本研究旨在探索新疆褐牛产奶性状相关候选基因多态性与泌乳性状及体细胞评分(SCS)的相关性,探究新疆褐牛多态性位点的群体遗传特征。基于课题组前期DNA混池重测序的结果筛选17个SNPs突变信息,并采用基质辅助激光电离解吸飞行时间质谱法(...本研究旨在探索新疆褐牛产奶性状相关候选基因多态性与泌乳性状及体细胞评分(SCS)的相关性,探究新疆褐牛多态性位点的群体遗传特征。基于课题组前期DNA混池重测序的结果筛选17个SNPs突变信息,并采用基质辅助激光电离解吸飞行时间质谱法(Sequenom Mass Array Genotype)分型技术验证FASN、FSHR、HAL、GPIHBP1、NIBPL、C9、PDE9A、PTK2、STAT1、ZNF66、ZNF567、ZNF7、ZNF623和ZNF804A基因在新疆乌鲁木齐种牛场、新疆天山畜牧生物工程股份有限公司和新疆塔城地区种牛场共计262头新疆褐牛母牛群体中的遗传多态性,运用SAS 8.1软件GLM过程分析这14个基因多个SNP位点对新疆褐牛群体的遗传效应及其与305天产奶量、乳脂率、乳蛋白率、乳糖率、总固体和SCS的关联性。结果表明,17个SNPs均处于哈代-温伯格平衡状态(P>0.05),9个SNPs与新疆褐牛1个或多个泌乳性状达到显著(P<0.005)或极显著(P<0.001)关联,这些位点分别位于FASN、FSHR、HAL、ZNF66、ZNF7、ZNF804A、GPIHBP1和PDE9A基因上。提示这些基因可尝试作为新疆褐牛产奶性状分子标记的候选基因,为新疆褐牛产奶性状的分子标记辅助选育提供依据和参考。展开更多
文摘利用2008-2016年出生的27 444头宁夏地区荷斯坦奶牛生产性能(dairy herd improvement,DHI)数据及体型线性评分数据计算乳脂率(fat percentage,FP)、乳蛋白率(protein percentage,PP)、体细胞评分(somatic cell score,SCS)、305d产奶量(milk yield of 305days,MYD)、初产日龄(age at first calving,AFC)、产犊间隔(calving interval,CI)和体况评分(linear classification scores,LCS)的遗传参数。利用DMU v 6.0软件,采用AI-REML模块结合EM算法并配合多性状动物模型,以季节、场、年份、胎次和动物个体加性遗传效应作为模型的影响因素。计算结果表明,宁夏地区奶牛的FP、PP、SCS、MYD、AFC、CI和LCS的遗传力分别为0.14、0.19、0.19、0.31、0.37、0.10和0.07,同时得出了奶牛不同性状的育种值、遗传相关和奶牛生产性能指数2(China performance index 2,CPI2)值。本研究通过对宁夏地区奶牛DHI数据的深挖和遗传评估,准确地把握了宁夏奶牛群体结构特征,对于奶牛的选种选配、育种规划和选择指数的构建有重要意义。
文摘本研究旨在探索新疆褐牛产奶性状相关候选基因多态性与泌乳性状及体细胞评分(SCS)的相关性,探究新疆褐牛多态性位点的群体遗传特征。基于课题组前期DNA混池重测序的结果筛选17个SNPs突变信息,并采用基质辅助激光电离解吸飞行时间质谱法(Sequenom Mass Array Genotype)分型技术验证FASN、FSHR、HAL、GPIHBP1、NIBPL、C9、PDE9A、PTK2、STAT1、ZNF66、ZNF567、ZNF7、ZNF623和ZNF804A基因在新疆乌鲁木齐种牛场、新疆天山畜牧生物工程股份有限公司和新疆塔城地区种牛场共计262头新疆褐牛母牛群体中的遗传多态性,运用SAS 8.1软件GLM过程分析这14个基因多个SNP位点对新疆褐牛群体的遗传效应及其与305天产奶量、乳脂率、乳蛋白率、乳糖率、总固体和SCS的关联性。结果表明,17个SNPs均处于哈代-温伯格平衡状态(P>0.05),9个SNPs与新疆褐牛1个或多个泌乳性状达到显著(P<0.005)或极显著(P<0.001)关联,这些位点分别位于FASN、FSHR、HAL、ZNF66、ZNF7、ZNF804A、GPIHBP1和PDE9A基因上。提示这些基因可尝试作为新疆褐牛产奶性状分子标记的候选基因,为新疆褐牛产奶性状的分子标记辅助选育提供依据和参考。