利用生物信息学方法对番茄SUTs基因家族成员基因及蛋白质序列进行生物信息学分析,并对基因的表达特性进行研究。番茄SlSUTs基因家族共有3个成员,蛋白质的分子质量在54.15~64.99 k D之间;3个基因均匀分布在4号、5号和11号染色体上;基因...利用生物信息学方法对番茄SUTs基因家族成员基因及蛋白质序列进行生物信息学分析,并对基因的表达特性进行研究。番茄SlSUTs基因家族共有3个成员,蛋白质的分子质量在54.15~64.99 k D之间;3个基因均匀分布在4号、5号和11号染色体上;基因的内含子和外显子结构模式有3种,差异显著。番茄SlSUTs和拟南芥AtSUTs氨基酸都具有2种基序存在形式,且相同基序形式的基序位置存在关系一致。番茄和拟南芥SUTs蛋白的二级结构都有4种,其中α螺旋占比最多,β折叠占比最少,蛋白具有11或12个跨膜结构域,亚细胞定位都在细胞膜上。植物SUTs基因的进化关系遵循物种种属的亲缘关系,番茄SlSUTs基因与葡萄的进化关系更相近。番茄SlSUTs基因在不同组织和果实不同发育时期的表达都不相同,说明SlSUTs基因的表达具有一定的组织特异性。展开更多
文摘利用生物信息学方法对番茄SUTs基因家族成员基因及蛋白质序列进行生物信息学分析,并对基因的表达特性进行研究。番茄SlSUTs基因家族共有3个成员,蛋白质的分子质量在54.15~64.99 k D之间;3个基因均匀分布在4号、5号和11号染色体上;基因的内含子和外显子结构模式有3种,差异显著。番茄SlSUTs和拟南芥AtSUTs氨基酸都具有2种基序存在形式,且相同基序形式的基序位置存在关系一致。番茄和拟南芥SUTs蛋白的二级结构都有4种,其中α螺旋占比最多,β折叠占比最少,蛋白具有11或12个跨膜结构域,亚细胞定位都在细胞膜上。植物SUTs基因的进化关系遵循物种种属的亲缘关系,番茄SlSUTs基因与葡萄的进化关系更相近。番茄SlSUTs基因在不同组织和果实不同发育时期的表达都不相同,说明SlSUTs基因的表达具有一定的组织特异性。