利用生物信息学方法筛选与宫颈癌发生、发展和预后相关的血管生成相关基因(angiogenesis related gene,ARG),并进行相关预后风险模型的构建与验证。首先,从TCGA数据库中检索宫颈癌患者的表达谱和临床特征,并提取差异表达的ARG;其次,采用...利用生物信息学方法筛选与宫颈癌发生、发展和预后相关的血管生成相关基因(angiogenesis related gene,ARG),并进行相关预后风险模型的构建与验证。首先,从TCGA数据库中检索宫颈癌患者的表达谱和临床特征,并提取差异表达的ARG;其次,采用Lasso Cox回归筛选预后ARG,构建相关预后模型;再次,使用GSE52903和GSE44001数据集进行外部验证;最后,利用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)探讨宫颈癌预后机制。筛选结果显示,共获得15个预后ARG,分别为EFNA1、ITGA5、EPHB4、NRP1、CDH5、PLAU、BMP6、DLL4、JUN、CA9、MMP1、BAIAP2L1、SERPINF1、F2RL1和FGFR2。GSE52903和GSE44001数据集的Kaplan-Meier生存曲线显示,高风险组的总生存期(overall survival,OS)(P=0.005)和无病生存期(disease-free survival,DFS)(P<0.001)显著低于低风险组。受试者操作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析结果显示,GSE52903验证集在1年、3年和5年的曲线下面积(area under the curve,AUC)值分别为0.84、0.77和0.73,C-指数为0.72;GSE44001验证集在1年、3年和5年的AUC值分别为0.71、0.72和0.70,C-指数为0.70,说明该模型对患者预后具有很强的预测效能。GSEA分析富集的通路主要涉及DNA复制、细胞外基质(extracellular matrix,ECM)受体相互作用、补体和凝血级联等,这些过程与宫颈癌发生、发展紧密相关。以上结果表明,这15个关键ARG可能是宫颈癌预后潜在的生物标志物。展开更多
目的探究血清前白蛋白(prealbumin,PA)和视黄醇结合蛋白(retinol-binding protein,RBP)在肝硬化及肝硬化合并肝癌患者中的临床价值。方法收集2022年1月至2022年9月在西南医科大学附属医院收治的428例肝硬化患者的临床资料。同时,根据Chi...目的探究血清前白蛋白(prealbumin,PA)和视黄醇结合蛋白(retinol-binding protein,RBP)在肝硬化及肝硬化合并肝癌患者中的临床价值。方法收集2022年1月至2022年9月在西南医科大学附属医院收治的428例肝硬化患者的临床资料。同时,根据Child-Pugh分级、终末期肝病模型(model for end stage liver disease,MELD)评分和本次入院是否合并肝癌对肝硬化患者进行分组,测定患者血清PA和RBP的水平,分析两项指标与肝硬化患者肝脏储备功能及肝硬化合并肝癌的相关性。结果Child-Pugh-A级患者的血清PA和RBP水平最高,Child-Pugh-C级最低,随着Child-Pugh分级的升高,血清PA和RBP水平逐渐降低(P<0.05);低MELD组患者血清PA和RBP水平显著高于高MELD组(P<0.05);肝硬化合并肝癌组患者的血清PA和RBP水平显著高于非肝癌组(P<0.05);进一步采用Spearman相关检验分析,血清PA、RBP水平与肝硬化患者Child-Pugh分级和MELD评分呈负相关(r<0,P<0.05),血清PA水平与肝癌的发生也呈负相关(r<0,P<0.05)。结论血清PA和RBP能够灵敏地反映肝功能损伤情况,评估肝硬化患者的残余肝细胞功能,并且PA在一定程度上能够预测肝癌的发生。展开更多
文摘利用生物信息学方法筛选与宫颈癌发生、发展和预后相关的血管生成相关基因(angiogenesis related gene,ARG),并进行相关预后风险模型的构建与验证。首先,从TCGA数据库中检索宫颈癌患者的表达谱和临床特征,并提取差异表达的ARG;其次,采用Lasso Cox回归筛选预后ARG,构建相关预后模型;再次,使用GSE52903和GSE44001数据集进行外部验证;最后,利用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)探讨宫颈癌预后机制。筛选结果显示,共获得15个预后ARG,分别为EFNA1、ITGA5、EPHB4、NRP1、CDH5、PLAU、BMP6、DLL4、JUN、CA9、MMP1、BAIAP2L1、SERPINF1、F2RL1和FGFR2。GSE52903和GSE44001数据集的Kaplan-Meier生存曲线显示,高风险组的总生存期(overall survival,OS)(P=0.005)和无病生存期(disease-free survival,DFS)(P<0.001)显著低于低风险组。受试者操作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析结果显示,GSE52903验证集在1年、3年和5年的曲线下面积(area under the curve,AUC)值分别为0.84、0.77和0.73,C-指数为0.72;GSE44001验证集在1年、3年和5年的AUC值分别为0.71、0.72和0.70,C-指数为0.70,说明该模型对患者预后具有很强的预测效能。GSEA分析富集的通路主要涉及DNA复制、细胞外基质(extracellular matrix,ECM)受体相互作用、补体和凝血级联等,这些过程与宫颈癌发生、发展紧密相关。以上结果表明,这15个关键ARG可能是宫颈癌预后潜在的生物标志物。
文摘目的探究血清前白蛋白(prealbumin,PA)和视黄醇结合蛋白(retinol-binding protein,RBP)在肝硬化及肝硬化合并肝癌患者中的临床价值。方法收集2022年1月至2022年9月在西南医科大学附属医院收治的428例肝硬化患者的临床资料。同时,根据Child-Pugh分级、终末期肝病模型(model for end stage liver disease,MELD)评分和本次入院是否合并肝癌对肝硬化患者进行分组,测定患者血清PA和RBP的水平,分析两项指标与肝硬化患者肝脏储备功能及肝硬化合并肝癌的相关性。结果Child-Pugh-A级患者的血清PA和RBP水平最高,Child-Pugh-C级最低,随着Child-Pugh分级的升高,血清PA和RBP水平逐渐降低(P<0.05);低MELD组患者血清PA和RBP水平显著高于高MELD组(P<0.05);肝硬化合并肝癌组患者的血清PA和RBP水平显著高于非肝癌组(P<0.05);进一步采用Spearman相关检验分析,血清PA、RBP水平与肝硬化患者Child-Pugh分级和MELD评分呈负相关(r<0,P<0.05),血清PA水平与肝癌的发生也呈负相关(r<0,P<0.05)。结论血清PA和RBP能够灵敏地反映肝功能损伤情况,评估肝硬化患者的残余肝细胞功能,并且PA在一定程度上能够预测肝癌的发生。
