为探究文山地区不同基因型小米辣根际细菌群落结构特征差异,采用16S r DNA高通量测序对本地野生品种小米辣‘M218’和人工选育品种小米辣‘M240’的根际土壤细菌群落进行结构、功能预测分析。结果表明:两个小米辣品种间共有OTU数为379个...为探究文山地区不同基因型小米辣根际细菌群落结构特征差异,采用16S r DNA高通量测序对本地野生品种小米辣‘M218’和人工选育品种小米辣‘M240’的根际土壤细菌群落进行结构、功能预测分析。结果表明:两个小米辣品种间共有OTU数为379个,其中‘M218’独有OTU为3个,‘M240’独有的OTU为1个。门水平下第一大优势菌是变形菌门(Proteobacteria),各样本中分别占61.29%和63.76%,其次是拟杆菌门(Bacteroidetes),各样本中分别占13.55%和12.08%;在鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)中,‘M218’丰度高于‘M240’。α多样性分析显示两者间无显著差异,但在Unifrac距离PCoA分析中样本间相似度差异较大。基于COG数据库PICRUSt2功能预测表明,E类(氨基酸转运和代谢)、C类(能量产生和转换)和M类(细胞壁、细胞膜和膜结构的生物合成)等丰度值较高,其中小米辣‘M218’丰度值比‘M240’高。相较‘M240’,小米辣‘M218’根际细菌群落具有较高物种丰度和生命活动。展开更多
文摘为探究文山地区不同基因型小米辣根际细菌群落结构特征差异,采用16S r DNA高通量测序对本地野生品种小米辣‘M218’和人工选育品种小米辣‘M240’的根际土壤细菌群落进行结构、功能预测分析。结果表明:两个小米辣品种间共有OTU数为379个,其中‘M218’独有OTU为3个,‘M240’独有的OTU为1个。门水平下第一大优势菌是变形菌门(Proteobacteria),各样本中分别占61.29%和63.76%,其次是拟杆菌门(Bacteroidetes),各样本中分别占13.55%和12.08%;在鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)中,‘M218’丰度高于‘M240’。α多样性分析显示两者间无显著差异,但在Unifrac距离PCoA分析中样本间相似度差异较大。基于COG数据库PICRUSt2功能预测表明,E类(氨基酸转运和代谢)、C类(能量产生和转换)和M类(细胞壁、细胞膜和膜结构的生物合成)等丰度值较高,其中小米辣‘M218’丰度值比‘M240’高。相较‘M240’,小米辣‘M218’根际细菌群落具有较高物种丰度和生命活动。