相关性分析。结果显示:汶上芦花鸡的平均蛋重显著高于藏鸡和茶花鸡(P≤0.05);藏鸡和茶花鸡的蛋壳色泽显著浅于狼山鸡(P≤0.05),藏鸡的蛋壳强度显著高于狼山鸡(P≤0.05);汶上芦花鸡的蛋白高度显著高于藏鸡(P≤0.05);5个品种的蛋黄色泽、蛋形指数、蛋黄比率和哈氏单位之间没有显著性差异(P>0.05)。5个品种的蛋壳强度和蛋壳厚度呈极显著正相关(P≤0.01),汶上芦花鸡的蛋重和蛋黄色泽呈极显著性正相关(P≤0.01),藏鸡的蛋重和蛋黄比率呈极显著性负相关(P≤0.01)。此外,5个品种蛋品质性状的平均变异系数都超过12%,证明保种群体内的遗传变异较大,群体近交程度较低,遗传多样性丰富。研究结果表明蛋品质性状在不同品种间存在显著差异且地方品种在蛋品质性状上具有优异的潜在性能,为地方鸡种资源的保护及开发利用提供基础数据参考。 展开更多
关键词 地方品种 蛋品质 蛋重 蛋壳强度
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基于简化基因组测序的天津猴鸡遗传进化研究 被引量:3
13
作者 夏树立 周成浩 +6 位作者 赵向华 于海涛 张会永 殷建玫 薛倩 韩威 李国辉 《中国家禽》 北大核心 2022年第7期1-5,共5页
为从基因组水平探究天津猴鸡群体遗传进化过程中的选择信号,补充完善地方鸡种选择信号图谱,发掘天津猴鸡的重要种质特性基因,试验根据纬度分布、遗传关系等条件筛选包括天津猴鸡群体在内的20个地方鸡种及2个引进鸡品种作为研究对象,利... 为从基因组水平探究天津猴鸡群体遗传进化过程中的选择信号,补充完善地方鸡种选择信号图谱,发掘天津猴鸡的重要种质特性基因,试验根据纬度分布、遗传关系等条件筛选包括天津猴鸡群体在内的20个地方鸡种及2个引进鸡品种作为研究对象,利用简化基因组测序技术开展基因组测序,分析比较天津猴鸡群体与其他鸡种群体的遗传差异,并对进化过程中受到选择的基因进行基因功能注释。结果显示:在天津猴鸡群体中检测出265869个SNP标记;遗传结构上天津猴鸡群体与狼山鸡等聚为一类,亲缘关系较近;受选择基因主要参与氨基酸生物合成、细胞内信号转导以及神经系统发育等通路或生物学过程;检测到6个与种质特性相关的受选择基因,与神经系统发育、激素调节和抗热应激等生理功能紧密相关。研究结果部分揭示了天津猴鸡的裸颈性状形成和抗热应激特性,为天津猴鸡的保护和种质特性评价提供重要理论依据。 展开更多
关键词 天津猴鸡 裸颈性状 遗传多样性 选择信号
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基于RAD-Seq技术的大围山微型鸡遗传进化分析 被引量:1
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作者 张会永 李国辉 +5 位作者 薛倩 周成浩 殷建玫 苏一军 夏树立 韩威 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第4期1393-1401,共9页
【目的】在分子水平上探讨大围山微型鸡的遗传进化。【方法】以大围山微型鸡与其他18个地方鸡品种及2个国外引进品种为研究对象,每个品种选取公鸡10只,母鸡20只,采血,提取全基因组DNA,进行简化基因组测序(RAD-Seq),鉴定21个品种基因组S... 【目的】在分子水平上探讨大围山微型鸡的遗传进化。【方法】以大围山微型鸡与其他18个地方鸡品种及2个国外引进品种为研究对象,每个品种选取公鸡10只,母鸡20只,采血,提取全基因组DNA,进行简化基因组测序(RAD-Seq),鉴定21个品种基因组SNP,计算大围山微型鸡遗传统计量,分析遗传多样性和遗传结构、筛选受选择基因并进行功能富集分析。【结果】在大围山微型鸡群体中鉴定出331892个SNPs。大围山微型鸡的平均杂合度(Ho)为0.219、核苷酸多样度(Pi)为0.245,近交系数(Fis)为0.107,与其他18个地方鸡种相比遗传多样性呈中度多态。聚类分析发现,大围山微型鸡与瓢鸡、茶花鸡和藏鸡聚为一类,亲缘关系较近,且与瓢鸡的群体分化指数(Fst)最低(0.0929),亲缘关系最近,与河南斗鸡的Fst最高(0.2179),亲缘关系最远。共筛选出200个受选择基因。GO分析结果显示,这些受选择基因主要富集在运动、刺激应答、信号传导等生物学过程;KEGG分析结果表明,这些受选择基因主要富集在代谢、肌动蛋白细胞骨架的调节、MAPK等信号通路。【结论】大围山微型鸡遗传多样性呈中度多态,与瓢鸡亲缘关系最近,本研究筛选出了200个受到选择的基因,这些基因在代谢、信号传导、颅骨发育等多个方面发挥作用。 展开更多
关键词 大围山微型鸡 简化基因组测序(RAD-Seq) 遗传进化
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基于RAD-seq静原鸡保种群体的遗传变异分析 被引量:6
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作者 马丽霞 曹国伟 +6 位作者 朱红芳 邓占钊 蔡正云 周成浩 韩威 顾亚玲 张娟 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期2104-2117,共14页
旨在分析静原鸡白羽、麻羽、黑羽保种群之间的遗传变异,挖掘调控特征性状的关键候选基因。本研究利用RAD-seq技术对180日龄特征明显、发育正常且健康的白羽、麻羽、黑羽静原鸡(每个羽色选取60个个体,40只母鸡,20只公鸡)进行测序,基于SN... 旨在分析静原鸡白羽、麻羽、黑羽保种群之间的遗传变异,挖掘调控特征性状的关键候选基因。本研究利用RAD-seq技术对180日龄特征明显、发育正常且健康的白羽、麻羽、黑羽静原鸡(每个羽色选取60个个体,40只母鸡,20只公鸡)进行测序,基于SNP标记计算观察杂合度(Ho)、群体内核酸多态性(Pi)、群体的平均近交系数(Fis)等指标,分析静原鸡3个类群的遗传多样性和群体结构,并通过选择性清除分析和全基因组关联分析(GWAS)筛选出候选基因,利用KOBAS对候选基因进行KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路富集,最终筛选出调控静原鸡羽色的候选基因。测序结果表明,静原鸡180个样品共产生198.83 Gb Clean Data,Q30达到93%以上。遗传多样性分析表明,白羽、麻羽、黑羽静原鸡分别鉴定出238533、233562和240820个SNPs标记,Ho、Pi和Fis分别在0.2732~0.2782、0.3049~0.3096和0.0961~0.1098之间。群体结构分析表明,静原鸡根据不同羽色分为不同类群。通过选择性清除分析和全基因组关联分析共筛选出11个(FZD4、WNT16、EDNRB、TYR、KRAS、CTNNB1、DDC、MC1R、CAMK2A、PRKCB、PRKCA)与静原鸡羽色相关的候选基因,富集结果显示这些基因主要与黑色素生成、酪氨酸代谢和Wnt信号传导等通路相关。综上所述,本研究利用SNPs标记信息可以全面地评价静原鸡的保种现状,为静原鸡的遗传资源保护奠定理论基础。同时,筛选出了与静原鸡羽色性状相关的候选基因,为静原鸡不同羽色的品系化培育提供新的遗传标记和基因靶点。 展开更多
关键词 静原鸡 RAD-seq 遗传多样性分析 选择性清除分析 全基因组关联分析
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鸡繁殖性能近交衰退相关CpG岛差异甲基化基因的筛选 被引量:3
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作者 薛倩 李国辉 +7 位作者 殷建玫 张会永 周成浩 朱云芬 邢伟杰 苏一军 邹剑敏 韩威 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期943-953,共11页
鸡繁殖性能近交衰退是地方鸡遗传资源活体保种过程中面临的重要问题之一,本研究旨在探讨全基因组CpG岛(CpG island, CGI)区DNA甲基化在鸡繁殖性能近交衰退中的作用。分别从狼山鸡高近交组和低近交组中各选取健康母鸡3只,即试验分2个组,... 鸡繁殖性能近交衰退是地方鸡遗传资源活体保种过程中面临的重要问题之一,本研究旨在探讨全基因组CpG岛(CpG island, CGI)区DNA甲基化在鸡繁殖性能近交衰退中的作用。分别从狼山鸡高近交组和低近交组中各选取健康母鸡3只,即试验分2个组,每组3个重复,然后采用全基因组重亚硫酸盐测序(WGBS)技术,检测分析两组个体性腺轴组织(包括卵巢和下丘脑)全基因组DNA甲基化差异,筛选差异甲基化区域(DMRs),并对CpG岛区差异甲基化基因进行功能注释和富集分析。结果表明,狼山鸡高近交组和低近交组比较,其卵巢和下丘脑基因组整体甲基化水平均不存在显著差异(P>0.05);高、低近交组间差异甲基化区域检测发现,下丘脑和卵巢中分别检测到5 948和4 593个差异甲基化区域,其中1 798和995个差异甲基化区域位于基因组CpG岛区,分别注释到1 020和552个基因;下丘脑中,这些CpG岛区差异甲基化基因显著富集在信号转导、神经系统发育、生殖系统发育和卵母细胞成熟调控等繁殖相关的GO条目,以及转化生长因子β信号通路、乙型肝炎、脂肪酸代谢、胰岛素信号通路等19条KEGG信号通路(P<0.05);卵巢中,CpG岛区差异甲基化基因显著富集于12条信号通路(P<0.05),包括慢性骨髓白血病、流感A、精氨酸和脯氨酸代谢、粘着连接等,一些与卵子发育和性激素分泌相关的信号通路也被富集到,如黄体酮介导的卵母细胞成熟、卵母细胞减数分裂、GnRH信号通路、雌激素信号通路等,其中包含CDC27、ADCY8、AKT3等10个差异甲基化基因。因此,本研究在狼山鸡高、低近交组间检测到了大量差异甲基化区域,并发现大量差异甲基化基因与繁殖性状相关,推测这些基因CpG岛区DNA甲基化可能在狼山鸡繁殖性能近交衰退调控中发挥重要作用,研究结果为进一步深入探索鸡繁殖性能近交衰退调控机制奠定了基础,为物种资源保护和家禽育种工作提供了理论参考依据。 展开更多
关键词 狼山鸡 DNA甲基化 繁殖性能 近交衰退 差异甲基化区域
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鸡繁殖性状近交衰退相关lncRNA的筛选 被引量:1
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作者 薛倩 李国辉 +7 位作者 邢伟杰 周成浩 张会永 殷建玫 朱云芬 曹愉夏 苏一军 韩威 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第6期2176-2185,共10页
【目的】筛选与鸡繁殖性状近交衰退相关的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),为深入探究lncRNA对鸡繁殖性能近交衰退调控机制提供参考。【方法】以狼山鸡高、低近交群体为试验素材,通过转录组测序技术分析狼山鸡下丘脑和卵巢中... 【目的】筛选与鸡繁殖性状近交衰退相关的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),为深入探究lncRNA对鸡繁殖性能近交衰退调控机制提供参考。【方法】以狼山鸡高、低近交群体为试验素材,通过转录组测序技术分析狼山鸡下丘脑和卵巢中lncRNA表达情况,筛选高、低近交组间差异表达lncRNA,并对其进行顺式调控靶基因预测及功能分析。【结果】狼山鸡下丘脑和卵巢中共鉴定出4222个lncRNAs,高、低近交组间比较发现,下丘脑中差异表达lncRNAs 35个,卵巢中差异表达lncRNAs 215个。下丘脑中差异lncRNAs中预测到顺式调控靶基因98个,这些靶基因显著富集于出生或孵化时胚胎发育终止、胚胎心导管发育、视黄酸应答等繁殖相关生物过程(P<0.05),涉及lncRNA MSTRG.9196.4、MSTRG.9195.2、MSTRG.6254.2以及相应靶基因DNAAF2和FKBP1B等胚胎发育相关基因;卵巢中差异lncRNAs预测到顺式调控靶基因414个,这些靶基因富集到卵母细胞减数分裂、MAPK、叶酸合成等信号通路,包括MSTRG.7683.1、MSTRG.13604.4、MSTRG.16570.1、MSTRG.8330.5、MSTRG.8330.4等神经内分泌调节及配子生成相关的lncRNAs。【结论】本研究在下丘脑和卵巢中筛选到了一系列鸡胚胎发育及配子生成调控相关差异lncRNAs,这些lncRNAs可作为鸡繁殖性能近交衰退候选lncRNAs,为进一步揭示鸡繁殖性能近交衰退调控机制提供线索。 展开更多
关键词 繁殖性状 近交衰退 差异表达 长链非编码RNA(lncRNA) 靶基因
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狼山鸡下丘脑和卵巢组织全基因组DNA甲基化分析
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作者 薛倩 李国辉 +7 位作者 张会永 殷建玫 周成浩 朱云芬 邢伟杰 苏一军 邹剑敏 韩威 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2021年第2期417-424,共8页
为了获得狼山鸡性腺轴组织基因组DNA甲基化水平和模式等表观遗传信息,试验采用全基因组重亚硫酸盐测序(whole genome bisulfite sequencing,WGBS)技术检测狼山鸡下丘脑和卵巢组织基因组DNA甲基化状态,分析两组织DNA甲基化水平及特异甲... 为了获得狼山鸡性腺轴组织基因组DNA甲基化水平和模式等表观遗传信息,试验采用全基因组重亚硫酸盐测序(whole genome bisulfite sequencing,WGBS)技术检测狼山鸡下丘脑和卵巢组织基因组DNA甲基化状态,分析两组织DNA甲基化水平及特异甲基化模式。结果表明,狼山鸡下丘脑和卵巢基因组整体甲基化水平分别为4.35%和3.48%,差异显著(P<0.05);下丘脑和卵巢中分别检测到6150000和10320000个甲基化胞嘧啶(mC)位点,其中mCG类型位点分别占69.99%和87.88%,下丘脑中非mCG位点占比约为卵巢中的2.5倍;与各染色体不同,两组织线粒体基因组中mCHH位点占比最高,其次是mCHG位点;卵巢基因组启动子区DNA甲基化水平极显著低于内含子和外显子区(P<0.01),极显著高于基因间区(P<0.01);下丘脑基因组启动子区DNA甲基化水平与内含子和外显子区相比差异不显著(P>0.05),却显著高于基因间区(P<0.05);下丘脑基因组各功能元件DNA甲基化水平均显著或极显著高于卵巢基因组(P<0.05;P<0.01)。综上,狼山鸡下丘脑和卵巢组织具有不同的DNA甲基化模式和特征,下丘脑中较高的非mCG位点比例可能在中枢神经系统发育中发挥重要作用,本研究结果为进一步分析鸡卵巢和下丘脑基因组DNA甲基化对其繁殖性能调控机制提供参考依据。 展开更多
关键词 狼山鸡 DNA甲基化 甲基化模式 卵巢 下丘脑
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静脉滴注青霉素引起静脉炎1例报道
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作者 姜美丽 唐振英 +1 位作者 孔燕 周成浩 《医学综述》 2007年第23期1916-1916,共1页
1临床资料 患者:男,61岁,右桡骨骨折术后,由于经济原因,仅住院5d,即要求带药出院回家去卫生室输液治疗,出院带药用法是0、9%的生理盐水250mL加入青霉素G钠盐640万U,静脉滴注,每日2次。村医给患者输液时总是在健侧上肢的一条... 1临床资料 患者:男,61岁,右桡骨骨折术后,由于经济原因,仅住院5d,即要求带药出院回家去卫生室输液治疗,出院带药用法是0、9%的生理盐水250mL加入青霉素G钠盐640万U,静脉滴注,每日2次。村医给患者输液时总是在健侧上肢的一条血管并且在一个针眼处反复输液, 展开更多
关键词 青霉素G钠盐 静脉滴注 静脉炎 输液治疗 临床资料 骨折术后 经济原因 生理盐水
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活血化痰复遂胶囊治疗中风后遗症120例
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作者 孙艺勇 张良 周成浩 《陕西中医》 2009年第6期673-674,共2页
目的:观察活血化痰类中药配伍组方治疗中风病恢复期的临床疗效。方法:治疗组采用自拟活血化痰复遂胶囊(桑枝、红花、鸡血藤、桃仁、皂刺、赤芍、钩藤等)口服,对照组采用曲克芦丁治疗。结果:治疗组总有效率88.5%,高于对照组76.1%。结论:... 目的:观察活血化痰类中药配伍组方治疗中风病恢复期的临床疗效。方法:治疗组采用自拟活血化痰复遂胶囊(桑枝、红花、鸡血藤、桃仁、皂刺、赤芍、钩藤等)口服,对照组采用曲克芦丁治疗。结果:治疗组总有效率88.5%,高于对照组76.1%。结论:活血化痰复遂胶囊治疗中风病恢复期疗效满意。 展开更多
关键词 中风后遗症/中医药疗法 活血祛瘀剂/治疗应用 祛痰剂(中药)/治疗应用 @活血化痰复遂胶囊
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