为进一步丰富番鸭羽色性状遗传机制的研究,运用Illumina高通量测序技术对不同性别的黑羽及白羽番鸭皮肤组织进行转录组测序,经GO富集分析和KEGG通路注释对差异表达基因功能进行解析,利用qRT-PCR对部分RNA-Seq数据进行验证。结果显示,公...为进一步丰富番鸭羽色性状遗传机制的研究,运用Illumina高通量测序技术对不同性别的黑羽及白羽番鸭皮肤组织进行转录组测序,经GO富集分析和KEGG通路注释对差异表达基因功能进行解析,利用qRT-PCR对部分RNA-Seq数据进行验证。结果显示,公黑羽番鸭皮肤(HFPF.G)vs母黑羽番鸭皮肤(HFPF.M)获得差异基因2 131个,公白羽番鸭皮肤(BFPF.G)vs母白羽番鸭皮肤(BFPF.M)获得差异基因780个,黑羽番鸭皮肤(HFPF)vs白羽番鸭皮肤(BFPF)获得差异基因684个,通过上述三组韦恩分析,以黑、白羽番鸭皮肤对比组(HFPF vs BFPF)504个差异基因为番鸭羽色候选基因,进一步筛选获得番鸭羽色性状相关前10个差异表达,其溶质转运蛋白(Solute carrier,SLC)家族成员SLC7A11和SLC25A4可能对番鸭黑、白羽色性状遗传起重要调控作用。同时发现细胞色素P450对外源物质的代谢作用信号通路、谷胱甘肽代谢信号通路、cAMP信号通路等可能参与番鸭黑白羽色性状遗传的调控过程。研究表明,SLC7A11和SLC25A4可用于黑羽番鸭的羽毛分子辅助选育。展开更多
文摘为进一步丰富番鸭羽色性状遗传机制的研究,运用Illumina高通量测序技术对不同性别的黑羽及白羽番鸭皮肤组织进行转录组测序,经GO富集分析和KEGG通路注释对差异表达基因功能进行解析,利用qRT-PCR对部分RNA-Seq数据进行验证。结果显示,公黑羽番鸭皮肤(HFPF.G)vs母黑羽番鸭皮肤(HFPF.M)获得差异基因2 131个,公白羽番鸭皮肤(BFPF.G)vs母白羽番鸭皮肤(BFPF.M)获得差异基因780个,黑羽番鸭皮肤(HFPF)vs白羽番鸭皮肤(BFPF)获得差异基因684个,通过上述三组韦恩分析,以黑、白羽番鸭皮肤对比组(HFPF vs BFPF)504个差异基因为番鸭羽色候选基因,进一步筛选获得番鸭羽色性状相关前10个差异表达,其溶质转运蛋白(Solute carrier,SLC)家族成员SLC7A11和SLC25A4可能对番鸭黑、白羽色性状遗传起重要调控作用。同时发现细胞色素P450对外源物质的代谢作用信号通路、谷胱甘肽代谢信号通路、cAMP信号通路等可能参与番鸭黑白羽色性状遗传的调控过程。研究表明,SLC7A11和SLC25A4可用于黑羽番鸭的羽毛分子辅助选育。