目的基于转录组测序技术筛选甲状腺微小乳头状癌潜在高风险侵袭性相关的差异表达基因,生物信息学进一步分析探讨具有调控作用的分子通路并寻找功能性靶向基因.方法应用转录组测序技术对15例潜在高风险侵袭性(7例局部淋巴结转移,3例腺体...目的基于转录组测序技术筛选甲状腺微小乳头状癌潜在高风险侵袭性相关的差异表达基因,生物信息学进一步分析探讨具有调控作用的分子通路并寻找功能性靶向基因.方法应用转录组测序技术对15例潜在高风险侵袭性(7例局部淋巴结转移,3例腺体外组织侵犯,5例多癌灶)和9例惰性甲状腺微小乳头状癌进行差异表达基因的筛查,并对差异基因进一步行生物信息学在线分析.结果共筛选出1269个差异基因.经GO数据库分析,差异基因主要聚类在趋化性、细胞黏附、细胞-基质黏附、钙黏蛋白结合等集合中(P<0.05);经KEGG数据库分析,肌动蛋白细胞骨架调节通路(regulation of actin cytoskeleton)、细胞的焦点粘连通路(focal adhesion)、PI3K-Akt信号通路(PI3K-Akt signaling pathway)、黏着小带通路(adherens junction)以及癌症途径通路(pathways in cancer)差异基因富集的显著程度高(P<0.05),是应关注的关键通路;其中,功能性下调基因ITGA2、ITGA3和ITGAV差异表达明显,富集程度较高,处于信号通路的核心调控位置,是与PTMC潜在高风险侵袭性相关的重要基因(P<0.05).结论与惰性PTMC相比,具有潜在高风险侵袭性特征的PTMC在基因表达的整体模式上存在明显差异,而整合素家族的ITGA2、ITGA3和ITGAV基因是需要重点关注的与PTMC潜在高风险侵袭性相关的功能性靶向基因.展开更多
目的预测丝裂原活化蛋白激酶(mitogenactivated protein kinase10,MAPK10)及整合素α6(Integrinα6)在声门上型喉癌中对紫杉醇+顺铂+5氟尿嘧啶(TPF)诱导化疗方案敏感性的价值。方法将2014年9月~2016年9月在我科治疗的57例声门上型喉鳞...目的预测丝裂原活化蛋白激酶(mitogenactivated protein kinase10,MAPK10)及整合素α6(Integrinα6)在声门上型喉癌中对紫杉醇+顺铂+5氟尿嘧啶(TPF)诱导化疗方案敏感性的价值。方法将2014年9月~2016年9月在我科治疗的57例声门上型喉鳞状细胞癌患者纳入研究。所有患者接受2个周期的TPF方案诱导化疗,并将患者按照疗效分为化疗敏感组和化疗耐受组。采用免疫组化对所有患者病理标本中MAPK10及Itga6表达进行检测,并分析mRNA与蛋白表达一致性,以及蛋白表达与患者临床病理资料之间的关系。结果 MAPK10在敏感组中表达率较高为90.48%,Itga6在耐受组中表达率较高为83.33%,两组之间差异有统计学意义。MAPK10在耐受组中表达水平低于敏感组,Itga6 mRNA高于敏感组,差异有统计学意义。一致性检验表明MAPK10及Itga6在耐受组之中mRNA表达及与蛋白表达一致性较高。MAPK10及Itga6的表达与年龄、性别、肿瘤直径无关;MAPK10的表达与临床分期、病理分级相关,阳性率越低患者病情越重。Spearman等级相关分析结果表明MAPK10与Itga6表达水平之间存在负相关关系,在敏感组喉癌组织中MAPK10与Itga6表达水平之间同样存在负相关关系。结论 MAPK10在对化疗耐受的喉癌组织中表达下调,而Itga6表达上调,且表达水平之间存在负相关关系,因此有可能成为喉癌诱导化疗疗效预测的分子标志物。展开更多
头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)是常见的癌症类型之一。尽管多种治疗方式如手术、放疗、化疗、靶向治疗等已经广泛应用,但过去的二十多年中,患者的生存率缺乏显著的改善。免疫治疗作为新兴的治疗方法,...头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)是常见的癌症类型之一。尽管多种治疗方式如手术、放疗、化疗、靶向治疗等已经广泛应用,但过去的二十多年中,患者的生存率缺乏显著的改善。免疫治疗作为新兴的治疗方法,在复发或转移(recurrence or metastasis,R/M)HNSCC中体现出振奋人心的疗效,但是目前筛选适合病例的手段仍显不足,个性化且可靠的用于预测疗效的生物标志物和新治疗策略尚待研发。本研究复习了免疫治疗在HNSCC中的应用,发掘肿瘤免疫异质性与免疫治疗疗效的预测指标;除了程序性细胞死亡受体-1(programmed cell death protein 1,PD-1)表达具有明显的疗效预测意义外,IFN-γ、CXCL、MTAP、SFR4/CPXM1/COL5A1等,以及肿瘤成纤维细胞(cancer-associated fibroblasts,CAFs)、外泌体、外周血指标也可能对免疫治疗效果的预测具有提示意义。展开更多
文摘目的基于转录组测序技术筛选甲状腺微小乳头状癌潜在高风险侵袭性相关的差异表达基因,生物信息学进一步分析探讨具有调控作用的分子通路并寻找功能性靶向基因.方法应用转录组测序技术对15例潜在高风险侵袭性(7例局部淋巴结转移,3例腺体外组织侵犯,5例多癌灶)和9例惰性甲状腺微小乳头状癌进行差异表达基因的筛查,并对差异基因进一步行生物信息学在线分析.结果共筛选出1269个差异基因.经GO数据库分析,差异基因主要聚类在趋化性、细胞黏附、细胞-基质黏附、钙黏蛋白结合等集合中(P<0.05);经KEGG数据库分析,肌动蛋白细胞骨架调节通路(regulation of actin cytoskeleton)、细胞的焦点粘连通路(focal adhesion)、PI3K-Akt信号通路(PI3K-Akt signaling pathway)、黏着小带通路(adherens junction)以及癌症途径通路(pathways in cancer)差异基因富集的显著程度高(P<0.05),是应关注的关键通路;其中,功能性下调基因ITGA2、ITGA3和ITGAV差异表达明显,富集程度较高,处于信号通路的核心调控位置,是与PTMC潜在高风险侵袭性相关的重要基因(P<0.05).结论与惰性PTMC相比,具有潜在高风险侵袭性特征的PTMC在基因表达的整体模式上存在明显差异,而整合素家族的ITGA2、ITGA3和ITGAV基因是需要重点关注的与PTMC潜在高风险侵袭性相关的功能性靶向基因.
文摘头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)是常见的癌症类型之一。尽管多种治疗方式如手术、放疗、化疗、靶向治疗等已经广泛应用,但过去的二十多年中,患者的生存率缺乏显著的改善。免疫治疗作为新兴的治疗方法,在复发或转移(recurrence or metastasis,R/M)HNSCC中体现出振奋人心的疗效,但是目前筛选适合病例的手段仍显不足,个性化且可靠的用于预测疗效的生物标志物和新治疗策略尚待研发。本研究复习了免疫治疗在HNSCC中的应用,发掘肿瘤免疫异质性与免疫治疗疗效的预测指标;除了程序性细胞死亡受体-1(programmed cell death protein 1,PD-1)表达具有明显的疗效预测意义外,IFN-γ、CXCL、MTAP、SFR4/CPXM1/COL5A1等,以及肿瘤成纤维细胞(cancer-associated fibroblasts,CAFs)、外泌体、外周血指标也可能对免疫治疗效果的预测具有提示意义。