基于全基因组重测序研究文昌鸡产蛋性能的影响因素

旨在通过研究文昌鸡进化过程的特征,深入理解影响产蛋性能的因素,为文昌鸡优良品种选育提供基础。本研究采集35只健康文昌鸡(35周龄,15公,20母)和30只健康江汉鸡(35周龄,10公,20母)的血液组织各3 mL提取DNA,采用全基因组重测序方法建库测序。首先,对于原始测序数据用trimmomatic软件过滤,获得高质量序列比对到鸡的参考基因组,GATK软件提取变异位点SNPs,设置参数质控去除低质量、假阳性变异位点,进一步采用snpEff对过滤的SNPs进行基因结构和功能注释。然后,比较文昌鸡和江汉鸡的群体结构差异,分别设置评估群体差异参数Fst、ROD、Tajima′s D的阈值,筛选受到选择的区域,并对这些区域的基因进行功能富集。结果表明:1)文昌鸡测序获得1.05 Tb clean data,平均每个样本大约29.97 Gb,测序深度大约28×;江汉鸡测序获得1.10 Tb clean data,每个样本大约36.72 Gb,测序深度大约35×;平均比对率>98%。2)两个群体基因结构注释总数均是内含子>基因间区>上下游调控区>编码区;系统进化树和主成分分析显示文昌鸡和江汉鸡亲缘关系较远;文昌鸡的连锁不平衡程度低于江汉鸡。3)与产蛋性能相关基因的功能富集结果主要包括3种必须氨基酸(缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸)代谢途径、钙离子沉积、金属肽酶抗氧化、肾上腺素和催乳素受体活性等功能,而且这些通路的基因都位于受到强烈选择的区域。综上所述,影响文昌鸡产蛋性能的因素主要包括必须氨基酸代谢、矿物质沉积和抗氧化、性腺激素分泌,这3个因素在进化过程中都受到强烈选择,对产蛋性能发挥重要调控作用。从进化分子遗传学角度研究鸡的产蛋机理,不但能够促进理解文昌鸡产蛋性能的进化特征,而且有助于加速高产蛋鸡品种或品系的培育。

巴戟天多糖对文昌鸡生长性能、血清免疫和抗氧化指标及免疫器官发育的影响

【目的】本试验通过研究饲粮中添加巴戟天多糖(Morinda officinalis polysaccharide,MOP)对文昌鸡生长性能、血清免疫和抗氧化指标及免疫器官发育的影响,旨在为MOP在肉鸡生产中得到深入应用提供参考依据。【方法】选取6日龄体重相近、健康的雌性文昌鸡600只,随机分为5组,每组8个重复,每个重复15只鸡,对照组鸡饲喂基础饲粮,试验组鸡分别在基础饲粮中添加250、500、1000和2000 mg/kg的MOP,试验期40 d。在试验第1、40天分别称重,试验期间以重复为单位记录采食量和剩料量,计算平均日增重(ADG)、平均日采食量(ADFI)和料重比(F/G);在试验第40天每重复选取1只试验鸡采血,屠宰后采集胸腺、脾脏、法氏囊并称重,测定血清生化指标、抗氧化指标和免疫指标,并测定免疫器官指数。【结果】与对照组相比,①饲粮中添加不同水平的MOP对文昌鸡的终末体重、ADG和ADFI无显著影响(P>0.05),但250 mg/kg MOP组的F/G显著提高(P<0.05),其余试验组F/G无显著变化(P>0.05)。②250 mg/kg MOP组文昌鸡血清免疫球蛋白G(IgG)含量、500 mg/kg MOP组血清IgM含量均显著提高(P<0.05);500和1000 mg/kg MOP组血清丙二醛(MDA)含量显著降低(P<0.05);2000 mg/kg MOP组血清谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)活性显著提高(P<0.05)。③500、1000和2000 mg/kg MOP组文昌鸡法氏囊指数均显著提高(P<0.05)。【结论】饲粮中添加250及500 mg/kg MOP可提高文昌鸡血清免疫球蛋白含量,添加500、1000和2000 mg/kg MOP可改善文昌鸡血清抗氧化指标,促进免疫器官法氏囊的生长发育。本试验中,MOP添加量以500 mg/kg为宜。

巴戟天多糖对文昌鸡肠道形态、肠道免疫屏障功能和盲肠微生物的影响

试验旨在研究饲粮中添加巴戟天多糖(Morinda officinalis polysaccharide,MOP)对文昌鸡肠道形态、肠道免疫屏障功能和盲肠微生物的影响。选取6日龄健康雌性文昌鸡600只,随机分为5组,每组8个重复,每个重复15只鸡。对照组饲喂基础饲粮,各试验组分别在基础饲粮中添加250、500、1000、2000 mg/kg的MOP。试验期40 d。结果表明:与对照组相比,各试验组十二指肠和空肠绒毛高度/隐窝深度均显著提高(P<0.05),500、1000、2000 mg/kg MOP组回肠绒毛高度/隐窝深度显著提高(P<0.05);250、500、1000 mg/kg MOP组十二指肠紧密连接蛋白Occludin mRNA相对表达量显著提高(P<0.05),1000、2000 mg/kg MOP组十二指肠肿瘤坏死因子-α(TNF-α)mRNA相对表达量显著降低(P<0.05);250、500 mg/kg MOP组盲肠观测物种数和Ace指数显著提高(P<0.05);各试验组Shannon指数均显著上升(P<0.05);2000 mg/kg MOP组的Simpson指数显著提高(P<0.05);250、500、1000 mg/kg MOP组的Chao1指数均显著增加(P<0.05)。各试验组盲肠弯曲杆菌门相对丰度均显著降低(P<0.05),1000、2000 mg/kg MOP组文昌鸡盲肠另枝菌属相对丰度显著降低(P<0.05),有益菌副拟杆菌属相对丰度显著提高(P<0.05);2000 mg/kg MOP组链球菌相对丰度显著降低(P<0.05);250、2000 mg/kg MOP组拟杆菌属相对丰度显著降低(P<0.05),CHKCI001菌属相对丰度显著提高(P<0.05)。研究表明,在文昌鸡的饲粮中添加适量MOP可改善肠道黏膜形态,提高十二指肠紧密连接蛋白Occludin mRNA表达量,降低炎症因子TNF-αmRNA表达量,增加盲肠微生物Alpha多样性和均匀度,增加肠道有益菌含量,促进肠道健康,MOP添加量以500 mg/kg为宜。

木薯在家禽饲粮中应用的研究进展

随着我国集约化家禽养殖业的迅速发展,家禽饲料原料的需求量迅速增加。但谷物饲料的短缺及持续居高的价格使家禽饲料生产行业亟须探寻更为廉价的能量替代饲料。木薯具有产量高、富含淀粉和纤维、能值较高等特点,在家禽养殖中可替代玉米或其他能量饲料。木薯产品的有效利用已被证明可降低家禽生产中的饲料成本。但木薯的利用受许多因素的限制,如低蛋白质以及抗营养因子,使用正确的加工及科学的配方可以提高木薯在家禽饲粮中的添加水平。文章综述木薯的营养特性、饲料化利用方式及在家禽饲粮中的应用研究,为木薯在家禽饲粮中的应用提供参考。

屎肠球菌细胞外囊泡对小鼠生长性能、肠道形态和粪便菌群的影响

【目的】探究屎肠球菌细胞外囊泡(Enterococcus faecium extracellular vesicles,Efm-EV)对小鼠生长性能、免疫、肠道形态和粪便菌群的影响,为屎肠球菌作为微生物饲料添加剂在动物生产中的推广应用提供理论依据。【方法】将20只雄性C57BL/6小鼠随机分为对照组和试验组,每组10个重复,每个重复1只小鼠。试验期为5 d,试验组小鼠每隔1 d灌胃含有500 μg的 Efm-EV悬液,每只灌胃150 μL;对照组小鼠灌胃等量PBS溶液。记录小鼠每天的采食量、试验开始和结束时的体重,计算小鼠的平均日增重、平均日采食量、料重比。【结果】与PBS处理相比,Efm-EV处理小鼠的终末体重 、平均日增重、平均日采食量、料重比没有显著变化。Efm-EV处理小鼠的血清IgA和IgG水平与PBS处理小鼠相比显著下降(P<0.05),而小鼠血清IL-10水平显著提升(P<0.05),TNF-α无显著变化。与PBS处理相比,Efm-EV处理小鼠十二指肠绒隐比显著提高(P<0.05),而小鼠十二指肠绒毛高度、隐窝深度,空肠和回肠的绒毛高度、隐窝深度、绒隐比无明显变化。灌胃Efm-EV处理小鼠粪便菌群在门水平上提高了厚壁菌门(Firmicutes)的细菌数量,降低了拟杆菌门(Bacteroidetes)的细菌数量;在科水平上提高了毛螺菌科(Lachnospiraceae)的丰度,降低了Muribaculaceae科的丰度;在属水平上显著提高了小鼠瘤胃球菌科UCG009 (Ruminococcaceae UCG 009)的丰度(P<0.05)。【结论】灌胃Efm-EV能够提高小鼠机体的抗炎水平,改善小鼠十二指肠形态结构,提高瘤胃球菌科UCG009的相对丰度。

屎肠球菌对五指山断奶仔猪肠道健康及微生物群落的影响

本试验旨在研究屎肠球菌对五指山断奶仔猪肠道健康及微生物群落的影响及对断奶应激的缓解作用。试验选取初始体重为(3.79±0.24) kg的33日龄五指山未断奶仔猪18头,随机分为对照组、断奶组和屎肠球菌组,每组6头(公母各占1/2)。对照组仔猪不进行断奶处理,在33日龄时灌喂20 mL磷酸盐缓冲液(PBS),并饲喂母乳至38日龄;断奶组仔猪33日龄时灌喂20 mL PBS,35日龄断奶,并饲喂饲粮至38日龄;屎肠球菌组仔猪33日龄时灌喂20 mL屎肠球菌(灌喂量为1×109CFU/kg BW),35日龄断奶,并饲喂饲粮至38日龄。38日龄时,将所有试验猪进行屠宰,并测定其肠道形态、酶活性及微生物群落。结果表明:1)在各组初始体重一致的情况下,断奶组仔猪终末体重出现下降,而对照组和屎肠球菌组仔猪终末体重均有所提高。2)与对照组相比,断奶组仔猪十二指肠、空肠和回肠绒毛高度、绒毛宽度和绒毛表面积均极显著降低(P<0.01),十二指肠隐窝深度显著提高(P<0.05),十二指肠绒毛高度/隐窝深度(V/C)值极显著降低(P<0.01)。与断奶组相比,屎肠球菌组仔猪十二指肠、空肠和回肠绒毛高度、绒毛宽度和绒毛表面积均极显著提高(P<0.01),十二指肠隐窝深度显著降低(P<0.05),十二指肠V/C值极显著提高(P<0.01)。3)与对照组相比,断奶组仔猪十二指肠和回肠β-半乳糖苷酶活性显著降低(P<0.05),屎肠球菌组空肠和回肠α-淀粉酶活性显著或极显著提高(P<0.05或P<0.01)。与断奶组相比,屎肠球菌组仔猪十二指肠β-半乳糖苷酶活性显著提高(P<0.05)。与对照组和断奶组相比,屎肠球菌组仔猪各肠段脂肪酶活性均极显著提高(P<0.01)。4)与断奶组相比,屎肠球菌组仔猪回肠Chao1指数显著提高(P<0.05)。与对照组相比,断奶组仔猪回肠中变形菌门相对丰度明显提高,回肠中厚壁菌门相对丰度明显降低。与断奶组相比,屎肠球菌组仔猪回肠中厚壁菌门和罗姆布茨菌属相对丰度明显提高,结肠中乳杆菌属相对丰度明显提高,结肠中拟杆菌门相对丰度明显降低。综上所述,断奶前灌喂屎肠球菌菌液可通过改善五指山断奶仔猪肠道形态及菌群结构,并通过提高其肠道相关酶活性,缓解断奶对仔猪的负面影响,进而促进断奶仔猪健康生长。

海南黑山羊与其F1代杂交羊皮下脂肪转录组测序比较分析

为了研究海南黑山羊与其F1代杂交羊(努比亚山羊公羊与海南黑山羊母羊杂交)皮下脂肪组织的遗传差异,本研究采用RNA-Seq技术和生物信息学方法对2种山羊皮下脂肪组织进行转录组测序分析,运用DESeq鉴定2种山羊皮下脂肪组织间差异表达的mRNAs和lncRNAs,对差异表达的mRNAs进行GO功能、KEGG通路富集分析,同时对差异表达的lncRNAs进行靶基因预测分析。结果显示:海南黑山羊与其F1代杂交羊皮下脂肪间存在330个差异表达的mRNAs,其中4个基因在F1代杂交羊皮下脂肪中特异表达、1个基因在海南黑山羊皮下脂肪中特异表达,在330个差异表达的mRNAs中,根据差异倍数大小,排名前10位的基因分别是PLXDC1、AOC1、SHROOM3、NTS、SPATS2、LOC102181165、BDKRB2、GSDMA、ETNK2、EPOR;存在138个差异表达的lncRNAs,其中9个在F1代杂交羊皮下脂肪中特异表达、5个在海南黑山羊皮下脂肪中特异表达。此外,本研究共获得143个差异表达lncRNAs顺式作用靶基因和135个差异表达lncRNAs反式作用靶基因。本研究为进一步研究山羊皮下脂肪沉积的遗传机理提供科学依据。

海南黑山羊及其F1代杂交羊背最长肌转录组测序比较分析

为了鉴定和分析海南黑山羊与其F1代杂交羊(努比亚山羊公羊与海南黑山羊母羊杂交)背最长肌中差异表达的mRNA和lncRNA,试验以6月龄海南黑山羊及其F1代杂交羊公羊为试验动物,逐头采集背最长肌样品,采用RNA-Seq技术和生物信息学方法对两种山羊背最长肌进行转录组测序分析,运用DESeq软件鉴定两种山羊背最长肌组织间差异表达的mRNA和lncRNA,对差异表达基因进行GO功能注释、KEGG信号通路富集分析,同时对差异表达的lncRNA进行靶基因预测分析。结果表明:海南黑山羊及其F1代杂交羊背最长肌间存在276个差异表达的mRNA,其中1个mRNA只在海南黑山羊背最长肌中表达,2个mRNA只在F1代杂交羊背最长肌中表达;在273个共同表达的mRNA中,根据差异倍数大小,排名前10位的分别是NDUFB5、TMEM237、LOC102170968、TXLNB、GPR63、OSBPL1A、KERA、LOC108638040、BMF、HSP70.1。存在145个差异表达的lncRNA,其中16个只在海南黑山羊背最长肌中表达,7个只在F1代杂交羊背最长肌中表达。276个差异表达基因共富集在50个GO功能条目上,主要包括生物学过程、细胞组分和分子功能,富集的KEGG信号通路主要包括PI3K-AKI、细胞因子与细胞因子受体相互作用、趋化因子、MAPK和黏着斑信号通路。获得197个差异表达lncRNA顺式作用靶基因和142个差异表达lncRNA反式作用靶基因。说明海南黑山羊及其F1代杂交羊背最长肌具有不同表达水平的mRNA和lncRNA,两种山羊肌肉组织中均存在特异性表达的mRNA和lncRNA。

五指山猪与临高猪杂交利用效果研究

五指山猪(Wuzhishan pig)因原产于海南省五指山区而得名,是我国著名珍稀地方小型猪种,因肉质细嫩鲜美而深受人们喜爱,尤其白切或红焖五指山猪已成为当地餐桌上的必备佳肴,作为中高档肉用产品开发着广阔的前景。临高猪(LinGao pig)是海南特有的地方优良猪种,其乳猪产品“临高烤乳猪”为海南“四大名吃”之一。

姜黄素对海南屯昌猪生长性能、饲料养分表观消化率和血清生化指标的影响

【目的】研究饲粮中添加姜黄素对生长期海南屯昌猪生长性能、血清生化指标和饲料养分表观消化率的影响。【方法】选取健康、体重(35.88 kg±0.25 kg)接近的80头海南屯昌猪,随机分成5组,每组4个重复,每个重复4头猪,其中对照组饲喂基础饲粮,抗生素组在基础饲粮中添加300 mg/kg硫酸黏膜杆菌素,3个试验组分别在基础饲粮中添加200(姜黄素1组)、400(姜黄素2组)和600 mg/kg(姜黄素3组)姜黄素。预饲期7 d,正试期50 d。试验第51天早上称重,计算生长性能;从每组随机选取6头猪静脉采血,检测血清生化指标;每个重复随机收集3头猪的新鲜粪便,测定饲料养分表观消化率。【结果】与对照组相比,姜黄素3组猪平均日增重(ADG)提高23.82%(P<0.05);料重比(F/G)降低20.06%(P<0.05);血清天门冬氨酸氨基转移酶(AST)活性和二氨氧化酶(DAO)含量分别降低22.23%和29.31%(P<0.05);血清IgA含量提高21.14%(P<0.05)。与抗生素组相比,姜黄素3组猪平均日增重(ADG)提高23.09%(P<0.05);粗纤维表观消化率提高42.14%(P<0.05);血清AST活性降低31.75%(P<0.05)。姜黄素2组猪平均日增重与对照组和抗生素组均无显著差异(P>0.05),粗纤维表观消化率极显著高于对照组和抗生素组(P<0.05);与对照组相比,姜黄素1、2组猪血清D-乳酸和DAO含量均显著降低(P<0.05)。【结论】饲粮中添加600 mg/kg姜黄素可以提高生长期海南屯昌猪的生长性能和粗纤维表观消化率,提升机体免疫状态,具有替代抗生素的潜力。

椰子粕对文昌鸡生长性能、屠宰性能和肉品质的影响

本试验旨在研究不同水平椰子粕对文昌鸡生长性能、屠宰性能和肉品质的影响。选取480只80日龄健康状态良好的文昌鸡,随机分为4组,每组6个重复,每个重复20只鸡。对照组饲喂基础饲粮,3个试验组分别在基础饲粮中添加1.50%、4.50%和7.50%椰子粕。试验期为40 d。结果显示:1)与对照组相比,1.50%和7.50%组料重比均显著下降(P<0.05);各组间末重、平均日增重和平均日采食量均无显著差异(P>0.05)。2)与对照组相比,1.50%组屠宰率显著提高(P<0.05),而其他试验组屠宰性能均无显著差异(P>0.05)。3)与对照组相比,4.50%组胸肌pH 24 h显著降低(P<0.05),各试验组pH 45 min、24 h滴水损失、熟肉率、剪切力和腿肌pH 24 h均无显著差异(P>0.05)。4)与对照组相比,各试验组肌肉肌纤维直径和平均横截面积都无显著差异(P>0.05)。5)与对照组相比,1.50%和7.50%组胸肌中粗蛋白质含量显著提高(P<0.05),但各试验组肌肉中水分、肌内脂肪和腿肌粗蛋白质含量无显著差异(P>0.05)。综上可知,在本试验条件下,饲粮中添加1.50%~7.50%的椰子粕未对文昌鸡生长性能、屠宰性能和肉品质产生不利影响;饲粮中添加1.50%椰子粕可以显著降低料重比,同时提高屠宰率。

植物多糖的生物学功能及其在猪生产中的研究进展

抗生素在动物生产的使用会造成药物残留,动物产生耐药性,污染环境,威胁人和动物的健康。植物多糖具有抗氧化、增强机体免疫、提高生产性能、改善肠道健康等生物学功能,可作为抗生素替代品应用于动物生产中。文章重点介绍了植物多糖的理化性质、生物学功能及其在猪生产中的应用,以期为植物多糖在猪生产中的进一步应用提供参考。

牛大力多糖对育肥期海南猪生长性能、血清生化指标、免疫指标及肠道菌群的影响

试验旨在研究牛大力多糖对育肥期海南猪生长性能、血清生化指标、免疫指标及肠道菌群的影响。选取体重(68.11±1.20)kg、健康、阉割的育肥期海南猪32头,随机分为2组,每组4个重复,每个重复4头猪。对照组猪饲喂基础日粮,牛大力多糖组在基础日粮中添加0.1%牛大力多糖。预试期7 d,试验期70 d。结果显示,与对照组相比,牛大力多糖组海南猪的平均日采食量(ADFI)显著降低(P<0.05);猪血清甘油三酯(TG)含量和谷丙转氨酶(ALT)活性显著降低(P<0.05),高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)含量显著提高(P<0.05);血清免疫球蛋白G(IgG)、免疫球蛋白M(IgM)、免疫球蛋白A(IgA)和肿瘤坏死因子-α(TNF-α)的含量均显著提高(P<0.05)。与对照组相比,牛大力多糖组Chao1物种的丰富度显著降低(P<0.05);在门水平上,脱硫菌门相对丰度显著降低(P<0.05);在科水平上,普雷沃菌科相对丰度显著升高(P<0.05),Muribaculaceae、肠杆菌科、脱硫弧菌科的相对丰度显著降低(P<0.05);在属水平上,丁酸厌氧杆菌、高氏瘤胃球菌群(Ruminococcus_gauvreauii_group)、粪球菌属、月形单胞菌属、布劳特氏菌属的相对丰度显著上调(P<0.05),大肠志贺氏杆菌、脱硫弧菌、Shuttleworthia的相对丰度显著下调(P<0.05)。HDL-C含量与Marvinbryantia的相对丰度呈显著正相关(P<0.05)。研究表明,日粮中添加0.1%牛大力多糖能够降低育肥期海南猪的ADFI,改善血脂代谢,提高机体免疫力,优化结肠菌群结构,促进有益菌生长和抑制有害菌增殖。

五指山猪和长白猪断奶仔猪肠道免疫性能及微生物多样性比较分析

【目的】探讨早期断奶对五指山猪和长白猪小肠肠道免疫性能及微生物多样性的影响差异。【方法】选择生长发育及营养状况良好、28日龄断奶的长白猪与五指山猪各6头,于50日龄采集小肠各段组织、内容物、黏膜,依次采用石蜡切片(HE染色)、16S rDNA V3-V4区基因高通量测序、实时荧光定量PCR测定,比较两品种间肠道形态学、肠道菌群及肠道黏膜免疫相关基因mRNA相对表达量的差异。【结果】①五指山猪空肠绒毛高度显著低于长白猪(P<0.05)。②长白猪十二指肠与回肠微生物多样性均较五指山猪更丰富(P<0.05)。③在门水平上,五指山猪空肠、回肠中厚壁菌门(Firmicutes)的丰度均显著高于长白猪,但变形菌门(Proteobacteria)出现相反的表达趋势(P<0.05)。在属水平上,五指山猪回肠中乳杆菌属(Lactobacillus)的丰度显著高于长白猪(P<0.05)。④黏膜免疫相关基因表达量的检测结果显示,长白猪十二指肠中抑炎因子白细胞介素10(IL-10)和紧密连接蛋白闭锁小带蛋白1(ZO1)的mRNA表达量均显著高于五指山猪(P<0.05);而空肠与回肠中促炎因子肿瘤坏死因子-α(TNF-α)的mRNA表达量均显著低于五指山猪(P<0.05)。【结论】与长白猪相比,早期断奶后五指山猪小肠肠道免疫性能及微生物多样性较差,可适当延长五指山猪的断奶日龄来减少仔猪腹泻率,以保证断奶仔猪的成活率。

植物单宁的生物学功能及其在畜禽生产中的应用研究进展

植物单宁是一种生物学活性较强的多酚类天然植物提取物,具有调节机体抗氧化能力、抗菌消炎、抗病毒和抗腹泻等生理功能,在国内外有着广泛的研究和应用,其饲用安全、使用效果显著。文章综述了植物单宁的生物学功能,及其在畜禽生产上的应用效果,主要体现在促进畜禽的健康、改善肉品质和生长性能、维持瘤胃稳态,旨在为植物单宁在畜禽生产中进一步的研究和应用提供理论支撑和实践参考。

植物源miR156a-5p对五指山断奶仔猪肠道菌群和上皮屏障的影响

本试验旨在探究植物源miR156a-5p对五指山断奶仔猪肠道菌群和上皮屏障的影响。选取初始体重为(5.82±0.13)kg的35日五指山龄断奶仔猪12头,随机分为2组,每组6个重复,每个重复1头。对照组饲喂无意义单链核酸,试验组饲喂合成的植物源miR156a-5p(每天600 pmol/kg)。试验期7 d。结果表明:与对照组相比,1)试验组的终末体重和平均日增重均无显著差异(P>0.05),肺脏指数显著增加(P<0.05);2)试验组的血清白蛋白和高密度脂蛋白胆固醇含量显著或极显著提高(P<0.05);3)试验组十二指肠Chao1指数和Observed_otus指数显著提高(P<0.05),空肠Simpson指数显著降低(P<0.05),盲肠Shanon指数和Simpson指数显著或极显著提高(P<0.05或P<0.01),结肠Simpson指数显著提高(P<0.05);4)试验组十二指肠拟杆菌目(Bacteroidales)、拟杆菌纲(Bacteroidia)和拟杆菌属(Bacteroides)的富集显著增加(P<0.05),十二指肠纤毛菌属(Leptotrichia)、颤螺旋菌属(Oscillibacter)、UCG-010、螺杆菌属(Helicobacter)、脱硫弧菌属(Desulfovibrio)、Clostridia_vadinBB60_group、副萨特氏菌属(Parasutterella)和理研菌属(Rikenella)等的富集显著增加(P<0.05);5)试验组十二指肠pH和隐窝深度极显著提高(P<0.01);6)试验组十二指肠载脂蛋白A1(APOA1)和尾型同源盒转录因子2(CDX2)mRNA相对表达量极显著上调(P<0.01),十二指肠黏糖蛋白2(MUC2)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)和β防御素1(DEFB1)mRNA相对表达量显著上调(P<0.05)。综上所述,植物源miR156a-5p可调节断奶五指山仔猪十二指肠、空肠、盲肠和结肠菌群α多样性,增加十二指肠pH及拟杆菌纲、目和属水平的富集,改善十二指肠上皮分化、化学屏障和黏膜免疫屏障功能。

粗纤维水平对定安鹅胸肌纤维性状及肉品质的影响

为研究粗纤维水平对定安鹅胸肌纤维性状及肉品质的影响,选取144只70日龄定安鹅公鹅,随机分为3组,每组4个重复,每重复12只。分别饲喂粗纤维水平为6.30%、8.25%和10.15%的饲粮,试验期35 d。结果表明:(1)与6.30%组相比,10.15%组定安鹅胸肌肌纤维总横截面积、8.25%组胸肌肌纤维密度分别提高24.16%和20.22%(P<0.05)。(2)8.25%组胸肌pH45 min和pH24 h比10.15%组各降低2.71%和2.90%(P<0.05);8.25%组胸肌剪切力较6.30%和10.15%组分别降低15.09%和17.47%(P<0.05)。(3)与6.30%和10.15%组相比,8.25%组定安鹅胸肌水分含量分别提高16.57%和24.11%(P<0.05);10.15%、8.25%组定安鹅胸肌粗蛋白质水平比6.30%组分别增加5.71%和7.81%(P<0.05)。10.05%组定安鹅胸肌肌苷酸含量较8.25%组提高50.77%(P<0.05)。(4)与6.30%和8.25%组相比,10.15%组胸肌苯丙氨酸含量分别升高5.88%和7.14%(P<0.05)。综上所述,8.25%~10.15%粗纤维水平可改善定安鹅肌纤维特性及肉品质。

五指山猪骨骼肌全基因组甲基化鉴定与分析

为了研究五指山猪背最长肌与半腱肌的遗传差异,鉴定差异甲基化区域(DMRs)和差异甲基化基因(DMGs),采用全基因组重亚硫酸盐测序技术(WGBS)对五指山猪背最长肌和半腱肌进行DNA甲基化水平检测和DMRs分析,对DMGs进行基因本体(GO)功能、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并与已有的转录组数据进行整合分析,探讨基因组甲基化对基因表达差异的影响。结果显示:五指山猪背最长肌和半腱肌全基因组范围内胞嘧啶甲基化主要发生在CG序列上;在CG序列环境下,启动子和第一外显子区域的甲基化水平低于其他基因区域,该环境下五指山猪背最长肌和半腱肌间存在348613个DMRs和17484个DMGs,DMGs主要富集到61个GO条目和289个KEGG通路;在五指山猪背最长肌和半腱肌mRNA差异表达前10位的基因中,锌指结构家族成员4(ZIC4)、锌指结构家族成员1(ZIC1)、成对同源异型结构域蛋白转录因子1(PITX1)、碱性-螺旋-环-螺旋转录因子1(SIM1)、小清蛋白(PVALB)、SEC14类脂质结合因子5(SEC14L5)、丝氨酸蛋白酶抑制剂B家族成员11(SERPINB11)、肌球蛋白结合蛋白H(MYBPH)这8个基因存在DMRs,5个基因(ZIC4、PITX1、SIM1、SEC14L5、MYBPH)存在启动子区甲基化差异。本研究为阐明五指山猪骨骼肌生长发育机制提供表观遗传学依据。

海南地方猪内脏器官的解剖学比较分析

为了研究海南地方猪的器官解剖学特征,获得不同海南地方猪种器官的基础性数据,试验通过称重、解剖测量并进行统计分析,获得海南地方猪器官的相对重量和长宽比。结果显示,定安猪的肾脏(双肾)相对重量显著高于其他3种海南地方猪;五指山猪的肾脏(双肾)相对重量显著低于其他3种海南地方猪;临高猪的脾脏相对重量显著高于墩头猪;定安猪的肝脏(含胆)的相对重量显著高于临高猪和五指山猪。五指山猪的心脏长宽比显著高于定安猪;墩头猪的肾脏长宽比显著高于其他3种海南地方猪;五指山猪的肾脏长宽比显著高于定安猪。本研究成功获得海南地方猪4种器官的形态特征和发育情况,为下一步开展基因组和转录组差异分析提供表型数据支撑。

PRLR基因外显子10多态性与西农萨能奶山羊产奶性能的相关分析

设计4对引物,采用PCR-SSCP技术检测催乳素受体(PRLR)基因外显子10在西农萨能奶山羊群上的单核苷酸多态性,同时研究该基因对其产奶性能的影响。结果表明:引物P2、P3与P4扩增片段具有多态性,P1的扩增片段不存在多态性。应用P2扩增片段,在西农萨能奶山羊中仅检测到AA和AB基因型,纯化测序表明AA与AB基因型相比有2处突变,C27T的突变没有导致氨基酸变化,第189处的碱基缺失导致氨基酸由组氨酸变为酪氨酸和苏氨酸。AA和AB基因型之间产奶量的最小二乘均值差异显著(P<0.05),AA基因型在各胎次产奶量和平均产奶量等指标上均高于AB基因型,其中第3胎的产奶量达到显著水平(P<0.05);应用P3扩增片段,在西农萨能奶山羊中检测到3种基因型(CC、CD、DD),纯化测序表明CC与DD基因型相比有2处突变(C103A和T106C),分别导致氨基酸由赖氨酸变为苏氨酸、苏氨酸变为异亮氨酸;3种基因型之间产奶量的最小二乘均值差异不显著(P>0.05)。应用P4扩增片段,在西农萨能奶山羊中也只检测到EE和EF基因型,纯化测序表明EE与EF基因型相比有1处突变(A114G),该突变导致氨基酸由蛋氨酸变为缬氨酸;EE和EF基因型之间产奶量差异显著(P<0.05)。EE基因型的个体各胎次产奶量均比EF型高,其中在第3、4胎产奶量和前4胎平均产奶量3项指标上都达到显著水平(P<0.05)。研究结果提示:PRLR基因对奶山羊产奶量有显著影响,因此认为PRLR基因外显子10位点可作为奶山羊高产奶量的标记辅助选择的有效分子标记。